Wynne, Michael J.;Kamiya, Mitsunobu;West, John A.;Goer, Susan Loiseaux-de;Lim, Phaik-Eem;Sade, Ahemad;Russell, Hannah;Kupper, Frithjof C.
ALGAE
/
v.35
no.2
/
pp.157-165
/
2020
Culture isolates of the genus Hypoglossum (Delesseriaceae, Rhodophyta) were obtained and their development and morphological structure over many years were followed in the laboratory. Molecular data (rbcL, large subunit ribosomal DNA, and cytochrome c oxidase subunit I) were obtained from these strains and evidence presented to recognize the new species: Hypoglossum sabahense from Sabah, Malaysia. Because various aspects of morphology in culture specimens differ significantly from types based on field specimens we have to rely mainly on the molecular criteria in ascribing a new taxonomic name here. This also is complicated by the major lack of molecular phylogenetic evidence for Hypoglossum and other Delesseriaceae. The 'Germling Emergence Method' and 'serendipity' are proving valuable in discovering significant new taxa from laboratory cultures which otherwise might never be known.
Moe, Than Naing;Das, Kallol;Kang, In-Kyu;Lee, Seung-Yeol;Jung, Hee-Young
The Korean Journal of Mycology
/
v.48
no.3
/
pp.187-195
/
2020
Two unreported fungal isolates, KNU-GW1901 and KNU-AP100C, were collected from soil sample in Gyeongsangbuk-do, Korea. Their cultural and morphological characteristics were examined after 4 weeks of incubation at 25℃ on potato dextrose agar (PDA), malt extract agar (MEA), and oatmeal agar (OA). The conidial shape of KNU-GW1901 was aseptate, hyaline, globose to ellipsoidal, oblong, and reniform to pyriform and 2.61-4.97×1.93-3.61 ㎛ in size, whereas no conidial structures were observed in KNU-AP100C. The internal transcribed spacer (ITS) regions, large subunit (LSU), and small subunit (SSU) sequences were used to determine the taxonomic positions of the strains using the maximum likelihood phylogenetic tree. The isolate KNU-GW1901 was closely clustered with Plenodomus sinensis MFLUCC 17-0767, and KNU-AP100C was closely matched with P. collinsoniae CBS 120227. Based on the findings of morphological, cultural, and phylogenetic analysis, the isolates KNU-GW1901 and KNU-AP100C were identical to the previously described P. sinensis and P. collinsoniae isolates, respectively, which are first reported in Korea.
During the rainy season in Thailand, specimens of Phallus chiangmaiensis sp. nov. and P. merulinus were collected from Chiang Mai and Samut Sakhon Provinces, respectively. Molecular phylogenetic analyses based on sequences of the nuclear ribosomal large subunit (LSU), nuclear ribosomal 5.8S gene including the internal transcribed spacer regions 1 and 2 (ITS), and the protein-coding gene atp6 (mitochondrial adenosine triphosphate [ATP] synthase subunit 6) support the placement of the new species within Phallus. Phallus chiangmaiensis has a well-developed white indusium and campanulated caps with reticulate surfaces. It differs morphologically from the related species, as supported by the phylogenetic data. Phallus merulinus is reported here as a species that was re-encountered in Thailand. The descriptions of the species are accompanied by illustrations of macro- and micro- morphological features, and a discussion of the related taxa is presented.
Moe, Than Naing;Das, Kallol;Diane, Avalos-Ruiz;Kang, In-Kyu;Lee, Seung-Yeol;Jung, Hee-Young
The Korean Journal of Mycology
/
v.49
no.3
/
pp.315-324
/
2021
In this study, the fungal strains KNU-Gunwi 2B and KNU-SOT5 were isolated from root-soil in a hillside and the cherry tree bark (Prunus serrulata), respectively from Gyeongbuk province in Korea. The strain KNU-SOT5 produced dark brown chlamydospores that were smooth to lightly rough-walled, globose to ellipsoidal, and the conidia were aseptate, guttulate, mostly fusiform with a diameter of 5.3-17.6×4.2-7.0 ㎛. Strain KNU-Gunwi 2B produced phialides that were smooth-walled, cylindrical with semi-papillate apices and the conidia were pale-green, broadly ellipsoid, and sometimes cylindrical with a diameter of 4.4-8.0×2.3-4.0 ㎛. The strain KNU-SOT5 and KNU-Gunwi 2B were resolved based on cultural and morphological characteristics, along with the phylogenetic analysis using the small subunit (SSU), large subunit (LSU), and internal transcribed spacers (ITS) regions. The fungal strains KNU-SOT5 and KNU-Gunwi 2B were identified as Dothidea insculpta and Metarhizium rileyi, which have not been reported in Korea.
Morphology of a strain of unspecified Skeletonema species established from Korean coast was examined by light, fluorescence and scanning electron microscopy, and SSU(small subunit) and LSU(large subunit) rDNA of the strain were also sequenced. The specimen was characterized by solitary or short chains, and each cell contained 1-2 chloroplasts. The valve face was slightly convex, and the terminal fultoportula processes (TFPPs) were open and showed narrow distal ends that could be truncated or spiny with claw-like protrusions. The basal part of the TFPPs was tubular and oblique to the cell axis. The intercalary fultoportula processes (IFPPs) were also narrow, completely open, and joined in a 1 : 1 junction. Occasionally, one IFPP was connected with two opposing IFPPs. The morphological features of the specimen were identical to those of Skeletonema pseudocostatum. Molecular phylogeny based on SSU rDNA revealed that the Korean strain is nested within a clade comprising S. pseudocostatum and S. tropicum. However, based on D1-D2 LSU rDNA sequences, a clade including S. pseudocostatum and a Korean strain was separated from the S. tropicum clade. This indicates that the Korean strain can be identified as S. pseudocostatum. This species represents the first record from Korean coastal waters.
Park, Sang Ah;Jeong, Hae Jin;Ok, Jin Hee;Kang, Hee Chang;You, Ji Hyun;Eom, Se Hee;Yoo, Yeong Du;Lee, Moo Joon
ALGAE
/
v.36
no.4
/
pp.299-314
/
2021
Some species in the dinoflagellate genus Alexandrium are bioluminescent. Of the 33 formally described Alexandrium species, the bioluminescence capability of only nine species have been tested, and eight have been reported to be bioluminescent. The present study investigated the bioluminescence capability of seven Alexandrium species that had not been tested. Alexandrium mediterraneum, A. pohangense, and A. tamutum were bioluminescent, but A. andersonii, A. hiranoi, A. insuetum, and A. pseudogonyaulax were not. We also measured the bioluminescent intensity of A. affine, A. fraterculus, A. mediterraneum, A. ostenfeldii, A. pacificum, A. pohangense, A. tamarense, and A. tamutum. The mean 200-second-integrated bioluminescence intensity per cell ranged from 0.02 to 32.2 × 104 relative luminescence unit per cell (RLU cell-1), and the mean maximum bioluminescence intensity per cell per second (BLMax) ranged from 0.01 to 10.3 × 104 RLU cell-1 s-1. BLMax was significantly correlated with the maximum growth rates of Alexandrium species, except for A. tamarense. A phylogenetic tree based on large subunit ribosomal DNA (LSU rDNA) showed that the bioluminescent species A. affine, A. catenella, A. fraterculus, A. mediterraneum, A. pacificum, and A. tamarense formed a large clade. However, the toxicity or mixotrophic capability of these species was split. Thus, their bioluminescence capability in this clade was more consistent than their toxicity or mixotrophic capability. Phylogenetic trees based on LSU rDNA and the luciferase gene of Alexandrium were consistent except for A. pohangense. The results of the present study can provide a basis for understanding the interspecific diversity in bioluminescence of Alexandrium.
During an investigation of fungi from an elm tree infested with bark beetles in Korea, one isolate, DUCC401, was isolated from elm wood. Based on morphological characteristics and phylogenetic analysis of the internal transcribed spacer and 28S rDNA (large subunit) sequences, the isolate, DUCC401, was identified as Mariannaea samuelsii. Mycelia of the fungus grew faster on malt extract agar than on potato dextrose agar and oatmeal agar media. Temperature and pH for optimal growth of fungal mycelia were 25oC and pH 7.0, respectively. The fungus demonstrated the capacity to degrade cellobiose, starch, and xylan. This is the first report on isolation of Mariannaea samuelsii in Korea.
In this study, we examined arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) community structure colonizing field-cultivated ginseng roots according of different ages, such as 1- to 5-year-old plant, collected from Geumsan-gun, Korea. A total of seven AMF species namely, Funnelliformis caledonium, F. moseae, Gigaspora margarita, Paraglomus laccatum, P. occultum, Rhizophagus irregularis, and Scutellospora heterogama were identified from the roots using cloning, PCR-restriction fragment length polymorphism and sequence analysis of the large subunit region in rDNA. AMF species diversity in the ginseng roots decreased with the increase in root age because of the decreased species evenness. In addition, the community structures of AMF in the roots became more uniform. These results suggest that the age of ginseng affects mycorrhizal colonization and its community structure.
In the screening of fungal diversity, two strains were collected from the soil of Yeongcheon and dissected guts from the bodies of Chinese rice grasshopper (Oxya chinensis), Chinese grasshopper (Acrida cinerea), and Far eastern devil grasshopper (Oedaleus infernalis) from Daejeon in Korea. They were identified as Umbelopsis vinacea (KNU-YC-1801B) and Mucor hiemalis f. corticola (KNU-20F7, KNU-20F8, KNU-20F9). Multigene phylogenetic analyses of the internal transcribed spacer (ITS) regions, and large subunit (LSU) sequence data confirmed two unreported taxa along with their morphology. The results of molecular phylogeny firmly supported the detailed description and illustration for each taxon. As far as we know, both Umbelopsis vinacea and Mucor hiemalis f. corticola are the first reported taxa in Korea.
A fungal strain was isolated from a soil sample collected in Korea and designated as YW23-8. Based on a sequence analysis of the internal transcribed spacer (ITS) regions, the isolate was assigned to the genus Sarcopodium. Moreover, a phylogenetic analysis based on the concatenated nucleotide sequences of the ITS regions and the large subunit of the nuclear ribosomal RNA (LSU) gene showed that the strain YW23-8 occupies a distinct phylogenetic position within Sarcopodium. The isolate had significant differences from its closest neighbors, S. circinosetiferum, S. circinatum, S. macalpinei, and S. vanillae. Morphological features such as different conidial structures, the absence of septation in conidia, and the presence of milky white watery droplets along with the results of the phylogenetic analysis clearly distinguish YW23-8 from the closest Sarcopodium species. We therefore conclude that strain YW23-8 represents a novel species of the genus Sarcopodium for which we propose the name Sarcopodium terrigenum.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.