• Genes and Genomics
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• 제40권12호
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• pp.1351-1361
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• 2018

A new cold tolerant germplasm resource named glutinous rice 89-1 (Gr89-1, Oryza sativa L.) can overwinter using axillary buds, with these buds being ratooned the following year. The overwintering seedling rate (OSR) is an important factor for evaluating cold tolerance. Many quantitative trait loci (QTLs) controlling cold tolerance at different growth stages in rice have been identified, with some of these QTLs being successfully cloned. However, no QTLs conferring to the OSR trait have been located in the perennial O. sativa L. To identify QTLs associated with OSR and to evaluate cold tolerance. 286 $F_{12}$ recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross between the cold tolerant variety Gr89-1 and cold sensitive variety Shuhui527 (SH527) were used. A total of 198 polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers that were distributed uniformly on 12 chromosomes were used to construct the linkage map. The gene ontology (GO) annotation of the major QTL was performed through the rice genome annotation project system. Three main-effect QTLs (qOSR2, qOSR3, and qOSR8) were detected and mapped on chromosomes 2, 3, and 8, respectively. These QTLs were located in the interval of RM14208 (35,160,202 base pairs (bp))-RM208 (35,520,147 bp), RM218 (8,375,236 bp)-RM232 (9,755,778 bp), and RM5891 (24,626,930 bp)-RM23608 (25,355,519 bp), and explained 19.6%, 9.3%, and 11.8% of the phenotypic variations, respectively. The qOSR2 QTL displayed the largest effect, with a logarithm of odds score (LOD) of 5.5. A total of 47 candidate genes on the qOSR2 locus were associated with 219 GO terms. Among these candidate genes, 11 were related to cell membrane, 7 were associated with cold stress, and 3 were involved in response to stress and biotic stimulus. OsPIP1;3 was the only one candidate gene related to stress, biotic stimulus, cold stress, and encoding a cell membrane protein. After QTL mapping, a total of three main-effect QTLs-qOSR2, qOSR3, and qOSR8-were detected on chromosomes 2, 3, and 8, respectively. Among these, qOSR2 explained the highest phenotypic variance. All the QTLs elite traits come from the cold resistance parent Gr89-1. OsPIP1;3 might be a candidate gene of qOSR2.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제19권3호
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• pp.249-255
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• 2015

Wnk kinase maintains cell volume, regulating various transporters such as sodium-chloride cotransporter, potassium-chloride cotransporter, and sodium-potassium-chloride cotransporter 1 (NKCC1) through the phosphorylation of oxidative stress responsive kinase 1 (OSR1) and STE20/SPS1-related proline/alanine-rich kinase (SPAK). However, the activating mechanism of Wnk kinase in specific tissues and specific conditions is broadly unclear. In the present study, we used a human salivary gland (HSG) cell line as a model and showed that $Ca^{2+}$ may have a role in regulating Wnk kinase in the HSG cell line. Through this study, we found that the HSG cell line expressed molecules participating in the WNK-OSR1-NKCC pathway, such as Wnk1, Wnk4, OSR1, SPAK, and NKCC1. The HSG cell line showed an intracellular $Ca^{2+}$ concentration ($[Ca^{2+}]_i$) increase in response to hypotonic stimulation, and the response was synchronized with the phosphorylation of OSR1. Interestingly, when we inhibited the hypotonically induced $[Ca^{2+}]_i$ increase with nonspecific $Ca^{2+}$ channel blockers such as 2-aminoethoxydiphenyl borate, gadolinium, and lanthanum, the phosphorylated OSR1 level was also diminished. Moreover, a cyclopiazonic acid-induced passive $[Ca^{2+}]_i$ elevation was evoked by the phosphorylation of OSR1, and the amount of phosphorylated OSR1 decreased when the cells were treated with BAPTA, a $Ca^{2+}$ chelator. Finally, through that process, NKCC1 activity also decreased to maintain the cell volume in the HSG cell line. These results indicate that $Ca^{2+}$ may regulate the WNK-OSR1 pathway and NKCC1 activity in the HSG cell line. This is the first demonstration that indicates upstream $Ca^{2+}$ regulation of the WNK-OSR1 pathway in intact cells.

• The Plant Pathology Journal
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• 제19권1호
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• pp.57-63
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• 2003

An insertion sequence identified as a solo long terminal repeat (LTR) of a new rice copia-like retrotransposon was detected in the ORE of the Pi-b gene from the rice cv. Nipponbare, and was designated as Osr1. Osr1 consists of a 6386 bp nucleotide sequence including 965 bp LTRs on both ends with an 82％ nucleotide sequence identity to the wheat Tarl retrotransposon on reverse transcriptase. Nucleotide divergence was noted among the individual LTRs, as well as the coding region of Osr1. Various restriction fragment length polymorphism (RFLP) of LTR were detected in indica cultivars, whereas, only a few could be detected in the japonica cultivars. The population of Osr1 is lower in the wild-type rice compared with that in the domesticated cultivars. The insertion of LTR sequence in the h-b gene in the susceptible cultivar suggested that retro-tyansposon-mediated insertional mutation might play an important role in the resistance breakdown, as well as in the evolution of resistance genes in rice.

• 대한전자공학회논문지TC
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• 제48권4호
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• pp.47-52
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• 2011

CFAR(constant false alarm rate)는 능동 소나 시스템에서 사용되는 자동 탐지 신호처리 알고리듬이다. CFAR 알고리듬 중에서도 OS(ordered statistics) CFAR는 CA(cell averaging), SO(smallest of), GO(greatest of)에 비해 비균일 환경에서 탐지 성능이 우수하다. 그러나 OS CFAR는 다중 표적 상황에서 일정 개수 이상의 표적이 나타나면 탐지 성능이 나빠지는 단점을 갖고 있다. 이에 본 논문에서는 다중 표적 환경에서 OS CFAR보다 좀 더 강인한 OSR(ordered statistics ratio) CFAR 알고리듬을 제안하고 컴퓨터 모의실험을 통하여 간섭 표적 개수에 따른 성능을 기존의 CFAR 기법과 비교 분석하였다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제25권5호
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• pp.449-457
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• 2021

The sleep-wake cycle is regulated by the alternating activity of sleep- and wake-promoting neurons. The dorsal raphe nucleus (DRN) secretes 5-hydroxytryptamine (5-HT, serotonin), promoting wakefulness. Melatonin secreted from the pineal gland also promotes wakefulness in rats. Our laboratory recently demonstrated that daily changes in nitric oxide (NO) production regulates a signaling pathway involving with-no-lysine kinase (WNK), Ste20-related proline alanine rich kinase (SPAK)/oxidative stress response kinase 1 (OSR1), and cation-chloride co-transporters (CCC) in rat DRN serotonergic neurons. This study was designed to investigate the effect of melatonin on NO-regulated WNK-SPAK/OSR1-CCC signaling in wake-inducing DRN neurons to elucidate the mechanism underlying melatonin's wake-promoting actions in rats. Ex vivo treatment of DRN slices with melatonin suppressed neuronal nitric oxide synthase (nNOS) expression and increased WNK4 expression without altering WNK1, 2, or 3. Melatonin increased phosphorylation of OSR1 and the expression of sodium-potassium-chloride co-transporter 1 (NKCC1), while potassium-chloride co-transporter 2 (KCC2) remained unchanged. Melatonin increased the expression of tryptophan hydroxylase 2 (TPH2, serotonin-synthesizing enzyme). The present study suggests that melatonin may promote its wakefulness by modulating NO-regulated WNK-SPAK/OSR1-KNCC1 signaling in rat DRN serotonergic neurons.

• Industrial Engineering and Management Systems
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• 제1권1호
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• pp.19-28
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• 2002

An operation sequence of parts is one of the most important production factors in the design of cellular manufacturing systems. Many similarity coefficient method (SCM) based approaches have been proposed to solve cell formation problems in the literature. However, most of them do not consider the operation sequence factor. This study presents an operation sequence ratio (OSR) and modifies some existing similarity coefficients using the OSR to solver cell formation problems considering operation sequences. The computational results show that the OSR ratio is useful and robust in solving cell formation problems with operation sequences.

• The Korean Journal of Ecology
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• 제28권5호
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• pp.237-243
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• 2005

To study entering and exiting routes of male and female Hynobius leechii to a breeding site and staying time of them within the breeding site, we monitored a breeding population located in the research forests of Kangwon National University. The breeding site was surrounded by a drift fence associated with nine pitfall traps. The breeding season of this population was about one month, from 16 March to 13 April, 2005. Breeding males arrived earlier at the breeding pond than females did. The operational sex ratio (OSR), defined as the ratio of males to females which are ready to mate, over a breeding season was female-biased as 0.67 male vs 1 female (57 males vs 87 females), but daily OSRs, OSR in a particular day, within the breeding pond were male-biased with $1.36\sim7.5$ male vs f female in six days out of seven investigated days. While breeding males stayed in the breeding pond for about 11 days, breeding females left the pond as soon as they completed oviposition. However, the females stayed at terrestrial areas near the pond for about seven days before completely leaving the breeding site. Entering and exiting routes to the breeding site were different between males and females, and between ovulated and oviposited females. Both males and females arrived earlier at the breeding site stayed longer within the site. Males stayed longer within the breeding site lost more body weight.

• 한국항행학회논문지
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• 제26권6호
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• pp.418-426
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• 2022

반송파 기반 위성항법 보강시스템은 GNSS(global navigation satellite system) 측정치 오차를 보상하는 방식에 따라 OSR(observation space representation)과 SSR(state space representation)으로 구분된다. 대표적인 OSR 기반 보강시스템인 N-RTK(network real time kinematics)는 약 100 km 수준의 서비스 영역 내에서 cm급 측위 정확도를 확보할 수 있는 시스템이지만, 일반적으로 사용자-인프라 간 양방향 통신 방식에 의해 서비스가 구현된다. 이러한 특징으로 인해 N-RTK를 활용한 위성 기반 cm급 전국토 정밀 측위 서비스 구축은 현실적으로 많은 제약이 따른다. 반면, SSR 보강시스템은 서비스 영역 내 모든 사용자에게 동일한 보정정보를 제공하기 때문에 단방향 서비스에 적합하고, 각 보정정보의 전송주기를 유동적으로 조절할 수 있으므로 위성 기반 광역 정밀 보정정보 방송 서비스에 적합하다. 이러한 장점으로 인해 위성항법시스템을 보유한 각국은 SSR 보정정보 기반의 PPP(precise point positioning)/PPP-RTK 정밀 측위 서비스 구축에 박차를 가하고 있다. 이에 본 논문에서는 위성 기반 SSR 보정정보 방송 서비스들의 구성 및 특징, 측위 성능 분석을 통해 PPP/PPP-RTK 서비스 동향과 정밀 측위 현황을 파악하고자 한다.

• 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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• 제33권6호
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• pp.631-643
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• 2006

시간이 변함에 따라 위치 좌표를 변경하는 모바일 환경에서 이동 객체는 자신의 위치를 기준으로 질의를 요청한다. 연속적인 스카이라인 질의 처리를 위한 효율적인 영역 결정 기법에서는 이동 객체의 속도와 방향과는 무관한 최적화된 스카이라인 영역(OSR: Optimal Skyline Region)을 미리 계산하여 질의에 답할 수 있다. 이에 따라 이동 객체의 위치를 중심으로 하고 가장 가까운 영역 변까지의 거리를 반경으로 하는 원(Vcircle: Validity Circle)을 유효 영역으로 결정하여 질의 발생 빈도를 감소하는 기법이 제안되고 있다. 그러나 원은 최초 질의가 발생한 시점의 이동 객체 위치에 따라 면적이 가변적이므로 질의 발생 빈도도 가변적이고, 객체가 최적화된 스카이라인 영역 내에서 이동하는 경우에 재질의가 빈번하게 발생하는 문제점이 발생한다. 예를 들어 사용자는 '현재 위치에서 가깝고 숙박료가 싸고, 해변과의 거리가 가까운 호텔을 검색하라'는 질의를 할 수 있다. 이 경우, 이동 객체와 대상 객체의 거리뿐만 아니라 대상 객체의 다중 속성을 고려해야하고, 스카이라인 질의 결과는 이동 객체의 현재 위치와 대상 객체의 거리에 따라 유효하지 않을 수 있으므로 이동 객체의 위치 변경에 따라 스카이라인을 재계산해야 하며, 새로운 결과를 요청하기 위해 연속적인 질의가 발생한다. 이 논문에서는 항상 볼록 다각형을 형성하는 최적화된 스카이라인 영역의 특징을 이용하여 스카이라인 영역의 최대내부원(IVcircle: Interior Validity Circle)을 정적 유효 영역으로 결정하는 기법을 제안한다. 실험을 통하여 영역내의 평균 질의 발생 빈도를 기존의 Vcircle을 이용한 동적 유효 영역 결정 기법보다 평균 52.55%가 감소함을 보인다.

• 해양환경안전학회지
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• 제23권6호
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• pp.690-698
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• 2017

베트남은 3,444 km가 넘는 해안선, 수천 개의 섬 그리고 길이 4260 km 이상인 2,360개의 강과 수로가 있는 해양국이다. 선박에 의한 유류수송의 빈도와 수송량이 증가하면서 기름유출사고의 가능성이 과거 어느 때보다 높아지고 있다. 해상에서의 연료유 및 화물유의 유출은 해양생태계, 연안자원 및 인간건강은 물론 사회 경제에 대하여 광범위하고 장기적인 영향을 미친다. 본 연구는 20년 동안의 기름유출사고 건수와 유출량과 같은 베트남의 해양기름유출 현황 그리고 기름유출대응(OSR)에 대한 국가체제 등과 같은 국가대응체계에 관한 전반을 보여줄 뿐만 아니라, 특히 베트남과 한국 사이의 국가기름유출대응체제를 비교함으로써 기름유출사고에 대응하여 베트남의 국가역량을 강화하기 위한 권고안을 제시하고자 한다. 그 결과, 베트남의 해양기름유출사고 건수와 유출량은 한국의 하락 추세와는 대조적으로 상승 추세를 보였다. 이는 베트남의 연안 해역에서 실제적 기름유출 가능성이 높다는 것을 의미한다. 따라서 베트남의 국가기름유출대응역량을 강화하기 위한 3가지 주요 권고안을 다음과 같이 제안한다. 즉 (1) OPRC협약의 수락 이행 그리고 유류오염으로 인한 피해 및 손실을 보상하는 국가기금의 조성과 같은 기름유출사고에 대비하고 대응하기 위한 법률제도를 포함한 국가기름유출대응 시스템을 강화하기 위한 방안의 개발; (2) 일관된 보고, 경보 및 모니터링 시스템의 강화; (3) 표준 교육과정 내용으로 구성된 교육 및 훈련 프로그램의 개발을 제안하고자 한다.