• 제목/요약/키워드: PTS system

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Brevibacterium ammoniagenes의 30S 리보좀 단백질 S1을 코드하는 유전자의 염기서열 (Nucleotide Sequence of the Putative Gene Encoding 30S Ribosomal Protein S1 from Brevibacterium ammoniagenes)

  • 윤기홍;이미성;오영필;최정호
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.147-151
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    • 2000
  • Brevibacterium ammoniagenes 염색체상에서 phosphotrans-ferase system의 glucose permease를 코드하는 ptsG 유전자와 인접한 지역의 염기서열을 결정한 결돠 1,467 nucleo-tides로 구성된 1개의 open reading frame(ORF)이 발견되었고 이것은 489 아미노산 잔기로 구성되는 단백질을 코드하는 것으로추정된다. 이러한 ORF로부터 추정된 단백질의 아미노산 잔기배열을 분석한 결과 30S 리보좀을 구성하는 단백질중의 하나인 S1과 상동성이 높은 것으로 나타났는데 특히 Mycobacterium tuberculosis M. leprae와 Srepto-myces coelicola의 S1단백질의 아미노산 잔기배열과 각각 83%, 74%m, 77%의 매우 높은 상동성을 보였으며 Escherichia coli의 것과도 약 40%의 상동성을 보였다 이로보아 B.ammoniagenes 염색체상에서 ptsG 유전자와 인접한 지역에 존재하는 ORF는 리보좀 단백질 S1의 유전자로 추정된다. 또한 이들은 염색체상에서 동일한 방향으로 판독되며 S1의 유전자가 ptsG의 위 지역으로 266 nucleotides 떨어져 존재하고 있다.

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A Hybrid PAPR Reduction Scheme for Optical Wireless OFDM Communication Systems

  • Abdulkafi, Ayad Atiyah;Alias, Mohamad Yusoff;Hussein, Yaseein Soubhi;Omar, Nazaruddin;Salleh, Mohd Kamarulzamin Bin
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제12권3호
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    • pp.1136-1151
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    • 2018
  • This paper proposes a new hybrid scheme to decrease the high peak to average power ratio (PAPR) of optical orthogonal frequency division multiplexing (OFDM) signals in visible light communication (VLC) systems. The PAPR causes nonlinear signal distortions and high power requirements for the VLC transmitter (light emitting diode, LED). The proposed method is applicable for both direct current-biased optical OFDM (DCO-OFDM) and asymmetrically clipped optical OFDM (ACO-OFDM). In the proposed scheme, the PTS method is firstly modified to fit both optical OFDM approaches transmission and then combined with signal clipping method for further PAPR reduction and bit error rate (BER) improvement of the VLC system. The performance of hybrid scheme has been evaluated and compared with the original OFDM based VLC system, conventional PTS and clipping methods. The results show that the hybrid scheme outperforms other methods in terms of both the PAPR reduction and BER performance.

Cognitive Radio 시스템에서 Non-Contiguous OFDM의 PAPR 감소기법 분석 (PAPR Reduction Techniques Analysis of Non-Contiguous OFDM in Cognitive Radio Systems)

  • 전석훈;오진오;서만중;임성빈
    • 대한전자공학회논문지TC
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    • 제48권9호
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    • pp.27-34
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    • 2011
  • 무선 통신 시스템의 효율을 높이기 위해 제안된 무선인지 (Cognitive Radio) 시스템은 2차 사용자가 주사용자 (primary user)의 스펙트럼을 서로 공유하는 시스템이다. 2차 사용자가 주사용자에게 간섭을 일으키지 않으면서 효율적으로 데이터를 전송하기 위해서 NC-OFDM (Non-contiguous Orthogonal Frequency Division Multiplexing)을 사용한다. 하지만 NC-OFDM은 기존 OFDM과 마찬가지로 높은 PAPR (Peak-to-Average Power Ratio)을 발생시켜 시스템 성능을 저하시킨다. 본 논문에서는 첫 번째로 NC-OFDM에서 부반송파의 분포에 따른 PAPR에 대해 분석하였다. 두 번째로 기존 OFDM의 PAPR 감소기법인 PTS (Partial Transmit Sequence)와 SLM (Selective Mapping)을 NC-OFDM에 적용하여 PAPR 감소성능을 확인하였다. 마지막으로 pruned-FFT가 적용된 PAPR 감소기법을 NC-OFDM에 적용할 경우 계산복잡도를 기존 OFDM과 비교하였다. 시뮬레이션을 통해 pruned-FFT가 적용된 NC-OFDM이 기존 OFDM보다 PAPR 감소성능 및 계산복잡도 측면에서 보다 효율적임을 검증하였다.

DNA microarray를 이용한 항진균 활성세균 Bacillus lentimorbus WJ5의 유전자 발현 분석 (DNA Microarray Analysis of Gene Expression in Antifungal Bacterium of Bacillus lentimorbus WJ5)

  • 이영근;김재성;장유신;조규성;장화형
    • 미생물학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.141-147
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    • 2003
  • 여러 항진균 활성 관련 유전자들의 발현 수준을 동시에 연구하기 위하여 DNA microarray를 이용하여 유전자들의 발현 패턴을 비교 분석하였다. 본 연구에서는 항진균활성을 가지는Bacillus lentimorbus WJ5의 genomic DNA를 무작위 하게 제한효소로 절단하여 2,000개의 DNA단편을 microarray하였으며, 감마선($^{60}Co$)조사로 유도된 7종의 항진균 활성 결핍 돌연변이체와 발현양상을 정량적으로 비교하였다. Gene Cluster (Michael Risen, Stanford Uniy.)를 이용한 DNA microarray의 분석 결과, 총 408개의 DNA 단편이 발현되는 것을 확인할 수 있었으며, 이들 중 20개의 DNA단편이 항진균 활성 결핍 돌연변이체에서 발현이 억제되는 것으로 나타났다. 특히,pbuX (xanthine permease, K222), ywbA (phosphotransferase system enzyme II, K393), ptsG (PTS glucose specific enzyme II ABC component, K877), yufO (ABC transporter(ATP-binding protein), K1301), 그리고 ftsY (signal recognition particle (docking protein), K868)는 모든 돌연변이체에서 동시에 발현되는 down-regulation된 유전자들로서 물질 이동과 관련된 것으로 보고되어 있으며, 항진균 활성 관련 신호 및 물질의 이동에 관여할 것으로 사료되어진다.

OFDM 통신방식에서 PAPR 감소를 위한 SDM 방식 (A SDM Method for the PAPR Reduction in the OFDM Communication System)

  • 유호진;유흥균
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제14권3호
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    • pp.244-252
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    • 2003
  • 본 논문에서는 OFDM(Orthogonal Frequency Division Multiplexing)통신 시스템에서 발생하는 중요한 문제점인 PAPR(Peak to Average Power Ratio)을 저감하기 위하여 새로운 SDM(Subband Division Method) 방식을 제안한다. 제안 방식은 데이터 서브 블록을 몇 개의 서브블록으로 나누어 PAPR이 낮게 되는 서브블록까지 전송하고, 나머지 서브 블록은 다음번에 전송하는 방식이다. 적용 알고리즘에 따라 SDM 1과 SDM 2를 제안하였고 각각 성능을 분석 비교하였다. 제안 방식은 기존의 PAPR 저감 기법중 가장 좋은 PTS 방식과 비교하였을 경우, 비슷한 PAPR 저감성능을 보이면서도, 상당한 계산량 감소를 보인다.

OFDM 시스템에서의 GD방식과 Radix-2 DIF IFFT를 이용한 효과적인 PAPR 감소 방식 (A New PAPR Reduction Method in the OFDM System using GD and Radix-2 DIF IFFT)

  • 이선호;이해기;김성수
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제8권3호
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    • pp.41-46
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    • 2008
  • PAPR을 극복하기 위해서 SLM, PTS, SPW와 GD 같은 많은 연구들이 진행되었다. 본 논문에서는 PAPR을 줄이고 늘어난 계산량을 GD방식과 Radix-2 DIF IFFT 과정을 통하여 성능을 향상시키는 방법을 제시한다. 그리고 특정값을 설정하여 일정한 특정값을 만족하는 경우에는 제안된 방식의 일부분만으로 특정값을 만족하는 데이터 시퀀스를 선택하여 전송할 수 있고, 그렇지 못한 경우는 성능 향상을 위해 남은 부분을 수행하여 가장 적은 PAPR을 갖는 데이터 시퀀스를 선택하여 전송하는 방식이다.

OFDM 시스템에서 SPW(Sub-Block Phase Weighting) 기법을 이용한 개선된 PAPR 저감 기법 (An Improved PAPR Reduction Using Sub-block Phase Weighting (SPW) Method in OFDM Communication System)

  • 김선애;강영철;서재원;유흥균
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제16권11호
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    • pp.1123-1130
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    • 2005
  • 본 논문에서는 PAPR 저감 기법인 SPW(Sub-block Phase Weighting) 기법에서 PAPR(Peak-to-Average Power Ratio)이 저감되도록 조절한 부가 정보를 처리하는 방법을 제안한다. SPW기법은 입력 데이터를 여러 개의 서브블록으로 나누고 위상 회전 벡터를 곱해주는 것으로 피크 전력을 줄여준다. SPW 기법은 부반송파 수와 변조방식, 서브 블록의 수가 PTS 기법과 같을 때 서로 유사한 점을 지니고 있지만, 오직 한 개의 IFFT(Inverse Fast Fourier Transform)를 사용한다는 점에서 기존의 PTS(Partial Transmit Sequence)나 SLM(Selected Mapping) 기법과는 다르다. SPW기법은 비록 PAPR을 효율적으로 줄일 수 있지만 계산 복잡도 문제는 여전히 존재한다. 본 논문에서는 위상 조절을 위 한 방법으로서 flipping 알고리즘과 full iteration 알고리즘을 사용하였다. 컴퓨터 시뮬레이션을 통하여 제안 방식의 특성을 분석하고 성능을 검토하였다.

유전자 알고리즘을 적용한 PTS에 의한 새로운 OFDM 시스템 PAR 감소 기법 (A New PAR Reduction Scheme in OFDM Systems by PTS Using Genetic Algorithm)

  • 김성수;김명제
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제16권10호
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    • pp.995-1002
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    • 2005
  • Orthogonal frequency division multiplexing(OFDM) 시스템은 peak-to-average power ratio(PAR) 문제를 가진다. 일반적으로, partial transmit sequence(PTS) 기법을 이용하여 최적의 PAR 감소 성능을 얻기 위해서는 나눈 부블록의 수와 위상 요소(phase factor)에 관한 모든 탐색을 해야 한다 나눈 부블록 수와 위상 요소 수가 많을수록 PAR 감소 성능은 더 개선되지만, 계산량 또한 부블록 수에 따라 지수적으로 증가하여 송신기의 복잡도와 처리시간지연을 초래한다. 따라서 전송되는 신호의 PAR을 최적에 가깝게 줄이면서 동시에 계산량도 함께 줄일 수 있는 기법이 요구된다. 본 논문에서는 PTS 기법에서 최적의 PAR 감소 성능을 갖는 위상 요소를 찾기 위해 최적화 문제에 많이 사용되고 있는 유전자 알고리즘(Genetic Algerian: GA)을 이용함으로써 PAR 문제를 해결하고, 동시에 계산량도 함께 감소시켜 송신기의 복잡도와 처리시간 지연을 줄이는 기법을 제안하며, 제안된 기법의 PAR 감소 성능과 계산량을 기존의 제안된 방법들과 비교하였다. 또한, 본 논문에서 제안한 기법이 적은 계산량으로도 일반기법에 더 가까운 PAR 감소 성능을 가짐을 보였다.

Cloning and Expression of the Gene Encoding Glucose Permease of the Phosphotransferase System from Brevibacterium flavum in Escherichia coli

  • Kwon, Il;Lee, Kyu-Nam;Lee, Jung-Kee;Pan, Jae-Gu;Oh, Tae-Kwang;Lee, Hyung-Hoan;Yoon, Ki-Hong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제5권4호
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    • pp.188-193
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    • 1995
  • A Brevibacterium flavum gene coding for glucose permease of the phosphoenolpyruvate-dependent phosphotransferase system (PTS) was cloned by complementing the Escherichia coli ZSCl13 mutations affecting a ptsG gene with the B. flavum genomic library. From the E. coli clone grown as red colony on a MacConkey plate supplemented with glucose as an additional carbon source, a recombinant plasmid was isolated and named pBFT93. The plasmid pBFT93 was identified as carrying a 3.6-kb fragment of B. flavum chromosomal DNA which enables the E. coli transformant to use glucose or man nose as a sole carbon source in an M9 minimal medium. The non-metabolizable sugar analogues, 2-deoxy-D-glucose (2-DG) and methyl-$\alpha$-D-glucopyranoside (MeGlc) affected the growth of ZSCl13 cells carrying the plasmid pBFT93 on minimal medium supplemented with non-PTS carbohydrate, glycerol, as a sole cabon source, while the analogues did not repress the growth of ZSCl13 cells without pBFT93. It was also found that both $2-deoxy-D-[U-^{14}C]glucose{\;}and{\;}methyl-{\alpha}-D-[U-^{14}C]glucopyranoside$ could be effectively transported into ZSCl13 cells transformed with plasmid pBFT93. Several in vivo complementation studies suggested that the B. flavum DNA in pBFT93 encodes a glucose permease specific for glucose and mannose.

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트리거를 이용한 비동기 데이터의 동기화 처리 알고리즘 연구 (A synchronized processing algorithm of asynchronous data with trigger)

  • 박성진;유지상
    • 한국통신학회논문지
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    • 제28권12A호
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    • pp.1002-1008
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    • 2003
  • 지상파 데이터 방송은 실제 구현이나 설계의 관점에서는 많은 분야가 시작 단계에 불과하다고 볼 수 있고, 그나마 연구되어온 것은 비동기 데이터에 대한 서비스위주로 기술이 개발되어왔다. 본 논문에서는 지상파 데이터 단말에서 좀 더 다양한 데이터 방송 서비스 컨텐츠의 처리가 가능하도록 하기 위하여 트리거 정보를 이용한 비동기 데이터의 동기화 처리알고리즘을 제안하고 있다. 트리거 데이터가 DSM-CC section에 캡슐화 되어, MPEG-2 TS를 통해 수신되면, PC형 셉톱박스를 통해 데이터가 분리된다. 분리된 비동기 데이터와 트리거 데이터는 제안된 알고리즘을 통해 저장되고, STC(system time clock)와 PTS(presentation time stamp)가 일치할 때, 이미 수신되어 저장된 비동기 데이터를 DAU(data access unit) 단위로 화면에 오버레이 하여 재생하여 준다. 본 알고리즘을 검증하기 위해 컨텐츠는 XML(extensible markup language)로 저작되었으며, DA(declarative application) 브라우저를 이용하였다.