FDG PET 영상에서 MTV는 종양의 전체 대사정도를 반영하여 종양의 체적을 나타낸다. 하지만 MTV는 영상재구성의 영향을 받게 된다. 본 연구의 목적은 팬텀실험을 통하여 영상재구성에 따라 SUVmax의 역치 값을 달리하여 실제 체적과 MTV의 상관관계를 평가해보고자 하였다. NEMA IEC Body 팬텀에 $^{18}F-FDG$를 구와 배후 방사능의 비율(4:1, 8:1, 10:1, 20:1)이 되도록 주입 후 영상을 획득하였다. 획득한 영상에 4가지 방법(OSEM3D, OSEM3D+PSF, OSEM3D+TOF, OSEM3D+TOF+PSF)으로 영상을 재구성한 후 다양한 SUVmax 역치 값을 적용하여 MTV의 변화를 비교해 보았다. 전반적으로 SUVmax 역치 값이 증가 할수록 MTV가 감소하였으며, 구와 배후방사능 비율이 증가할수록 동일한 SUVmax 역치 값에서 MTV가 감소하였다. PSF와 TOF+PSF재구성영상에서 40% 역치 값, OSEM3D와 TOF 재구성 영상에서는 45% 역치 값을 적용하였을 때 팬텀의 실제체적과 MTV의 높은 상관관계를 보였다. 이번 연구결과를 통하여 영상재구성에 따라 MTV 측정에 기초적인 자료로 제공되어 질 것으로 사료된다.
Localized in vivo 31P NMR spectroscopy was applied to evaluate the postmortem catabolism of high energy phosphates in rabbit skeletal muscle tissue. In the premortem processes all of the important high energy phosphate metabolites were characterized, and particularly phosphocreatine (PCr) resonance signal was the strongest. In the immediate phases of the postmortem processes the signal intensities of PCr, phosphomonoesters (PME), phosphodiesters(PDE), $\alpha$-, $\beta$- and ${\gamma}$-adenosine triphosphate (ATP) resonance began to decrease while the signal intensity of inorganic phosphorus (Pi) resonance began to increase. The present study suggests that localized in vivo 31P NMR spectroscopy may provide more precise biochemical information of the early postmortem period based on the metabolic alterations of phosphate. The unique ability of localized in vivo 31P NMR spectroscopy to offer noninvasive information about tissue biochemistry in animals as well as human may have an impact on thanatochronology and medicolegal science.
Gene set enrichment analysis (GSEA)는 두 개의 클래스를 가지는 마이크로어레이 실험 데이터 분석을 위해 생물학적 특징을 기반으로 구성된 다양한 유전자-집합 중에서 두 클래스의 발현값들이 통계적으로 중요한 차이를 나타내는 유의한 유전자-집합을 추출하기 위한 분석 방법이다. 특히, 유전자에 대한 다양한 생물학적인 정보를 지닌 유전자 주석 데이터베이스(Cytogenetic Band, KEGG pathway, Gene Ontology 등)를 이용하여 마이크로어레이 실험에 사용된 전체 유전자 중 특정 기능을 가지는 유전자들을 그룹화하여 다양한 유전자-집합을 발굴하고, 각 유전자-집합 내에서 두 클래스간에 발현값의 차이를 참조하여 유의한 유전자들을 결정하여, 이를 기반으로 통계적으로 유의한 유전자-집합들을 최종 검출하는 방법이다. 본 논문에서는 GSEA 분석 과정에서 현재 주로 사용되고 있는 signal-to-noise ratio 기반 유전자 서열화(gene ranking) 방법 대신에, Fisher criterion을 이용한 유전자 서열화 방법을 적용함으로써 기존의 GSEA 방법에서 추출하지 못한 생물학적으로 의미 있는 새로운 유의 유전자-집합을 추출하는 방법을 제안하고자 한다. 또한, 제안한 방법의 성능을 고찰하기 위하여 공개된 Leukemia 관련 마이크로어레이 실험 데이터 분석에 적용하였으며, 기존의 알려진 결과와 비교 분석함으로써 제안한 방법의 유용성을 검증하고자 하였다.
The response of IPTG induction was investigated through the monitoring of the alkali consumption rate and buffer capacity during the cultivation of recombinant E. coli BL21 (DE3) harboring the plasmid pRSET-LacZ under the control of lac promoter. The rate of alkali consumption increased along with cell growth, but declined suddenly after approximately 0.2 h of IPTG induction. The buffer capacity also declined after 0.9 h of IPTG induction. The profile of buffer capacity seems to correlate with the level of acetate production. The IPTG response was monitored only when introduced into the mid-exponential phase of bacterial cell growth. The minimum concentration of IPTG for induction, which was found out to be 0.1 mM, can also be monitored on-line and in-situ. Therefore, the on-line monitoring of alkali consumption rate and buffer capacity can be an indicator of the metabolic shift initiated by IPTG supplement, as well as for the physiological state of cell growth.
To evaluate the effect of obesity on serum leptin and insulin levels in 80 elementary school children (aged 10.8 yr, 47 boys, 33 girls), we collected the anthropometric data and measured serum leptin and insulin levels. Serum leptin level and insulin resistance are known as factors which are associated with obesity and obesity related diseases such as diabetes, cardiovascular disease, hypertension. The results were as follows. The serum levels of insulin (p<0.001), leptin (p<0.001) and HOM $A_{IR}$ (p<0.001) in obese group were significantly higher than those of other groups. The obesity indices correlated significantly to serum levels of insulin and leptin, but not to fasting glucose level. These results suggested that circulating leptin and insulin concentrations may act as a humoral signal indicator to adiposity-associated metabolic disorder in elementary school children.
Rhizobium and related genera are soil bacteria with great metabolic plasticity. These microorganisms survive in many different environments and are capable of eliciting the formation of nitrogen-fixing nodules on legumes. The successful establishment of symbiosis is precisely regulated and requires a series of signal exchanges between the two partners. Quorum sensing (QS) is a prevalent form of population density-dependent gene regulation. Recently, increasing evidence indicates that rhizobial quorum sensing provides a pervasive regulatory network, which plays a more generalized role in the physiological activity of free-living rhizobia, as well as during symbiosis. Several rhizobia utilize multiple, overlapping quorum sensing systems to regulate diverse properties, including conjugal transfer and copy number control of plasmids, exopolysaccharide biosynthesis, rhizosphere-related functions, and cell growth. Genomic and proteomic analyses have begun to reveal the wide range of functions under quorum-sensing control.
유전자의 생물학적 기능을 밝히고 세포 내 상호작용을 이해하는 것은 post-genome era의 가장 중요한 작업 중 하나이다. 세포는 서로 다른 컴포넌트들의 상호작용에 의해 아주 복잡한 네트워크를 구성한다. 생화학적 네트워크에는 metabolic, regulatory, signal transduction과 같은 세포의 프로세스를 포함한다. 이러한 생화학적 네트워크들은 서로 다른 정보체계를 가지고 각기 다른 데이터베이스에 분산되어 저장관리 되고 있다. 따라서 생화학적 네트워크 데이터를 체계적으로 효율적으로 저장, 관리하기 위한 데이터베이스에 대한 필요성이 증대되고 있다. 본 논문에서는 기존의 생화학적 네트워크 데이터베이스의 장.단점을 분석하고 객체지향 방식에 입각한 새로운 생화학적 네트워크 데이터의 통합을 위한 시스템 모델을 제시한다. 제안된 시스템 모델은 생화학적 네트워크 데이터에 대한 생물학전 관계를 자연스럽게 표현할 수 있는 객체지향 모델을 사용하였다. 또한 생화학적 네트워크 모델을 묘사하기 위한 응용프로그램 사이의 데이터 교환의 표준언어인 SBML[2]스키마를 기반으로 하고 있다.
Rheumatoid arthritis, osteoarthritis, and periodontal disease are bone destructive diseases mainly caused by inflammation. Various studies are being conducted to develop treatments for inflammatory bone destructive diseases. Many of these studies involve plant-derived natural compounds. In these studies, cell differentiation, signal transduction pathways, and bone resorption were measured at the cellular level. In disease-induced animal models, the amount of inflammatory mediators or matrix destructive enzymes and serum metabolic markers were measured. This study examined the effects of plant-derived natural compounds, such as flavonoids, on inflammatory bone destructive diseases. In addition, we structurally classified various substances used to maintain bone health and summarized the biological effects and related mechanisms of the components.
Although the Herba Cirsii is known to posses beneficial health effects, the anti-diabetic effects and the mechanism of action have not been elucidated. In the present study we have shown that Herba Cirsii Extract (HCE) can stimulate glucose uptake in OP9 adipocytes. Unlike insulin, HCE did not stimulate the Ser473 phosphorylation and activation of Akt. The increasing effects of HCE on glucose uptake were inhibited by PD680509 and compound C pretreatment, which means that the glucose uptake effects by HCE were carried out by extracelluar signal-regulated kinase1/2(ERK1/2) and AMP-activated protein kinase (AMPK) activation. Further studies revealed that HCE stimulated glucose transport occurs through a mechanism involving ERK1/2 activation and AMPK activation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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