• 식물조직배양학회지
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• 제25권5호
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• pp.341-346
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• 1998

색소유전자의 전이를 통하여 새로운 색소발현체계를 가진 품종을 육종하기 위한 기초연구로 stock (Matthiola incana R. Br.)의 꽃봉오리로부터 cDNA-library를 합성하였고 screening을 통하여 anthocyanin 합성경로의 중요효소의 하나인 DFR (dihydroflavonol 4-reductase) 유전자를 분리하였다. 염기서열분석을 수행하여 분리유전자의 크기가 1450bp 이며 이중 coding region은 1029 bp 임을 확인하였다. 이미 밝혀진 다른 식물체의 DFR 유전자와 서로 염기서열의 일치성을 비교해 본 결과 외자엽식물인 옥수수와 보리와는 각각 61%를 보였으며, 쌍자엽식물인 페튜니아, 금어초, 거베라, 과꽃 그리고 카네이션 등 과는 66%-67%의 일치성을 나타내었다. 아울러 염기서열의 G/C 함량분석을 통하여 쌍자엽식물의 G/C 함량은 외자엽식물의 그것에 비해 매우 낮은 수치를 나타내었다. 분리유전자의 발현을 확인하기 위하여 인위적으로 기내에서의 전사와 해석을 수행한 결과 42-44 kd 크기의 단백질을 확인하였다. Southern blot 분석의 결과 DFR 유전자는 stock의 genome에 다른 대부분의 식물체와 유사하게 한 개가 존재하며 야생종과 돌연변이종의 stock을 분리 DFR 유전자를 probe 로 Northern blot 분석을 수행하여 돌연변이종인 lineK17b가 DFR 돌연변이임을 확인하였다.

• 한국차세대컴퓨팅학회논문지
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• 제15권3호
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• pp.7-15
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• 2019

세계적으로 ICT(Information & Communication Technology)를 통한 비용절감 및 업무혁신이 이루어지면서 클라우드 컴퓨팅(이하 클라우드) 시장이 급성장하고 있다. 이러한 패러다임에 맞춰 우리나라는 다양한 연구를 통해 공공부문, 국방 분야 등 다양한 분야에 클라우드를 도입시키기 위해 노력하고 있다. 특히 국방 분야에서는 2015년 육·해·공·군 전산소를 통합하여 국방통합데이터센터(DIDC, Defense Integrated Data Center)를 설립하였으며, 센터 내 일부 시스템을 대상으로 IaaS(Infrastructure as a Service) 형태의 클라우드 서비스를 제공하고 있다. 국방통합데이터센터 및 추후 도입될 국방 분야의 다양한 클라우드 시스템에서 네트워크 지연, 시스템 자원 고장 등과 같은 시스템 장애가 발생하게 되면 전장의 결과와 직결되기 때문에 국방 부문의 클라우드 시스템에 가용성을 보장하는 것은 중요한 이슈라 할 수 있다. 그러나 국방 클라우드의 모든 시스템을 대상으로 최고 수준의 가용성을 확보하는 것은 비효율적일 수 있으며, 클라우드 시스템 구축으로 얻을 수 있었던 효율성이 감소할 수 있다. 본 논문에서는 국방 클라우드 시스템의 가용성 확보 수준을 단계별로 분류 및 정의하고, 각 가용성 확보 수준에 따른 Erasure Coding 및 장애 허용 시스템, 재난 복구 시스템 기술 도입 전략을 제안한다.

• 한국수정란이식학회지
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• 제31권3호
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• pp.287-291
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• 2016

For evaluating the boar semen quality, sperm motility (MOT) is an important parameter because the movement of spermatozoa indicates active metabolism, membrane integrity and fertilizing capacity. Estrogen receptors 2(ESR2) is involved in estrogen related apoptosis in cell cycle spermatogenesis, but their functions have not been confirmed in pig until now. Therefore, this study was conducted to analyze their association with sperm motility and kinematic characteristics. DNA samples from 105 Duroc pigs with records of semen motility and kinematic characteristics [Total motile spermatozoa (MOT), Curvilinear velocity(VCL), Straight-line velocity(VSL), the ratio between VSL and VCL(LIN), Amplitude of Lateral Head displacement(ALH)] were analyzed. A SNP in coding region of ESR2 g.35547A > G in exon 5 was associated with MOT (p < 0.05) in Duroc population. Therefore, we suggest that the porcine ESR2 gene may be used as a molecular marker for Duroc boar semen quality, although its functional effects were not defined yet. These results might shed new light on the roles of ESR2 in spermatogenesis as candidate gene for boar fertility, but still the lack of association across populations should be considered.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권3호
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• pp.413-418
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• 2016

Myostatin (MSTN) is a secreted growth factor expressed in skeletal muscle and adipose tissue that negatively regulates skeletal muscle mass. Gene knockout of MSTN can result in increasing muscle mass in sheep. The objectives were to investigate whether myostatin gene can be edited in sheep by transcription activator-like effector nucleases (TALENs) in tandem with single-stranded DNA oligonucleotides (ssODNs). We designed a pair of TALENs to target a highly conserved sequence in the coding region of the sheep MSTN gene. The activity of the TALENs was verified by using luciferase single-strand annealing reporter assay in HEK 293T cell line. Co-transfection of TALENs and ssODNs oligonucleotides induced precise gene editing of myostatin gene in sheep primary fibroblasts. MSTN gene-edited cells were successfully used as nuclear donors for generating cloned embryos. TALENs combined with ssDNA oligonucleotides provide a useful approach for precise gene modification in livestock animals.

• 한국방송∙미디어공학회:학술대회논문집
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• 한국방송공학회 2009년도 추계학술대회
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• pp.63-66
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• 2009

기존의 H.264/AVC 비디오 표준은 고화질 비디오 부호화를 지원하지만 고해상도에 특화된 요소 기술이 도입되지 않아 만족할만한 성능을 보이지 못한다. 현존하는 동영상 압축 표준 중 가장 뛰어난 H.264/AVC 표준의 인트라 $16{\times}16$ 예측은 매크로블록에 인접한 최대 33개의 주변 화소를 이용하여 매크로블록에 속한 256개의 화소 값을 예측한다. 특히, 전체 예측 모드 중 수직과 수평 예측 모드에서는 16개의 수직 또는 수평 위치에 위치한 주변 화소로 전체 매크로블록 내의 화소 값을 예측하므로 매크로 블록의 끝으로 갈수록 예측의 정확도가 떨어져 부호화 비트가 증가한다. 고화질 영상에서는 인트라 $16{\times}16$ 모드로 부호화되는 블록이 많으므로 수행되므로 인트라 $16{\times}16$ 예측의 정확도를 높일 수 있는 기술이 필요하다. 본 논문에서는 기존의 H.264/AVC의 예측 방법보다 예측 정확도가 높은 새로운 라인 기반 $16{\times}16$ 인트라 예측 방법을 제안한다. 일반적으로 편평한 특성을 보이는 인트라 $16{\times}16$ 블록이라도 좀 더 가까운 화소를 참조 화소로 사용하면 예측의 정확도를 높여 부호화 비트를 줄일 수 있다. 이를 이용하여 제안하는 알고리즘에서는 인트라 $16{\times}16$ 블록에서 16개 화소 한 줄을 단위로 예측 및 부호화를 수행한다. 1080p HD급 테스트 영상을 이용하여 실험한 결과, 기존의 H.264/AVC FRExt High 프로파일에 비해 평균 약 6.92%의 부호화 비트를 감소시킬 수 있음을 보였다.

• Plant Biotechnology Reports
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• 제4권3호
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• pp.185-192
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• 2010

The Arabidopsis ${\omega}$-3 fatty acid desaturase (AtFAD7) catalyzes the synthesis of trienoic fatty acids (TA). A transgenic tobacco line, T15, was produced by a sense AtFAD7 construct and showed a cosuppression-like phenotype, namely extremely low TA levels. The sequence similarity between AtFAD7 and a tobacco ortholog gene, NtFAD7, was moderate (about 69%) in the coding sequences. AtFAD7 siRNAs accumulated at a high level, and both AtFAD7 and NtFAD7 mRNAs are degraded in T15 plants. The low-TA phenotype in T15 was dependent on a tobacco RNA-dependent RNA polymerase6 (NtRDR6). We also produced tobacco RNAi plants targeting AtFAD7 gene sequences. The AtFAD7 siRNA level was trace, which was associated with a slight reduction in leaf TA level. Unexpectedly, this RNAi plant showed an increased NtFAD7 transcript level. To investigate the effect of translational inhibition on stability of the NtFAD7 mRNAs, leaves of the wild-type tobacco plants were treated with a translational inhibitor, cycloheximide. The level of NtFAD7 mRNAs significantly increased after cycloheximde treatment. These results suggest that the translational inhibition by low levels of AtFAD7 siRNAs or by cycloheximide increased stability of NtFAD7 mRNA. The degree of silencing by an RNAi construct targeting the AtFAD7 gene was increased by co-existence of the AtFAD7 transgene, where NtRDR6-dependent amplification of siRNAs occurred. These results indicate that NtRDR6 can emphasize silencing effects in both cosuppression and RNAi.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2001년도 춘계학술발표대회
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• pp.47-47
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• 2001

The neuropeptide vasopressin (VP) is a nine- amino acid hormone synthesized as preprohormone in the cell bodies of hypothalamic magnocellular neurons. The tumor in magnocellular neurons of the hypothalamus is associated with disfunctions of the cell bodies, leading to the diabetes insipidus. In order to study with the diabetes insipidus caused by a defect in VP synthesis and its secretion, we have produced the transgenic mice regulated by vasopressin promoter inserted to SV40 T antigen coding sequence (pVPSV.IGR2.1). One transgenic line expressing high levels of SV40 T antigen was propagated. The founder and all transgene positive adult animals have appeared with shorten mortality or apparent phenotypic abnormalities, including immune complex disease, and eventually die between 4 and 8 months of age. The mRNA and protein of SV40T antigen transgene were detected in brain of fetus as well as in brain, spleen, lung and lymph node in moribund at the age of 20 weeks. Histological analysis of transgenic mice showed that tumor developed in brain similar to primitive neuroectodermal tumors (PNET) in man. We also detected lymphomas in spleen and lymph node, and consequent tumor formation in various tissues of the transgenic mice. In pVPSV.IGR2.1, 21% mice showed brain tumor (PNET) at 5 weeks and 100% mice showed brain tumor after 15 weeks. In addition, Expression of apoptosis related genes (Bcl-28 & Bax) was increased over their age in mice with PNET as compared to control mice. Apoptosis related gene expression might be deregulated in mice with brain tumor. However, transgenic mice were not developed with the diabetes insipidus. These mice represent the first disease model to exhibit primitive neuroectodermal tumor in brain, as well as a unique model system for exploring the cellular pathogenesis of lymphomas.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제19권7호
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• pp.258-264
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• 2018

본 논문은 마이크로 그리드 최적 운영을 위해 Differential Search (DS) 알고리즘을 적용하였다. DS 알고리즘은 이주하는 생물의 유사 브라운 운동 형태의 임의보행 (random-walk)을 모의하여 개발된 알고리즘이다. DS 알고리즘은 다른 최적화 알고리즘과 달리 한 개 이상의 개체를 동시에 사용 할 수 있고, 유사 최적해중에서 전역 최적 해를 선별하는 직진성 특성으로 multi-modal 함수들의 해법을 위한 성공적인 탐색 전력을 지니고 있으며, 높은 비선형성과 불연속성을 갖는 전력계통의 다른 분야에도 효율적으로 적용될 수 있다. 마이크로 그리드 시스템은 풍력 발전기, 디젤발전기, 연로전지 및 태양광 발전기로 구성된다. 풍력 발전기는 가변 출력특성을 이용하여 모델링 하였다. 연료비용과 연료가 전력으로 변환되는 경우의 효율을 포함시켜 시스템의 비용을 최소화 하였으며, 마이크로 그리드 단독 운용에 관해서만 분석하였다. 본 연구는 신재생 에너지원 기반의 마이크로 그리드의 최적 운영에 대해 코딩의 단순성, 빠른 수렴 속도, 정확성 및 효율성을 갖춘 DS 알고리즘을 적용하여 다른 알고리즘의 최적 값과 비교하였다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권23호
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• pp.10355-10361
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• 2015

Background: MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNA molecules found in multicellular eukaryotes which are implicated in development of cancer, including cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC). Expression is controlled by transcription factors (TFs) that bind to specific DNA sequences, thereby controlling the flow (or transcription) of genetic information from DNA to messenger RNA. Interactions result in biological signal control networks. Materials and Methods: Molecular components involved in cSCC were here assembled at abnormally expressed, related and global levels. Networks at these three levels were constructed with corresponding biological factors in term of interactions between miRNAs and target genes, TFs and miRNAs, and host genes and miRNAs. Up/down regulation or mutation of the factors were considered in the context of the regulation and significant patterns were extracted. Results: Participants of the networks were evaluated based on their expression and regulation of other factors. Sub-networks with two core TFs, TP53 and EIF2C2, as the centers are identified. These share self-adapt feedback regulation in which a mutual restraint exists. Up or down regulation of certain genes and miRNAs are discussed. Some, for example the expression of MMP13, were in line with expectation while others, including FGFR3, need further investigation of their unexpected behavior. Conclusions: The present research suggests that dozens of components, miRNAs, TFs, target genes and host genes included, unite as networks through their regulation to function systematically in human cSCC. Networks built under the currently available sources provide critical signal controlling pathways and frequent patterns. Inappropriate controlling signal flow from abnormal expression of key TFs may push the system into an incontrollable situation and therefore contributes to cSCC development.

• 한국음향학회지
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• 제20권4호
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• pp.29-34
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• 2001

본 논문에서는 고품질 음성 서비스를 가능하게 하는 광대역 음성 부호화기의 선 스펙트럼 주파수 (line spectral frequency: ISF) 계수 양자화기를 설계하였다. 광대역 음성 부호화기를 위한 효율적인 LSF 계수 양자화기를 설계하기 위하여, 인접 프레임간의 상관도를 이용하였으며, 각 해당 프레임의 ISF 계수에 대한 양자화를 인접 프레임간 상관도가 높은 프레임과 상관도가 낮은 프레임으로 나누어 독립적으로 수행하였다. 인접 프레임간 상관도가 높은 프레임의 LSF계수 양자화를 위하여 예측 피라미드형 벡터 양자화기 (predictive pyramid vector quantizer: PPVQ)를 사용하여 양자화하였고, 상관도가 낮은 프레임의 LSF 계수는 피라미드형 벡터 양자화기 (PVQ)를 사용하여 양자화 하였다. PPVQ에서 예측기로 1차 AR 예측기를 사용하였다. 광대역 음성 부호화기를 위해 본 논문에서 설계된 UF 계수양자화기를 평균스펙트럼 왜곡(spectral distortion: SD) 성능 관점에서 실험한 결과, LSF계수 양자화에 할당된 비트가 프레임당 40비트일 때, 평균 SD값이 1 dB 내외이고, 2 dB 이상 및 4 dB 이상 outlier가 각각 3.87%및 0.01%인 transparent한 성능을 얻을 수 있었다.