• 제목/요약/키워드: Mutant Generation

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Methylelaiophylin의 항균활성 (Antibacterial Activities of Methylelaiophylin)

  • 이동선;이상한;우주형;이진만;서영배;홍순덕
    • 생명과학회지
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    • 제7권3호
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    • pp.180-185
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    • 1997
  • Methylelaiophylin은 gram양성균에 대하여 광범위한 항균활성을 보이며, 특히Bacillus subtilis에서 superoxide redicals을 발생하여 항균활성을 나타낸다. B. subtilis에 대한 항균활성은 wild type strain보다 mutant strain인 rec$^{-}$에 대하여 더민감하며, 이러한 항균력은 항산화제인 dithiothreito에 의하여 현저히 감소되었다. 또한 항균력은 세포내 RNA합성보다 DN합성에 효과적으로 작용하였다. 이러한 결과들은 methylelaiophylin의 항균활성이 세포내에서 발생한 활성산소에 의하여 기인한 것임을 나타낸다.

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황색종 연초 품종의 Gamma선에 의한 돌연변이 유기 및 변이형질의 유전분석 II. 변이형질의 유전분석 (Induced Mutant by Gamma Rays and Genetic Analysis for Mutant Characters in Flue-cured Tobacco Variety(Nicotiana tabacum L.) II. Genetic Analysis for Mutant Characters in Flue-cured Tobacco)

  • 정석훈;이승철;김흥배
    • 한국연초학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.116-125
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    • 1992
  • This experiment was conducted to examine characteristics of agronomic characters and estimate of gene effect for several mutant characters. The genetic populations were derived from cross between 83H-5 and Hicks. There were significant difference for plant height, stlk height, leaf shape and bacterial wilt disease index except leaf number, leaf length, and what is more, F3 variance is more than Bl and B2 generation from cross 83H-5 X Hicks. Gene actions for stalk height and bacterial wilt disease were estimated by 3-parameter, and by 6- parameter model for all characters except above two characters but stalk height and bacterial wilt disease index are not significant in the additive and dominance effects. Dominant$\times$dominant epitasis for plant height, dominant and dominant$\times$dominant epistasis for leaf length, additive and additive$\times$additive and dominant$\times$dominant epistasis for leaf width, and additive and additive$\times$dominant epistasis for days to flower were appeared significant in gene action.

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벼 초거대배 돌연변이계통의 영양 및 작물학적 특성 (Nutritional and Agronomic Characteristics of Super-Giant Embryo Mutant in Rice)

  • 고희종;박순직;원용재;허문회
    • 한국작물학회지
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    • 제38권6호
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    • pp.537-544
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    • 1993
  • 화청벼 에서 유기된 초거대배 돌연변리계통을 육성하고 그의 미립 외형특성, 단백질함량 및 아미노산 조성, 지질함량 및 지방산 조성, 비타민 함량등의 영양특성 및 작물학적 특성을 원품종과 대비하여 조사하였다 그 결과는 다음과 같다. 1. 초거대배 변리계통의 현미 외형크기는 원품종과 차이가 없었으나, 1000립중은 원품종의 74.5%이었고, 1립당 배의 크기는 건물중으로 322%이었다. 2. 현미의 단백질함량은 8.99%로 화청벼의 7.39%에 비해 높았고, 저장단백질의 조성은 차이가 없었다. 아미노산조성에서는 현미 전체로 볼 때 lysine 함량이 월등히 증대되었고, methionine, serine, ,tyrosine 함량이 다소 감소되었다. 3. 현미의 지질함량은 5.7%로 원품종의 3.8%에 비해 1.5배 증가하였다. 지방산 중 팔미틴 산 함량은 증가하였고, 리놀산 함량은 감소하였다. 4. 배의 비타민 $B_1,B_2$, niacin함량에서 초거대배미와 원품종과는 차이가 없었으며, ${\alpha}$-tocopherol 함량은 감소하였으나, 현미 전체로 보면$B_1,B_2$, ${\alpha}$-tocopherol 함량이 월등히 증가하였다. 5. 초거대배미는 고영양미로서의 이용가치가 클것으로 판단되었다. 6. 초거대배 변이계통(M4)들의 정조수량은 원품종인 화청벼(556kg/10a)에 비해 69.2~78.8% 정도이었다. 생육형질의 변이계수로 보아 대부분 계통들이 고정된 것으로 나타났다.

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Future Perspectives on New Approaches in Pathogen Detection

  • Li, Peng;Ho, Bow;Ding, Jeak Ling
    • 대한의생명과학회지
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    • 제21권4호
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    • pp.165-171
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    • 2015
  • Microbial pathogens are responsible for most of the rapidly-spreading deadly infectious diseases against humans. Thus, there is an urgent need for efficient and rapid detection methods for infectious microorganisms. The detection methods should not only be targeted and specific, but they have to be encompassing of potential changes of the pathogen as it evolves and mutates quickly during an epidemic or pandemic. The existing diagnostics such as the antibody-based ELISA immunoassay and PCR methods are too selective and narrowly focused; they are insufficient to capture newly evolved mutant strains of the pathogen. Here, we introduce a fresh perspective on some new technologies, including aptamers and next generation sequencing for pathogen detection. These technologies are not in their infancy; they are reasonably mature and ready, and they hold great promise for unparalleled applications in pathogen detection.

자외선 조사에 의한 Nannochloropsis oculata의 지질 축적량 향상 변이주 생성 및 특성 분석 (UV-induced Mutagenesis of Nannochloropsis oculata for the Increase of Lipid Accumulation and its Characterization)

  • 김종훈;박현진;김영화;주현;이상훈;이재화
    • 공업화학
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    • 제24권2호
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    • pp.155-160
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    • 2013
  • 미세조류의 지질축적을 증가시키는 것에 대한 돌연변이 생성 및 분리에 관한 연구는 바이오디젤 산업에 중요한 문제이다. 본 연구에서는, 광합성 미세조류인 Nannochloropsis oculata (N. oculata)를 이용하여 자외선(UV-B 타입)으로 돌연변이를 유도하였다. 그 결과 콜로니가 생성되었고, 그 이후에 f/2 액체배지와 고체배지에 배양하였다. 몇 주간 배양후, 변화된 세포성장률과 세포건조중량, 그리고 몇 가지 중요한 세포 구성 요소를 조사하였다. 수천 개의 변이주 중 두 개의 변이주가 야생균주에 비해서 증가된 세포성장과 높은 지질 축적을 보였다. 또한 증가된 세포성장률과 함께 단백질 과발현 현상이 관찰되었다. 그러나 돌연변이주의 클로로필 생합성의 감소를 확인 할 수 있었다.

The Role of Abp140p in Actin Dynamics of Budding Yeast

  • Lim, Bum-Soon;Lee, Yong-Keun;Pon, Liza A.;Yang, Hyeong-Cheol
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제30권1호
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    • pp.17-22
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    • 2005
  • In the previous studies of Saccharomyces cerevisiae, Abp140p (actin binding protein 140) fused to GFP has been only a protein that can label actin cables of yeast cells so far. However, the role of Abp140p in actin dynamics was remained elusive. In this study, the function of Abp140p was investigated with a deletion mutant and overexpression of GFP fused Abp140p. The deletion mutant was slightly more susceptible to Latrunculin-A (Lat-A), an actin-monomer sequestering agent, than wild type, although no significant deformation of actin structures was caused by ABP 140 deletion. Overexpression of Abp140p-GFP retarded cell growth, and produced thick and robust actin cables. Lat-A was not able to destabilize the thick actin cables, which suggests that actin dynamics was compromised in the cells with surplus of Abp140p. Therefore, Abp140p seems to stabilize actin cables together with other bundling proteins. Recently, actin cable dynamics of budding yeast was found to have a resemblance to that of filopodial tip of cultured mammalian cells. Retrograde movement of actin cables from buds to mother cells indicated local generation of the cable at bud sites. By using Abp140p-GFP, we traced the steps in the generation of a new actin cable after elimination of old cables by sodium azide. Before the appearance of a new actin cable, Abp140p-GFP concentrated in buds and disappeared, as mother cells became abundant in actin cables. Our observations provide a direct evidence of actin cable formation at buds of budding cells.

Mutagen4J: 효과적인 Java 프로그램 변이 생성 도구 (Mutagen4J: Effective Mutant Generation Tool for Java Programs)

  • 전이루;김윤호;홍신;김문주
    • 정보과학회 논문지
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    • 제43권9호
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    • pp.974-982
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    • 2016
  • 프로그램 변이 분석은 분석대상 프로그램의 코드를 변형한 다양한 프로그램 변이를 활용해 분석대상 프로그램의 특성을 분석하는 기법이다. 효과적인 변이 분석을 위해서는 분석대상 프로그램의 동작을 다양하게 변화시키는 유용한 변형 연산자의 사용이 필수적이다. 현재까지 Java 프로그램을 대상으로 제안된 변이 생성 도구들은 변형 연산자의 종류가 제한적이거나, 최근 Java 언어 요소로 작성된 분석대상 프로그램의 경우 올바른 변이 생성을 지원하지 못하는 한계가 있다. 본 논문은 Java 프로그램을 위한 새로운 변이 생성 도구 Mutagen4J를 소개한다. Mutagen4J는 기존 연구를 통해 유용한 것으로 알려진 프로그램 변형 연산자를 추가로 지원하며, 최근 Java 언어요소를 처리함으로써, Java 프로그램에 대한 효과적인 변이 분석을 지원한다. 기존 Java 프로그램 변이 생성 도구와 비교 실험을 수행한 결과, Mutagen4J이 기존 도구보다 유용한 변이를 평균 2.3배 생성하였다.

자외선 조사(照射)에 의한 Agrobacterium tumefaciens Arginine 요구주(要求株)의 유도와 선발 (Mutation and Selection of Agrobacterium tumefaciens Arginine Auxotroph by UV Irradiation)

  • 이윤;박노동;김광식
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제28권2호
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    • pp.92-97
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    • 1985
  • Agrobacterium tumefaciens A 136에 자외선은 조사(照射)하여 Ti-plasmid 숙주로 이용할 수 있는 arginine 영양요구주를 선발하고자 하였다. A. tumefaciens의 생육을 600nm에서의 흡광도(吸光度)로 측정할 때 TY배지에서 2% 접종시 7시간 부터 16시간 사이에 대수기를 보였고 generation time은 4.8시간이었다. $800{\mu}w/cm^2$의 자외선 강도로 $30{\sim}50$초 조사(照射)에서 $1{\sim}0.1%$의 생존율을 보였다. 자외선 조사(照射)로 mutation을 유도한 다음 5,000개의 colony에서 15개의 mutants를 얻었으며 그 중 2개는 arginine 영양요구주였고 3개는 asparagine 영양요구주였다.

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Genetic Analysis of Spontaneous Lactose-Utilizing Mutants from Vibrio vulnificus

  • Baek, Chang-Ho;Lee, Ko-Eun;Park, Dae-Kyun;Choi, Sang-Ho;Kim, Kun-Soo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권12호
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    • pp.2046-2055
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    • 2007
  • Wild-type V. vulnificus cannot grow using lactose as the sole carbon source or take up the sugar. However, prolonged culture of this species in media containing lactose as the sole carbon source leads to the generation of a spontaneous lactose-utilizing (LU) mutant. This mutant showed strong ${\beta}$-galactosidase activity, whereas the wild-type strain showed a barely detectable level of the activity. A mutant with a lesion in a gene homologous to the lacZ of E. coli in the bacterium no longer showed ${\beta}$-galactosidase activity or generated spontaneous LU mutants, suggesting that the lacZ homolog is responsible for the catabolism of lactose, but the expression of the gene and genes for transport of lactose is tightly regulated. Genetic analysis of spontaneous LU mutants showed that all the mutations occur in a lacI homolog, which is located downstream to the lacZ and putative ABC-type lac permease genes. Consistent with this, a genomic library clone containing the lad gene, when present in trans, made the spontaneous LU mutants no longer able to utilize lactose as the sole carbon source. Taken together with the observation that excessive amounts of exogenously supplemented possible catabolic products of lactose have negative effects on the growth and survivability of V. vulnificus, we suggest that V. vulnificus has evolved to carry a repressor that tightly regulates the expression of lacZ to keep the intracellular toxic catabolic intermediates at a sublethal level.

Directed Evolution of Soluble α-1,2-Fucosyltransferase Using Kanamycin Resistance Protein as a Phenotypic Reporter for Efficient Production of 2'-Fucosyllactose

  • Jonghyeok Shin;Seungjoo Kim;Wonbeom Park;Kyoung Chan Jin;Sun-Ki Kim;Dae-Hyuk Kweon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제32권11호
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    • pp.1471-1478
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    • 2022
  • 2'-Fucosyllactose (2'-FL), the most abundant fucosylated oligosaccharide in human milk, has multiple beneficial effects on human health. However, its biosynthesis by metabolically engineered Escherichia coli is often hampered owing to the insolubility and instability of α-1,2-fucosyltransferase (the rate-limiting enzyme). In this study, we aimed to enhance 2'-FL production by increasing the expression of soluble α-1,2-fucosyltransferase from Helicobacter pylori (FucT2). Because structural information regarding FucT2 has not been unveiled, we decided to improve the expression of soluble FucT2 in E. coli via directed evolution using a protein solubility biosensor that links protein solubility to antimicrobial resistance. For such a system to be viable, the activity of kanamycin resistance protein (KanR) should be dependent on FucT2 solubility. KanR was fused to the C-terminus of mutant libraries of FucT2, which were generated using a combination of error-prone PCR and DNA shuffling. Notably, one round of the directed evolution process, which consisted of mutant library generation and selection based on kanamycin resistance, resulted in a significant increase in the expression level of soluble FucT2. As a result, a batch fermentation with the ΔL M15 pBCGW strain, expressing the FucT2 mutant (F#1-5) isolated from the first round of the directed evolution process, resulted in the production of 0.31 g/l 2'-FL with a yield of 0.22 g 2'-FL/g lactose, showing 1.72- and 1.51-fold increase in the titer and yield, respectively, compared to those of the control strain. The simple and powerful method developed in this study could be applied to enhance the solubility of other unstable enzymes.