• 제목/요약/키워드: Northern Blot

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Pharmacokinetic Changes in Drugs during Protein-Calorie Malnutrition: Correlation between Drug Metabolism and Hepatic Microsomal Cytochrome P450 Isozymes

  • Lee, Joo-Hyun;Suh, Ok-Kyung;Lee, Myung-Gull
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제27권7호
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    • pp.693-712
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    • 2004
  • The rats with protein-calorie malnutrition (PCM, 5% casein diet for a period of 4-week) were reported to exhibit 60 and 80% suppression in the hepatic microsomal cytochrome P450 (CYP) 1 A2 and CYP2C11 levels, respectively, and 40-50% decreases in CYP2E1 and CYP3A 1/2 levels compared to control (23% casein diet for a period of 4-week) based on Western blot analysis. In addition, Northern blot analysis showed that CYP1 A2, CYP2E1, CYP2C11, and CYP3A1/2 mRNAs decreased in the state of PCM as well. Hence, pharmacokinetic changes of the drugs in rats with PCM [especially the area under the plasma concentration-time curve from time zero to time infinity (AUC) changes of metabolite(s)] reported from literatures were tried to explain in terms of CYP isozyme changes in the rats. Otherwise, the time-averaged nonrenal clearance ($CL_{NR}$) of parent drug was compared. Pharmacokinetic changes of the drugs in other types of malnutritional state, such as kwashiorkor and marasmus, in both human and animal models were also compared. The drugs reviewed are as follows: diuretics, antibiotics, anticancer agents, antiepileptics, antiarrythmics, analgesics, xanthines, antimalarials, and miscellaneous.

Modified Suppression Subtractive Hybridization Identifies an AP2-containing Protein Involved in Metal Responses in Physcomitrella patens

  • Cho, Sung Hyun;Hoang, Quoc Truong;Phee, Jeong Won;Kim, Yun Young;Shin, Hyun Young;Shin, Jeong Sheop
    • Molecules and Cells
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    • 제23권1호
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    • pp.100-107
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    • 2007
  • The moss Physcomitrella patens has two life cycles, filamentous protonema and leafy gametophore. A modified from of suppression subtractive hybridization (SSH), mirror orientation selection (MOS), was applied to screen genes differentially expressed in the P. patens protonema. Using reverse Northern blot analysis, differentially expressed clones were identified. The identified genes were involved mainly in metal binding and detoxification. One of these genes was an AP2 (APETALA2) domain-containing protein (PpACP1), which was highly up-regulated in the protonema. Alignment with other AP2/EREBPs (Ethylene Responsive Element Binding Proteins) revealed significant sequence homology of the deduced amino acid sequence in the AP2/EREBP DNA binding domain. Northern analysis under various stress conditions showed that PpACP1 was induced by ethephon, cadmium, copper, ABA, IAA, and cold. In addition, it was highly expressed in suspension-cultured protonema. We suggest that PpACP1 is involved in responses to metals, and that suspension culture enhance the expression of genes responding to metals.

Toward Functional Genomics of Plant-Pathogen Interactions: Isolation and Analysis of Defense-related Genes of Rot Pepper Expressed During Resistance Against Pathogen

  • Park, Do-Il;Lee, Sang-Hyeob
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제18권2호
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    • pp.63-67
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    • 2002
  • To understand plant-pathogen interactions, a complete set of hot pepper genes differentially expressed against pathogen attack was isolated. As an initial step, hundreds of differentially expressed cDNAS were isolated from hot pepper leaves showing non-host resistance against bacterial plant pathogens (Xanthomonas campestris pv. glycines and Pseudomonas syringae pv. syringae) using differential display reverse transcription polymerase chain reaction (DDDRT-PCR) technique. Reverse Northern and Northern blot analyses revealed that 50% of those genes were differentially expressed in pepper loaves during non-host resistance response. Among them, independent genes without redundancy were micro-arrayed for further analysis. Random EST sequence database were also generated from various CDNA libraries including pepper tissue specific libraries and leaves showing non-host hypersensitive response against X. campestris pv. glycines. As a primary stage, thousands of cDNA clones were sequenced and EST data were analyzed. These clones are being spotted on glass slide to study the expression profiling. Results of this study may further broaden knowledge on plant-pathogen interactions.

Particle Bombardment 방법을 이용한 인공 씨감자의 형질전환 (Genetic Transformation of Intact Potato Microtuber by Particle Bombardment)

  • 최경화;전재흥;김현순;정영희;임용표;정혁
    • 식물조직배양학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.87-91
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    • 1997
  • 제초제 저항성 유전자를 코팅시킨 입자를 particle bombardment 기법으로 자주감자 품종의 인공씨감자에 도입시켰다. 발아직전에 있는 인공씨감자의 생장점 부위를 집중적으로 particle bombardment 한 후 발아한 인공씨감자를 온실에 심었다. 온실에서 5주동안 생육시킨 후 northern 분석결과 유전자가 발현된 2개의 형질전환체를 선발하였고 제초제 살포 실험을 한 결과 형질전환 되지않은 식물체는 모두 고사하였지만 형질전환된 2개의 자주감자 식물체는 생존하였다.

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Acetosyringone을 이용한 효율적인 White Clover의 형질전환 (Efficient Transformation of Trifolium repens L. Using Acetosyringone)

  • 권태호
    • 한국자원식물학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.107-113
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    • 1997
  • 화이트 클로버의 배축, 잎, 미숙배 유래의 embryogenic callus에 식물 binary vector인 pBI121을 포함하는 A. tumefaciens LBA4404를 접종하여 효과적으로 화이트 클로버를 형질전환시켰다. A. tumefaciens를 이용한 화이트 클로버의 형질전환은 acetosyringone을 사용함으로써 품종간의 차이가 없이 배발생 캘러스에서 16-19%를 보였다. 재분화 식물체의 PCR 및 Northern 분서글 통하여 형질 전환된 화이트 클로버의 염색체내에 GUS 유전자가 안정되게 도입되었고 식물체내에서 mRAN로 발현됨을 확인하였다. 또한, GUS 유전자가 식물체내에서 단백질로 발현됨을 확인하기 위하여 형질 전환되어진 화이트 클로버부터 단백질을 추출하고 분광분석법에 의하여 GUS의 활성을 측정하였으며, 시료간에 약간의 차이는 있으나 유의적인 GUS 활성을 확인하였다.

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Agrobacterium tumefaciens에 의한 상추 (Lactuca sativa L.)의 형질전환 (Genetic Transformation of Lettuce (Lactuca sativa L.) with Agrobacterium tumefaciens)

  • 최언옥;양문식;김미선;은종선;김경식
    • 식물조직배양학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.55-58
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    • 1994
  • Agrobacterium-based vector를 이용하여 상추를 형질전환 및 재분화 하였다. 즉 $C_{a}$ MV 35S promoter와 GUS 유전자를 reporter로 가지고 있는 pBl121을 Agrobacterium tmfaciens LBA4404에 도입시킨 후 상추의 자엽 절편과 cocultivation을 통하여 형질전환 시키고 재분화 시켰다. Southern 및 Northern 분석을 통하여 형질 전환 및 재분화된 상추에 GUS 유전자가 안정하게 도입되고 식물체내에서 mRNA로 발현됨을 확인하였다. 또한 GUS 유전자가 식물 체내에서 단백질로 발현됨을 확인하기 위하여 상추 잎의 단백질 추출액을 이용하여 분광분석법에 의하여 GUS의 활성을 측정하였다. 시료간의 약간의 차이는 있으나 시료로부터 유의적인 GUS 활성을 확인하였다.

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팽이버섯의 자실체형성 초기과정에서 특이적으로 발현하는 유전자의 클로닝 (Cloning of a Gene Specifically Expressed During Early Stage of Fruiting Body Formation in Flammulina velutipes)

  • 김둘이;동지칙
    • 한국균학회지
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    • 제27권3호통권90호
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    • pp.187-190
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    • 1999
  • 팽이버섯의 자실체 분화 과정에서 특이적으로 발현하는 유전자 분리를 위한 cDNA library는 발이처리 후 7일째 배양한 균사체의 mRNA에 의해 만들어졌다. cDNA클론 FVFD16(Flammulina velutipes fruiting body differentiation)은 자실체 분화 과정에서 특이적으로 발현되는 클론으로 differential screening에 의해 선발되었다. Northern 분석에 의해 FVFD16의 발현 특성을 관찰한 결과, 1일과 4일째의 균사체에서 현저한 발현량을 나타내었다. FVFD16의 염기 서열을 검색한 결과, FVFD16의 mRNA는 open reading frame을 포함한 128의 아미노산 잔기(13.5kDa)를 가진 단백질로 추정되었다.

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한국 분리주 감자 잎말림 바이러스 (PLRV) 외피 단백질 유전자의 클로닝 및 감자 내 도입 (Cloning of Coat Protein Gene from Korean Isolate Potato Leafroll Virus (PLRV) and Introduction into Potato (Solanum tuberosum))

  • 서효원;이정윤;박영은;조지홍;함영일;조현묵
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제32권4호
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    • pp.243-250
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    • 2005
  • 한국 분리주 감자잎말림바이러스 (PLRV)로부터 627bp 크기의 외피단백질 유전자의 ORF (AF296280)를 분리하여 장려품종 감자인 '수미'를 형질전환 하였다. 17계통의 형질전환체를 선발하여 온실과 포장에서 5세대를 증식하면서 PLRV에 대한 저항성이 큰 5계통을 선발 하였다. 도입된 유전자들의 유전적인 안정성을 확인하기위해 PCR, Southern, 그리고 northern blot 분석을 수행하였다. 또한 클론으로 증식된 형질전환 감자들의 특성과 저항성도 검정하였다. 형질전환된 감자들에서 PLRV의 외피단백질 유전자는 안전적으로 발현되며 저항성을 유지하였으며, 유사도가 비교적 낮은 감자 바이러스 Y (PVY)에는 저항성을 나타내지 않았다. 따라서 이러한 저항성은 도입된 유전자와 유사성도가 높은 바이러스에 저항성을 나타내는 homology dependent gene silencing으로 판단되었다. 유망계통 형질전환 감자 계통들의 포장평가를 통해 PLRV에 대한 저항성을 제외한 주요한 농업적 특성과 식물학적 특성은 형질전환 되지 않은 감자와 큰 차이를 보이지 않았다.

Rat 바닐로이드 수용체 TRPV1과 Rab11-FIP3의 특이적 결합 (Specific Interaction of Rat Vanilloid Receptor, TRPV1 with Rab11-FIP3)

  • 이순열;김미란
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제12권1호
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    • pp.312-317
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    • 2011
  • 캡사이신 채널로 알려진 바닐로이드 수용체 TRPV1 (캡사이신채널, Transient Receptor Potential Vanilloid 1)은 통증발현에서 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 하지만 TRPV1의 활성조절에 관여하는 단백질에 대하여는 알려진 바가 많지 않다. 최근 rat TRPV1과 직접적으로 결합하는 단백질을 탐색하여 mouse Rab11-FIP3 (rab11-family interaction protein 3)가 rat TRPV1과 직접적으로 결합한다는 것이 보고되었다. Rab11은 여러 가지의 세포내 이동에 관여하는 것으로 보고되었다. 그러므로 Rab11-FIP3과의 결합을 통해 TRPV1의 세포막으로의 이동에 관여할 것으로 추측할 수 있다. 본 연구에서는 전에 보고된 연구가 mouse와 rat 이라는 다른 종의 단백질끼리의 결합이기 때문에 같은 종에서의 상호작용을 확인하고 Rab11-FIP3의 TRPV1의 세포막으로의 이동에서의 역할을 알아보고자 현재까지 동정되지 않은 rat의 Rab11-FIP3의 유전자를 GenBank 서열을 바탕으로 rat 뇌의 RNA 로부터 cDNA 를 클로닝하여 유전자를 분리하고 TRPV1 과의 관계를 세포생물학적으로 알아보았다. 연구결과 rat의 Rab11-FIP3는 489개의 아미노산 서열을 가지고 있으며 human과는 80%, mouse와는 90% 이상 아미노산 서열의 상동성을 보였다. 조직별 분포는 심장, 뇌, 간, 콩팥, 정소에서 발현되고 있는 것을 northern blot assay와 western blot assay 로 확인하였다. rat 의 뇌조직에서 TRPV1 과 Rab11-FIP3 단백질이 결합하여 colocalize 하는 것을 면역화학방법으로 확인하였다. 이 결합은 같은 family 의 TRPV2 와는 결합하지 않는 특이적 결합이므로 Rab11-FIP3 가 TRPV1 과 상호작용하여 세포막으로의 이동에 관여할 것이라는 것을 시사한다.

감미단백질 모넬린 발현 딸기 형질전환 식물체 개발 (Development of transgenic strawberry plants expressing monellin, a sweet protein)

  • 민성란;고석민;유재일;박지현;이소영;이인하;김현숙;김태일;최필선;정원중;김석원;김종현;유장렬
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제42권3호
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    • pp.180-185
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    • 2015
  • '여봉'과 '매향' 딸기 식물체로부터 잎 절편을 형질전환 재료로 이용하였다. CaMV 35S promoter에 모넬린 유전자가 연결된 pGA482-pS1D 벡터가 들어있는 아그로박테리움 EHA105 균주를 매개로 형질전환을 수행하였다. 공동 배양 후 잎 절편체로부터 캘러스 형성과 식물체 재분화율은 '여봉' 품종이 '매향' 품종보다 높았으며 이들 형질전환 식물체는 정상적으로 생육하여 개화하였다. PCR 및 Southern blot 분석을 통해 1-2 카피의 모넬린 유전자가 형질전환 딸기 식물체에 도입되었음을 확인하였으며, Northern blot 분석을 통하여 두 품종에서 모두 모넬린 유전자가 발현됨을 확인하였다. 비록 장기간 계대배양된 이들 딸기 형질전환 식물체에서는 모넬린 유전자가 escape 되는 경향을 보였지만, 본 연구에서 확립된 형질전환 시스템은 딸기의 유전적 개량을 위한 새로운 기회를 제공할 수 있을 것이다.