Lu, Xiao H.;Zhang, Xi M.;Jiao, Xiao L.;Hao, Jianjun J.;Zhang, Xue S.;Luo, Yi;Gao, Wei W.
Journal of Ginseng Research
/
v.44
no.3
/
pp.506-518
/
2020
Background: Red-skin root of Asian ginseng (Panax ginseng) significantly reduces the quality and limits the production of ginseng in China. The disease has long been thought to be a noninfectious physiological disease, except one report that proved it was an infectious disease. However, the causal agents have not been successfully determined. In the present study, we were to reveal the pathogens that cause red-skin disease. Methods: Ginseng roots with red-skin root symptoms were collected from commercial fields in Northeast China. Fungi were isolated from the lesion and identified based on morphological characters along with multilocus sequence analyses on internal transcription spacer, β-tubulin (tub2), histone H3 (his3), and translation elongation factor 1α (tef-1α). Pathogens were confirmed by inoculating the isolates in ginseng roots. Results: A total of 230 isolates were obtained from 209 disease samples. These isolates were classified into 12 species, including Dactylonectria sp., D. hordeicola, Fusarium acuminatum, F. avenaceum, F. solani, F. torulosum, Ilyonectria mors-panacis, I. robusta, Rhexocercosporidium panacis, and three novel species I. changbaiensis, I. communis, and I. qitaiheensis. Among them, I. communis, I. robusta, and F. solani had the highest isolation frequencies, being 36.1%, 20.9%, and 23.9%, respectively. All these species isolated were pathogenic to ginseng roots and caused red-skin root disease under appropriate condition. Conclusion: Fungal complex is the causal agent of red-skin root in P. ginseng.
Yoon, Sang Chul;Jeong, Yeon Kyu;Ji, Hwan Sung;Shin, Ari;Kim, Zang Geun;Choi, Kwang Ho
Journal of the Korean Society of Fisheries and Ocean Technology
/
v.51
no.1
/
pp.79-85
/
2015
Three specimens of larvae (5.2~7.8 mm in standard length (SL)), of the family Scombridae, were collected from the southeastern waters off Jeju Island in August, 2014. These specimens were identified to Katsuwonus pelamis have melanophores distributed on the 1st dorsal-fin spines and post ventral margin on caudal peduncle. An analysis of the cytochrome oxidase submit I (COI) sequences (652 base pairs) of mitochondrial DNA showed that our specimens must be K. pelamis, because their sequences were concordant with those of the adult K. pelamis (genetic distance= 0.000~0.002), followed by Auxis rochei (genetic distance= 0.061~0.063) and Euthynnus affinis (genetic distance= 0.077~0.079). During the larval stage, K. pelamis differed from Thunnus spp. species in melanophores distribution period of 1st dorsal-fin spines, lower jaws and ventral margin on caudal peduncle. In conclusion, occurrence of K. pelamis larvae means Korean waters are potential spawning ground of K. pelamis.
Flammulina velutipes is a popular edible basidiomycete mushroom found in East Asia and is commonly known as winter mushroom. Mushroom development showing dramatic morphological changes by different environmental factors is scientifically and commercially interesting. To create a genetic database and isolate genes regulated during mushroom development, cDNA libraries were constructed from three developmental stages of mycelium, primordium, and fruit body in F. velutipes. We generated a total of 5,431 expressed sequence tags (ESTs) from randomly selected clones from the three cDNA libraries. Of these, 3,332 different unique genes (unigenes) were consistent with 2,442 (73%) singlets and 890 (27%) contigs. This corresponds to a redundancy of 39%. Using a homology search in the gene ontology database, the EST unigenes were classified into the three categories of molecular function (28%), biological process (29%), and cellular component (6%). Comparative analysis found great variations in the unigene expression pattern among the three different unigene sets generated from the cDNA libraries of mycelium, primordium, and fruit body. The 19-34% of total unigenes were unique to each unigene set and only 3% were shared among all three unigene sets. The unique and common representation in F. velutipes unigenes from the three different cDNA libraries suggests great differential gene expression profiles during the different developmental stages of F. velutipes mushroom.
Intestinal giant-cystic disease (IGCD) of the Israel carp (Cyprinus carpio nudus) has been recognized as one of the most serious diseases afflicting inland farmed fish in the Republic of Korea, and Thelohanellus kitauei has been identified as the causative agent of the disease. Until now, studies concerning IGCD caused by T. kitauei in the Israel carp have been limited to morphological and histopathological examinations. However, these types of diagnostic examinations are relatively time-consuming, and the infection frequently cannot be detected in its early stages. In this study, we cloned the full-length 18S rRNA gene of T. kitauei isolated from diseased Israel carps, and carried out molecular identification by comparing the sequence with those of other myxosporeans. Moreover, conventional PCR and real-time quantitative PCR (qPCR) using oligonucleotide primers for the amplification of 18S rRNA gene fragment were established for further use as methods for rapid diagnosis of IGCD. Our results demonstrated that both the conventional PCR and real-time quantitative PCR systems applied herein are effective for rapid detection of T. kitauei spores in fish tissues and environmental water.
Kim, Woo-Jin;Kong, Hee-Jeong;Kim, Young-Ok;Nam, Bo-Hye;Kim, Kyung-Kil
Animal cells and systems
/
v.13
no.2
/
pp.179-186
/
2009
Discriminating between eel species of the genus Anguilla using morphological characteristics can be problematic, particularly in the glass eel and elver stages. In this study, sequence-characterized amplified region (SCAR) and polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers were developed for the identification of Anguilla japoniea, Anguilla btcoior bicaor. Anguilla rostrata, and Anguilla anguilla. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) fragments from A. japoniea (362 bp), A. bicolor bicctor (375 bp), A. rostrata (375 bp), and A. anguilla (375 bp) were isolated, sequenced, and converted to SCAR markers. The principal difference between the SCARs of A. japoniea and the three other species is the absence of a 13 bp deletion in the A. japoniea SCAR. Specific PCR primers amplified a 290 bp fragment for A. japoniea and 303 bp fragments for A. bicolor bicoior. A. rostrata, and A. anguilla. Restriction enzyme digestion with Taql, Mael, and Tru9l yielded PCR-RFLP patterns with differences that, when analyzed together, are sufficient for distinguishing each of the four eel species. In addition, RAPD fragments for A. japoniea (577 bp), A. bicoior bicoor (540 bp), A. rostrata (540 bp), and A. anguilla (509 bp) were also isolated and sequenced. The A. japoniea, A. bicoior blcoior. A. rostrata, and A. anguilla PCR products contain ten, nine, nine, and eight tandem repeats, respectively, of a 37 bp sequence. These results suggest that SCAR and PCR-RFLP markers and repeat numbers for specific loci will be useful for the identification of these four Anguilla eel species.
Islam, Azharul;Hao, Hong;Hossain, Mohammed Kamal;Rahman, Mahmudur
Journal of Forest and Environmental Science
/
v.38
no.1
/
pp.38-47
/
2022
Hymenodictyon orixensis (Roxb.) Mabberley (locally known as Bhutum in Bangladesh) is both an ecologically and economically valuable multipurpose tree species for afforestation and reforestation programs in Bangladesh. Seed germination and seedling development study of H. orixense were conducted to find out the response to different growing medium, e.g., polybag (15×10 cm (T0) and 20×15 cm (T1)), sand medium in propagator house (T2), conventional nursery bed (T3), and root trainer (T4) in the Nursery. Consequently, germination behavior and seedling morphological parameters of H. orixense were assessed. The results revealed that the sand medium of the propagator house (T2) provided the highest germination % (58.57±22.30) and the highest germination energy (11.43±2.43) followed by seedlings growing in 20×15 cm polybags (T1) containing forest topsoil and cow-dung at a ratio of 3:1. Except for germination energy, germination values, and germination capacity, other seed biology parameters, particularly imbibition, germination period, germination rate, and plant survival percent in T1, T2, T3, and T4 were significantly (p<0.05) different from T0. Each phenotypic parameter of seedlings and dry matter of shoot and root significantly differed from control except root length (p<0.992). Based on this study, Polybags of 20×15 cm size are regarded as the best medium for quality seedling development of H. orixense. The nursery bed (T3) had the lowest germination performance and developed more inferior quality seedlings. Thereby, 20×15 cm size of polybags with conventional soil and cow-dung media is recommended for maximum germination and to grow the quality seedlings of H. orixense in the Nursery.
Le Dinh Thao;Hyorim Choi;Yunhee Choi;Anbazhagan Mageswari;Daseul Lee;Seung-Beom Hong
The Plant Pathology Journal
/
v.39
no.4
/
pp.384-396
/
2023
Colletotrichum acutatum species complex is one of the most important groups in the genus Colletotrichum with a high species diversity and a wide range of host plants. C. acutatum and related species have been collected from different plants and locations in Korea and deposited into the Korean Agricultural Culture Collection (KACC), National Institute of Agricultural Sciences since the 1990s. These fungal isolates were previously identified based mainly on morphological characteristics, and a limitation of molecular data was provided. To confirm the identification of species, 64 C. acutatum species complex isolates in KACC were used in this study for DNA sequence analyses of six loci: nuclear ribosomal internal transcribed spacers (ITS), betatubulin 2 (TUB2), histone-3 (HIS3), glyceraldehyde3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), chitin synthase 1 (CHS-1), and actin (ACT). The molecular analysis revealed that they were identified in six different species of C. fioriniae (24 isolates), C. nymphaeae (21 isolates), C. scovillei (12 isolates), C. chrysanthemi (three isolates), C. lupini (two isolates), and C. godetiae (one isolate), and a novel species candidate. We compared the hosts of KACC isolates with "The List of Plant Diseases in Korea", previous reports in Korea and global reports and found that 23 combinations between hosts and pathogens could be newly reported in Korea after pathogenicity tests, and 12 of these have not been recorded in the world.
Soo Yeon Choi;You Kyoung Lee;Chang Ok Geum;Shinhwa Kim;Hyunjung Chung;Sang-Min Kim;Yong Hoon Lee
The Korean Journal of Mycology
/
v.51
no.4
/
pp.383-387
/
2023
Peanut plants showing mild wilt were found in fields of Iksan, Korea, in August 2021. The diseased peanut plants were collected, and the causal pathogens were isolated using potato dextrose agar (PDA) medium. The isolated IS-1 strain formed white mycelia on PDA, which turned black with age. Sclerotia were produced on the PDA and barley leaves laid on water agar 7 d after incubation at 30℃. The sequences of both the internal transcribed spacer (ITS) region and calmodulin gene of IS-1 showed a 100% similarity with that of Macrophomina phaseolina. A phylogenetic tree constructed using the ITS regions of fungal pathogens causing disease in peanut plants indicated that the IS-1 stain belongs to M. phaseolina. The inoculation of IS-1 sclerotia into peanut seedlings resulted in yellowing and wilt symptoms in aboveground plants and brown to dark rots in roots 35-40 d after inoculation. Overall, the morphological characteristics, molecular identification, and pathogenicity of IS-1 indicate that the causal pathogen is M. phaseolina. This is the first report of charcoal rot caused by M. phaseolina on peanut plants in Korea. Further study is needed to develop the control measures for charcoal rot in peanut plants.
Shinhwa Kim;Soo Yeon Choi;Hyunjung Chung;Nak Jung Choi;Bo Yoon Seo;Sang-Min Kim
The Korean Journal of Mycology
/
v.52
no.1
/
pp.55-60
/
2024
In August 2023, leaf spot disease was observed in peanuts in Cheongju-si, Korea. Leaf spots occurred at the leaf margins and the lesions gradually expanded. Diseased leaf areas were light or dark brown and irregular in shape. A fungal isolate was obtained from symptomatic leaf and cultured on potato dextrose agar (PDA) medium at 25℃. An isolate was identified as Colletotrichum sojae based on morphological characteristics and sequences of the internal transcribed spacers, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, chitin synthase-1, actin, and 𝛽-tubulin genes. Pathogenicity tests were performed on peanut seedlings in a conidial suspension (1×106 conidia/mL). Lesions were observed on the peanut leaf 5 d after inoculation. The pathogen was re-isolated from the lesions of the inoculated leaves. To the best of our knowledge, this is the first report of anthracnose on peanut caused by C. sojae in Korea.
The geotectonics and geomorphic structure of Korea resulted from the Song-rim Disturbance and the Daebo orogenic movements. Afterward this mountainous peninsula underwent several geological changes on a small scale, and it was also claimed that the steady rising of the elevated peneplain of the eastern coast and the submerging of the southwestern coastal area are largely due to the tilted block movement. These views have been generally accepted good in several ways, but they are limited in range or lacking in theoretical integration. The present writer investigated the geology of the Mt. Chi-ri-san and the Honam coal mining area for a geological map in 1965, respectively. The results of these studies convinced the present writer that the conventional views, which were based upon a theory of lateral pressure should be reconsidered in many respects, and more recent studies made it clear that the morphological development in the southwestern area can be better explained by the orogenic movement and rock control. The measurement of submerging speed of the western coastal area (Pak. Y. A., 1969) and a new account on the geology and tectonics of the Mid-central region of South Korea (Kim O.J., 1970) act as an encouragement to a new explanation. The present writer's researches on the extreme southwestern portion of the peninsula show that the steady submerging of this area cannot be attributed to a simple downthrown block phenomenon caused by block movement. It is no more than the result of the differential movement of uplifting in the eastern and western coastal areas and the rising of sea-level in the post-glacial period. This phenomenon could be easily explained by the comparison of the rate of rise in sea-level and amount of heat flow between Korea and other areas in the world. The existance of the erosional planes in the Sobaik-San ranges also provide an evidence of an upheaval in the western coast area. Though the Sobaik-San ranges largely follow the direction of the Sinian system. They consist of the numerous branches, whose trends run more or less differently from their main trend because of the disharmonic folding, are converged into Mt. Sobaik-San and Chupungryung. The undulation of the land is not wholely caused by orogenic movements, where as the present writer confirmed that the diversity of morphological development is the direct reflection of geological conditions such as rocks and processes which constitute the basic elements of geomorphic structure. An east-west directed mountain range which could be named as Hansan mountain range, was claimed to be oriented by the joint control. The geological conditions such as a special erosion and weathering of agglomerate and breccia tuff usually produce pot-hole like submarine features which cause the whirling phenomenon at the southwestern coast channel.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.