KIPS Transactions on Software and Data Engineering
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v.5
no.2
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pp.69-78
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2016
Ischemic stroke is a disease that the brain tissues cannot function by reducing blood flow due to thrombosis or embolisms. Due to the nature of the disease, it is most important to identify the status of cerebral vessel and the medical images are necessarily used for its diagnosis. Among many indicators, brain MRI is most widely utilized because experts can effectively obtain the semantic information such as cerebral anatomy aiding the diagnosis with it. However, in case of emergency diseases like ischemic stroke, even though a intelligent system is required for supporting the prompt diagnosis and treatment, the current systems have some difficulties to provide the information of medical images intuitively. In other words, as the current systems have managed the medical images based on the basic meta-data such as image name, ID and so on, they cannot consider semantic information inherent in medical images. Therefore, in this paper, to provide core information like cerebral anatomy contained in brain MRI, we suggest a template-driven medical images mapping method. The key idea of the method is defining the mapping characteristics between anatomic feature and representative images by using template images that can be representative of the whole brain MRI image set and revealing the semantic relations that only medical experts can check between images. With our method, it will be possible to manage the medical images based on semantic.
Lim, Kang-Taek;Park, Se-Hyuck;Shin, Dong-Ik;Cho, Byung Moon;Oh, Sae Moon;Hwang, Do Yun
Journal of Korean Neurosurgical Society
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v.29
no.1
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pp.113-117
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2000
Objective : Asymptomatic cyst of the pineal gland is a common incidental finding in adults on computerized tomography or magnetic resonance image(MRI) or at postmortem examination. This study was conducted to identify MRI findings of the benign pineal cysts and to determine the proper management of asymptomatic pineal cysts. Methods : From January 1995 to March 1999, 13 cases of asymptomatic pineal cysts were diagnosed incidentally on MRI. The mean age of the patients at diagnosis was 43 years(ranged 8 to 69 years). Five patients were females and eight patients were males. We analyzed the clinical presentations and MRI findings. Results : Clincal features were not related to pineal cysts in all 13 cases included posttraumatic headache in seven cases, headache related to brain tumor in two cases, one of facial palsy, one of diabetic neuropathy, and two of other diseases. MRI demonstrated a well-demarcated mass lesion(mean 1.3cm in diameter) of low signal intensity on T1-weighted images and high signal intensity on T2-weighted images. Gadolinium-enhanced MRI, performed in 10 cases, demonstrated a rim enhancement. Hydrocephalus was not present in all cases. Follow-up MRI(ranged 12 to 36 months) obtained in 3 of the 13 patients showed stability of cyst size. After symptomatic treatment, presenting symptoms were resolved in all patients and symptom related to pineal cysts have not been developed during follow up period(mean 27 months). Conclusion : The long-term behavior of asymptomatic pineal cysts is still unknown. But we advocate conservative management of these benign pineal cysts that may be developmental variants of normal pineal gland.
In this paper, an algorithm that can define the threshold value automatically proposed in order to detect a brain ventricle in MRI brain images. After the wavelet transform, edge sharpness, which means the average magnitude of detail signals on the contour of the object, was computed by using the magnitude of horizontal and vertical detail signals. The contours of a brain ventricle were detected by increasing the threshold value repeatedly and computing edge sharpness. When the edge sharpness became maximal, the optimal threshold was determined, and the detection of a brain ventricle was accomplished finally. In this paper, we compared the proposed algorithm with the geodesic active contour model numerically and verified the efficiency of the proposed algorithm by applying real MRI brain images.
Purpose: In this study, we investigated the possible motor pathways of hemiplegic stroke patients usin combined TMS and BOLD fMRI approach and evaluated the correlation between TMS a fMRI methods. Method: Four subjects, who demonstrated left hemiplegia after stroke, are included. TMS was performed using a Dantec Mag2 stimulator (Dantec Company, USA) in single puls mode with figure eight-shaped coil. Following TMS localization, The BOLD T2*-weight images were acquired with echo planar imaging sequence (TR = 1.2 sec, TE = 60 msec, and flip angle = 90). Motor activation was studied by means of a repetitive fing flexion-extension task. The stimulation protocol comprised 10 cycles of alternating activati and rest (10 images per cycle). Total 60 cycles were performed and each cycle take abou 1.5 sec. The resulting images were then analyzed with STIMULATE (CMRR, U, o Minnesota) to generate functional maps using a student t-test (p < 0.0005) and cluste analysis.
Introduction : Recent studies Suggested that there is a strong correlation between acupuncture stimulation and its related cortical activation. Anther study showed that either positive or negative BOLD effects could be observed depending on anatomical structure in acupuncture stimulation. In ttis study, we investigated a new acupoint $KI_6$ (照海), which was known as motor-related acupoint and obtained an evidence that the stimulation of $KI_6$ resulted in either negative or positive BOLD response to stimulation. Methods & Results : 1. Subjects and paradigms : Two separate stimulation paradigms were performed on five healthy (aged 22-23 yrs) in this study. First, the paradigm of acupuncture stimulation was that the acupuncture needle was inserted in acupoints $KI_6$, which is located in lateral side of the foot and then continuously twisted(補瀉를 除外한 捻轉法) for 70 seconds for 10 cycles of activation. During rest period (70 seconds), the needle was completed removed from acupoint. Total 60 cycles were performed and 10 images were obtained per cycle. Second, nonacupoint was randomly selected and the same paradigm was performed as acupoint stimulation. The stimulation protocol comprised 10 cycles of alternating. activation and rest (10 images per cycle). Total 60 cycles were performed and each cycle take about 1.5 sec for motor task. Subjects take an at least 15 minutes break before starting anther paradigm. 2. fMRI mapping : Multi-slice functional images were obtained on a 1.5T Magnetom Vision MRI scanner (Simens Medical, Erlangen, Germany) equipped with high performance whole-body gradients. The BOLD T2 * - weighted images were acquired with acho planar imaging sequence (TR = 1.2 sec, TE = 60 msec, and flip angle = $90_{\circ}$). The other sequence parameter are : FOV = 210 mm, matrix=$64{\times}128$ or $64{\times}64$, slice number=10 and slice thickness = 5 or 8 mm. the anatomic images were obtained with Spin-echo T1-weighted images. The resulting images were then anaiyzed with STIMULATE (CMRR, U. of Minnesota) to generate functional maps using a student T-test (p < 0.005) and cluster analysis. Both positive and negative response were evaluated. Conclusions : We have observed the activation of the motor cortex by stimulating motor-related acupoint ($KI_6$). Among five subjects, negative BOLD response was shown in four and positive response in one. All subjects showed positive response to conventional finger flexion-extension task. To understand the detailed mechanisms of correlation between acupuncture stimulation and BOLD fMRI changes and two typs of response, further study strongly required.
Fluid accumulation within the tympanic bulla is an important diagnostic indicator of canine otitis media although its identification can be a challenge using currently available imaging techniques. The purpose of this study was to compare radiography, computed tomography (CT) and magnetic resonance imaging (MRI) in the identification of fluid accumulation within canine tympanic bulla. Unilateral tympanic bulla in 10 beagles were experimentally filled with blood or saline. Quantitative analysis of CT images were obtained by using Hounsfield unit (HU). MR signal intensity was obtained by using region of interesting (ROI) and compared with those of gray matter. On the CT image, the presence of blood or saline produced a fluid opacity occupying the tympanic bulla. On the MR image, the appearance of blood in the tympanic bulla was isointense in T1-weighted images and hyperintense in T2-weighted images. However, the appearance of saline in the tympanic bulla was hypointense in T1-weighted images and hyperintense in T2-weighted images. This study suggest that CT and MR imaging are useful methods for detection and differentiation of fluid in canine tympanic bulla.
Park, Jinho;Hong, Hye-Jin;Yang, Young-Joong;Ahn, Chang-Beom
Investigative Magnetic Resonance Imaging
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v.19
no.1
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pp.19-30
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2015
Purpose: A new compressed sensing technique by iterative truncation of small transformed coefficients (ITSC) is proposed for fast cardiac CINE MRI. Materials and Methods: The proposed reconstruction is composed of two processes: truncation of the small transformed coefficients in the r-f domain, and restoration of the measured data in the k-t domain. The two processes are sequentially applied iteratively until the reconstructed images converge, with the assumption that the cardiac CINE images are inherently sparse in the r-f domain. A novel sampling strategy to reduce the normalized mean square error of the reconstructed images is proposed. Results: The technique shows the least normalized mean square error among the four methods under comparison (zero filling, view sharing, k-t FOCUSS, and ITSC). Application of ITSC for multi-slice cardiac CINE imaging was tested with the number of slices of 2 to 8 in a single breath-hold, to demonstrate the clinical usefulness of the technique. Conclusion: Reconstructed images with the compression factors of 3-4 appear very close to the images without compression. Furthermore the proposed algorithm is computationally efficient and is stable without using matrix inversion during the reconstruction.
Finite element method (FEM) provides several advantages over other numerical methods such as boundary element method, since it allows truly volumetric analysis and incorporation of realistic electrical conductivity values. Finite element mesh generation is the first requirement in such in FEM to represent the volumetric domain of interest with numerous finite elements accurately. However, conventional mesh generators and approaches offered by commercial packages do not generate meshes that are content-adaptive to the contents of given images. In this paper, we present software that has been implemented to generate content-adaptive finite element meshes (cMESHes) based on the contents of MR images. The software offers various computational tools for cMESH generation from multi-slice MR images. The software named as the Content-adaptive FE Mesh Generation Toolbox runs under the commercially available technical computation software called Matlab. The major routines in the toolbox include anisotropic filtering of MR images, feature map generation, content-adaptive node generation, Delaunay tessellation, and MRI segmentation for the head conductivity modeling. The presented tools should be useful to researchers who wish to generate efficient mesh models from a set of MR images. The toolbox is available upon request made to the Functional and Metabolic Imaging Center or Bio-imaging Laboratory at Kyung Hee University in Korea.
A lesion that is hyperintense on diffusion-weighted imaging (DWI) and hypointense on the apparent diffusion coefficient (ADC) map is a characteristic magnetic resonance imaging (MRI) finding in acute ischemic infarction. In some cases, however, these findings can persist for a few months after infarct onset. It is thought that these finding reflect the different evolution speeds of the infarcted tissue. We report a patient with a right middle cerebral artery territory infarction with persistent hyperintensity on DWI and hypointensity on the ADC map for over 8 months. To our knowledge, this is the most persistent case of hyperintensity lesion on DWI and the serial MRI images of this patient provide important information on the evolution of infarcted tissue.
This paper provides a non-Bayesian method based on the expanded EM algorithm for segmenting the magnetic resonance images degraded by bias field. For the images with the intensity as a pixel value, many segmentation methods often fail to segment it because of the bias field(with low frequency) as well as noise(with high frequency). Our contextual approach is appropriately designed by using normal mixture model incorporated with Markov random field for noise-corrective segmentation and by using the penalized likelihood to estimate bias field for efficient bias filed-correction.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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