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저온성균 Sporosarcina psychrophilia로부터 Aspartate Transcarbamylase 유전자의 클로닝 및 염기서열 분석 (Molecular Cloning and Nucleotide Sequence Analysis of pyrB Gene Encoding Aspartate Transcarbamylase from Psychrophilic Sporosarcina psychrophilia)

  • 성혜리;안원근;김사열
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.312-319
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    • 2002
  • 저온성 균인 Sporosarcina psychrophilia의 염색체 DNA를 추출하여 Sau3AI으로 부분 절단하고 pUC19 vector에 ligation 시킨 후, Escherichia coli pyrB mutant 균주에 형질전환하여 uracil이 없는 AB배지에서 생존하는 균주를 선택한 후, 그 plasmid를 분리하여 pSMI과 pSM2라고 명명하였다. 두 plasmid의 염기배열을 결정한 결과 pSM2 insert DNA는 pSMl insert DNA 부분을 포함하는 2,606 nucleotide 단편이었다. 염기서열을 분석하였을 때 이것은 1개의 완전한 open reading frame(ORF)과 2개의 부분 ORFs를 포함하고 있었다. 두 번째 위치한 완전한 ORF는 Bacillus caldolyticus aspartate transcarbamylase(pyrB)와 아미노산 서열 수준에서 59% 상동성을 보였고, 첫 번째와 세 번째 위치한 부분적 ORFs는 각각 Bacillus속의 uracil permease(pyrP)와 dihydoorotase(pyrC)와 높은 상동성을 보였다. 그리고 pyrB와 pyrP사이에 intergenic 부분에는 잠재적인 terminator, antiterminator, anti-antiterminator 구조를 포함하고 있었다. 이러한 결과는 S. psychrophilia pyrimidine 생합성에 관련된 유전자들은 다른 Bacillus속에서 알려진 바와 같이 유전자군을 형성하고 있을 것으로 추정했다. S. psychrophilia pyrB 유전자의 생성물을 과다발현 시키고 정제해서 그 단백질을 SDS-PAGE로 확인한 결과 27 kDa 부근에서 band를 확인할 수 있었으며, 정제한 단백질도 ATCase 효소활성을 지니고 있었다.

PU.1 유전자(cDNA)의 인위적 변이체 클로닝 (Molecular Cloning of Mutant cDNA of PU.1 Gene)

  • 류종석;유시현
    • KSBB Journal
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    • 제10권5호
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    • pp.499-509
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    • 1995
  • PU.1은 6개의 특이적인 purine-rich 염기서열 (5' -GAGGAA-3 )로 구성된 PU box에 결합하는 transcription activator이다. 이 PUol은 macro phage와 B-cell에서만 발현되어 이들 세포를 활성 화시키므로, 포유통물의 연역계를 연구하는 데 중요 한 위치를 차지하고 있다. Full length PUol cDNA 는 open reading frame 816개의 DNA 염기로 구성 되어 있으므로, 아미노산 2727~의 합성을 지령한다. PUol의 활성화는 이를 구성하고 있는 polypeptide 중 세린 잔기가 인산화되어 전사인자로서 작용한다 고 추측된다. PU.1은 22개의 세린을 함유하고 있으 며, 정확한 인산화 위치 빛 수량은 알 수 없으나, casein kinase II 에 의하여 인산화된다고 추측되는 제41,45,132'133,148번째 아미노산 세린들이 제1 차 target sites이다. 본 연구에서는 이상의 제41, 45, 132,133, 148번 아미노산 세린 codon(AGC, AGC, AGC.TCA, TCT)이 알라닌 codon(GCC, GCC, GCC.GCA, G GCT)으로 치환된 4가지의 점돌연변이체 클론 (pKKS41A, pRKS45A, pMKS132$.$133A, pMKS­1 148A)을 다음과 같이 제조하였다. Wild type PUol cDNA(template)를 해당되는 mutant DNA primers로 증폭(PCRjSOE)하여 mutant cDNA 단편을 얻었다. 이를 Hind III와 Xba I 으로 절단된 pBlu­e escript KS +에 접합시킨 후, 대장균(E. coli XLI ~ Blue)에 형질전환시켰다. 이 점돌연변이체들은 인산화 부위 및 수량은 물론 PU.1의 구조 및 기능 (Structure and Function) 연구에 기여할 것이다.

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영상 재구성 방법에 따른 Bone SPECT 영상의 질과 검사시간에 대한 실효성 비교 (Comparison of Effectiveness about Image Quality and Scan Time According to Reconstruction Method in Bone SPECT)

  • 김우현;정우영;이주영;류재광
    • 핵의학기술
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    • 제13권1호
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    • pp.9-14
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    • 2009
  • 최근 영상 처리 기법의 발전으로 영상의 질은 저하시키지 않고 검사 소요시간을 단축시키는 방법들이 개발되고 있다. 특히 단층 촬영의 경우 영상 재구성 방법을 개선하여 영상의 질이 우수한 영상을 획득할 수 있게 되었다. Philips사의 PRECEDENCE 16 감마카메라를 이용해 보편적으로 시행하고 있는 분석법에 의한 FBP 방법과 반복법에 의한 Astonish, 3D OSEM 방법을 이용해 각각 영상을 재구성하여 정성적인 분석과 정량적인 분석을 통해 영상 획득시간을 다르게 한 영상간의 비교와, 동일한 시간으로 획득한 영상을 비교하여 영상의 질이 우수한 재구성 방법에 대해 연구 하였다. 정성적인 분석을 위해 blind test를 한 결과, 영상 획득시간에 따른 영상의 질은 거의 차이가 없는 것을 확인할 수 있었다. 또한 정량적인 분석을 통해서도 영상 획득시간에 따른 영상의 질은 통계적으로 유의한 차이가 없었다. 하지만 영상 획득시간이 동일한 영상을 재구성 방법에 따라 분석한 결과는 통계적으로 유의한 차이가 있음을 확인할 수 있었다. 영상의 질은 반복법을 이용하는 Astonish에 의해 재구성된 영상이 해상력이 좋고 임상적으로 진단적 정보를 제공하는데 우수한 영상으로 판단된다. 영상을 재구성하기 위한 소요시간이 길고 저장 공간의 부족 등으로 현재까지 많이 사용되지 않던 반복법에 의한 재구성 방법이 영상의 질은 향상시키고 검사시간은 단축 할 수 있는 방법이 될 수 있음을 확인하였다.

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P-Δ 효과를 고려한 기둥항복형 강구조 골조의 안정성 (Stability of Steel Frames with Weak Column-Strong Beam Considering P-Δ effect)

  • 김희동;이명재
    • 한국강구조학회 논문집
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    • 제15권4호통권65호
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    • pp.457-466
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    • 2003
  • 본 연구의 목적은 실험적 방법을 통하여 P-${\Delta}$ 효과를 고려한 기둥항복형 강구조 골조의 안정성을 고찰하는데 있다. 이를 위하여 3개의 1층 1스팬 기둥항복형 강구조 비가새 골조에 대한 가력실험을 실시하였다. 실험의 변수로는 기둥의 강성과 축력비를 적용하였다. 실험결과 기둥의 강성 감소는 P-${\Delta}$효과를 증가시켜 골조의 안정성에 큰 영향을 미치는 것으로 나타났으며, 특히 보항복형 골조와 비교하여 최대내력 도달 이후의 내력자하 현상이 다소 급격하게 나타났다. 이것은 기둥의 강성이 낮은 기둥항복형 골조의 경우 P-${\Delta}$효과의 영향이 골조의 안정성에 미치는 영향이 증가되어 나타난 현상으로 사료된다.

건물 복도에서의 밀도와 이동속도 측정 (Measurement of the Movement Speed and Density of People on a Building Corridor)

  • 김운형;이규홍;김종훈
    • 한국화재소방학회논문지
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    • 제31권1호
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    • pp.36-41
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    • 2017
  • 단일 복도에서의 단방향 피난 이동 실험의 수행 결과, 평균 밀도 $2.36P/m^2$에서 0.55 m/s의 속도를 보이고 있다. S.F.P.E. Handbook에서 제시된 복도에서의 밀도기반 속도 수식 계산결과와 평균값을 비교할 때, 본 실험이 0.55 m/s, SFPE 수식이 0.53 m/s로서 0.02 m/s의 차이를 보였으며 데이터 별로 분석한 결과, 최대 0.38 m/s의 큰 차이를 나타내고 있다. 일부 실험결과는 보행속도의 증가에 따라 밀도가 높아짐을 보였으며 실험 결과분석은 전체 실험시간에 대한 평균 데이터를 사용하였다. 동영상에 대한 프레임단위 분석과 같은 세부적인 시간분석을 수행한다면 더욱 신뢰성 있는 데이터를 확보할 수 있을 것으로 보인다.

통합 전력품질 제어기의 과전류 보호방법에 관한 연구 (A Study on Over Current Protection Method of Unified Power Quality Conditioners)

  • 이우철;김한정
    • 조명전기설비학회논문지
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    • 제16권5호
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    • pp.22-28
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    • 2002
  • 본 논문에서는 직렬형, 병렬형 능동전력필터로 구성되어 있는 통합전력품질 제어기(UPQC)의 과전류에 대한 보호기법이 제시되며, 해석된다. 제안된 과전류 보호기법은 직렬형 능동전력필터에 과전류의 기본파 성분에 대해서고 임피던스를 갖는 기능을 부여함으로써 구현하였으며, 세 가지 방법을 제시하였다. 첫 번째 방법은 p-q이론을 이용하여 기본파 전원전류를 검출하여 보호하는 방법, 두 번째 방법은 동기 좌표계에서 부하전류의 기본파 성분을 검출하여 보호하는 방법, 세 번째 방법은 입력전압을 검출하여 보호하는 방법이다. 전원계통에서 과전류가 흘렀을 경우 제안된 방법들은 UPQC에 부가적인 회로 없이 보호해 줄 수 있다. 제안된 방법의 타당성은 시뮬레이션 결과를 통하여 입증된다.

이용자 기반의 비디오 키프레임 자동 추출을 위한 뇌파측정기술(EEG) 적용 (Toward a Key-frame Extraction Framework for Video Storyboard Surrogates Based on Users' EEG Signals)

  • 김현희;김용호
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.443-464
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    • 2015
  • 본 연구는 뇌파측정기술(EEG)과 사건관련유발전위 P3b를 활용하여 이용자의 인지적 반응을 측정한 후 비디오 키프레임을 자동으로 추출할 수 있는지의 가능성을 조사해 보았다. 20명의 피험자들을 대상으로 뇌파를 측정하고 분석한 결과, 적합 이미지 자극 시 좌측 두정엽 영역이 우측 두정엽 영역보다 더 활성화되며, 좌우측간 두정엽 영역의 활성화 정도가 유의한 차이를 보였다. 비적합 이미지 자극 시에는 좌측 두정엽 영역이 적합 이미지보다 덜 활성화되고, 두정엽 영역의 좌우간 활성화도 유의한 차이가 없는 것으로 나타났다. 이외에, 모든 채널의 평균값(MGFP1)의 잠재기, 채널 동시성 패턴 등에서도 두 자극간에 차이를 보여 뇌파측정기술에 기반한 키프레임 자동 추출이 가능한 것으로 확인되었다.

연어류 근육의 종류, 수입국 및 부위별 식품학적 품질 특성 비교 (Comparison on the Food Quality Characteristics of Muscles from Salmonids according to Species, Imported Country, and Separated Part)

  • 허민수;최병대;김기현;강상인;김용중;김진수
    • 한국수산과학회지
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    • 제48권1호
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    • pp.16-25
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    • 2015
  • This study compared the food quality of salmonid fishes according to the species, country of origin, and separated part, such as fillet and frame. The proximate composition of chum salmon from Norway (CS-N) was 74.4% moisture, 19.5% crude protein, 4.2% crude lipid, and 1.2% ash. These values were within roughly 1% for the other salmon species. There was no significant difference (at P<0.05) in the Hunter a value of salmon muscle according to sepatated parts. However, there was a significant difference (P<0.05) in Hunter a value of salmon muscle according to the species and country of origin. There were significant differences in odor intensity and hardness of the salmon according to the species. The major free amino acid in all of the salmon muscles was anserine, which ranged from 61.3 to 73.0%. The taste value was the highest for salmon imported from Alaska (CS-A), followed by pink salmon, CS-N, and muscle separated from the frame (AS-C). In the taste value of all salmon muscles, the major amino acid was glutamic acid. The total amino acid content of salmon muscles ranged from 18.36 to 19.64 g/100 g, and the major amino acids were glutamic acid and aspartic acid. There were differences in the mineral contents, including Ca, P, K, and Fe, and fatty acid composition of salmon muscle according to species.

Sphingomonas chungbukensis DJ77 균주에서 2- hydroxychromene-2-carboxylate isomerase를 암호화하는 phnS 유전자의 염기서열과 상동성 분석 (Sequence and phylogenetic analysis of the phnS gene encoding 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase in Sphingomonas chungbukensis DJ77)

  • 엄현주;강민희;김영필;김성재;김영창
    • 미생물학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.123-127
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    • 2003
  • Sphingomonas chungbuken교 DJ77은 phenanthrene을 단일 탄소원과 에너지원으로 이용하여 살아갈 수 있다. pUPXS는 phenanthrene과 naphthalene분해를 위해 필요한 2-hydroxychromene-2-carboxylate (HCCA) isomerase를 암호화하는phnS유전자를 포함한다. 본 논문에서는 phnS유전자가 포함된 3271 bp의 염기 서열을 결정하였다. 이 유전자는 ATG를 개시코돈으로 사용하며, TAA를 종결 코돈으로 사용하고 있다. 또한 개시 코돈의 5 bp앞쪽으로 GGAA라는 ribosomal binding site를 갖는다. phnS는 총 594 bP의 open reading frame을 포함하며,158개의 아미노산으로 구성되었다. phns를 구성하는 아미노산서열은 S. aromaticivorans F199의 유사서열과 87%의 유사성을 나타냈다. phns 유전자는 biphenyl dioxygenase를 구성하는 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase를 암호화하는 phnQ와 ferredoxin를 암호화 하는 phnR과 같은 operon을 이루며, 이들 유전자의 downstream에 위치하고 있다.

Molecular Cloning of the Antiapoptotic Gene, p35, from Bombyx mori Nuclear Polyhedrosis Virus K1

  • Lee, Kwang Sik;Park, Hye Jin;Kim, Seong Ryul;Lee, Sang Mong;Sohn, Hung Dae;Jin, Byung Rae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제3권1호
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    • pp.25-29
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    • 2001
  • We have cloned and characterized an antiapoptotic gene, p35, which blocks apoptosis, from Bombyx mori nuclear polyhedrosis virus (BmNPV) K1 strain. The 897 bp p35 has an open reading frame of 299 amino acids. The BmNPV-K1 p35 showed a high identity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus and BmNPV T3 strain. The BmNPV-K1 p35 was different from the amino acid sequences of BmNPV T3 at 6 positions. The p35 gene of BmNPV-K1 was 99.2% identical at the nucleotide level and 98% identical at the amino acid level to BmNPV T3. The location of p35 gene in the BmNPV-K1 genome was confirmed by Southern blot analysis and its expression patterns at the transcriptional level in the infected cells were con- firmed by Northern hybridization analysis.

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