• 한국동물위생학회지
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• 제31권3호
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• pp.369-374
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• 2008

The objective of this study was to differentiate the beef species between Hanwoo and Holstein from a total of 1,081 beef samples using PCR-RFLP of MC1R gene. When a PCR product of 403 bp specific band amplified from bovine MC1R gene sequence was digested with restriction enzyme MspA1I, Hanwoo type showed 2 bands, 220 bp and 183 bp size bands. Holstein type, however, showed three bands, 220 bp, 138 bp and 45 bp size band, respectively. The results of the differential test for beef species were as following; 7 samples (0.64%) were determined to Holstein type, of which 4 were submitted from administrative authorities, other 3 from self-collection planing, and none from civilian clients including school.

• 대한수의학회지
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• 제45권1호
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• pp.25-28
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• 2005

The melanocortin 1 receptor (MC1R) plays an important role in regulation of melanin pigment synthesis within mammalian melanocytes. Mutations within the gene encoding MC1R have been shown to explain coat color variations within several mammalian species including cattle. To develope a rapid and accurate method for the identification of Hanwoo meat, we performed a single nucleotide polymorphism (SNP) analysis in Melanocortin 1 receptor (MC1R) gene using TaqMan$^{(R)}$ MGB probe-based real-time PCR. Two specific probes (one for Hanwoo and the other for Holstein and Black angus) were designed. At the 5' end of 2 TaqMan$^{(R)}$ MGB probes, 6-carboxyfluorescein (FAM) was labeled for Hanwoo, and VIC for Holstein and Black angus. As a result, Hanwoo samples showed FAM-positive signal only, whereas other samples showed VIC-positive. This result suggests that the TaqMan$^{(R)}$ MGB probe based real-time PCR technique would be very accurate, easy and reproducible method to discriminate between Hanwoo meat and Holstein/Black angus meat.

• 대한수의학회지
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• 제45권3호
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• pp.335-339
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• 2005

The melanocortin 1 receptor (MC1R) plays an important role in regulation of melanin pigment synthesis within mammalian melanocytes. Mutations within the gene encoding MC1R have been shown to explain coat color variations within several mammalian species including cattle. To develope a rapid and accurate method for the identification of Hanwoo, we performed a modified PCR-RFLP analysis of MC1R gene using single nucleotide polymorphism (SNP) within MC1R as a target. A size of 538 bp (537 bp for Hanwoo) was amplified by PCR, digested with Hpa II, and electrophoresed on a 1.5% agarose gel. A PCR product from Hanwoo showed a single band of 537 bp, whereas two fragments of 328 bp and 210 bp were detected in both Holstein and Black angus. The current result suggests that the PCR-RFLP using our primers and enzyme digestion system would be very accurate, easy and reproducible method to discriminate between Hanwoo and Holstein/Black angus meat.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제51권3호
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• pp.193-200
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• 2009

본 연구는 한국재래돼지의 MC1R 유전자형을 결정하고 MC1R 유전자의 변이와 육질과의 연관성을 규명하기 위하여 실시하였다. 재래돼지의 MC1R 유전자형을 분석한 결과 중국재래돼지품종이 속하는 $E^{D1}$ 내에서도 0201형에 속하는 것으로 나타났으며 몇몇의 재래돼지에서는 $E^P$ 유전자형이 출현하였는데 이는 Berkshire 품종의 혼입으로 인한 것으로 사료된다. 흑색의 모색과 관련되어 있다고 보고된 Leu102Pro (T1132C) 변이를 재래돼지와 Yorkshire의 양방향 교배로 생산된 F2 집단의 171 두를 대상으로 분석하고 육질형질과의 연관성을 분석하였다. 모든 육질형질에 대하여 유의적인 효과를 나타내지 않았으며 이로써 돼지의 흑색모색과 육질과는 연관성이 없으며 다른 육질관련 유전자에 의해 영향을 받는다는 근거를 제공하였다. 또한 Duroc 품종에서 AA으로 고정되어 있어 다른 품종과의 구분 기준이 되는 Ala243Thr (G1554A) 변이를 이용하여 종돈검정소에서 출하된 Landrace, Yorkshire, Duroc, Berkshire 순종집단에 대한 유전자형 빈도를 조사하였으며 Berkshire를 제외한 나머지 품종에서 이형접합체가 일부 출현하였다.

• 한국동물위생학회지
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• 제30권4호
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• pp.557-562
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• 2007

This study was carried out to discriminate Hanwoo from the milking and hybrid cattle by detection of MC1R gene related to bovine hair color. One hundred sixty six samples were collected from the abattoir (n = 106) and local market (n = 60). The beef from abattoir were originated from Hanwoo (n=27), Holstein (n=29), Hybrid (n=45) and imported cattle (n=5), respectively. The beef from market consisted of Hanwoo (n=36), Holstein (n=7) and imported ones (n=17). Commercialized screening kit (Kogenebiotec, Korea) was used for MC1R gene analysis. As a result, Hanwoo was discriminated from Holstein. However, 9 of 45 hybrid and 11 of 22 imported beef samples were indistinguishable from Hanwoo. It could be explained by second generation of crossing of Hanwoo with Holstein or the cattle with silver or yellow hair. This results suggest that additional tests as well as MC1R gene detection be needed to confirm Hanwoo beef among cattle beef.

• 한국축산식품학회지
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• 제24권4호
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• pp.355-360
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• 2004

본 연구는 축우의 모색발현에 관여하는 MC1R, MGF 및 TYRP1 3종류의 모색 유전자의 PCR-RFLP marker를 이용하여 쇠고기 품종 판별기술을 개발하고자 수행하였다. MC1R 유전자의 104번째 아미노산을 지정하는 codon에 GGT 염기를 갖고 있는 Holstein 젖소와 Angus 육우는 제한효소 인지부위가 존재하여 537 bp증폭산물이 절단되어 329와 208bp 두개의 band가 검출되었으나 한우에서는 GTG로 G 염기가 T염기로 치환됨으로써 제한효소 인식부위가 소실되어 537 bp의 단일 bind 만이 검출되었다. 따라서, 이처럼 MC1R 모색유전자의 품종 간 특정 염기서열의 차이가 곧 특정 제한효소의 염기 서열상의 인지 부위 차이를 가져와 한우와 Holstein 젖소 및 Angus 육우 품종간의 RFLP 유전자형 출현에 확실한 차이가 인정되어 한우 품종에 특이적인 MC1R 유전자의 RFLP marker를 이용한 한우육 판별이 가능하였다. 또한, MGF 유전자의 RFLP 유전자형 출현빈도에서 한우는 r/r형이 75％로 출현율이 매우 높은 유전자형으로 분석된 반면 Hereford종은 R/R 형이 80％로 출현율이 매우 높았고 Holstein종과 Angus종은 R/r형이 100％ 출현함으로써 한우와 Holstein 및 수입육우 품종간의 MGF 유전자형 출현빈도에 뚜렷한 차이가 인정되었다. 한편, TYRP1 유전자의 RFLP유전자형을 분석한 결과 모든 품종에서 동일한 RFLP type이 검출되어 TYRP1 모색 유전자를 이용한 쇠고기 품종 구별은 불가능한 것으로 나타났다. 따라서, 소 모색 관련 MC1R과 MGF 두 유전자의 품종 특이적 PCR-RFLP 유전자형은 한우육과 국내산 Holstein젖소고기 및 Angus 수입육간의 품종을 식별하는데 매우 유용한 DNA marker로 이용될 수 있음이 확인되었다.

• 대한수의학회지
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• 제45권3호
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• pp.351-357
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• 2005

Here I describe a multiplex allele specific PCR-based approach for the rapid detection between Hanwoo and Holstein meat associated with Melanocortin 1 receptor (MC1R) gene. Specific and universal oligonucleotide primers were used in combination to detect the presence of a single nucleotide polymorphism within the bovine MC1R DNA sequence. The presence of the bovine MC1R gene is indicated by the production of a single control PCR product, whilst positive samples generate an alternative smaller specific product over the same region. The mutations in MC1R104 codon revealed depending on the presence or absence of an indicative fragment amplified from the wild-type allele of this codon. As little as 0.39 ng and 1.56 ng of genomic DNA of Hanwoo and Holstein could be detected by MAS-PCR assay, respectively. This technique, which is widely used in human genetic screening, provides a reliable and sensitive result that has not been documented for the identification of bovine coat color. The MAS-PCR assay approach was proven to be useful in complementing routine beef DNA analysis for differentiation of these MC1R variants and it would facilitate the screening of deceiving sales of Holstein meat in the butcher shop.

• 한국동물위생학회지
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• 제28권3호
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• pp.259-265
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• 2005

The melanocortin 1 receptor (MC1R) encoded by the coat color extension gene (E) plays a key role in the signaling pathway of melanin synthesis. The primers for the amplification of bovine MC1R gene were designed based on a bovine MC1R gene sequence (GenBank accession no. Y19103). A size of 483bp (482bp for Hanwoo) was amplified by PCR, digested with Hpa II restriction enzyme and electrophoresed in $1.5\%$ agarose gel. When the amplified DNA product (483 bp) was digested with Hpa II restriction enzyme, Hanwoo meat showed a single band of 482bp, whereas two fragments of 325bp and 158bp were detected in Holstein, Angus and meat of Hanwoo / Holstein cross cow having back coat color phenotype, respectively. The results of this experiment Indicate that new designed primers of bovine MCIR gene may be useful for identification of Hanwoo meat from Holstein, Black Angus and Hanwoo / Holstein cross cow meat.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권2호
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• pp.207-212
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• 2002

본 연구에서는 제주 재래흑돈의 모색에 관여하는 MC1R 유전자를 이용하여, 모색유전자 빈도를 조사함으로써, 제주 재래흑돈군 확보를 위한 선발계획 수립에 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 공시동물은 랜드레이스, 대요크셔, 듀록 각 품종별 20두와 제주흑돈 93두 등 총 153두를 공시하여 수행하였다. 품종별 MC1R 유전자형을 설정하기 위하여 genbank에 등록되어 있는 돼지 MC1R 유전자(AF181964)를 참고로 하여 두 쌍의 primer (MERL1-EPIG2, EPIG1-EPIG3)를 제작 PCR 증폭을 수행하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 428bp의 PCR 산물을 얻었으며, primer EPIG1-EPIG3를 이용하여 405bp의 PCR산물을 얻었다. 이들 증폭된 PCR 산물은 서로 다른 2개의 제한효소를 이용하여 PCR-RFLP를 실시하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 증폭한 428bp의 PCR산물은 제한효소 BspHⅠ(TCATG|A)을 이용하여 절단하였으며, primer EPIG1-EPIG3으로 증폭한 405bp의 PCR산물은 제한효소 AccⅡ(CGC|G)를 이용하여 절단하였다. 이들 절단된 DNA 단편은 TBE buffer에서 전기영동 후 EtBr로 염색하거나 Silver stain 염색을 하여 다형현상을 관찰하였으며, 본 연구의 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 제한효소 BspHⅠ을 이용하여 PCR-RFLP을 수행한 결과 백색의 랜드레이스와 대요크셔는 전 개체 모두가 2개의 밴드(256bp, 172bp)가 확인되었으며, 듀록은 절단되지 않은 하나의 밴드(428bp)가 확인 되었다. 그러나 제주 흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 발견되었는데, 전체 93두중 밴드가 하나인 개체는(428bp)는 29두(31.2%), 밴드가 두 개인 개체는(256bp, 172bp)는 19두(20.4%), 밴드가 3개인(428bp, 256bp, 172bp) 개체는 전체의 절반 정도인 45두(48.4%)이었다. 2. AccⅡ를 이용하여 PCR-RFLP를 실시한 결과 랜드레이스와 대요크셔 종에서는 2개의 밴드(222bp, 183)가 확인 되었으며, 듀록은 한 개의 밴드(405bp)만이 관찰되었다. 그러나 제주흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 확인되었으며, 분포빈도는 BspHⅠ을 이용한 PCR- RFLP 결과와 동일하였다. 3. 이상의 결과를 MC1R 유전자형으로 분류하면 백색품종인 랜드레이스와 대요크셔 품종은 MC1R*3 allele이었으며, 적색의 듀록은 MC1R*4 allele로서 도입종의 모색유전자는 한가지 형태로 고정되어 있었다. 그러나 제주 재래흑돈에 있어서 MC1R*2 allele과 MC1R*3 allele 모두 다 나타났으며, 대부분은 이들의 헤테로 형태였다. 따라서 제주 재래흑돈의 모색고정을 위하여 종모돈 선정시 MC1R 유전자를 이용하면, 짧은 기간 내에 모색이 고정될 것으로 추정되며, 명확한 유전양상 구명을 위해서는 agouti 유전자의 추가 연구가 필요할 것으로 사료된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제30권2호
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• pp.154-159
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• 2017

Objective: This study was designed to characterize the DNA polymorphisms of the melanocortin-1 receptor (MC1R) gene in indigenous Saudi Arabian sheep breeds exhibiting different color coats, along with individuals of the Sawaknee breed, an exotic sheep imported from Sudan. Methods: The complete coding region of MC1R gene including parts of 3' and 5' untranslated regions was amplified and sequenced from three the indigenous Saudi sheep; Najdi (generally black, n = 41), Naeimi (generally white with brown faces, n = 36) and Herri (generally white, n = 18), in addition to 13 Sawaknee sheep. Results: Five single nucleotide polymorphisms (SNPs) were detected in the MC1R gene: two led to nonsynonymous mutations (c.218 T>A, p.73 Met>Lys and c.361 G>A, p.121 Asp>Asn) and three led to synonymous mutations (c.429 C>T, p.143 Tyr>Tyr; c.600 T>G, p.200 Leu>Leu, and c.735 C>T, p.245 Ile>Ile). Based on these five SNPs, eight haplotypes representing MC1R $E^d$ and $E^+$ alleles were identified among the studied sheep breeds. The most common haplotype (H3) of the dominant $E^d$ allele was associated with either black or brown coat color in Najdi and Sawaknee sheep, respectively. Two other haplotypes (H6 and H7) of $E^d$ allele, with only the nonsynonymous mutation A218T, were detected for the first time in Saudi indigenous sheep. Conclusion: In addition to investigating the MC1R allelic variation in Saudi indigenous sheep populations, the present study supports the assumption that the two independent nonsynonymous Met73Lys and Asp121Asn mutations in MC1R gene are associated with black or red coat colors in sheep breeds.