A Korean endemic and evergreen small tree ' Dendropanax morbifera $L_{EV}$.(Araliaceae)' is a component of evergreen forest and mainly idstributein sourthern region and islands in Korea. A local population of D. morbifera which is located between evergreen and deciduous forest within 50m x 50m quadrate was investigated to ascertain the change of population structure, emergence and growth dynamics of seedlings and saplings, and pattern of spatial distribution by the temproal and spatial expansion of population . The result of analysis of population structure by Importnace Value(IV), evergreen forest showed a high species diversity of evergreen tree species such as Cinnamomum japonicum, Machilus japonica, Neolitsea serica, Daphniphyllum macropodum, Ligustrum japonicum, and etc, in middle and under story than in upper story where Camelia japonica and Quercus acuta were dominant. And in conterminous deciduous fores, the major component of evergreen forest in this region, Camellia japonica, Quercus acuta, evergreen tree of Lauraceae and etc. were abundant in only under story. IV of D. morbifera differed from among three story. In comparative analysis of emergence and growth dynamics of D. morbifera seedlings and saplings between evergreen and deciduous forest, emergece and density of seedlings were significantly greater in evergreen than in deciduous forest, and growth of height and basal diameter of seedlings and saplings were slightly larger in evergreen than in deciduous forest. The spatial distribution patterns by Moristia's index mapping of indivuduals using a lattice method of XY axis within this population showed that seedlings(age up to 2 years) and saplings (age>2 years and height<1m) both evergreen and deciduous forest were more or less aggregated apart from mature trees, and thougth intermediate trees(height>1m and dbh<10cm) had a aggregated distribution pattern, mature trees(dbh>10cm were uniform. In conclusion , the expansion of D. morbfera population from evergreen to deciduous forest accompanied with a mumber of evergreen woody species, and also, emergence and recruitment, and growth of seedlings were greatly influenced moisture and canopy by around community structure.
The total methylotrophic population associated with rice plants from different cultivars was enumerated at three different stages: vegetative, flowering, and harvesting. The bacterial population in the leaf, rhizosphere soil, endophytic in the stem and roots, and epiphytic in the florets and grains were determined from four rice cultivars, Il-mi, Nam-pyeoung, O-dae, and Dong-jin, sampled from three different field sites. The methylotrophic bacteria isolated on AMS media containing 0.5% methanol as the sole carbon source uniformly showed three distinct morphologies, which were recorded as separate groups and their distribution among the various samples was determined using the ecophysiological index. The growth stage at the time of sampling had a more significant effect on the methylotrophic population and their distribution than the field site or cultivar. A similar effect was also observed for the PPFMs, where their population in different plant parts increased from V10 to R4 and then decreased towards stage R9. A canonical discriminant analysis of the PPFM population from different parts of rice showed clear variations among the cultivars, sampled sites, and growth stages, although the variations were more prominent among the growth stages.
The concentrations of 4 kalosaponins from tissues of Kalopanax septemlobus (Thunb.)Koidz grown in 7 provenances in Korea were determined by HPLC. Kalosaponin contents in plant part were much higher in the inner bark(30.59 mg/g on the dry weight basis) than those of young leaves(22.74 mg/g on the dry weight basis) and root bark(18.02 mg/g on the dry weight basis). A considerable range of variation in the contents was observed among population. The kalosaponin contents in inner bark from each population were highest in the Mt. Barwang (30.37 mg/g on the dry weight basis) followed by Mt. Gariwang, Hanra II, Mangun, Paltan, and Hanra I population. A variation of kalosaponin contents among population may be affected by both environmental and genetic factors. Establishment of selection and propagation of high kalosaponin containing trees can be a good source for the development of valuable forest products.
Influence of the moisture content in soils was examined on population variations of soil microbes, including Cylindrocarpon destructans causing root rot of ginseng, in vivo and under the field condition. Fungal populations decreased in soils treated with various moisture contents in vivo as days after the treatment in creased, but there was not a significant difference in the population among other treatments except 135% moisture content (flooding) at 15 weeks after the treatment. In flooded soils populations of total fungi and C. destructans were reduced to 1/10 and 1/50 of initial populations, respectively. There was, however, a little difference in the population of total bacteria or Actinomycetes between before and at 15 weeks after flooding. On the other hand, population variations of bacteria and Actinomycetes were much greater than those of fungi at different intervals after the moisture treatment. Variations of microbial populations in flooded soils under the field condition were similar to those in vivo. Especially, populations of Fusarium and pectolytic bacteria in flooded soils were reduced to 1/100 of populations in nonflooded soils at 170 days after treatment.
In this study, 29 simple sequence repeat (SSR) markers were used to analyze the genetic diversity and population structure of 125 rice accessions from 40 different origins in Africa, Asia, Europe, South America, and Oceania. A total of 333 alleles were detected, with an average of 11.5 per locus. The mean values of major allele frequency, expected heterozygosity, and polymorphism information content (PIC) for each SSR locus were 0.39, 0.73, and 0.70, respectively. The highest mean PIC was 0.71 for Asia, followed by 0.66 for Africa, 0.59 for South America, 0.53 for Europe, and 0.47 for Oceania. Model-based structure analysis revealed the presence of five subpopulations, which was basically consistent with clustering based on genetic distance. Some accessions were clearly assigned to a single population in which >70% of their inferred ancestry was derived from one of the model-based populations. In addition, 12 accessions (9.6%) were categorized as having admixed ancestry. The results could be used to understanding the genetic structure of rice cultivars from these regions and to support effective breeding programs to broaden the genetic basis of rice varieties.
The bean bug Riptortus clavatus Thunberg (Heteroptera: Alydidae) is an important pest, causing serious yield loss in soybean. But the information on mechanism of resistance to R. clavatus is limited. The objective of this study was to identify QTLs for R. clavatus resistance using simple sequence repeat (SSR) markers in a soybean population of recombinant inbred lines (RILs) developed from the cross PI 171451 ${\times}$ Hwaeomputkong. A genetic map from this population was constructed with a total of 136 SSR markers covering 1073.9 cM on 20 linkage groups (LGs). With 126 $F_5$ RILs, two independent QTLs for resistance to R. clavatus were mapped on LGs B1 and C2. The amount of phenotypic variation explained by these QTLs ranged from 12 to 16%. PI 171451 showed an escape response to R. clavatus. Under feeding conditions, 14.4% of RILs showed greater resistance to R. clavatus than the resistant parent. The resistance to R. clavatus in soybean from PI 171451 was incomplete and quantitatively inherited and the QTLs for resistance to R. clavatus detected in the RIL population were not significantly affected by epistatic interactions.
Ghorbanipour, Ali;Rabiei, Babak;Rahmanpour, Siamak;Khodaparast, Seyed Akbar
The Plant Pathology Journal
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v.35
no.3
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pp.189-199
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2019
In this research, the relationships among the 31 microsatellite markers with charcoal rot disease resistance related indices in 130 different soybean cultivars and lines were evaluated using association analysis based on the general linear model (GLM) and the mixed linear model (MLM) by the Structure and Tassel software. The results of microsatellite markers showed that the genetic structure of the studied population has three subpopulations (K=3) which the results of bar plat also confirmed it. In association analysis based on GLM and MLM models, 31 and 35 loci showed significant relationships with the evaluated traits, respectively, and confirmed considerable variation of the studied traits. The identified markers related to some of the studied traits were the same which can probably be due to pleiotropic effects or tight linkage among the genomic regions controlling these traits. Some of these relationships were including, the relationship between Sat_252 marker with amount of charcoal rot disease, Satt359, Satt190 and Sat_169 markers with number of microsclerota in stem, amount of charcoal rot disease and severity of charcoal rot disease, Sat_416 marker with number of microsclerota in stem and amount of charcoal rot disease and the Satt460 marker with number of microsclerota in stem and severity of charcoal rot disease. The results of this research and the linked microsatellite markers with the charcoal rot disease-related characteristics can be used to identify the suitable parents and to improve the soybean population in future breeding programs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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