• 제목/요약/키워드: Northern hybridization

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누에 배형성기 초기 발현 유전자 개발 연구 (A Study on the Development of an Early Embryonic Gene of the Silkworm, Bombyx mori)

  • 최광호;구태원;김성렬;박승원;김성완;강석우
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제50권2호
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    • pp.122-125
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    • 2012
  • 본 연구는 누에 배자 발생 초기 특이 발현 유전자 프로모터를 개발하기 위한 연구의 일환으로 추진하였다. 누에 초기 및 후기 배자로 부터 분리한 mRNA를 사용하여 subtractive hybridization 분석법으로 누에 배자 발생 초기 특이 발현 유전자 4종을 선발할 수 있었다. 선발된 4종 유전자는 각각 BmNanos protein mRNA, BmNanos-P protein mRNA, BmNanos-O protein mRNA 및 BmVasa protein mRNA 유전자와 매우 높은 상동성을 보였다. 또한, 본 연구에서는 Northern hybridization 분석 및 real time PCR 분석을 통하여 배자 초기에 특이적으로 고발현하는 BmNanos-like 등 4개 선발 유전자의 발현 특성을 확인하였다. 이러한 결과는 추후 추진 할 누에 형질전환용 전이벡터의 효율성 제고를 위한 연구에 활용될 것으로 기대된다.

세균 유래 단백질연결효소 Transglutaminase의 클로닝과 효모에서의 발현 (Expression and Cloning of Microbial Transglutaminase in S. cerevisiae)

  • 김현영;오동순;김종화
    • 한국균학회지
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    • 제36권1호
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    • pp.93-97
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    • 2008
  • 방선균 Streptomyces mobaraensis IFO13819 유래 transglutaminase(mTGase)는 칼슘 비의존성으로 식품산업에서 유용하게 이용되고 있는 효소이다. mTGase는 406개의 아미노산으로 구성되어 있는데 leader와 pro 부위는 75개, 구조 부위는 331개의 아미노산으로 구성되어있다. mTGase의 pro와 구조 유전지를 pYAEG-TER 벡터에 클로닝하고 Saccharomyces cerevisiae 2805에 형질전환하였다. 형질전환체에서 mTGase의 발현을 Northern hybridization을 통해 확인하였으며, 최대 26 mU/ml의 mTGase의 활성을 측정할 수 있었다.

Polymerase Chain Reaction 방법에 의한 Halobacteria gvp 유전자의 역전사 및 증폭 (Reverse Transcription and Amplification of Halobacterial gvp Genes with Polymerase Chain Reaction Method)

  • 윤병수;이상섭
    • 미생물학회지
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    • 제30권6호
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    • pp.456-459
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    • 1992
  • Halobacteria 의 gvpD. gvpE 유전자는 가스포 형성에 관여하는 유전자로, 이들은 그 transcripts 의 분석에 있어 특유의 연약성 때문에 많은 실험상의 문제를 야기시키고 있다. 본 실험은 연약한 mRNA 를 reverse transcriptase 를 사용, DNA 로 바꾸고 이를 다시 PCR(Polymerase Chain Reaction) 방법으로 증폭시킴으로써, 유전자의 연약한 mRNA 를 다시 상보적인 안정한 DNA 로 대치케 하여 RNA 상의 cloning, RNA sequencing 을 용이하게 하였다. 결과는 유전자 gvpD 에서 거의 전 ORF(Open Reading Frame) 의 범위에서 northern hybridization 에서 발견치 못한 transcipts 를 확인할 수 있었다.

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Sarcoma 180 세포에서 비파엽에서 분리한 올솔레산이 c-myc 과 c-Ha-ras 암유전자 발현에 미치는 영향 (Effects of Ursolic Acid Isolated from Eriobotrya Japonica on c-myc and c-Ha-ras Oncogene Expression at Sarcoma 180 cell)

  • Yang-Ae Choi;Tae Hyong Rhew;Kun-Young Park;Hae-Young Chung;Jae-Chung Hah
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제21권3호
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    • pp.314-318
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    • 1992
  • 비파엽에서 분리동정한 활성성분인 울솔레산을 sarcoma 180 cells에 처리하여 c-myc과 c-Ha-ras 암유전자 발현에 있어서 변화를 조사하였다. 그 결과 c-myc 유전자의 발현에서는 뚜렸한 감소가 관찰되었으나 c-Ha-ras 유전자 발현은 대조군과 거의 차이가 없었다. Cell proliferation에 중요한 역할을 하는 것으로 추측되고 있는 c-myc 유전자 발현의 감소는 지금까지 보고된 그 물질의 antipromotional effect와 관계있는 것으로 보여진다.

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벼 (Oryza sativa L.)배양세포의 고중력유도성 cDNA의 탐색 (Screening of Gravity Inducible cDNAs in Rice(Oryza sativa L.) Cultured Cell)

  • 권순태;김길웅
    • 식물조직배양학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.111-115
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    • 1994
  • 벼(Oryza sativa L. cv Nipponbaie)배양세포에 중력 450,000 x g를 처리하여 cDNA library를 만들고, 무처리 및 고중력을 처리한 cDNA 프로브로 스크리닝을 실시하여 고중력에 특이적으로 양성반응을 나타내는 GSC 13 및 GSC124 cDNA를 선발하였다. 선발된 두 유전자 GSC 13 및 GSC 124의 길이는 각각 1.34 및 0.67 kilobase pairs였으며, 배양세포내에서 관련된 transcript의 크기는 각각 2.0 및 1.9 kilobase pairs인 것으로 나타났다. 두 유전자를 프로브로한 Northern hybridization을 실시한 결과 GSC 13, GSC 124 공히 배양세포내에 고중력처리에 의해 특이적으로 축적되는 mRNA가 나타났으며, 중력강도 300,000 x g 에 비해 450,000 x g 처리에서 더욱 강한 축적을 보였고 450,000 x g 4시간 처리에서 최대의 수준을 보였다.

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Screening of Differentially Expressed Genes in Heterosigma akashiwo, a Red-Tide Causing Organism, Induced by Exposure to High Light

  • Ko, Young-Seok;Cho, Kyung-Je;Moon, Byoung-Yong
    • Journal of Photoscience
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    • 제8권3_4호
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    • pp.93-97
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    • 2001
  • Heterosigma akashiwo has been reported as red-tide causing phytoplankton in the Korean coastal area during summer when they are exposed to high light. It also shows photosynthetic adaptability to strong light during culture in the laboratory. On the basis of these observations, we tried to find out some genes specifically expressed in Heterosimga akashiwo during exposure to high light, assuming that they might have some resistant mechanisms associated with light adaptation. For this purpose, we carried out DD-PCR to detect differentially expressed mRNAs from cells that had been illuminated under high light for 3 days. We found eight cDNA clones that had been expressed specificically for high light. When they were further screened by reverse Northern hybridization, three of them were identified to be positive cDNA clones. When these cDNA fragments were subjected to DNA sequencing and then their base sequences were compared to GenBank database, one of them showed sequence homology 86% identical to the partial sequence of 16S rRNA gene of eubacterium CRO-18.

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Profiling of Differentially Expressed Genes in Human Cervical Carcinoma

  • Lee, Seung-Hoon;Shim, Chan-Sub;Lee, Je-Ho
    • Animal cells and systems
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    • 제13권4호
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    • pp.381-389
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    • 2009
  • Using the DDRT-PCR, a series of differentially expressed genes in human primary cervical cancer was isolated. Among the 250 PCR amplimers, 88 gene fragments were confirmed by reverse Northern hybridization. Homology searches indicated that 26 out of 88 were previously known genes including calmodulin, human BBC1, histone H3.3, a series of ribosomal proteins (RPL19, RPS19, and RPS12), translation initiation factor (eIF-4AI), lactoferrin, integrin ${\alpha}6$, cell-surface antigens (CD9 and CD59), transcription factor (mbp-1), and mitochondrial proteins. Several unknown clones showed sequence homology with known genes. Furthermore, six of the unknown genes showed identical sequence with expressed sequence tags (EST) of unknown function. Differential expression patterns of identified genes were further examined and confirmed with multiple pairs of cervical cancer samples using Northern hybridization. Our profiling of differentially expressed genes may provide useful information about the underlying genetic alterations in human cervical carcinoma and diagnostic markers for this disease. The precise roles of these genes in cancer development remain to be elucidated.

Expression of EuNOD-ARP1 Encoding Auxin-repressed Protein Homolog Is Upregulated by Auxin and Localized to the Fixation Zone in Root Nodules of Elaeagnus umbellata

  • Kim, Ho Bang;Lee, Hyoungseok;Oh, Chang Jae;Lee, Nam Houn;An, Chung Sun
    • Molecules and Cells
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    • 제23권1호
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    • pp.115-121
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    • 2007
  • Root nodule formation is controlled by plant hormones such as auxin. Auxin-repressed protein (ARP) genes have been identified in various plant species but their functions are not clear. We have isolated a full-length cDNA clone (EuNOD-ARP1) showing high sequence homology to previously identified ARP genes from root nodules of Elaeagnus umbellata. Genomic Southern hybridization showed that there are at least four ARP-related genes in the genome of E. umbellata. The cDNA clone encodes a polypeptide of 120 amino acid residues with no signal peptide or organelle-targeting signals, indicating that it is a cytosolic protein. Its cytosolic location was confirmed using Arabidopsis protoplasts expressing a EuNOD-ARP1:smGFP fusion protein. Northern hybridization showed that EuNOD-ARP1 expression was higher in root nodules than in leaves or uninoculated roots. Unlike the ARP genes of strawberry and black locust, which are negatively regulated by exogenous auxin, EuNOD-ARP1 expression is induced by auxin in leaf tissue of E. umbellata. In situ hybridization revealed that EuNOD-ARP1 is mainly expressed in the fixation zone of root nodules.

백서 난소에서 성선자극호르몬에 의한 RGS-2의 발현 조절 (Gonadotropin Regulation of Regulator of G Protein Signaling 2 (RGS-2) Expression in the Rat Ovary)

  • 이여일;이은숙;김선애;김미영;조문경;전상영
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제35권2호
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    • pp.111-118
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    • 2008
  • 연구방법: 미성숙 백서 난소의 과배란 유도를 위해 PMSG를 주사하고, 배란을 위해서 hCG를 주입하였다. RGS-2의 유전자 발현양상을 조사하기 위하여는 Northern blot 분석과 in situ hybridization 분석을 시행하였다. 결 과: 미성숙 백서에 성선자극호르몬인 PMSG를 복강내 주사했을 때 RGS-2 mRNA 발현에 영향을 미치지 않음을 Northern blot analysis로 확인할 수 있었으나, hCG를 주입했을 때는 1시간에서 3시간 내에 발현이 증가됨을 알 수 있었다. In situ hybridization으로 살펴본 RGS-2 mRNA의 발현세포는 난포의 크기에 관계없이 난자였으나, hCG로 처리한 후에는 배란 전 난포와 성장중인 난포의 과립막 세포이었다. 그러나, RGS-2 단백의 발현은 hCG 처치와 관계없이 난포막 세포이었다. 상기 생체 실험과 마찬가지로 시험관에서도 배란 전 난포의 과립막 세포에 대한 LH 처리는 RGS-2 유전자 발현을 1시간 내에 촉진하였다. 또한, 성선자극호르몬 분비호르몬 2 길항제도 이러한 LH의 촉진작용을 증진시켰다. 결 론: 본 연구로 배란 전 과립막 세포에서 성선자극호르몬인 LH/hCG와 성선자극호르몬 분비호르몬 길항제에 의해 RGS-2의 발현이 증진되는 양상으로 보아 RGS-2가 배란과정 동안에 Gq protein 신호전달을 조절할 것으로 추정된다.

Bacillus subtilis dgk (diacylglycerol kinase) 유전자의 생리적 자극에 의한 유도발현 (Expression Patterns of Bacillus subtilis Diacylglycerol Kinase Gene Induced by Physiological Stimuli)

  • Lee, Mi-Young;Suh, Seok-Jong;Lee, Jin-Hyung;Song, Bang-Ho;Kim, Jong-Cuk
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.15-20
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    • 2002
  • Diacylglycerol Kinase (DGK)는 E. coli 및 진핵세포에서의 신호전달에 관여하며, 또한 미생물에서 생리적 자극에 따라 다른 발현 양상을 보이는 것으로 밝혀져 있다. Bacillus subtilis에서 이 유전자에 대한 환경에서의 자극 신호들, 즉 pH 변화, 삼투압의 변화 및 온도의 변화에 따른 발현양상을 연구하였다. 이미 동정된 dgk locus의 KpnI-HindIII의 0.45 kb의 DNA fragment를 probe로 하여 Dot blot, Northern blot analysis를 통해 발현량을 조사해 본 결과 dgk 유전자는 pH변화, 삼투압의 변화 및 온도의 변화에 대응하여 발현되는 유전자임을 알 수 있었다. 특히 낮은 pH, 고 삼투압, 및 저온에서 dgk 유전자의 발현량이 많아짐을 확인 할 수 있었다. Northern hybridization에서 약 2.5kb의 mRNA가 관찰되었다. dgk gene의 ORF size는 약 0.4 kb로 관찰된 transcript size와는 일치하지 않았다. 따라서 Streptococcus mutans의 dgk gene과 마찬가지로 B. subtilis의 dgk 유전자도 polycistronic mRNA로 발현되는 것을 추정할 수 있었으며, 염색체상의 dgk gene에서 상류의 ORF2까지의 크기가 약 2.5 kb로 관찰된 mRNA size와 동일하였다. dgk gene 상류의 ORF2영역의 0.6 kb의 DNA fragment를 probe로 하여 northern blot hybridization을 수행한 결과, 2.5 kb의 mRNA가 관찰되었으며 발현되는 형태도 dgk probe를 이용한 결과와 동일하였다. 따라서 dgk gene은 상류부위의 ORF2 gene과 operon을 형성하여 polycistronic mRNA로 전사되는 것으로 판단된다.