Long interspersed element-1 (LINE-1 or L1) is an autonomous retrotransposon, which is capable of inserting into a new region of genome. Previous studies have reported that these elements lead to genomic variations and altered functions by affecting gene expression and genetic networks. Mounting evidence strongly indicates that genetic diseases or various cancers can occur as a result of retrotransposition events that involve L1s. Therefore, the development of methodologies to study the structural variations and interpersonal insertion polymorphisms by L1 element-associated changes in an individual genome is invaluable. In this study, we applied a systematic approach to identify human-specific L1s (i.e., L1Hs) through the bioinformatics analysis of high-throughput next-generation sequencing data. We identified 525 candidates that could be inferred to carry non-reference L1Hs in a Korean individual genome (KPGP9). Among them, we randomly selected 40 candidates and validated that approximately 92.5% of non-reference L1Hs were inserted into a KPGP9 genome. In addition, unlike conventional methods, our relatively simple and expedited approach was highly reproducible in confirming the L1 insertions. Taken together, our findings strongly support that the identification of non-reference L1Hs by our novel target enrichment method demonstrates its future application to genomic variation studies on the risk of cancer and genetic disorders.
Sung, Chi Rim;Kim, Kyu-Bong;Lee, Joo Young;Lee, Byung-Mu;Kwack, Seung Jun
Toxicological Research
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v.35
no.2
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pp.131-136
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2019
Ethylhexyl dimethyl para-aminobenzoic acid (PABA) is an oily yellow liquid derivative of water-soluble PABA commonly used in sunscreen. Ethylhexyl dimethyl PABA is widely used as an ingredient in many cosmetics at an average concentration of 1.25% (0.5-2.0%) in Korea. Previous studies, including those involving animals, have demonstrated that ethylhexyl dimethyl PABA is toxic to the following four organs: testis, epididymis, spleen, and liver. In addition, experiments using human keratinocytes found that ethylhexyl dimethyl PABA inhibits cell growth and DNA synthesis at low concentrations, and halted the cell cycle of MM96L cells (human melanoma cell line) at the G1 phase. Despite limited clinical data in humans, many studies have confirmed increased mutagenicity of ethylhexyl dimethyl PABA following exposure to sunlight, which suggests that this molecule is likely to contribute to onset of sun-induced cancer despite protecting the skin through absorption of UVB. For risk assessment, the no observed adverse effect level (NOAEL) chosen was 100 mg/kg bw/day in a 4 weeks oral toxicity study. Systemic exposure dosage (SED) was 0.588 mg/kg bw/day for maximum use of ethylhexyl dimethyl PABA in cosmetics. Based on the risk assessment and exposure scenarios conducted in this study, the margin of safety (MOS) was calculated to be 180.18 for a sunscreen containing 8% ethylhexyl dimethyl PABA, which is the maximum level allowed by the relevant domestic authorities.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.32
no.4
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pp.261-270
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2018
The aim of this study was to evaluate the antitumor activities of Typhae pollen (TP) by confirming in vitro cytotoxicity and in vivo anti-tumor and immune-modulatory effect with anti-cachexia effect. The MTT assay is used in HepG2 cell to detect potential cytotoxic activities of aqueous extract of Typhae pollen (TPe). After HepG2 tumor cell implantation, eight mice per groups were assigned to six groups. Three different dosages of TPe (500, 250 and 125 mg/kg) were orally administered in the amount of $10m{\ell}/kg$ and sorafenib also administered 20mg/kg, every day for 35 days from 28 days after the tumor cell implantation. We observed the changes on body weights, tumor volume and weights, lymphatic organ, serum interferon $(IFN)-{\gamma}$ levels, splenocytes and peritoneal NK cell activity, splenic tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$, interleukin $(IL)-1{\beta}$, IL-10 contents. Periovarian fat weights, serum IL-6 levels, thicknesses of deposited periovarian adipose tissue and mean diameters were also detected to monitor the tumor-related anticachexic effects. In tumor masses, the immunoreactivities of cleaved caspase-3 and cleaved poly (ADP-ribose) polymerase (cleaved PARP) - apoptotic marks, cyclooxygenase-2 (COX-2), inducible nitric oxide synthases (iNOS) and tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$ were additionally observed by immunohistochemistry. The results were compared with sorafenib. Decreases of COX-2 were demonstrated in sorafenib and TPe treated mice and also increases of iNOS in tumor masses were observed in TPe, not in sorafenib. TPe increased periovarian fat pad weights compared with tumor-bearing controls and sorafenib treated mice. TPe showed increases of splenic $TNF-{\alpha}$, IL-10 and $IL-1{\beta}$, serum $IFN-{\gamma}$ and NK cell activities corresponding to increases of spleen weights, lymph node weights and non-atrophic changes of lymph nodes. Our results show oral treatment of TPe 500, 250 and 125 mg/kg has potent in vitro and in vivo antitumor activities through modest cytotoxic effects, immunomodulatory effects and apoptotic activities in HepG2 tumor cells. In addition, TPe can prevent cancer related cachexia.
Melanoma-associated antigen (MAGE) family genes have been considered as potentially promising targets for anticancer immunotherapy. MAGED4 was originally identified as a glioma-specific antigen. Current knowledge about MAGED4 expression in glioma is only based on mRNA analysis and MAGED4 protein expression has not been elucidated. In the present study, we investigated this point and found that MAGED4 mRNA and protein were absent or very lowly expressed in various normal tissues and glioma cell line SHG44, but overexpressed in glioma cell lines A172,U251,U87-MG as well as glioma tissues, with significant heterogeneity. Furthermore, MAGED4 protein expression was positively correlated with the glioma type and grade. We also found that the expression of MAGED4 inversely correlated with the overall methylation status of the MAGED4 promoter CpG island. Furthermore, when SHG44 and A172 with higher methylation were treated with the DNA demethylating agent 5-aza-2'-deoxycytidine (5-AZA-CdR) reactivation of MAGED4 mRNA was mediated by significant demethylation in SHG44 instead of A172. However, 5-AZA-CdR treatment had no effect on MAGED4 protein in both SHG44 and A172 cells. In conclusion, MAGED4 is frequently and highly expressed in glioma and is partly regulated by DNA methylation. The results suggest that MAGED4 might be a promising target for glioma immunotherapy combined with 5-AZA-CdR to enhance its expression and eliminate intratumor heterogeneity.
Park, Jeong-Min;Lee, Sung-Hyun;Kim, Jung-Ok;Park, Hong-Ju;Park, Jae-Bok;Sin, Jeong-Im
Korean Journal of Food Science and Technology
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v.36
no.1
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pp.141-146
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2004
Fungal products indirectly mediate anti-tumor effects in vitro and in vivo. To investigate whether Lentinus edodes might possess direct anti-tumor substance, L. edodes was extracted and tested on human papillomavirus (HPV) 16 oncogenes-associated animal tumor cells (TC-1) and in an animal tumor model. Only water extract displayed direct anti-proliferative effects in TC-1 tumor cells in vitro. This inhibition was dose-dependent, and inhibitory concentration ($IC_{50}$) was $800\;{\mu}g/mL$. Fungal extracts also showed growth inhibition to human cervical cancer cells (CaSki and HeLa) similarly to TC-1 tumor cells. When fungal extracts were added at a high dose (1.5 mg/mL), cell growth was inhibited within 6 hr following extract treatment. Cell growth inhibition was blocked by heat treatment, but not by low pH, which is indicative of heat sensitivity of this anti-proliferative substance. Cell growth suppression was mediated by apoptosis, as determined by Annexin V and propidium iodide staining. When challenged with TC-1 cells, direct intratumoral injection of fungal extracts resulted in some positive effect on tumor growth inhibition, as compared to oral delivery. Results suggest that heat labile substance of L. edodes suppresses growth of HPV oncogenes-associated tumor cells through apoptosis.
The objective of this study is to investigate the effect of multivitamin on macrophage activity in Raw 264.7 cell and repeated oral dose toxicity in Sprague-Dawely rat of multivitamin. Raw 264.7 cells were treated with 50 and $100{\mu}g/mL$ multivitamin for 24 h. To measure the activity of macrophages, NO and TNF-${\alpha}$ assays were performed in Raw 264.7 cells. Treatment with 50 and $100{\mu}g/mL$ multivitamin for 24 h significantly increased production of NO and TNF-${\alpha}$ compared with control groups, indicating activation of macrophages. The female rats were treated with multivitamin of control group, low group (0.24 g/kg), medium group (1 g/kg) and high group (2 g/kg) intragastrically for 4 weeks, respectively. We examined the body weight, the feed intake, the clinical signs and serum biochemical analysis. We also observed the histopathological changes of liver, ovary, brain, adrenal gland, spleen, kidney, heart and lung in rats. No significant differences in body weights, feed intake, biochemical analysis and histopathological observations between control and multivitamin treatment group were found. In conclusion, multivitamin is physiologically safe and improve macrophage activity.
Park, Jung-Won;Chun, Ji-Eun;Yang, Dong-Kun;Bak, Eun-Jung;Kim, Han;Lee, Myeong-Heon;Hwang, Eui-Kyung;Lee, Chung-Bok;Woo, Gye-Hyeong
Korean Journal of Veterinary Research
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v.52
no.2
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pp.125-131
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2012
Rabbit hemorrhagic disease is a highly acute and fatal viral disease caused by rabbit hemorrhagic disease virus (RHDV). Since first outbreak in Korea 1987, RHDV has been continually affected in the country, but the pattern of outbreak seem to be changed. In this study, to understand the pathogenesis of the new RHDVa serotype, we therefore carried out to inoculate RHDVa to rabbits, and to examine the sequential histopathologic changes and viral distribution. Macroscopically, various sized dark red or white spots or appearance were observed in the liver, lung, kidney uterus and ureter. In euhanized rabbits, significant pathologic findings such as infiltration of heterophils and mononuclear cells were observed at 24 hours after inoculation (HAI), and these were sequentially extended periportal to centrilobular area. However, in dead rabbits, severe hepatic degeneration and/or necrosis with relatively weak inflammatory responses were observed. RHDV antigens began to detect in liver, spleen, and lung from 12 HAI by PCR. Immunohistochemically, RHDV positive cells were seen in only liver from 24 HAI, and the degree of immunogen reactivity was stronger in dead rabbits than in euthanized ones. In conclusion, RHDVa caused the subacute or chronic infection accompanying low mortality and moderate to severe inflammatory reaction in rabbits, suggesting the possibility that RHD could become endemic.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.21
no.4
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pp.856-859
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2007
We have investigated the antimetastatic and antitumor effects of Ginsenoside Rh2 and ${\beta}-glucan$ unsing an experimental metastatic mouse model intravenously injected with B 16 melanoma F 10 cells. Animal groups are divided into six groups according to the dosage of drug administration and the kind of drugs. The groups are control, ${\beta}-glucan$ with 50, 100 and 200 mg/kg, Geinsenoside Rh2 50 mg/kg, and ${\beta}-glucan$ 50 mg/kg + Ginsenoside Rh2 50 mg/kg. Oral administration of various concentration of ${\beta}-glucan$( 50, 100, and 200 mg/kg) were reduced the lung- metastatics induced by metastatic B16 melanoma F 10 cells injection with a dose dependent manner in the syngenic mice. At same dosage group, Ginsenoside Rh2 (50 mg/kg) has more antimetastatic effect than the ${\beta}-glucan$(50 mg/kg). The highest antimetastatic effects was observed in the ${\beta}-glucan$ 50 mg/kg + Ginsenoside Rh2 50 mg/kg group and has a similar tendency in the anti-tumor effects, including decrease of the average tumor weight and increase of the average survival rate. There are no differences of the average tumor weights were apparent in the ${\beta}-glucan$ groups, however there were little decrease of the average tumor weight in Ginsenoside 50 mg/kg group and ${\beta}-glucan$ 50 mg/kg + Ginsenoside Rh2 50 mg/kg group than that of the control group. The rate of average survival rate in the ${\beta}-glucan$ 50 mg/kg + Ginsenoside Rh2 50 mg/kg group, ${\beta}-glucan$ 200 mg/kg, ${\beta}-glucan$ 100 mg/kg and ${\beta}-glucan$ 50 mg/kg, and Ginsenoside 50 mg/kg groups were highly in order. These data suggest that antimetastatic and antitumor effect of combination of Ginsenodide Rh2 and ${\beta}-glucan$ be the highest in this study.
The purpose of this study was to evaluate the viability of periodontal ligament cells in rat teeth using slow cryo-preservation method under pressure by means of MTT assay and WST-1 assay. Eighteen teeth of Sprague-Dawley white female rats of 4 week-old were used for each group. Both sides of the first and second maxillary molars were extracted as atraumatically as possible under Tiletamine anesthesia. The experimental groups were group 1 (Immediate control), group 2 (Cold preservation at $4^{\circ}C$for 1 week), group 3 (Slow freezing), group 4 (Slow freezing under pressure of 3 MPa). F-medium and 10% DMSO were used as preservation medium and cryo-protectant. For cryo-preservation groups, thawing was performed in $37^{\circ}C$water bath, then MTT assay and WST-1 assay were processed. One way ANOVA and Tukey method were performed at the 95% level of confidence. The values of optical density obtained by MTT assay and WST-1 were divided by the values of eosin staining for tissue volume standardization. In both MTT and WST-1 assay, group 4 showed significantly higher viability of periodontal ligament cells than group 2 and 3 (p < 0.05), but showed lower viability than immediate control group. By the results of this study, slow cryo-preservation method under pressure suggests the possibility for long term cryo-preservation of the teeth.
Halitosis is a generally accepted marker of diseases in the oral cavity and of systemic and gastrointestinal disorders. Based on these authors' previous findings (that (1) there is a close association between H. pylori infection and halitosis; (2) Korea red ginseng may suppress the colonization of H. pylori, fight H. pylori-induced cytotoxicity, and impose significant anti-inflammatory actions in patients with chronic gastritis; and (3) H. pylori infection is linked with the generation of significant levels of volatile sulfur compounds (VSCs), and the levels of VSCs correlate significantly with H. pylori-associated mucosal damages), in the current study, the authors documented the molecular mechanisms of Korea red ginseng's efficacy in ameliorating halitosis. When the RAW 264.7 cells were treated with the $H_2S$ releasing compound NaHS, the mRNA expression of cystathionine ${\gamma}$-lyase (CSE), IL-6, COX-2, and iNOS were more significantly induced compared with the vehicle-treated group. The cytoskeletal components of ezrin's and moesin's mRNA expressions were elevated by NaHS treatment accompanied by the activation of MAPK, p38, and ERK. Korea red ginseng pretreatment reduced both the NaHS-induced CSE expression and the proinflammatory genes (e.g., IL-6, COX-2, and iNOS) in a concentration-dependent manner. The ERM expression and the phosphorylation of p38 were also significantly reduced by Korea-red-ginseng pretreatment. Overall, Korea red ginseng pretreatment imposed significant anti-inflammatory effects through the downregulation of the NaHS-triggered proinflammatory gene expression, CSE, and ERM mRNA expression. Korea red ginseng could thus be said to be a key remedy of halitosis and to be effective in relieving gastric inflammation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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