Nitrogen is an element need to grow plants growth. Plants take up nitrogen in the form of nitrate or ammonium. Most of plants absorb nitrogen source as fertilizers. But from 50 to 70% of fertilizers applied were washed away. This study was conducted to isolate free-living nitrogen fixing bacteria from reed and to examine its beneficial traits for developing sustainable biofertilizers. Enriched consortium obtained from a reed in Ansan was developed for the fixing of nitrogen. Nitrogen fixing bacteria isolated from an enriched culture in Congo Red Medium was analyzed by 16s rDNA sequencing. AKC-10 was isolated and shown to have excellent nitrogen fixing ability. The optimum conditions of nitrogen fixing ability were $25^{\circ}C$ ($237.50{\pm}39.65\;nmole{\cdot}mg-protein^{-1}{\cdot}h^{-1}$ and pH 7 ($168.335{\pm}12.84$ nmole/hr mg-protein). It was identified as Microbacterium hominis [(AKC-10 (similarity : 99%)]. This strain was had to IAA (indole-3-acetic acid) productivity and ACC(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid) deaminase activity. Therefore, Microbacterium hominis AKC-10 stimulated plant development in the soil, enhancing the efficiency of remediation.
한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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pp.190-190
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2017
Chemical fertilizers have been used to increase crop production and contributed to escaping food shortages. However, excessive use of chemical fertilizers over a long period caused many problems such as environmental pollution and the hampered production potential of the land. Thus, it is necessary to develop eco-friendly bio-fertilizers that can replace the use of chemical fertilizers. Here, we tested the effect of some nitrogen-fixing microorganims on the plant growth promotion. Seventy free-living nitrogen fixing microorganisms were isolated from rhizosphere of crop cultivation fields, streamside soils and sludge in Ansung, Korea. Of them, three strains (NF2-4-1, Yeast; EMM409, Mesorhizobium; Gsoil662, Burkholderia) were selected to be most efficient in the capacity of N-fixing nitrogen based on colony forming cell assay in N-free media. To investigate the ability to promote plant growth, these strains were inoculated into the soil and cabbage were grown for 4 weeks in the grown chamber. Fresh weight, dry weight, and leaf area were measured from 4-week-old plants. Phenotypic analysis revealed that the growth of the plants inoculated with NF2-4-1 and EMM409 strains were significantly promoted compared to the mock-treated control plants, while Gsoil662-inoculated plants did not show statically significant promotion. These results indicate that these nitrogen-fixing microorganims can be used to develop plant growth promoting bio-fertilizers. Further analysis on nitrogen fixing level in soil by these strains will be tested.
국내 논의 흙으로부터 벼과식물에 관련된 질소 고정 미생물을 238주 분리하여 비교적 활성이 높은 4주의 질소고정활성 미생물을 선별하여 이중 3주는 K. pneumoniae, 1주는 E. agglomerans로 동정하였다. NFB3, NFB264, NFB278의 3주는 1.7-84Mdal. 의 plasmid들을 가지고 있었으나 이들 plasmid에 질소고정유전자 단편을 함유하고 있지는 않았다. 선별미생물의 chromosomal DNA상에 존지하는 질소고정 유전자는 K. pneumoniae M5al의 질소고정유전자와 homology를 나타냈으며, 이들의 질소고정유전자는 K. pneumoniae M5al의 질소고정유전자와 제한효소 절단부위가 상이하였다.
담수상태(湛水狀態)의 논토양(土壤)에서 광합성미생물(光合成微生物) 및 타양성미생물(他養性微生物)에 의한 질소고정력(窒素固定力)을 알기 위하여 우리나라 전국(全國) 수도(水稻) 삼요소시비량시험지(三要素施肥量試驗地) 16개소(個所)의 무질소구(無窒素區) 표토(表土)를 채취(採取)하여 초자실(硝子室)에서 항온(恒溫)하면서 토양통(土壤統), 농업기후대(農業氣候帶), 논토양유형(土壤類型), 토성(土性) 및 배수정도(排水程度)에 따른 질소고정량(窒素固定量) 차이조사(差異調査)를 한 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 담수항온기간중(湛水恒溫期間中) 광합성질소고정미생물(光合成窒素固定微生物)에 의한 Acetylene 환원력(還元力)은 항온(恒溫) 7일째, 그리고 타양성질소고정미생물(他養性窒素固定微生物)에 의한 Acetylene 환원력(還元力)은 항온(恒溫) 35일째 가장 높았다. 2. 타양성미생물(他養性微生物)에 의한 질소고정력(窒素固定力)이 가장 높은 토양통(土壤統)은 장계(長溪), 옥천(沃泉) 및 화동통(華東統)이었으며 질소고정력(窒素固定力)이 낮은 토양(土壤)은 부용(芙蓉) 및 대정통(大靜統)이었다. 광합성미생물(光合成微生物)에 의한 질소고정력(窒素固定力)이 가장 높은 토양(土壤)은 대정(大靜) 및 지산통(芝山統)이였으며 낮은 토양(土壤)은 장계(長溪), 함창통(咸昌統)이였다. 3. 항온(恒溫) 105 일간(日間) Acetylene 환원법(還元法)에 의한 생물질소고정량(生物窒素固定量)은 광합성미생물(光合成微生物)에 의하여 3.0mg, 그리고 타양성미생물(他養性微生物)에 의하여 4.9mg/100g이었다. 4. 농업기후대별(農業氣候帶別) 생물질소고정량(生物窒素固定量)은 광합성미생물(光合性微生物)의 경우 기온(氣溫)이 온난(溫暖)한 남부해안지역(南部海岸地域)에서 높고 타양성미생물(他養性微生物)은 산간지(山間地)와 충청내륙지역(忠淸內陸地域)에서 높았다. 5. 답토양유형별(沓土壤類型別) 질소고정량(窒素固定量)은 광합성미생물(光合成微生物)의 경우 보통답(普通沓) 토양(土壤)에서 높고 타양성미생물(他養性微生物)의 경우는 조립질(粗粒質)의 사질답(砂質畓) 토양(土壤)에서 높았다. 6. 토양(土壤)의 특성별(特性別) 질소고정력(窒素固定力)을 볼 때 광합성미생물(光合成微生物)은 배수(排水) 약간불량(若干不良)한 식질(埴質) 혹(或)은 식양질토양(埴壤質土壤)에서 높고 타양성미생물(他養性微生物)은 배수양호(排水良好)한 사질토양(砂質土壤)에서 높았다.
Bacteria were isolated from roots of plants belonging to family Solanaceae and Gramineae, inhabited in Dokdo island. Fifty six endospore-forming bacteria grown on tryptic soy broth (TSB) agar medium and 23 nitrogen-fixing bacteria (NFB) grown on nitrogen free agar medium were isolated, respectively. The isolates were partially identified by analyzing the 16S rDNA and categorized into phylogenetic groups. The 16S rDNA sequences of each identified isolates were compared with sequences of each type strains to analyze phylogenetic relationship by phylogenetic tree. As a result, endospore-forming bacteria and nitrogen-fixing bacteria were classified into 4 and 6 lineage groups, respectively. Among these isolated, 18 were presumed to be novel species candidates based on the similarity (lower than 98%) analysis of the l6S rDNA sequences.
The mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling cascade is essential for a wide range of cellular responses in plants, including defense responses, responses to abiotic stress, hormone signaling, and developmental processes. Recent investigations have shown that the stress, ethylene, and MAPK signaling pathways negatively affect the formation of nitrogen-fixing nodules by directly modulating the symbiotic signaling components. However, the molecular mechanisms underlying the defense responses mediated by MAPK signaling in the organogenesis of nitrogen-fixing nodules remain unclear. In the present study, I demonstrate that the Medicago truncatula mitogen-activated protein kinase kinase 5 (MtMKK5)-Medicago truncatula mitogen-activated protein kinase 3/6 (MtMPK3/6) signaling module, expressed specifically in the symbiotic nodules, promotes defense signaling, but not ethylene signaling pathways, thereby inhibiting nodule development in M. truncatula. U0126 treatment resulted in increased cell division in the nodule meristem zone due to the inhibition of MAPK signaling. The phosphorylated TEY motif in the activation domain of MtMPK3/6 was the target domain associated with specific interactions with MtMKK5. I have confirmed the physical interactions between M. truncatula nodule inception (MtNIN) and MtMPK3/6. In the presence of high expression levels of the defense-related genes FRK1 and WRKY29, MtMKK5a overexpression significantly enhanced the defense responses of Arabidopsis against Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 (Pst DC3000). Overall, my data show that the negative regulation of symbiotic nitrogen-fixing nodule organogenesis by defense signaling pathways is mediated by the MtMKK5-MtMPK3/6 module.
벼과식물과 관련된 질소고정균을 분리하기 위하여 한반도 남부지방의 19지역에서 쌀, 밀, 귀리, 보리, 호밀, 옥수수 등을 채집하여 이들의 뿌리로부터 free living bacteria와 endophyte를 분류하였다. Colony의 형태, 크기, 색깔 등과 16S rDNA 염기서열을 근거로 63종으로 분류하였다. nifH 유전자 염기서열 결정과 nitrogenase 활성 측정을 통하여 분리균주 모두 질소고정 능력이 있음을 확인하였다. 그리고 식물에서 분리한 내생균의 특징 중 하나인 cellulase활성이 대부분의 분리 균주에서 확인되었다.
수종(數種)의 비두과식물(非荳科植物)의 뿌리로 부터 질소고정균(窒素固定菌)을 분리(分離)하여 분리(分離)된 균(菌)에 대(對)해서 숙주식물(宿主植物)의 접종실험(接種實驗)을 하여 유효균(有效菌)의 선발(選拔)을 한 결과(結果) 1. 9개(個)의 식물(植物)에 대(對)해서는 시금치, 배추, 오이, 갓 및 가지에서 비교적(比較的) 높은 아세칠렌 환원능(還元能)을 가진 균주(菌株)를 얻었고 2. 그 중(中)에서 아세칠렌 환원능(還元能)이 큰 4개(個)의 숙주식물(宿主植物)중 시금치, 배추, 오이에서 양호(良好)한 생육(生育)을 하는 균주(菌株)를 찾았다. 특(特)히 시금치에서 접종효과(接種效果)가 현저(顯著)하였다. 3. 이상(以上)의 결과(結果)로 부터 비두과식물(非荳科植物)의 뿌리에도 약한 협생(協生)을 하는 질소고정균(窒素固定菌)이 생육(生育)되고 있어 뿌리의 생장(生長) 및 분화(分化)를 촉진(促進)시켜 지상부(地上部)의 생육(生育)을 왕성하게 하는 것으로 판단(判斷)된다.
In an effort to identify possible microbes for seeking bioagents for remediation of herbicide-contaminated soils, seven species of phototrophic nonsulfur bacteria (Rhodobacter capsulatus and sphaeroides, Rhodospirillum rubrum, Rhodopseudomonas acidophila, blastica and viridis, Rhodomicrobium vannielii) were grown in the presence of the herbicide, butachlor, and bacterial growth rates and nitrogen fixation were measured with different carbon sources. Under general conditions, all species showed 17-53% reductions in growth rate following butachlor treatment. Under nitrogen-fixing conditions, Rb. capsulatus and Rs. rubrum showed 1-4% increases in the growth rates and 2-10% increases in nitrogen-fixing abilities, while the other 5 species showed decreases of 17-47% and 17-85%, respectively. The finding that Rp. acidophila, Rp. blastica, Rp. viridis and Rm. vannielii showed stronger inhibitions of nitrogenase activity seems to indicate that species in genera Rhodobacter and Rhodospirillum are less influenced by butachlor than those in Rhodopseudomonas and Rhodomicrobium in terms of nitrogen-fixing ability. Overall, nitrogenase activity was closely correlated with both growth rate and glutamine synthetase activity (representing nitrogen metabolism). When the carbon sources were compared, pyruvate (three carbons) was best for all species in terms of growth rate and nitrogen fixation, with malate (four carbons) showing intermediate values and ribose(five carbons) showing the lowest; these trends did not change in response to butachlor treatment. We verified that each of the 7 species had a plasmid ($12.2{\sim}23.5\;Kb$). We found that all 7 species could use butachlor as a sole carbon source and 3 species were controlled by plasmid-born genes, but it is doubtful whether plasmid-born genes were responsible to nitrogen fixation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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