Sumon, Md Afsar Ahmed;Sumon, Tofael Ahmed;Hussain, Md. Ashraf;Lee, Su-Jeong;Jang, Won Je;Sharifuzzaman, S.M.;Brown, Christopher L.;Lee, Eun-Woo;Hasan, Md. Tawheed
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.32
no.6
/
pp.681-698
/
2022
The Nile tilapia Oreochromis niloticus, Atlantic salmon Salmo salar, rainbow trout Oncorhynchus mykiss, olive flounder Paralichthys olivaceus, common carp Cyprinus carpio, grass carp Ctenopharyngodon idella and rohu carp Labeo rohita are farmed commercially worldwide. Production of these important finfishes is rapidly expanding, and intensive culture practices can lead to stress in fish, often reducing resistance to infectious diseases. Antibiotics and other drugs are routinely used for the treatment of diseases and sometimes applied preventatively to combat microbial pathogens. This strategy is responsible for the emergence and spread of antimicrobial resistance, mass killing of environmental/beneficial bacteria, and residual effects in humans. As an alternative, the administration of probiotics has gained acceptance for disease control in aquaculture. Probiotics have been found to improve growth, feed utilization, immunological status, disease resistance, and to promote transcriptomic profiles and internal microbial balance of host organisms. The present review discusses the effects of single and multi-strain probiotics on growth, immunity, heamato-biochemical parameters, and disease resistance of the above-mentioned finfishes. The application and outcome of probiotics in the field or open pond system, gaps in existing knowledge, and issues worthy of further research are also highlighted.
In this study, a microbial risk assessment was performed for the bacteria Vibrio parahaemolyticus, which causes a foodborne illness following the consumption of Jeotgal, a fermented seafood in South Korea. The assessment comprised of six stages: product, market, home, consumption, dose-response, and risk. The initial contamination level (IC) was calculated based on the prevalence of V. parahaemolyticus in 90 Jeotgal samples. The kinetic behavior of V. parahaemolyticus was described using predictive models. The data on transportation conditions from manufacturer to market and home were collected through personal communication and from previous studies. Data for the Jeotgal consumption status were obtained, and an appropriate probability distribution was established. The simulation models responding to the scenario were analyzed using the @RISK program. The IC of V. parahaemolyticus was estimated using beta distribution [Beta (1, 91)]. The cell counts during transportation were estimated using Weibull and polynomial models [δ = 1 / (0.0718 - 0.0097 × T + 0.0005 × T2)], while the probability distributions for time and temperature were estimated using Pert, Weibull, Uniform, and LogLogistic distributions. Daily average consumption amounts were assessed using the Pareto distribution [0.60284,1.32,Risk Truncate(0,155)]. The results indicated that the risk of V. parahaemolyticus infection through Jeotgal consumption is low in South Korea.
Soil microorganism activity in an agricultural field is affected by various factors including climate conditions, soil chemical properties, and crop cultivation. In this study, we elucidate the correlation between microorganism activity and agricultural environment factors using the dehydrogenase activity (DHA) value, which is one of the indicators of soil microbial activity. As a result, the various factors noted above were related to the DHA value. Annual rainfall, soil Mg2+, bacterial and fungal diversities, types of crops, developmental stages, seasons, and cultivation status were highly correlated with the DHA value. Furthermore, next-generation sequencing (NGS) analysis was used to identify that the type of crop affected soil microbial compositions of both bacteria and fungi. Soil used for soybean cultivation showed the highest relative abundance for Verrucomicrobia, Planctomycetes, and Acidobacteria but Actinobacteria and Firmicutes had the lowest relative abundance. In the case of soil used for potato cultivation, Actinobacteria had the highest relative abundance but Proteobacteria had the lowest relative abundance. Armatimonadetes showed the highest relative abundance in soil used for cabbage cultivation. Among the fungal communities, Mortierellomycota had the highest relative abundance for soybean cultivation but the lowest relative abundance for cabbage cultivation; further, Rozellomycota, Chytridiomycota, and Cercozoa had the highest relative abundance for cabbage cultivation. Basidiomycota had the highest relative abundance for potato cultivation but the lowest relative abundance for soybean cultivation.
Min-Jin, Kwak;Min Young, Park;Ki-Peum, Sung;Hanbae, Lee;Kwang-Youn, Whang;Younghoon, Kim
Journal of Animal Science and Technology
/
v.64
no.6
/
pp.1092-1104
/
2022
Using antibiotics as growth promoter has been banned in poultry feed industry, thus various researchers try to seek an alternative to replace the growth-promoting antibiotics. In this study, we aimed to evaluate the growth performance via intestinal nutrient utilization and cecal microbial composition of broiler after dietary supplementation with most commonly using antibiotics, zinc bacitracin, and sophorolipid. A total of 180 1-day-old chicks were randomly assigned, and dietary treatment was as follow: CON, basal diet; ZB, 100 ppm of zinc bacitracin supplemented diet; and SPL, 250 ppm of sophorolipid supplemented diet. Their growth performance was evaluated and the samples of blood, small intestine, and ileal and cecal digesta were collected for biochemical, histological, and genomic analyses. The body weight and average daily gain of 7-day-old chicks were higher in ZB and those in overall experimental period were improved by ZB and SPL supplementation (p < 0.05). Their intestinal characteristics were not affected by dietary treatments in duodenum and ileum. Nonetheless, villus height was increased by SPL supplementation in jejunum (p < 0.05). Moreover, dietary SPL supplementation could down-regulate the expression level of pro-inflammatory cytokine, IL-1β (p < 0.05). mRNA levels of lipid and protein transporters did not differ among the treatments, however, relative expression levels of carbohydrate transporters, GLUT2 and SGLT1 were increased in broiler chicken's jejumum fed zinc bacitracin and sophorolipid supplemented diets (p < 0.05). Dietary zinc bacitracin supplementation could increase the population of Firmicutes in phylum level, and the portion of Turiciacter in genus level. On the other hands, the portion of Faecalibacterium was increased by dietary SPL supplementation compared to the other treatments. Our findings suggest that SPL supplementation improves growth performance through enhanced carbohydrate utilization capacity via improvement of gut morphological status and modulation of the cecal microbial population of broilers.
Han Hae Kim;Yeon Ji Kim;Kwang-Youn Kim;Chul Soo Shin;Jong-Won Yoon;Seon-min Jeon;Bo-Mee Kim;Jeongsu Bang;Kyungho Kim
The Korean Journal of Food And Nutrition
/
v.36
no.3
/
pp.193-201
/
2023
Prebiotics are known as components of intestinal microbiota that can improve and maintain human health status by stimulating the growth and activity of the intestinal tract as a method of controlling the intestinal environment. In this study, we examined whether 2'-fucosyllactose (FL) could affect intestinal microbial population and bowel activity. Water content and frequency of mouse feces were increased in the 2'-FL treated group at a high concentration (1,000 mg/kg), with brightness of the color enhanced and physical properties diluted. In addition, intestinal microbial analysis showed that harmful bacteria Clostridium and Staphylococcus strains were decreased and beneficial bacteria such as Lactobacillus strains were markedly increased in the group treated with a high concentration of 2'-FL compared to those in the control group. These findings suggest that administration of 2'-FL can maintain healthy bowel activity by reducing harmful bacteria population and improving diluted physical properties.
Yeuni Yu;Donghyun Han;Hyomin Kim;Yun Hak Kim;Dongjun Lee
Journal of Genetic Medicine
/
v.20
no.2
/
pp.52-59
/
2023
Purpose: Colorectal cancer (CRC) is a common malignancy worldwide and the second leading cause of cancer-related deaths. In addition, lymph node metastasis in CRC is considered an important prognostic factor for predicting disease recurrence and patient survival. Recent studies demonstrated that the microbiome makes substantial contributions to tumor progression, however, there is still unknown about the microbiome associated with lymph node metastasis of CRC. Here, we first reported the microbial and tumor-infiltrating immune cell differences in CRC according to the lymph node metastasis status. Materials and Methods: Using Next Generation Sequencing data acquired from 368 individuals diagnosed with CRC (N0, 266; N1, 102), we applied the LEfSe to elucidate microbial differences. Subsequent utilization of the Kaplan-Meier survival analysis enabled the identification of particular genera exerting significant influence on patient survival outcomes. Results: We found 18 genera in the N1 group and 3 genera in the N0 group according to CRC lymph node metastasis stages. In addition, we found that the genera Crenobacter (P=0.046), Maricaulis (P=0.093), and Arsenicicoccus (P=0.035) in the N0 group and Cecembia (P=0.08) and Asanoa (P=0.088) in the N1 group were significantly associated with patient survival according to CRC lymph node metastasis stages. Further, Cecembia is highly correlated to tumor-infiltrating immune cells in lymph node metastasized CRC. Concolusion: Our study highlights that tumor-infiltrating immune cells and intratumoral microbe diversity are associated with CRC. Also, this potential microbiome-based oncology diagnostic tool warrants further exploration.
In Korea, groundwater is main water source in livestock farms. Most dairy and cattle farms have constructed their own wells for human drinking and livestock farming. However, these private residential wells have not been controlled by government and also there was scant study about livestock drinking water quality. Therefore this study was to monitor of the livestock farms' groundwater quality in Korea. Water samples were collected at 123 dairy and cattle farms and were analysed forty six substances with quality standard for drinking water approved by the Minister of Environment. Seventy eight (63.4%) of 123 samples failed to drinking water stand a test. The most frequent contaminants were nitrate-nitrogen and microbial. 22.8% (n=28) of samples showed nitrate-N concentration of higher than 10 mg/L meant that can't be used drinking water for human and the Nitrate-N concentration analysed in the range of 0.2 to 61.2 mg/L. All of 78 failed to drinking samples had microbial problems, especially 5.7% (n=7) of samples indicated water could be contaminated by feces. Other contaminants detected were zinc and evaporation residue. Especially detected zinc concentration (32 mg/L) was about ten times higher than standard of zinc (3 mg/L). Regression analysis indicated that groundwater pH did not influence to nitrate-N concentration but the hardness and chloride could affect to nitrate-N concentration in the groundwater. Most livestock farms were adjacent to crop farmland in Korea. This could cause contamination of groundwater with nitrate-N and pesticide that could accumulate livestock product. Moreover Heavy metal such as zinc and copper could be released from a corrosive plated water pipe in livestock farm. Put together, Korea livestock system is indoor, not pasture-based, hence livestock could be exposed to potential contaminated water consistently. Therefore on the basis of these data, appropriate livestock drinking water quality standards should be prepared to keep livestock healthy and their product safe. Further, livestock drinking water quality should be monitored continuously in suitable livestock drinking water standards.
This study was performed to evaluate the microbial contamination level of meat processing in butcher's shops in Seoul from January to November in 2010. A total of 695 samples (112 cotton work gloves, 342 utensils and equipments, 241 meat samples) were collected and the environmental hygiene of 89 butcher's shops was investigated. The aerobic plate count (APC), E. coli and pathogenic bacteria such as Staphylococcus aureus, Salmonella spp. were tested in the samples. As a result, the level of count on APC ranged $0{\sim}2.2{\times}10^6\;CFU/cm^2$ from the utensils & equipments, $1{\times}10^2{\sim}2.7{\times}10^8$ CFU/glove from the cotton work gloves and $1{\times}10^2{\sim}9.3{\times}10^6$ CFU/g from the meat samples. The level of count on E. coli ranged $0{\sim}2.5{\times}10^3\;CFU/cm^2$ from the utensils, $0{\sim}8.6{\times}10^4$ CFU/glove from the cotton work gloves and $0{\sim}1.4{\times}10^5$ CFU/g from the meat samples, respectively. Staphylococcus aureus and Salmonella spp. were detected in 11 samples and 2 samples from the cotton work gloves, utensils & equipments, respectively. The sanitation standard operating procedure (SSOP) was applicated at 49 butcher's shops. In order to improve sanitation of meat in butcher's shops, in this study, applications of SSOP, systemic sanitation education for employees, hygenic control of utensils & equipments, and continuous monitoring for microorganisms will be required.
The biosorption process has been established as characteristics of dead biomasses of both cellulosic and microbial origin to bind metal ion pollutants from aqueous suspension. The high effectiveness of this process even at low metal concentration, similarity to ion exchange treatment process, but cheaper and greener alternative to conventional techniques have resulted in a mature biosorption technology. Yet its adoption to large scale industrial wastewaters treatment has still been a distant reality. The purpose of this review is to make in-depth analyses of the various aspects of the biosorption technology, staring from the various biosorbents used till date and the various factors affecting the process. The design of better biosorbents for improving their physico-chemical features as well as enhancing their biosorption characteristics has been discussed. Better economic value of the biosorption technology is related to the repeated reuse of the biosorbent with minimum loss of efficiency. In this context desorption of the metal pollutants as well as regeneration of the biosorbent has been discussed in detail. Various inhibitions including the multi mechanistic role of the biosorption technology has been identified which have played a contributory role to its non-commercialization.
Advances in silage technology, including precision chop forage harvesters, improved silos, polyethylene sheeting, shear cutting silo unloaders, and the introduction of total mixed rations, have made silage the principal method of forage preservation. A better understanding of the biochemistry and microbiology of the four phases of the ensiling process has also led to the development of numerous silage additives. Although acids and acid salts still are used to ensile low-DM forages in wet climates, bacterial inoculants have become the most widely used silage additives in the past decade. Commercial inoculants can assure a rapid and efficient fermentation phase; however, in the future, these products also must contribute to other areas of silage management, including the inhibition of enterobacteria, clostridia, and yeasts and molds. Nonprotein nitrogen additives have the problems of handling, application, and reduced preservation efficiency, which have limited their wide spread use. Aerobic deterioration in the feedout phase continues to be a serious problem, especially in high-DM silages. The introduction of competitive strains of propionic acid-producing bacteria, which could assure aerobically stable silages, would improve most commercial additives. New technologies are needed that would allow the farmer to assess the chemical and microbial status of the silage crop on a given day and then use the appropriate additive(s).
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.