KIM KWON-JONG;EOM SEUNG-HEE;LEE SANG-PYO;JUNG HEE-SUN;KAMOUN SOPHIEN;LEE YOUN SU
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.15
no.3
/
pp.502-509
/
2005
Sexual reproduction plays an important role in the biology and epidemiology of oomycete plant pathogens such as the heterothallic species Phytophthora infestans. Recent worldwide dispersal of A2 mating type strains of P. infestans resulted in increased virulence, gene transfer, and genetic variation, creating new challenges for disease management. To develop a genetic assay for mating type identification in P. infestans, we used the Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique. The primer combination E+AT/M+CTA detected a fragment specific to A1 mating type (Mat-A1) of P. infestans. This fragment was cloned and sequenced, and a pair of primers (INF-1, INF-2) were designed and used to differentiate P. infestans Mat-A1 from Mat-A2 strains. The Mat A1-specific fragment was detected using Southern blot analysis of PCR products amplified with primers INF-1 and INF-2 from genomic DNA of 14 P. infestans Mat-A1 strains, but not 13 P. infestans Mat-A2 strains or 8 other isolates representing several Phytophthora spp. Southern blot analysis of genomic DNAs of P. infestans isolates revealed a 1.6 kb restriction enzyme (EcoRI, BamHI, AvaI)-fragment only in Mat-A1 strains. The A1 mating type-specific primers amplified a unique band under stringent annealing temperatures of $63^{\circ}C-64^{\circ}C$, suggesting that this PCR assay could be developed into a useful method for mating type determination of P. infestans in field material.
Park, Young-Sun;Jang, Jae-Hee;Bae, Bok-Sun;Seo, Jung-Sook
Nutritional Sciences
/
v.3
no.1
/
pp.3-10
/
2000
The present study was aimed at investigating the nutritional and physiological significance of rice bran as a source of dietary fiber as compared to pectin and wheat bran. The parameters for comparison included hypertrophy and morphology of intestines, stool weights and villus marker enzyme activity. For 6 weeks, 10 Sprague Dawley male rats were given one of six experimental diets: 1% cellulose control (CC), 5% pectin (P5), 5% rice bran(RB5), 10% rice bran(RB10), 5% wheat bran (WB5) or 10% wheat bran (WB10) based on the level of dietary fiber. Among experimental groups, food efficiency ratio and body weight gain was comparable. RB10 increased cecal and colonic tissue weights and content weights of cecum and colon as much as P5 did. Stool weight was positiviely correlated with colonic tissue weight (r=0.727, P<0.001), with colonic content weight(r=0.647, P<0.001). Small intestine length increased most in the P5 group, followed by the RB10 group. The scanning electron micrograph of jejunal villi from rice bran groups showed a leaf-shaped, smooth and regular pattern, whereas that of CC group produced a rather long shape. The wheat bran groups showed an irregular leafshaped pattern, and the pectin group typically produced leaf-shaped villi with surface damage. The activities of villus marker enzymes (maltase and sucrase) were higher in the bran-fed rats than in the control or pectin-fed rats. The results indicate than not only dietary fiber amounts but also fiber sources are closely related to the physiology and morphology of the large and small intestines in rats. Rice bran exerted effects on fecal output and trophic effects on the intestines similar to those of pectin.
Background/Aims: Cyclooxygenase-2 (COX-2), 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH), and microsomal prostaglandin E synthase-1 (mPGEs-1) regulate prostaglandin $E_2$ ($PGE_2$) expression and are involved in colon carcinogenesis. We investigated the expression of $PGE_2$ and its regulating genes in sporadic human colon tumors and matched normal tissues. Methods: Twenty colonic adenomas and 27 colonic adenocarcinomas were evaluated. COX-2 and 15-PGDH expression was quantified by real-time polymerase chain reaction. The expression of $PGE_2$ and mPGEs-1 was measured using enzyme-linked immunosorbent assay and Western blotting, respectively. Results: The expression of COX-2, mPGEs-1, and $PGE_2$ did not differ between the adenomas and matched distant normal tissues. 15-PGDH expression was lower in adenomas than in the matched normal colonic tissues (P<0.001). In adenocarcinomas, mPGEs-1 and $PGE_2$ expression was significantly higher (P<0.001 and P=0.020, respectively), and COX-2 expression did not differ from that in normal tissues (P=0.207). 15-PGDH expression was significantly lower in the normal colonic mucosa from adenocarcinoma patients than in the normal mucosa from adenoma patients (P=0.018). Conclusions: Early inactivation of 15-PGDH, followed by activation of COX-2 and mPGEs-1, contributes to $PGE_2$ production, leading to colon carcinogenesis. 15-PGDH might be a novel candidate marker for early detection of field defects in colon carcinogenesis.
The aerial parts of Eclipta prostrata is used as a traditional medicine and vegetable. In traditional folk medicine, it is used for treatment of hemorrhages, hepatic, disease, renal injuries, hair loss, tooth mobility, and viper bites. In this study, ten compounds (1 - 10) were isolated from the aerial parts of E. prostrata. A reliable high performance liquid chromatography equipped with photometric diode array detector (HPLC-PDA) method was developed to simultaneously quantitate 10 marker compounds [chlorogenic acid (1), paratensein 7-O--ᴅ-glucoside (2), quercetin 7-O--ᴅ-glucoside (3), luteolin 7-O--ᴅ-glucoside (4), apigenin 7-O--ᴅ-glucoside (5), apigenin 4'-O--ᴅ-glucoside (6), apigenin (7), luteolin (8), wedelolactone (9), and paratensein (10)]. In addition, compounds 5 and 6 showed considerable inhibitory effects against protein-tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) enzyme. Moreover, compounds 6 - 8, and 10 exhibited potent α-glucosidase inhibitory effects with IC50 values of 24.5 ± 1.9, 33.0 ± 0.5, 45.5 ± 0.1, and 23.8 ± 1.0 µM, respectively. All compounds (1 - 10) showed considerable acetylcholinesterase (AChE) inhibitory effects with IC50 ranging from 30.1 to 75.2 µM.
Lipoxygenase gives soybeans their grassy flavor, which can disrupt food processing efficiency. This study aimed to identify soybean genotypes with lipoxygenase deficiency among 1,001 soybean accessions and to develop kompetitive allele specific PCR (KASP) markers that can detect lipoxygenase mutations. Three lipoxygenase isozymes (Lox1, Lox2, and Lox3) were analyzed using a colorimetric assay based on a substrate-enzyme reaction. Among the 1,001 accessions examined, two (IT160160 and IT276392) exhibited a deficiency solely in Lox1, and one (IT269984) lacked both Lox1 and Lox2. IT160160 had a 74-bp deletion in exon 8 of Lox1 (Glyma13g347600), whereas IT276392 displayed a missense mutation involving the change of C to A at position 2,880 of Lox1. Moreover, we successfully developed four KASP markers that specifically target Lox1, Lox2, and Lox3 mutations. To validate the Lox1 KASP markers, we used two F2:3 populations generated through a cross between Daepung 2 (lipoxygenase wild type, maternal parent), IT160160, and IT276392 (null Lox1, paternal parent). The results revealed that the Daepung 2 × IT160160 group followed the expected 3:1 ratio according to Mendel's law, whereas the Daepung 2 × IT276392 group did not. Furthermore, a comparison between the colorimetric and KASP marker analyses results revealed a high agreement rate of 96%. KASP markers offer a distinct advantage by allowing the distinction of heterozygous types independent of other variables. As a result, we present an opportunity to expedite the lipoxygenase-deficient cultivar development.
This study was designed to examine the factors affecting in fertilization and development of embryos in vitro, and to examine whether zone drilling by laser irradiation can improve the hatching rate of IVF embryos from DNA marker-proved Hanwoo. DNA markers related to marbling score were identified using DNA fingerprinting with Ml3 probe and restriction enzyme Hae III. Oocytes were aspirated from immature ovarian follicles using a combined method of rectal ovarian-palpation and transvaginal ultrasound-guidance(6.5MHz) under local anesthesia. The aspirated oocytes were washed twice with fresh D-PBS containing 5% FBS and were rewashed 4 to 5 times with TCM-199 containing 5% FBS. A morphological grade of I to IV was assigned to each oocyte. Data were analyzed using the GLM procedure of SAS. Sperm separation methods did not have any significant effect on cleavage or developmental abilities of IVF embryos. Significantly(P<0.05) higher cleavage rate was observed in embryos from GI(60.0%, 3/5), GII(69.2%, 18/26) and GIII(62.1%, 59/95) compared to embryos from GIV oocytes(36.2%, 25/69). And the developmental rate to blastocyst stage was higher(P<0.05) in embryos from GI(33.3%, 1/3) and GII oocytes(38.9%, 7/18) than those from GIII(16.9%,10/59) and GIV oocytes(4.0%, 1/25). There was no significant difference in development of IVF embryos to blastocyst by media for in vitro culture. Proportion of hatched blastocyst was significantly(P<0.05) higher in embryos received zona drilling by laser than those of non-drilled.
This study was designed to establish the superior method for IVF embryos from DNA marker-proved Hanwoo cattle. DNA markers related to marbling score were identified using DNA fingerprinting with Ml3 probe and restriction enzyme Hae III. Oocytes were aspirated from unstimulated. immature ovarian follicles using a combined method of rectal ovarian-palpation and transvaginal ultrasound-guidance(6.5MHz) under local abesthesia. The aspirated oocytes were washed twice with fresh D-PBS containing 5% FBS and were rewashed 4 to 5 times with TCM-199 containing 5% FBS. A morphological grade of I to IV was assigned to each oocyte. Data were analysed using the GLM procedure of SAS. Mean number of follicles identified on ultrasound was 5.5 $\pm$2.9 in right and 4.3 $\pm$2.8 in left ovaries, respectively. The highest follicles(16.6$\pm$2.6) were found in 5101 cow compared to others. Recovery rate of follicular oocytes in individual cow was highest in 5101 cow with 89.3% in > 2mm and 94.0% in $\leq$ 2mm follicles. Total recovery rate was significantly(P<0.01) higher in $\leq$ 2mm(85.7%, 130/154) than > 2mm follicles(74.2%, 201/271). Significantly more oocytcs of Grade IV were recovered from > 2mm follicles. Mean number follicles recovered was 4.8$\pm$3.7. 3.0$\pm$3.4 and 0.3$\pm$0.6 in $\leq$2mm, 2~6mm and $\geq$6mm follicles. respectively. Our results imply that the more fertilizablc oocytes can be recovered from invisible-immature follicles by the combination of simultaneous rectal ovarian-palpation and ultrasound-guided approach in Hanwoo cattle.
Isozyme variations in 4 enzyme systems in Pinus densiflora for. multicaulis in 31 individual trees collected throughout the country were studied by starch gel electrophoresis using haploid megagametophyte tissue to compare with those of Pinus densiflora. A minimum of 7 loci were found to code for isozymes of the enzyme systems. No variation was found at locus GOT-A; at the remaining 6 variable loci(GDH-A, GOT-B, GOT-C, IDH-A, LAP-,A, LAP-B) and 2 to 4 alleles were identified. We could not find any marker alleles to distinguish Pinus densiflora for. multicaulis from Pinus densiflora at the isozymes studied here. Allele frequency distributions at each loci were almost all the same as those of P. densiflora. The percentage of polymorphic loci(99% level), the number of alleles per locus, the observed and expected heterozygosities were 85.7, 2.3, 0.165 and 0.186%, respectively. The level of genetic diversity in Pinus densiflora for. multicaulis seemed to be less than that of P. densiflora.
Seo, Back-Won;Kim, Hee-Kyoung;Lee, Yin-Won;Yun, Sung-Hwan
The Plant Pathology Journal
/
v.23
no.2
/
pp.51-56
/
2007
A plant pathogenic fungus, Gibberella zeae (anamorph: Fusarium graminearum), not only generates economic losses by causing disease on cereal grains, but also leads to severe toxicosis in human and animals through the production of mycotoxins in infected plants. Here, we characterized a histidine auxotrophic mutant of G. zeae, designated Z43R1092, which was generated using a restriction enzyme-mediated integration (REMI) procedure. The mutant exhibited pleiotropic phenotypic changes, including a reduction in mycelial growth and virulence and loss of sexual reproduction. Outcrossing analysis confirmed that the histidine auxotrophy is linked to the insertional vector in Z43R1092. Molecular analysis showed that the histidine requirement of Z43R1092 is caused by a disruption of an open reading frame, designated GzHIS7. The deduced product of GzHIS7 encodes a putative enzyme with an N-terminal glutamine amidotransferase and a C-terminal cyclase domain, similar to the Saccharomyces cerevisiae HIS7 required for histidine biosynthesis. The subsequent gene deletion and complementation analyses confirmed the functions of GzHIS7 in G. zeae. This is the first report of the molecular characterization of histidine auxotrophy in G. zeae, and our results demonstrate that correct histidine biosynthesis is essential for virulence, as well as sexual development, in G. zeae. In addition, our results could provide a G. zeae histidine auxotroph as a recipient strain for genetic transformation using this new selectable marker.
Noh, Gyu Pyo;Byun, Sung Hui;Jung, Dae Hwa;Lee, Jong Rok;Park, Sook Jahr;Kim, Sang Chan
Herbal Formula Science
/
v.28
no.4
/
pp.327-337
/
2020
Objective : Citri Unshius Pericarpium is the dried peel of mature fruit of Citrus unshiu Markovich and has been used to treat indigestion, vomiting, and removal of phlegm. This study investigated the hepatoprotective and antioxidant effect of CEE (Ethanol extract of Citri Unshius Pericarpium) in cadmium (CdCl2)-treated HepG2 cells. Methods : Component analysis of Citri Unshius Pericarpium was analyzed by UPLC with C18 column. Cell viability was determined by MTT assay. The enzyme activity of superoxide dismutase (SOD) and the level of reactive oxygen species (ROS) and reduced glutathione (GSH) were analyzed using commercially available kits. Results : Cadmium caused severe HepG2 cell death. Cadmium also increased ROS production, consistent with depletion of GSH and inhibition of the SOD enzyme. However, CEE treatment reduced cell death and relieved oxidative stress caused by cadmium toxicity. CEE lowered ROS levels and improved depletion of GSH levels. CEE also enhanced the enzymatic activity of SOD. In component analysis, hesperidin was the most abundant of the five marker compounds (Narigenin, Narigin, Narirutin, Hesperidin and Hesperidin), which assumes that hesperidin partially contributed to the antioxidant activity of CEE. Conclusion : These results suggested that CEE could be a potential substance to solve heavy metal-related health problems. In particular, inhibition of oxidative stress by CEE can be a way to treat liver damage caused by cadmium.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.