• 한국자원식물학회:학술대회논문집
• /
• 한국자원식물학회 2018년도 춘계학술발표회
• /
• pp.38-38
• /
• 2018

The genus Carduus (Asteraceae), containing ca. 90 species, is mainly distributed in Eurasia and Africa. Carduus species are one of the most hazardous invasive species, which causes serious environmental threats and biodiversity damages in North America. Thus, the member of Carduus are targeted for classical biological control in this region. Here, we provide the complete cp genome of Carduus crispus using next-generation sequencing technology. The size of cp genomes of C. crispus is 152,342 bp. It shows a typical quadripartite structure, consisting of the large single copy (LSC; 83,254 bp), small single copy (SSC; 18,706 bp), separated by a pair of inverted repeats (IRs; 25,191 bp). It contains 115 unique genes of which 21 genes duplicated in the IR regions. The cpSSR regions of Carduus species were searched through the complete chloroplast genome sequence using a tandem repeat search tool in Geneious with the parameters set to ${\geq}7$ mononucleotide repeats, ${\geq}4$ di- and trinucleotide repeats, and ${\geq}3$ tetra-, penta-, and hexanucleotide repeats. A total of 22 repeat motifs were identified, which may be useful for molecular identification of Korean Carduus species (C. cripus), and providing a guideline for its conservation.

• 대한전자공학회논문지SP
• /
• 제48권1호
• /
• pp.132-140
• /
• 2011

Ultra-High Definition Television (U-HDTV) 는 차세대 TV로 불리는 실감 TV의 가장 유망한 요소 기술로 주목받고 있으며 이를 효과적으로 압축하기 위한 병렬 비디오 부호화 기술 개발의 필요성이 증대되고 있다. 기존의 병렬 부호화 기술은 영상을 공간적으로 분할하고 분할비디오 (sub-sequence)를 독립적으로 부호화 하는 방식을 사용하였다. 본 논문에서는 분할비디오간의 높은 상호상관 (cross-correlation)을 이용하여 부호화 효율을 향상하는 파이프라인 (pipeline) 구조의 병렬 부 복호화기를 제안한다. 실험결과를 통하여 제안하는 기술이 압축 효율을 향상시키며 균일한 화질의 분할비디오를 생성하는 것을 확인한다.

• Mycobiology
• /
• 제48권5호
• /
• pp.364-372
• /
• 2020

To improve our understanding of the relationship between soil higher fungi (belonging to Ascomycota and Basidiomycota) and Abies koreana, we surveyed A. koreana soil fungal communities in a forest in Mt. Halla, Jeju Island, Korea by next-generation sequencing (Illumina Miseq). To confirm the soil higher fungal communities, we collected two types of soils from a defined plot: soils with dead (AKDTs) and living A. koreana (AKLTs), respectively. Soil fungi were classified into 2 phyla, 19 classes, 64 orders, 133 families, 195 genera, and 229 OTUs (895,705 sequence reads). Nonmetric multidimensional scaling (NMDS) showed significantly different soil higher fungal communities between AKDTs and AKLTs (p < .05). In addition, the saprophyte composition was significantly affected by A. koreana status (p < .05). The proportion of the mycorrhizal Clavulina spp. was different between soils with AKDTs and AKLTs, suggesting that Clavulina spp. may be a crucial soil fungal species influencing A. koreana. This study will lead to a better understanding of the ecological status of A. koreana in Mt. Halla. In addition, this study could be useful for the conservation and management of A. koreana habitats.

• 한국산학기술학회논문지
• /
• 제13권8호
• /
• pp.3618-3622
• /
• 2012

본 연구에서는 LCD 생산라인에서 장기적으로 정체상태에 있는 모듈의 수율을 높이고, 현재 TFT-LCD 생산공정에 필수적인 고압의 실리콘주입 장비 및 정밀 제어시스템을 개발하였다. 본 개발을 통하여 향후 본격생산을 준비중인 차세대 디스플레이 생산라인뿐만 아니라 중국으로 이전중인 LCD 생산 설비의 라인 환경에서 장비의 효율을 최대한 발휘함으로써 신규 투자비용을 최소화하고 최대의 효과를 창출할 수 있도록 세부 동작 시퀀스를 제어하기 위한 H/W와 S/W 시스템을 생산라인에 실장하였다. 또한, Fast-evacuating을 위한 Vacuum pump 구조를 제안하고 Pump control 회로 설계 및 실험을 통해 제품화하였다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
• /
• 한국정보과학회 2012년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.39 No.1(C)
• /
• pp.25-27
• /
• 2012

디노버 어셈블리는 레퍼런스 시퀀스 없이 리드의 염기 서열 정보를 이용하여 원래의 전체 시퀀스(original sequence)로 추정되는 시퀀스로 리드들을 재구성하는 방식이다. 최근의 NGS(Next Generation Sequencing) 기술은 대용량 리드를 훨씬 쉽게 저비용으로 생성할 수 있다는 장점이 있어, 이를 이용한 많은 연구가 이루어지고 있다. 그러나 NGS 리드 데이터를 이용한 디노버 어셈블리에 관한 연구는 국내외적으로 매우 미흡한 실정이다. 그 이유는 NGS 리드 데이터를 이용하여 디노버 어셈블리를 수행하는 경우 대용량 데이터, 복잡한 데이터 구조 및 처리 과정 등으로 인하여 매우 많은 시간과 공간이 소요될 뿐만 아니라 아직까지 다양한 분석 툴과 노하우 등이 충분히 개발되어 있지 않기 때문이다. 본 연구에서는 NGS 리드 데이터를 이용한 어셈블리의 실효성과 정확성을 검증한다. 또한 디노버 어셈블리의 처리 시간 및 공간 오버헤드를 해결하기 위하여 유사 종과의 리드 정렬을 활용하는 방안을 제안한다.

• 한국정보통신학회논문지
• /
• 제11권3호
• /
• pp.600-607
• /
• 2007

차세대 이동 멀티미디어 통신에서는 전송지연을 줄이고 버스트 시변채널의 시간변화를 제한하기 위해 버스트 전송이 많이 사용된다. 그러나 채널적응을 위한 훈련 심볼은 짧은 길이의 버스트 데이터에 대해 심각한 문제를 야기할 수 있다. 따라서 심볼에 대한 적응 등화기의 설계에 있어서 짧은 길이의 훈련 심볼과 빠른 수렴을 갖는 적응 알고리즘이 필요로 된다. 본 논문에서는 DMWT (discrete multi-wavelet transform)과 LMS(least mean square) adaptation 을 갖는 적응 등화기를 제안한다. 제안된 등화기는 복잡성의 증가를 최소화하면서도 현재의 transform-domain equalizer보다 빠른 수렴을 갖는다.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
• /
• 한국정보처리학회 2012년도 추계학술발표대회
• /
• pp.586-589
• /
• 2012

표절과 관련된 이슈가 주목받고 있는 상황에서 표절을 검출하는 방법에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 일반적으로 표절구간 검출을 위해 복잡한 자연어처리와 같은 의미론적 접근방법이 아닌 비교적 단순한 어휘기반의 문자열 처리 방법을 사용한다. 대표적인 방법으로는 지문법 (Fingerprinting)과 서열정렬 (Sequence alignment) 등이 있다. 하지만 이 방법들을 이용하여 대용량 문서에 대한 표절검사를 수행하기에는 시공간적 복잡도의 문제가 발생한다. 본 논문에서는 이러한 단점을 극복하기 위해 NGS (Next Generation Sequencing)에서 사용하는 BWT (Burrows-Wheeler Transform)[1]를 이용한 탐색방법을 응용한다. 또한 부분표절구간을 검출하고 정확도를 향상시키기 위해 질의문서를 분할하여 작은 조각으로 만든 뒤, 조각들에 대한 질의탐색을 수행한다. 본 논문에서는 질의문서를 분할하는 두 가지 방법을 소개한다. 두 가지 방법은 k-mer analysis를 이용한 방법과 random-split analysis를 이용한 방법으로, 각 방법의 장단점을 실험을 통해 분석하고 실제 부분표절구간의 검출 정확도를 측정하였다.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
• /
• 한국정보통신학회 2022년도 추계학술대회
• /
• pp.269-271
• /
• 2022

최근 몇 년 동안 LSTM 블록이 있는 RNN 네트워크는 순차적 데이터를 처리하는 기계 학습 작업에 광범위하게 사용되어왔다. 이러한 네트워크는 주어진 시퀀스에서 가능성이 다음으로 가장 높은 단어를 기존 신경망보다 더 정확하게 예측할 수 있기 때문에 순차적 언어 처리 작업에서 특히 우수한 것으로 입증되었다. 이 연구는 영어와 한국어로 된 150개의 성경 시편에 대한 세 가지 다른 번역에 대해 RNN/LSTM 신경망을 훈련하였다. 그런 다음 결과 모델에 입력 단어와 길이 번호를 제공하여 훈련 중에 인식한 패턴을 기반으로 원하는 길이의 새 시편을 자동으로 생성하였다. 영어 텍스트와 한국어 텍스트에 대한 네트워크 훈련 결과를 상호 비교하고 개선할 점을 기술한다.

• 한국ITS학회 논문지
• /
• 제14권5호
• /
• pp.30-37
• /
• 2015

MIMO(Multiple Input Multiple Output) 시스템을 사용하여 주파수 선택적 페이딩 환경에서 동작하는 차세대 무선 통신 시스템의 데이터 전송 속도를 향상시키기 위한 연구가 현재 활발히 진행 중이다. 여러 개의 송신 안테나에서 송신된 시호들이 혼합되어 각 수신 안테나에 수신되는데 이렇게 혼합된 신호를 분리하기 위해서 직교 특성을 갖는 훈련신호가 필요하며, 이 훈련신호를 사용하여 신호의 동기화 및 채널 추정을 수행할 수 있어야 한다. 본 논문에서는 MIMO 통신 시스템에 사용 가능한 시퀀스들을 소개하고, 관심 영역에 대하여 우수한 자기 상관 특성을 갖는 변형된 WeCAN(weighted cyclic algorithm new) 시퀀스를 제안한다. 모의실험을 통해 각 훈련신호의 자기 상관도를 비교하였으며, 또한 도플러 주파수 변화와 다중경로 전달 페이딩 환경에서의 상관 특성을 비교하였다.

• Journal of Plant Biotechnology
• /
• 제43권4호
• /
• pp.417-421
• /
• 2016

The complete chloroplast genome sequence of Panax ginseng breeding line 'G07006', showing higher salt tolerance, was confirmed by de novo assembly using whole genome next-generation sequences. The complete chloroplast (CP) genome size is 156,356 bp, including two inverted repeats (IRs) of 52,060 bp, separated by the large single-copy (LSC 86,174 bp) and the small single-copy (SSC 18,122 bp) regions. One hundred fourteen genes were annotated, including 80 protein-coding genes, 30 tRNA genes, and 4 rRNA genes. Among them, 18 sites were duplicated in the inverted repeat regions. By comparative analyses of the previously identified CP genome sequences of nine cultivars of P. ginseng and that of G07006, five useful SNPs were defined in this study. Since three of the five SNPs were cultivar-specific to Chunpoong and Sunhyang, they could be easily used for distinguishing from other ginseng accessions. However, on arranging SNPs according to their gene location, the G07006 genotype was 'GTGGA', which was distinct from other accessions. This complete chloroplast DNA sequence could be conducive to discrimination of the line G07006 (salt-tolerant) and further enhancement of the genetic improvement program for this important medicinal plant.