• 제목/요약/키워드: Mechanistic model

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Emerging role of Hippo pathway in the regulation of hematopoiesis

  • Inyoung Kim;Taeho Park;Ji-Yoon Noh;Wantae Kim
    • BMB Reports
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    • 제56권8호
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    • pp.417-425
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    • 2023
  • In various organisms, the Hippo signaling pathway has been identified as a master regulator of organ size determination and tissue homeostasis. The Hippo signaling coordinates embryonic development, tissue regeneration and differentiation, through regulating cell proliferation and survival. The YAP and TAZ (YAP/TAZ) act as core transducers of the Hippo pathway, and they are tightly and exquisitely regulated in response to various intrinsic and extrinsic stimuli. Abnormal regulation or genetic variation of the Hippo pathway causes a wide range of human diseases, including cancer. Recent studies have revealed that Hippo signaling plays a pivotal role in the immune system and cancer immunity. Due to pathophysiological importance, the emerging role of Hippo signaling in blood cell differentiation, known as hematopoiesis, is receiving much attention. A number of elegant studies using a genetically engineered mouse (GEM) model have shed light on the mechanistic and physiological insights into the Hippo pathway in the regulation of hematopoiesis. Here, we briefly review the function of Hippo signaling in the regulation of hematopoiesis and immune cell differentiation.

Regorafenib prevents the development of emphysema in a murine elastase model

  • Kwangseok Oh;Gun-Wu Lee;Han-Byeol Kim;Jin-Hee Park;Eun-Young Shin;Eung-Gook Kim
    • BMB Reports
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    • 제56권8호
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    • pp.439-444
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    • 2023
  • Emphysema is a chronic obstructive lung disease characterized by inflammation and enlargement of the air spaces. Regorafenib, a potential senomorphic drug, exhibited a therapeutic effect in porcine pancreatic elastase (PPE)-induced emphysema in mice. In the current study we examined the preventive role of regorafenib in development of emphysema. Lung function tests and morphometry showed that oral administration of regorafenib (5 mg/kg/day) for seven days after instillation of PPE resulted in attenuation of emphysema. Mechanistically, regorafenib reduced the recruitment of inflammatory cells, particularly macrophages and neutrophils, in bronchoalveolar lavage fluid. In agreement with these findings, measurements using a cytokine array and ELISA showed that expression of inflammatory mediators including interleukin (IL)-1β, IL-6, and CXCL1/KC, and tissue inhibitor of matrix metalloprotease-1 (TIMP-1), was downregulated. The results of immunohistochemical analysis confirmed that expression of IL-6, CXCL1/KC, and TIMP-1 was reduced in the lung parenchyma. Collectively, the results support the preventive role of regorafenib in development of emphysema in mice and provide mechanistic insights into prevention strategies.

도로기초에서 교통 및 환경하중에 의한 비선형 현장응력 평가 (Evaluation of Traffic Load and Moisture-Induced Nonlinear In-situ Stress on Pavement Foundation Layers)

  • 박성완;황규영;정문경;서영국
    • 한국지반공학회논문집
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    • 제25권7호
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    • pp.47-54
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    • 2009
  • 도로하부에 대한 현장에서의 역학적인 거동에 대한 이해는 교통기반시스템의 장기공용성을 예측하는데 매우 중요하다. 이러한 현장거동에서 지반재료에 대한 회복변형 거동 정량화는 교통하중과 환경조건을 고려한 역학적인 해석이 필수적이다. 따라서 본 논문에서는 한국도로공사 시험도로에서 현장자료의 계측과 분석을 통하여 선택된 도로하부 입상재료에 대한 구성방정식을 활용한 비선형 재료거동과 응력을 예측 분석하고 이를 현장자료와 비교하고 검증하였다.

Development of FEMAXI-ATF for analyzing PCMI behavior of SiC cladded fuel under power ramp conditions

  • Yoshihiro Kubo;Akifumi Yamaji
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • 제56권3호
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    • pp.846-854
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    • 2024
  • FEMAXI-ATF is being developed for fuel performance modeling of SiC cladded UO2 fuel with focuses on modeling pellet-cladding mechanical interactions (PCMI). The code considers probability distributions of mechanical strengths of monolithic SiC (mSiC) and SiC fiber reinforced SiC matrix composite (SiC/SiC), while it models pseudo-ductility of SiC/SiC and propagation of cladding failures across the wall thickness direction in deterministic manner without explicitly modeling cracks based on finite element method in one-dimensional geometry. Some hypothetical BWR power ramp conditions were used to test sensitivities of different model parameters on the analyzed PCMI behavior. The results showed that propagation of the cladding failure could be modeled by appropriately reducing modulus of elasticities of the failed wall element, so that the mechanical load of the failed element could be re-distributed to other intact elements. The probability threshold for determination of the wall element failure did not have large influence on the predicted power at failure when the threshold was varied between 25 % and 75 %. The current study is still limited with respect to mechanistic modeling of SiC failure as it only models the propagation of the cladding wall element failure across the homogeneous continuum wall without considering generations and propagations of cracks.

생태계기반 연안관리를 위한 생태모델 개발방향에 대한 기술적 검토 - 새만금 외해역 및 금강 하구역 사례 (Technical Reviews on Ecosystem Modeling Approach and its Applicability in Ecosystem-Based Coastal Management in Saemangeum Offshore and Geum River Estuary)

  • 김해철;김용훈;장원근;류종성
    • 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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    • 제18권3호
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    • pp.233-244
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    • 2015
  • 생태계기반 관리를 위해서는 정책적 활용도가 높은 생태모델이 개발되어야 한다. 이러한 생태모델이 개발되기 위해서는 복잡한 생태적 과정에 대한 면밀한 이해가 우선되어야 하며, 생태학자, 모델개발자, 이해당사자 그리고 관리자 사이의 원활한 의사소통이 필수적이다. 본 논문에서는 해양생태모델의 이론적 배경, 미국과 유럽의 생태모델의 최근 기술동향, 그리고 새만금 및 금강 하구역을 대상으로 우리나라 환경현안을 다루기 위한 생태모델 개발방향을 제시하였다. 기술동향에서 소개된 내용은 역학모델 중심의 생태순환모델과 통계모델이며 이들의 정책 활용 잠재성을 토의하였다.

자소엽 및 자소자의 염증조절 활성 비교 (Effects of Perilla frutescens L. on anti-oxidant and anti-inflammation activity)

  • 손형우;허진철;서명선;이상한
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제17권5호
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    • pp.757-761
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    • 2010
  • 자소는 여러 질환을 치료하는 식물로 알려져 있는데, 본 연구는 자소 추출물을 이용하여 항산화 활성 및 항염증 활성을 알아보았다. 자소 추출물을 이용한 DPPH, FRAP 실험 결과, 농도에 따른 항산화 활성을 확인할 수 있었으며, 자소자 추출물의 경우 고온/고압 추출시 활성이 증가하는 것을 알 수 있었다. 마우스 동물모델을 이용한 항아토피활성 결과 귀와 상피의 비후를 감소시키고, 면역세포의 침투현상을 억제하는 것으로 나타났다. 이상의 결과로, 자소는 항산화 및 염증완화 소재로 이용할 수 있음을 확인하였다.

Ginsenoside Rg3 attenuates skin disorders via down-regulation of MDM2/HIF1α signaling pathway

  • Han, Na-Ra;Ko, Seong-Gyu;Moon, Phil-Dong;Park, Hi-Joon
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제45권5호
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    • pp.610-616
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    • 2021
  • Background: Thymic stromal lymphopoietin (TSLP) acts as a master switch for inflammatory responses. Ginsenoside Rg3 (Rg3) which is an active ingredient of Panax ginseng Meyer (Araliaceae) is known to possess various therapeutic effects. However, a modulatory effect of Rg3 on TSLP expression in the inflammatory responses remains poorly understood. Methods: We investigated antiinflammatory effects of Rg3 on an in vitro model using HMC-1 cells stimulated by PMA plus calcium ionophore (PMACI), as well as an in vivo model using PMA-induced mouse ear edema. TSLP and vascular endothelial growth factor (VEGF) levels were detected using enzyme-linked immunosorbent assay or real-time PCR analysis. Murine double minute 2 (MDM2) and hypoxia-inducible factor 1α (HIF1α) expression levels were detected using Western blot analysis. Results: Rg3 treatment restrained the production and mRNA expression levels of TSLP and VEGF in activated HMC-1 cells. Rg3 down-regulated the MDM2 expression level increased by PMACI stimulation. The HIF1α expression level was also reduced by Rg3 in activated HMC-1 cells. In addition, Rg3-administered mice showed the decreased redness and ear thickness in PMA-irritated ear edema. Rg3 inhibited the TSLP and VEGF levels in the serum and ear tissue homogenate. Moreover, the MDM2 and HIF1α expression levels in the ear tissue homogenate were suppressed by Rg3. Conclusion: Taken together, the current study identifies new mechanistic evidence about MDM2/HIF1α pathway in the antiinflammatory effect of Rg3, providing a new effective therapeutic strategy for the treatment of skin inflammatory diseases.

고추 풋마름병 예찰 모형 개발 (Development of a Forecasting Model for Bacterial Wilt in Hot Pepper)

  • 김지훈;김성택;윤성철
    • 식물병연구
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    • 제18권4호
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    • pp.361-369
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    • 2012
  • 고추 풋마름병 예찰을 위한 개체군 모형을 개발하였다. 이 모델은 포장에서 고추 시들음을 일으키는 풋마름병원균의 월동 후 1차 감염 시기를 예측할 수 있는 모델이다. 이 모델은 감염환 중 병원균의 밀도와 기주에서의 병원성에 관여하는 요인이 발병의 주요소라 가정하여 만든 것이다. 병원균 증식은 재배 지역 토양 내부와 기주뿌리 내부에서 모의하였다. 뿌리에서 풋마름병 발병에 영향을 주는 주된 환경요소는 온도 및 감염 초기의 병원균 밀도로 가정하였고, 이 두 요소의 액체 배양액에서 증식실험을 통해 정량화 하였다. 또한 고추묘에서 온도에 따라 발병이 얼마나 달라지는 정도를 실험실 실험을 통해 접종원의 감염 수준을 정량화하여 감염을 모의하는 발병모형을 만들었다. 토양에 서식하는 병원균은 400 cells/g이상에서 기주 뿌리에 성공적으로 침입하고 뿌리내에서 온도에 따라 증식하다가 $10^9$ cells/g 이상이면 최소 고사율에 도달하므로, 이 시기를 풋마름병이 최초 감염(1차 감염)되는 초발일로 추정하였다. 2010년과 11년 전국 기상청 종관관측 자료를 통해 풋마름병을 예측한 결과 2011년에 초발일은 대부분의 지역에서 7월 중순과 하순이었는데 이는 2010년에 비해 10-15일 빠른 것이었다. 또한 경기도 지역내에서 종관관측 자료와 실제 논과 과수원 포장 관측 기상 자료로 구동된 모델 초발일을 비교한 결과 포장 기상 자료의 초발일이 1-3일 빠르게 나타났다.

대륙이동설을 통해 살펴본 새로운 과학이론의 제안전략과 확립과정 (Proposal Strategy and Establishment Process of a New Scientific Theory Examined through the Theory of Continental Drift)

  • 오준영;이은주
    • 대한지구과학교육학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.20-33
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    • 2024
  • 이 연구의 목표는 지구과학의 혁명 과정으로 설명되는 20세기 베게너의 대륙이동을 정당화하는 과학자들의 과학 활동을 살펴보면서 새로운 과학 이론의 제안 전략과, 이론 선택의 과정이 어떻게 이루어지는지를 방법론적으로 분석하는데 있다. 베게너의 대륙 이동설 이전에는 지구는 정적인 지구모형으로 지각의 상하 운동만을 고려하였다. 하지만 대륙이동설은 지구의 동적 모형으로 지각의 수평운동을 제안하여, 수많은 문제들을 제거하였다. 따라서 이 연구는 현재의 판구조론이 형성되기까지 수많은 과학자들의 합리적인 활동을 탐색하고자 한다. 또한, 대륙이동설은 기존의 정적모형인 지구수축설과 충돌한다. 즉, 지구가 이미 완성되고, 고정되고, 불변하는 정적인 모델이 아닌, 지구가 생성되고 변화하는 역동적인 모델을 제시함으로써 기존의 기계론적 세계관에서 벗어난다. 이러한 결과, 옛 지질학은 약화되고 새로운 지구물리학이 탄생하게 되었다. 그리고 대륙이동설과 학문후속세대에 의한 지속적인 탐구는 지구과학의 혁명을 가져왔다. 이는 지구과학교육에서 학생들을 위한 다양한 방법론의 교육자료로서, 학생들의 세계관의 변화를 위한 교육 자료로서 좋은 탐구대상이라고 할 수 있다.

Walnut phenolic extracts reduce telomere length and telomerase activity in a colon cancer stem cell model

  • Shin, Phil-Kyung;Zoh, Yoonchae;Choi, Jina;Kim, Myung-Sunny;Kim, Yuri;Choi, Sang-Woon
    • Nutrition Research and Practice
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    • 제13권1호
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    • pp.58-63
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    • 2019
  • BACKGROUND/OBJECTIVES: Telomeres are located at the chromosomal ends and progressively shortened during each cell cycle. Telomerase, which is regulated by hTERT and c-MYC, maintains telomeric DNA sequences. Especially, telomerase is active in cancer and stem cells to maintain telomere length for replicative immortality. Recently we reported that walnut phenolic extract (WPE) can reduce cell viability in a colon cancer stem cell (CSC) model. We, therefore, investigated the effect of WPE on telomere maintenance in the same model. MATERIALS AND METHODS: $CD133^+CD44^+$ cells from HCT116, a human colon cancer cell line, were sorted by Fluorescence-activated cell sorting (FACS) and treated with WPE at the concentrations of 0, 10, 20, and $40{\mu}g/mL$ for 6 days. Telomere lengths were assessed by quantitative real-time PCR (qRT-PCR) using telomere specific primers and DNA extracted from the cells, which was further adjusted with single-copy gene and reference DNA ($ddC_t$). Telomerase activity was also measured by qRT-PCR after incubating the PCR mixture with cell protein extracts, which was adjusted with reference DNA ($dC_t$). Transcriptions of hTERT and c-MYC were determined using conventional RT-PCR. RESULTS: Telomere length of WPE-treated cells was significantly decreased in a dose-dependent manner ($5.16{\pm}0.13$ at $0{\mu}g/mL$, $4.79{\pm}0.12$ at $10{\mu}g/mL$, $3.24{\pm}0.08$ at $20{\mu}g/mL$ and $3.99{\pm}0.09$ at $40{\mu}g/mL$; P = 0.0276). Telomerase activities concurrently decreased with telomere length ($1.47{\pm}0.04$, $1.09{\pm}0.01$, $0.76{\pm}0.08$, and $0.88{\pm}0.06$; P = 0.0067). There was a positive correlation between telomere length and telomerase activity (r = 0.9090; P < 0.0001). Transcriptions of both hTERT and c-MYC were also significantly decreased in the same manner. CONCLUSION: In the present cell culture model, WPE reduced telomere maintenance, which may provide a mechanistic link to the effect of walnuts on the viability of colon CSCs.