A rapid and sensitive method has been developed to detect hepatitis B virus DNA (HBV) by nested polymerase chain reaction (PCR) technique with primers specific for the surface and core regions in capillary thermal cycler within 80 min. The lower limit for detection by present PCR method is $10^{-5}$ pg of recombinant HBV DNA which is equivalent to that determined by one round of PCR amplification and Southern blot hybridization analysis. When boiled HBV positive serum was serially diluted 10-fold, HBV DNA was successfully determined in $1{\mu}l-10^{-3}$ of serum. HBV DNA was detected by present method in 69 clinical samples including HBsAg positives and negatives by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). When serum samples were amplified by nested PCR using surface and core region primers, HBV DNAs were detected in 37 of 69 samples (53.6%) and 18 of 69 samples (26.1%), respectively. These results can inform the infectious state of HBsAg positive pateints. A simple and rapid nested PCR protocol by using boiled serum as DNA template has been described for the clinical utility to determine HBV DNA in human serum.
우리 나라에서 발생하고 있는 급성 출혈성 질환인 신증후출혈열의 원인 바이러스는 Family Bunyaviridae의 Genus Hantavirus에 속하는 한탄과 서울바이러스에 의하여 발생되고 있다. 본 연구에서는 신증후출혈열로 의뢰된 환자에서 한탄바이러스에 대한 항체가를 간접면역형광항체법(indirect immunofluorescent antibody technique, IFAT), 면역효소측정법 (enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA) (IgG, IgM), 고비중입자응집반응 (high density composite particle agglutination, HDPA) 및 플라크감소중화시험 (plaque reduction neutralization test, PRNT) 등으로 비교 측정하였고, 신증후출혈열 환자로 확진된 15명의 한탄바이러스 혈청형을 PRNT와 혈청형 특이 역전사 효소 중합효소연쇄반응(nested reverse transcriptase polymerase chain reaction, nested RT-PCR)으로 확인하였다. 신증후출혈열로 의뢰된 환자에서의 한탄바이러스에 대한 IFAT, ELISA (IgG, IgM), HDPA그리고 PRNT비교에서 형광항체, ELISA IgG,응집항체 및 중화항체는 8명 모두 높게 나타났으며, ELISA IgM은 5명에서는 현저히 높은 항체를 보유하고 있었다. 신증후출혈 열 환자 15명에서는 높은 형광항체와 중화항체 역가를 나타내었고, 15명 중 12명은 한탄바이러스, 2명은 서울바이러스에 대한 높은 중화항체를 갖고 있었으며, 1명은 두 바이러스에 대하여 동일한 항체 역가를 나타내었으며, 혈청형 특이 primer를 사용한 nested RT-PCR에서는 15명 중 3명과 1명만이 한탄바이러스와 서울바이러스 primer에 대해 RNA가 검출되었다.
In this paper, we considered the design of gain scheduled controllers for linear systems with input constraints. The gain scheduled control is a method that uses larger control gain when the states are smaller, and smaller gain when it is larger. By doing this, we can use a full actuator capacity. Also we allow the over-saturation in control to improve the performance. First, we derive a control and a reachable set expressed as LMI form, while minimizing the $L_2$ gain from the disturbance to the measured output. Next, the reachable set is divided as nested subsets, and the control gains are obtained by minimizing the $L_2$ gain at each nested subset. Finally, the control gains are scheduled according to the status of states, i.e., the nested-subset in which the states are located. Performance of the proposed technique is illustrated through simulations of a six-story building subject to earthquake ground motion.
본 논문에서는 객체지향 데이터베이스의 중포속성에 대한 색인기법으로 다차원 색인구조를 이용하는 다차원 중포속성 색인기법은 MD-NAI를 제안한다. 중포석성에 대한 기존의 색인기법들은 중포된 객체에 대한 기존의 색인기법들은 B+-tree와 같은 일차원 색인구조를 이용함으로써, 클래스 계층과 중포속성이 포함된 복합 형태의 질의들에 대한 처리를 잘 지원하지 못한다. MD-NAI에서는 객체지향 데이터베이스의 클래스 계층에 대한 색인기법인 이차원 클래스 계층 색인기법(2D-CHI)을 다차원으로 확장한다. 2D-CHI는 키 속성 도메인과 클래스 식별자 도메인으로 구성된 이차원 도메인 공간상에서 객체들의 클러스터링을 다루는 색인기법이다. 본 논문의 MD-NAI에서는 색인된 중포속성을 표현하는 경로상의 각 클래스 계층마다 하나의 클래스 식별자 도메인을 할당하여 구성된 다차원 도메인 공간상에서 색인 엔트리들의 클러스터링을 다룬다. 따라서, MD-NAI에서는 기존의 색인기법에서 지원하기 어려운 질의의 대상 범위 클래스 계층상의 임의의 클래스들로 제한되거나, 질의에 포함된 복합속성들의 도메인이 클래스 계층상의 임의의 클래스들로 제한되는 경우에도 잘 지원할 수 있다.
Malaria elimination and control require prompt and accurate diagnosis for treatment plan. Since microscopy and rapid diagnostic test (RDT) are not sensitive particularly for diagnosing low parasitemia, highly sensitive diagnostic tools are required for accurate treatment. Molecular diagnosis of malaria is commonly carried out by nested polymerase chain reaction (PCR) targeting 18S rRNA gene, while this technique involves long turnaround time and multiple steps leading to false positive results. To overcome these drawbacks, we compared highly sensitive cytochrome oxidase gene-based single-step multiplex reaction with 18S rRNA nested PCR. Cytochrome oxidase (cox) genes of P. falciparum (cox-III) and P. vivax (cox-I) were compared with 18S rRNA gene nested PCR and microscopy. Cox gene multiplex PCR was found to be highly specific and sensitive, enhancing the detection limit of mixed infections. Cox gene multiplex PCR showed a sensitivity of 100% and a specificity of 97%. This approach can be used as an alternative diagnostic method as it offers higher diagnostic performance and is amenable to high throughput scaling up for a larger sample size at low cost.
DNA sequence-based typing is considered a robust tool for the discrimination of dinoflagellate species because of the availability of extensive rDNA sequences. Here, we present a rapid, cost-effective DNA-sequencing technique for various PCR products. This sequencing strategy relies on 'nested' or 'tailed' primer labeled with near-infrared dye, and uses a minimal volume of unpurified PCR product (ca. $5{\mu}L$) as the DNA template for sequencing reactions. Reliable and accurate base identification was obtained for several hundred PCR fragments of rRNA genes. This quick, inexpensive technique is widely applicable to sequence-based typing in clinical applications, as well as to large-scale DNA sequencing of the same genomic regions from related species for studies of molecular evolution.
To predict the effects of air pollutant in the coastal region, we have developed the air pollutant model, the reaction model and the deposition of NO, $NO_2, and O_3$. And the numerical model of air pollutant concentration employed the nested technique to calculate with the higher resolution for the area. The nested technique used two grid systems, one for the large scale calculating region with the coarse mesh grid (CMG) and the other for the small scale region with the fine grid (FMG). In other to prove the validity of the simulation model the calculations were conducted for the present situation. The results of them reasonably agree with the observed data and proved the validity of the model.
In this paper, a new indexing technique is proposed for efficient evaluation of nested queries on aggregation hierarchy in object-oriented data model. As an index data structure, an extended $B^{+}$ tree is introduced in which instance identifier to be searched and path information used for update of index record are stored in leaf node and subleaf node, respectively. the retrieval and update algorithm on the introduced index data structure is provided. Comparisons under a variety of conditions are given with current indexing techniques, showing improved performance in cost, i.e., the total number of pages accessed for retrieval and update.
We developed a numerical model that considered the influences on the thermal environment of vegetation, water surfaces and buildings to predict micro climatic changes in a few $\textrm{km}^2$ scales; and applied this model to the Mino residential development region in Osaka Prefecture by using a nested technique. The calculated temperatures and winds in the residential development region reasonably agreed with the observed ones. We then investigated the influences on the thermal environment of the construction of a dam, the change of the green coverage rate. The results obtained from the numerical simulations were qualitatively reasonable.
공유 변수를 가지는 병렬 프로그램의 오류 수정에서 경합 탐지는 중요하다. 왜냐하면, 경합은 프로그램의 비결정적인 수행을 유발하기 때문이다. 기존에 제시된 병렬 프로그램의 오류 수정 기법인 수행중 탐지 기법은 내포된 병렬 프로그램에서 최초 경합 탐지를 보장할 수 없다. 최초 경합을 수정하면 이후에 발생하는 경합들이 나타나지 않을 수 있으므로, 최초경합의 탐지는 중요하다. 본 논문에서는 내포 병렬 루프 프로그램을 대상으로 반복 수행을 통해서 최초경합을 탐지하는 기법을 제시한다. 반복 수행의 횟수는 최악의 경우에 프로그램의 내포 깊이 만큼이며 각 수행시의 효율성은 공유변수의 개수를 V, 프로그램의 최대 병렬성을 T라 할 때, 공간 복잡도 O(VT)와 시간 복잡도 O(T)를 가지므로 기존의 수행중 탐지 기법과 동일하다. 그러므로 본 기법은 효과적이고 실용적인 오류 수정을 가능하게 한다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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