멀티코어 CPU와 BLAS, LAPACK을 구현한 최적 수치라이브러리, 직접 희소 솔버의 대중화 등 PC나 워크스테이션 수준에서도 대규모 유한요소 모델을 해석할 수 있도록 컴퓨팅 환경이 급속도로 변화되었다. 이 논문에서는 멀티코어 CPU를 갖는 공유 메모리 구조에 대한 병렬 유한요소 프로그램 설계시 고려사항으로 (1) 최적화된 수치라이브러리의 사용, (2) 최신 직접 희소 솔버의 사용, (3) OpenMP를 이용한 병렬 요소 강성 행렬의 계산, (4) 희소행렬 저장방식의 일종인 triplet을 이용한 어셈블 기법 등을 제시하였다. 또한 대규모 수치모델을 통해 많은 시간이 소요되는 작업을 기준으로 병렬화 효과를 검토하였다.
C Cadiou;C Pichon;S Codis;M Musso;D Pogosyan;Y Dubois;J-F Cardoso;S Prunet
Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
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제496권4호
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pp.4787-4821
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2020
The merging rate of cosmic structures is computed, relying on the ansatz that they can be predicted in the initial linear density field from the coalescence of critical points with increasing smoothing scale, used here as a proxy for cosmic time. Beyond the mergers of peaks with saddle points (a proxy for halo mergers), we consider the coalescence and nucleation of all sets of critical points, including wall-saddle to filament-saddle and wall-saddle to minima (a proxy for filament and void mergers, respectively), as they impact the geometry of galactic infall, and in particular filament disconnection. Analytical predictions of the one-point statistics are validated against multiscale measurements in 2D and 3D realizations of Gaussian random fields (the corresponding code being available upon request) and compared qualitatively to cosmological N-body simulations at early times (z ≥ 10) and large scales (≥5 Mpc h-1). The rate of filament coalescence is compared to the merger rate of haloes and the two-point clustering of these events is computed, along with their cross-correlations with critical points. These correlations are qualitatively consistent with the preservation of the connectivity of dark matter haloes, and the impact of the large-scale structures on assembly bias. The destruction rate of haloes and voids as a function of mass and redshift is quantified down to z = 0 for a Lambda cold dark matter cosmology. The one-point statistics in higher dimensions are also presented, together with consistency relations between critical point and critical event counts.
Ki-Bong Kim;Hyeweon Nam;Hwajung Seo and Kiejung Park
한국생물정보학회:학술대회논문집
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한국생물정보시스템생물학회 2000년도 International Symposium on Bioinformatics
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pp.83-85
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2000
A lot of microbial genome sequencing projects is being done in many genome centers around the world, since the first genome, Haemophilus influenzae, was sequenced in 1995. The deluge of microbial genome sequence data demands new and highly automatic data flow system in order for genome researchers to manage and analyze their own bulky sequence data from low-level to high-level. In such an aspect, we developed the automatic data management system for microbial genome projects, which consists mainly of local database, analysis programs, and user-friendly interface. We designed and implemented the local database for large-scale sequencing projects, which makes systematic and consistent data management and retrieval possible and is tightly coupled with analysis programs and web-based user interface, That is, parsing and storage of the results of analysis programs in local database is possible and user can retrieve the data in any level of data process by means of web-based graphical user interface. Contig assembly, homology search, and ORF prediction, which are essential in genome projects, make analysis programs in our system. All but Contig assembly program are open as public domain. These programs are connected with each other by means of a lot of utility programs. As a result, this system will maximize the efficiency in cost and time in genome research.
염기서열 해독작업에서 각 핵산 단편을 조립하는 contig 구성문제에 활용이 가능한 computer program을 개발하였다. 본 프로그램은 국내에서 광범위하게 사용되고 있는 MS-Windows 운영체제의 개인용 컴퓨터에서 작동이 가능하며, GenBank, FASTA, ASCII 등과 같은 다양한 형태의 염기서열 자료를 입력할 수 있다. 두 단편에서 최대 유사도를 나타내는 부분을 정렬하는 작업에는 염기서열의 국부적 상동성을 계산하고 dynamic programming 알고리즘을 적용하는 방법을 이용하였다. 또한 사용하기 편리한 그래픽 방식의 인터페이스를 제공하여 초보자라도 손쉽게 조작할 수 있다는 장점을 갖는다. 본 프로그램의 성능을 검증하기 위하여 세균과 곰팡이로부터 해독된 16S rRNA 와 18S rRNA 유전자의 단편 염기서열을 재구성하는 작업에 프로그램을 사용하였을 때에 효율적인 작업이 가능하였다.
Over the past decade, the major efforts for lowering the cost of electronics has been devoted to increasing the packaging efficiency of the integrated circuits (ICs), which is defined by the ratio of all devices on system-level board compared to the area of the board, and to working on a larger but cheaper substrates. Especially, in flexible electronics, the latter has been the favorable way along with using novel nanomaterials that have excellent mechanical flexibility and electrical properties as active channel materials and conductive films. Here, the tool for achieving large area patterning is by printing methods. Although diverse printing methods have been investigated to produce highly-aligned structures of the nanomaterials with desired patterns, many require laborious processes that need to be further optimized for practical applications, showing a clear limit to the design of the nanomaterial patterns in a large scale assembly. Here, we demonstrate the alignment of highly ordered and dense silicon (Si) NW arrays to anisotropically etched micro-engraved structures using a simple evaporation process. During evaporation, entropic attraction combined with the internal flow of the NW solution induced the alignment of NWs at the corners of pre-defined structures. The assembly characteristics of the NWs were highly dependent on the polarity of the NW solutions. After complete evaporation, the aligned NW arrays were subsequently transferred onto a flexible substrate with 95% selectivity using a direct gravure printing technique. As proof-of-concept, flexible back-gated NW field effect transistors (FETs) were fabricated. The fabricated FETs had an effective hole mobility of 0.17 $cm2/V{\cdot}s$ and an on/off ratio of ${\sim}1.4{\times}104$. These results demonstrate that our NW gravure printing technique is a simple and effective method that can be used to fabricate high-performance flexible electronics based on inorganic materials.
대형 구조물의 기초나 지중 구조물 시공을 위한 대규모 굴착 시 매우 큰 토압이 발생할 수 있다. 이러한 큰 토압을 지지하기 위해 기존에 사용되어 온 강재 버팀보를 적용할 경우 경제성 및 효율성이 저하될 우려가 있다. 이러한 점을 개선하기 위해 PCT(Precast Concrete Truss) 시스템을 고안하였으며 이에 대한 실험 및 해석적 연구를 수행하였다. 콘크리트 트러스 부재의 조립 및 해체를 용이하게 하기 위해 적절한 연결방법이 제안되었다. 이러한 연결부를 포함한 PCT 시스템의 내하력을 검증하기 위해 실대형 실험이 실시되었으며, 실험결과는 구조해석결과와도 비교되었다. PCT 버팀보를 모사한 시험체는 극한하중 도달 시까지 좌굴이 발생하지 않았으나, 연결 부재 상세에 대한 일부 개선점이 도출되었다. PCT 시스템은 대규모 굴착 시 기존의 강재 버팀보를 대체하는 가설구조물로서 효율적으로 활용될 수 있을 것으로 기대된다.
Eigenvalue reduction schemes approximate the lower eigenmodes that represent the global behavior of the structures. In the previous study, we proposed a two-level condensation scheme (TLCS) for the construction of a reduced system. And we have improved previous TLCS with combination of the iterated improved reduced system method (IIRS) to increase accuracy of the higher modes intermediate range. In this study, we apply previous improved TLCS to multi-level sub-structuring scheme. In the first step, the global system is recursively partitioned into a hierarchy of sub-domain. In second step, each uncoupled sub-domain is condensed by the improved TLCS. After assembly process of each reduced sub-eigenvalue problem, eigen-solution is calculated by Lanczos method (ARPACK). Finally, Numerical examples demonstrate performance of proposed method.
Hydrophobins are surface active proteins that are produced by filamentous fungi including mushrooms. Their ability to self-assemble into an amphipathic membrane at any hydrophilic-hydrophobic interface is most intriguing. These small secreted proteins comprise of eight conserved cysteine residues which form four disulfide bridges and an extraordinary hydrophobic patch. Hydrophobins play critical roles in fungal (and/or mushrooms) growth as structural components and in the interaction of fungi and mushrooms with the environment. The biophysical and biochemical properties of the isolated proteins are remarkable, such as strong adhesion, high surface activity and the formation of various self-assembled structures. With the increasing demands of hydrophobins from fungi and mushroom sources, production and purification in large scale is under challenge. Various applications, ranging from food industries, cosmetics, nanotechnology, biosensors and electrodes, to biomaterials and pharmaceuticals are emerging and a bright future is foreseen.
The design flexibility and robustness have become key factors to handle various sources of uncertainties at the early phase of design. Even though designers are uncertain about which single values to specify, they usually have a preference for certain values over others. In the first and second reports of a four-part paper, a set-based design approach has been proposed for achieving design flexibility and robustness while capturing designer's preference, and its effectiveness has been illustrated with a simple vehicle side-door impact beam design problem. This report presents the applicability of the proposed design approach to the large-scale multi-objective design optimization with a successful implementation of real vehicle side-door structure design.
The antenna transmits and receives signals has a number of electronics that generate heat. For cooling, four fans and airways circulate air inside the antenna-equipped housing to exchange heat from the cooling plate assembly. In this study, fluid analysis was conducted to assess the suitability of the cooling system. The electronic components of the antenna exhibited temperature values lower than the maximum operating temperature of the components, which showed that the cooling system for the antenna had sufficient performance.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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