• Title/Summary/Keyword: LIMS(Laboratory Information Management System)

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A Study on Big Data Processing Technology Based on Open Source for Expansion of LIMS (실험실정보관리시스템의 확장을 위한 오픈 소스 기반의 빅데이터 처리 기술에 관한 연구)

  • Kim, Soon-Gohn
    • The Journal of Korea Institute of Information, Electronics, and Communication Technology
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    • v.14 no.2
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    • pp.161-167
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    • 2021
  • Laboratory Information Management System(LIMS) is a centralized database for storing, processing, retrieving, and analyzing laboratory data, and refers to a computer system or system specially designed for laboratories performing inspection, analysis, and testing tasks. In particular, LIMS is equipped with a function to support the operation of the laboratory, and it requires workflow management or data tracking support. In this paper, we collect data on websites and various channels using crawling technology, one of the automated big data collection technologies for the operation of the laboratory. Among the collected test methods and contents, useful test methods and contents useful that the tester can utilize are recommended. In addition, we implement a complementary LIMS platform capable of verifying the collection channel by managing the feedback.

A Study on the Development of Knowledge Management System for Biotechnology Laboratory (Biotechnology 연구실을 위한 지식 경영시스템의 개발에 관한 연구)

  • Bae, Jin;Yang, Yeo-Joo;Rho, Jae-Jeung
    • Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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    • 2002.05a
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    • pp.273-283
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    • 2002
  • 2000년 7월 인간게놈프로젝트 (Human Genome Project)가 완성되면서 Biotechnology(BT)산업에 대하여 많은 관심이 집중되고 있다. BT산업은 기술집약적·지식집약적인 산업 특성을 가지고 있고 R&D 활동의 중요성이 두드러진다. 이에 따라 방대한 데이터와 지식에 대한 효율적인 관리 등 R&D 전 과정에 걸쳐 생성되는 지식들에 대한 체계적인 관리가 요구된다 본 연구에서는 BT산업의 기초 조직인 BT연구실의 효과적이며 효율적인 업무 수행을 지원하기 위하여 기존의 지식경영시스템(Knowledge Management System, KMS)에 실험실정보관리시스템(Laboratory Information Management System, LIMS)이 통합된 BT실험실의 지식경영시스템 모델을 제시하였다. 이를 위해 BT연구실에서 생성되는 지식들의 체계를 분류하고 지식경영시스템 구축에 있어서의 핵심성공요인을 분석하였으며, 분석 결과를 바탕으로 모델을 개발하여 대학교 유전자 연구실에 실제 적용하였다.

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A Study for the design of a Mobile Medical Care System M-LIMS

  • Yang, Kyung-Sik;Koo, Kyung-Wan
    • International Journal of Internet, Broadcasting and Communication
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    • v.7 no.2
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    • pp.84-89
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    • 2015
  • About 30% of Mongolian population is populated in the capital of the nation. Too many hospitals are concentrated in size as compared to the capital. This creates a difficult environment to provide equal distribution of medical benefit. In order to resolve this issue of medical benefit inequality, a portable/travelling medical treatment system using 'M-LIMS' is proposed for real-life application. The system with M-LIMS to be designed will include functions such as composing, sharing charts among doctors, standardizing charts. M-LIMS will be designed considering Mongol's regional characteristics, and application plans will be proposed accordingly.

A DNA Microarray LIMS System for Integral Genomic Analysis of Multi-Platform Microarrays

  • Cho, Mi-Kyung;Kang, Jason Jong-ho;Park, Hyun-Seok
    • Genomics & Informatics
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    • v.5 no.2
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    • pp.83-87
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    • 2007
  • The analysis of DNA microarray data is a rapidly evolving area of bioinformatics, and various types of microarray are emerging as some of the most exciting technologies for use in biological and clinical research. In recent years, microarray technology has been utilized in various applications such as the profiling of mRNAs, assessment of DNA copy number, genotyping, and detection of methylated sequences. However, the analysis of these heterogeneous microarray platform experiments does not need to be performed separately. Rather, these platforms can be co-analyzed in combination, for cross-validation. There are a number of separate laboratory information management systems (LIMS) that individually address some of the needs for each platform. However, to our knowledge there are no unified LIMS systems capable of organizing all of the information regarding multi-platform microarray experiments, while additionally integrating this information with tools to perform the analysis. In order to address these requirements, we developed a web-based LIMS system that provides an integrated framework for storing and analyzing microarray information generated by the various platforms. This system enables an easy integration of modules that transform, analyze and/or visualize multi-platform microarray data.

The Intelligent Clinical Laboratory as a Tool to Increase Cancer Care Management Productivity

  • Mohammadzadeh, Niloofar;Safdari, Reza
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • v.15 no.6
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    • pp.2935-2937
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    • 2014
  • Studies of the causes of cancer, early detection, prevention or treatment need accurate, comprehensive, and timely cancer data. The clinical laboratory provides important cancer information needed for physicians which influence clinical decisions regarding treatment, diagnosis and patient monitoring. Poor communication between health care providers and clinical laboratory personnel can lead to medical errors and wrong decisions in providing cancer care. Because of the key impact of laboratory information on cancer diagnosis and treatment the quality of the tests, lab reports, and appropriate lab management are very important. A laboratory information management system (LIMS) can have an important role in diagnosis, fast and effective access to cancer data, decrease redundancy and costs, and facilitate the integration and collection of data from different types of instruments and systems. In spite of significant advantages LIMS is limited by factors such as problems in adaption to new instruments that may change existing work processes. Applications of intelligent software simultaneously with existing information systems, in addition to remove these restrictions, have important benefits including adding additional non-laboratory-generated information to the reports, facilitating decision making, and improving quality and productivity of cancer care services. Laboratory systems must have flexibility to change and have the capability to develop and benefit from intelligent devices. Intelligent laboratory information management systems need to benefit from informatics tools and latest technologies like open sources. The aim of this commentary is to survey application, opportunities and necessity of intelligent clinical laboratory as a tool to increase cancer care management productivity.

Development of Distributed LIMS for Microarray Data Share (마이크로어레이 데이터 공유를 위한 분산 LIMS개발)

  • Kim Hye-Jung;Cho Hwan-Gue
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2005.11b
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    • pp.247-249
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    • 2005
  • 마이크로어레이 기술로 인해 많은 양의 유전자 발현 데이터가 생겨났다. 데이터의 양이 많아짐에 따라 이를 체계적으로 관리해야 할 필요가 생겼고 이를 위해 LIMS(Laboratory Information Management System)가 만들어졌다. LIMS는 실험 데이터를 체계적으로 관리할 뿐만 아니라 같은 실험실에 있는 연구자 간에 데이터를 공유할 수 있는 장점을 갖고 있다. 만일 여러 연구실 간에 공동연구를 한다면 데이터의 공유가 필요하게 된다. 이를 좀 더 편리하게 하기 위해 다른 연구실의 LIMS에 저장된 데이터 중에 허용된 데이터에 한해서 자신의 LIMS에서 바로 접근할 수 있도륵 하는 분산 LIMS를 소개하고자 한다.

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Import quarantine for supporting local fisheries 'M-LIMS' Analysis and Design (수입 수산물의 현지 검역 지원용 'M-LIMS'의 분석 및 설계)

  • Yang, Kyung-Sik;Ahn, Woo-Young;Park, Sung-Sik;Koo, Kyung-Wan
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2014.07a
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    • pp.433-436
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    • 2014
  • 기존 수입 수산물 검역체계는 수십억의 예산을 사용하고 있다. 하지만, 현지 조사에서도 파견원을 보내는 시간이 존재하고 그에 따라 수산물의 상태가 달라질 수 도 있다. 이 논문에서는 이러한 검역체계의 한계를 극복하기 위하여 차량 내부에 장비를 설치 데이터를 분석 후 Server에 전송하는 시스템을 제안한다. 이 시스템을 사용하여 기존 검역체계의 단점을 보완한다. 그리고 베트남을 예상 시나리오로 설정하고 계획을 하였다. 이 시스템은 시간, 공간적인 제약을 극복하고 실시간 상호작용이 원활한 시스템으로 마련될 것이다.

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GELIM: An Integrated System with Genetic Network Analyzer and LIMS (GELIM: 유전자 네트워크 분석과 데이터 관리를 위한 통합 시스템)

  • Kim, Hye-Jung;Cho, Hwan-Gue;Park, Seon-Hee;Shin, Mi-Young;Jung, Ho-Youl;Lee, Kyung-Shin
    • Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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    • 2004.11a
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    • pp.286-295
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    • 2004
  • 생물학적으로 의미 있는 결과를 도출하기 위해서는 많은 실험 데이터가 필요하다. 최근에는 마이크로 어레이 실험 기술이 발달함에 따라 대량의 데이터를 얻을 수 있게 되었고, 이로 인해서 데이터를 체계적으로 관리하고 필요한 정보를 습득할 수 있는 시스템이 필요하게 되었다. LIMS(Laboratory Information Management System) 는 이러한 요구 조건을 충족시키기 위한 시스템으로 기존의 파일 시스템에 의존해서 비효율적으로 실험 데이터를 관리해 오던 것을 체계적이고 효율적으로 관리해 주기 위한 시스템이다. 대량의 유전자 발현 데이터의 생산은 유전자의 조절 네트워크 예측을 가능하게 하였다. 유전자간의 상호 작용을 분석하는 것은 세포의 활동을 이해하는데 매우 중요한 요소라고 할 수 있다. 본 논문에서는 기존의 LIMS 기능과 유전자 조절 네트워크 분석 시스템을 통합하여 사용자가 쉽게 데이터를 공유 및 습득할 수 있으며 편리한 사용자 인터페이스를 이용하여 컴퓨터에 익숙하지 않은 실험들도 쉽게 사용할 수 있는 GELIM(an Integrated system with GEnetic network analyzer and LIMs) 을 소개한다.

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Design of Laboratory Information Management System as a Knowledge Creation Tool for the KMS of BT Laboratory (BT 실험실의 KMS를 위한 지식 생성 툴로써의 실험실정보관리시스템 설계)

  • Bae, Jin;Hwang, Yoon-Min;Rho, Jae-Jeung
    • 한국IT서비스학회:학술대회논문집
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    • 2003.05a
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    • pp.428-435
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    • 2003
  • Post-Genome 시대의 Biotechnology(BT) 산업에 세계적으로 관심과 투자가 증가하고 있다. BT 산업은 기술 및 지식 집약적 특성상 R&D 활동이 중요하기에 BT 연구실의 실험 생산성 증가에 대한 연구가 필요하다. 이와 관련하여 연구실 지식경영과 지식경영시스템활용에 관한 연구가 활발히 진행되고 있다. 하지만 그 초점이 연구 지식들의 조직화, 체계화 및 검색기능 등의 원활한 지식 공급 시스템 구축에 있기에 효율적이고 효과적인 지식 생성 방안을 제시해 주지 못하고 있다. 이에 본 연구는 실험실 내 데이터 처리 및 통합 관리 역할을 해온 LIMS(Laboratory Information Management System)를 활용하여 실험 데이터들로부터 실험 디자인을 위한 효율적이고 효과적인 형식지(Explicit Knowledge)의 생성을 목적으로 하는 지식 생성 툴(Knowledge Creation Tool)을 설계하였다. 또한 상기 모델을 적용하여 실제 어떠한 형태로 지식이 생성되는지 A대학교 B유전자 연구실의 실험 데이터로 실증 분석해 보았다.

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A Study on How to Build a Cloud-based Laboratory Information Management System and Provide SaaS(Software as a Service) (클라우드 기반의 실험실정보관리시스템 구축 및 SaaS 제공 방안에 관한 연구)

  • Lim, Bock-Chool;Ryu, Ki-Sang
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2020.05a
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    • pp.327-329
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    • 2020
  • 실험실정보관리시스템 (LIMS)은 실험실 데이터를 저장, 가공, 검색 그리고 분석하기 위한 중앙화된 데이터베이스로서 정유, 석유화학, 정밀화학, 제조업, 금속, 제철, 식품, 의약, 연구소, 보건환경, 검사소 등 다양한 분야에 말라하여 적용이 가능한 시스템이다. LIMS를 재고 관리, 임상 연구, 프로젝트 관리 및 환자 데이터 관리를 위한 강력한 IT도구하고 하면서 특히 의료 분야에서 환자 치료가 향상되고 서비스 효율성이 높아짐 것이라고 하고 운영 비용의 절감이 가능하다. 확장성 및 비용절감과 핵심 기능을 위주로 제공하는 클라우드 및 웹 기반 솔루션의 발전으로 제4차 산업혁명의 핵심기술의 산증인의 분야로 기대가 된다.