• 제목/요약/키워드: Maximum likelihood procedure

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Estimation of Genetic Parameters and Trends for Length of Productive Life and Lifetime Production Traits in a Commercial Landrace and Yorkshire Swine Population in Northern Thailand

  • Noppibool, Udomsak;Elzo, Mauricio A.;Koonawootrittriron, Skorn;Suwanasopee, Thanathip
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권9호
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    • pp.1222-1228
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    • 2016
  • The objective of this research was to estimate genetic parameters and trends for length of productive life (LPL), lifetime number of piglets born alive (LBA), lifetime number of piglets weaned (LPW), lifetime litter birth weight (LBW), and lifetime litter weaning weight (LWW) in a commercial swine farm in Northern Thailand. Data were gathered during a 24-year period from July 1989 to August 2013. A total of 3,109 phenotypic records from 2,271 Landrace (L) and 838 Yorkshire sows (Y) were analyzed. Variance and covariance components, heritabilities and correlations were estimated using an Average Information Restricted Maximum Likelihood (AIREML) procedure. The 5-trait animal model contained the fixed effects of first farrowing year-season, breed group, and age at first farrowing. Random effects were sow and residual. Estimates of heritabilities were medium for all five traits ($0.17{\pm}0.04$ for LPL and LBA to $0.20{\pm}0.04$ for LPW). Genetic correlations among these traits were high, positive, and favorable (p<0.05), ranging from $0.93{\pm}0.02$ (LPL-LWW) to $0.99{\pm}0.02$ (LPL-LPW). Sow genetic trends were non-significant for LPL and all lifetime production traits. Sire genetic trends were negative and significant for LPL ($-2.54{\pm}0.65d/yr$; p = 0.0007), LBA ($-0.12{\pm}0.04piglets/yr$; p = 0.0073), LPW ($-0.14{\pm}0.04piglets/yr$; p = 0.0037), LBW ($-0.13{\pm}0.06kg/yr$; p = 0.0487), and LWW ($-0.69{\pm}0.31kg/yr$; p = 0.0365). Dam genetic trends were positive, small and significant for all traits ($1.04{\pm}0.42d/yr$ for LPL, p = 0.0217; $0.16{\pm}0.03piglets/yr$ for LBA, p<0.0001; $0.12{\pm}0.03piglets/yr$ for LPW, p = 0.0002; $0.29{\pm}0.04kg/yr$ for LBW, p<0.0001 and $1.23{\pm}0.19kg/yr$ for LWW, p<0.0001). Thus, the selection program in this commercial herd managed to improve both LPL and lifetime productive traits in sires and dams. It was ineffective to improve LPL and lifetime productive traits in sows.

Genetic and Non-genetic Factors Affecting Mortality in Lori-Bakhtiari Lambs

  • Vatankhah, M.;Talebi, M.A.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제22권4호
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    • pp.459-464
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    • 2009
  • Data and pedigree information for Lori-Bakhtiari sheep used in this study were 6,239 records of lamb mortality from 246 sires and 1,721 dams, collected from 1989 through 2007 from a Lori-Bakhtiari flock at Shooli station in Shahrekord. The traits investigated were cumulative lamb mortality from birth up to 7 days, up to 14 days, up to 21 days, and up to 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 and 12 months of age. The models included fixed factors that had significant effects and random direct genetic, maternal genetic and maternal permanent environmental effects. Variance components were estimated using the restricted maximum likelihood procedure applying three animal models with and without maternal and common environmental effects. The overall mean of cumulative lamb mortality rate was 22.95% from birth to 1 year of age, while the overall mortality rate up to 3 and from 3 to 6 months of age was 6.14% and 12.76%, respectively. The mortality rate after 6 months of age declined as the lambs grew older. The age of dam had no important effect on lamb mortality. The type of birth was more important during the preweaning period than at later ages, and lamb mortality rate was higher in twins. The year of birth, month of birth and sex of lamb significantly (p${\leq}$0.01) affected the cumulative lamb mortality rate at all ages. The least square mean of mortality during the final one-third of the lambing period was higher than the first and middle onethird of the lambing period. Male lambs were found to be at a higher risk of mortality than females. Birth weight of the lamb had a highly significant (p${\leq}$0.01) effect on lamb mortality at all ages as a quadratic regression. Direct and maternal heritability estimates of lamb mortality ranged from 0.01 to 0.13 and 0.01 to 0.05, respectively. Direct heritability increased with age of lamb, while maternal effects (genetic and common environmental) were important in the preweaning period. These results indicate that lamb mortality can be reduced first through farm management practices and secondly by genetic selection. Both animal and maternal effects should be considered in breeding programmes for reducing lamb mortality at preweaning.

중력식(重力式) 옹벽(擁壁)의 신뢰도(信賴度)에 관한 연구(研究) (Reliability Analysis of the Gravity Retaing Wall)

  • 백영식;이룡일
    • 대한토목학회논문집
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    • 제3권2호
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    • pp.127-135
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    • 1983
  • 옹벽(擁壁)의 안정해석(安定解析)에 있어, 신뢰도(信賴度)의 척도(尺度)로 종래(從來)의 안전율(安全率)(factor of safety) 대신 파괴확률(破壞確率)(probability of failure)이란 새로운 개념(槪念)을 도입(導入)하였다. 종래(從來)의 안정해석(安定解析)에 내포(內包)되어 있는 많은 불확실성(不確實性)(uncertainty)을 통계적(統計的) 처리(處理)에 의하여 합리적(合理的)으로 해석(解析)에 반영(反映)하고, simulation을 통하여 현실에 근사한 신뢰도(信賴度)(reliability)를 수치(數値)로 확인(確認)하였다. 흙의 강도정수(强度定數)(내부마찰각(內部摩擦角), 점착력(粘着力))는 일반(一般) Beta 분포(分布)를 따르는 확률변수(破率變數)로 취급(取扱)하였으며, 최우추정법(最尤推定法)에 의하여 구간(區間) [A, B]를 결정(決定)하였다. Rejection Method에 의해 Beta 분포(分布)를 따르는 난수(亂數)들을 생성(生成)하여 이에 대응(對應)하는 강도정수(强度定數)를 구(求)하는 방법(方法)을 제시(提示)하였다. 이렇게 하여 얻어진 강도정수(强度定數)를 써서, Monte Simulation 방법(方法)을 사용(使用)하여 다음과 같이 정의(定義)되는 옹벽(擁壁)의 파괴확률(破壞確率)을 구하였다. $$P_f=\frac{M}{N}$$ 여기서, N : simulation 여행(旅行) 회수(回數) M : simulation 결과(結果) 파괴회수(破壞回數) 상기(上記)한 해석방법(解析方法)에 따라 Computer Program을 개발(開發)하였으며, 예제(例題)를 개발(開發)된 Program으로 풀어 파괴확률(破壞確率)을 구하였다.

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계층적 Bayesian 모형 기반 지역빈도해석 모형 개발 (A Development of Regional Frequency Model Based on Hierarchical Bayesian Model)

  • 권현한;김진영;김운기;이정주
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제46권1호
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    • pp.13-24
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    • 2013
  • 본 연구에서는 계층적 Bayesian 기법을 이용한 새로운 지역빈도해석 모형을 개발하는데 목적이 있으며 이를 통해서 신뢰성 있는 매개변수를 추정과 동시에 지역빈도해석 절차의 불확실성 평가를 용이하게 접근할 수 있도록 하였다. 본 연구에서 제안되는 계층적 Bayesian 기반 지역빈도해석 모형(HBRFA)의 적합성을 평가하기 위해서 모의실험을 수행하였다. 즉, 10개의 모의 관측소를 대상으로 Monte-Carlo 모의를 통한 평가를 수행하였으며 전체적으로 HBRFA 모형이 기존 L-모멘트 방법에 비해 편의를 줄여주는 것으로 평가되었다. 특히 재현기간이 증가될수록 편의가 두드러지게 감소되는 것을 확인할 수 있었다. 전라북도의 6개 강우지점을 대상으로 HBRFA 모형과 기존 L-모멘트 기반 지역빈도해석 결과를 비교하였다. 계층적 Bayesian 모형의 특징을 평가하고자 매개변수의 Shrinkage 과정을 정량적으로 도출하여 제시하였으며 추정된 지역확률강수량이 기존 L-모멘트 기법과 유사한 결과를 갖는 것을 확인할 수 있었다. 더불어 빈도별 확률강수량의 불확실성을 정량적으로 제시할 수 장점을 확인할 수 있었다.

Accuracy of genomic-polygenic estimated breeding value for milk yield and fat yield in the Thai multibreed dairy population with five single nucleotide polymorphism sets

  • Wongpom, Bodin;Koonawootrittriron, Skorn;Elzo, Mauricio A.;Suwanasopee, Thanathip;Jattawa, Danai
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제32권9호
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    • pp.1340-1348
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    • 2019
  • Objective: The objectives were to compare variance components, genetic parameters, prediction accuracies, and genomic-polygenic estimated breeding value (EBV) rankings for milk yield (MY) and fat yield (FY) in the Thai multibreed dairy population using five single nucleotide polymorphism (SNP) sets from GeneSeek GGP80K chip. Methods: The dataset contained monthly MY and FY of 8,361 first-lactation cows from 810 farms. Variance components, genetic parameters, and EBV for five SNP sets from the GeneSeek GGP80K chip were obtained using a 2-trait single-step average-information restricted maximum likelihood procedure. The SNP sets were the complete SNP set (all available SNP; SNP100), top 75% set (SNP75), top 50% set (SNP50), top 25% set (SNP25), and top 5% set (SNP5). The 2-trait models included herd-year-season, heterozygosity and age at first calving as fixed effects, and animal additive genetic and residual as random effects. Results: The estimates of additive genetic variances for MY and FY from SNP subsets were mostly higher than those of the complete set. The SNP25 MY and FY heritability estimates (0.276 and 0.183) were higher than those from SNP75 (0.265 and 0.168), SNP50 (0.275 and 0.179), SNP5 (0.231 and 0.169), and SNP100 (0.251and 0.159). The SNP25 EBV accuracies for MY and FY (39.76% and 33.82%) were higher than for SNP75 (35.01% and 32.60%), SNP50 (39.64% and 33.38%), SNP5 (38.61% and 29.70%), and SNP100 (34.43% and 31.61%). All rank correlations between SNP100 and SNP subsets were above 0.98 for both traits, except for SNP100 and SNP5 (0.93 for MY; 0.92 for FY). Conclusion: The high SNP25 estimates of genetic variances, heritabilities, EBV accuracies, and rank correlations between SNP100 and SNP25 for MY and FY indicated that genotyping animals with SNP25 dedicated chip would be a suitable to maintain genotyping costs low while speeding up genetic progress for MY and FY in the Thai dairy population.

대퇴골 전자간 골절의 새로운 수술기법에 관한 생체역학적 분석 (A Biomechanical Study on a New Surgical Procedure for the Treatment of Intertrochanteric Fractures in relation to Osteoporosis of Varying Degrees)

  • 김봉주;이성재;권순용;탁계래;이권용
    • 대한의용생체공학회:의공학회지
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    • 제24권5호
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    • pp.401-410
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    • 2003
  • 본 연구에서는 유한요소법을 이용하여 대퇴골 전자간 골절 치료에 대한 다양한 수술기법을 골밀도 변화에 따라 생체역학적으로 분석하여 이를 평가하고자 한다. 이에 구현된 모델들은 압박 고관절 나사만을 이용하여 시술한 모델 (Type I), 삽입된 압박 고관절 나사 주위에 시멘트 영역을 확보한 뒤 골 시멘트로 보강하는 시술을 구현한 모델 (Type II),대학교추가의 골소실이 없이 시멘트를 가압하여 주입하는 시술을 구현한 모델 (TypeIII)의 3가지 형태로 구현하였다. 시술 상황에 따라 골절부위와 삽입물의 경계면 주위에 접촉요소를 사용하기 위해 적절한 마찰계수를 설정하였으며, 골다공증 정도 (Singh Indices, II∼V)에 따라 대퇴골의 물성치를 적절하게 적용시켰다. 각 모델에 있어 골밀도 변화에 따른 수술기법의 차이를 분석하기 위하여 다음과 같은 인자를 분석하였다 : (a) 대퇴골두 내에서의 von Mises 응력 부피비, (b) 대퇴골두 망상골과 인공 삽입물내에서의 최대 von Mises 응력 (PVMS), (c) 대퇴골두 내에서의 최대 von Mises 변형률 (MVMS), (d) 골절 부위와 인공 삽입물 주위에서의 미세운동량. 수술기법 중 Type III가 대퇴골두 내에서 골밀도 변화에 상관없이 가장 낮은 PVMS, MVMS 수치를 보여 가장 효율적인 결과를 나타내었다. 이는 기존 시술법 (Type I,II)에 비해 내고정 실패 가능성이 가장 적을 것으로 예측되었다. 특히, 골밀도가 낮을 때에는 Type III의 수술 효과가 더욱 커지는 것으로 나타났다. 또한, 삽입물 주위에서 미세운동량을 분석한 결과, Type III의 수치가 다른 시술법들의 15∼20%로 나타나 시멘트를 가 압하여 보강하는 시술법이 삽입물 주위의 미세운동을 억제하는데 있어 가장 효과적이다는 것을 증명하는 것이다. 이러한 결과로부터, 압박 고관절 나사를 이용한 대퇴골두 전자간 골절 치료에 있어 골 시멘트를 가압하여 보강하는 방법이 골밀도가 낮은 환자에 있어 인공삽입물의 내고정 및 골유합에 가장 큰 효과를 보일 것으로 사료된다.

문화관광축제 방문객의 평가속성 만족과 행동의도에 관한 연구 - 2006 광주김치대축제를 중심으로 - (The Effects of Evaluation Attributes of Cultural Tourism Festivals on Satisfaction and Behavioral Intention)

  • 김정훈
    • 마케팅과학연구
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    • 제17권2호
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    • pp.55-73
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    • 2007
  • 문화관광축제는 전국의 지역축제 가운데 광역시 도에서 추천한 축제 가운데 관광상품성이 크고, 경쟁력 있는 우수한 축제를 선정하여 지원하는 사업이다. 문화관광축제 종합평가계획(문화관광부, 2006)에 의하면 방문객의 만족도 평가, 전문위원 평가, 그리고 축제 개선실적 등을 감안하여 최우수축제, 우수축제, 유망축제, 예비축제로 선정되고 있다. 특히 예비축제를 제외한 문화관광축제는 공공부문의 사업비 지원을 받기 때문에 1,000여 개가 넘는 지역축제의 방문객 만족도 평가는 상호비교가 가능한 평가척도를 이용하여 종합평가분석이 이루어진고 있다. 이러한 견지에서 본 연구에서는 문화관광축제 공통평가속성이 방문객 만족과 사후행동의도에 미치는 영향관계를 파악하여, 향후 축제기획 시 방문객 만족도 제고와 지속가능한 문화관광축제로 선정되기 위한 시사점을 제시하였다. 본 연구에서는 이론연구를 통하여 문화관광축제 평가속성, 만족, 그리고 행위의도에 관한 변수를 도출하였으며, 2006 광주김치대축제 방문객을 대상으로 실증분석을 수행하였다. 문화관광축제 평가속성에 대한 요인분석을 통하여 홍보안내, 행사내용, 기념품 음식, 편의시설 요인을 도출하였으며, 축제방문객 만족과 행동의도와의 관계를 분석하였다. 연구모형을 통해 수립한 연구가설은 차이분석, 회귀분석, 공분산 구조분석 등을 통해 검증하였으며, 연구결과 모든 가설은 채택되었다. 향후 본 연구결과를 바탕으로 본 축제와 성격이 유사한 축제방문객 분석을 통한 비교연구를 기대한다.

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지능형 변동성트레이딩시스템개발을 위한 GARCH 모형을 통한 VKOSPI 예측모형 개발에 관한 연구 (A Study on Developing a VKOSPI Forecasting Model via GARCH Class Models for Intelligent Volatility Trading Systems)

  • 김선웅
    • 지능정보연구
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    • 제16권2호
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    • pp.19-32
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    • 2010
  • 학계와 금융파생상품 가격결정이나 변동성매매와 같은 실무영역 모두에서 주식시장의 변동성은 중요한 역할을 한다. 본 연구는 GARCH 모형에 기초하여 한국주식시장의 변동성을 정확히 예측함으로써 변동성매매시스템의 성과를 높일 수 있는 새로운 방법을 제시하였다. 특히, 여러 연구 자료에서 밝혀지고 있는 변동성 비대칭성개념을 도입하였다. 최근 새로 개발된 한국주식시장 변동성 지수인 VKOSPI를 변동성 대용값으로 사용한다. VKOSPI는 KOSPI 200 지수옵션의 가격을 이용하여 계산된 값으로서 옵션딜러들의 변동성 예측치를 반영하고 있다. KOSPI 200 옵션시장은 1997년 시작되었으며, 발전을 거듭하여 현재 하루 거래량이 1,000만 계약을 넘어서면서 세계 최고의 지수옵션시장으로 발전하였다. 이러한 옵션시장에 반영된 변동성을 분석하는 것은 투자자들에게 좋은 투자정보를 제공하게 될 것이다. 특히, 변동성 대용값으로 VKOSPI를 사용하면 다른 변동성 대용치를 사용할 때 발생하는 통계적 추정의 문제를 피해 갈 수 있다. 본 연구는 2003년부터 2006년의 KOSPI 200 지수 일별자료를 대상으로 최우도추정방법(MLE)을 이용하여 GARCH 모형을 추정한다. 비대칭 GARCH 모형으로는 Glosten, Jagannathan, Runke의 GJR-GARCH 모형, Nelson의 EGARCH 모형, 그리고 Ding, Granger, Engle의 PARCH모형을 포함하며 대칭 GARCH 모형은 (1, 1) GARCH 모형을 이용한다. 2007년부터 2009년까지의 KOSPI 200 지수 일별자료를 대상으로 반복적 계산과정을 통해 내일의 변동성 예측값과 오르고 내리는 변화방향을 예측하였다. 분석 결과 시장변동성과 예기치 않은 주가변동 사이에는 음의 상관관계가 존재하며, 음의 주가변동은 동일한 크기의 양의 주가변동보다 훨씬 더 큰 변동성의 증가를 가져옴을 알 수 있다. 즉, 한국 주식시장에도 변동성 비대칭성이 존재함을 보여주었다. GARCH 모형을 이용하여 내일의 VKOSPI의 등락방향을 예측하고 이를 이용하여 변동성 매매시스템을 개발하였다. 내일의 변동성이 상승할 것으로 예측되면 스트래들매수전략을 이용하고 반대로 변동성이 하락할 것으로 예측되면 스트래들 매도전략을 이용한다. 변동성의 변화방향성을 맞춘 경우에는 VKOSPI 변동분을 더하고 틀린 경우에는 변동분을 뺀 누적합을 이용하여 변동성매매전략의 총수익을 계산한다. 모형추정용 자료구간의 경우 통계적 기준인 MSPE 기준으로는 PARCH 모형의 적합도가 가장 높고, 예측방향의 적중도를 재는 MCP 기준으로는 EGARCH 모형이 가장 높은 값을 보여주었다. 테스트용 자료구간의 경우에는 PARCH 모형이 모형적합도와 내일의 변동성 등락방향 예측에서 가장 좋은 결과를 보여주었다. 모형추정용 자료구간의 경우 GARCH 모형 전체에서 매매이익을 기록하고 있고 테스트용 자료구간의 경우에는 EGARCH 모형을 제외한 GARCH 모형들이 매매이익을 보여주었다. 본 연구에서 나타난 변동성의 군집과 비대칭성 현상으로부터 변동성에 비선형성이 존재함을 알 수 있었으며, 비선형성에서 좋은 결과를 보이고 있는 인공지능시스템과 비대칭 GARCH 모형을 결합한다면 제안된 변동성매매시스템의 성과를 많이 개선할 수 있을 것으로 판단된다.