Purpose: An underlying factor for the failure of several clinical trials of anti-epidermal growth factor receptor (EGFR) therapies is the lack of an effective method to identify patients who overexpress EGFR protein. The quantitative dot blot method (QDB) was used to measure EGFR protein levels objectively, absolutely, and quantitatively. Its feasibility was evaluated for the prognosis of overall survival (OS) of patients with gastric cancer. Materials and Methods: Slices of 2×5 ㎛ from formalin-fixed paraffin-embedded gastric cancer specimens were used to extract total tissue lysates for QDB measurement. Absolutely quantitated EGFR protein levels were used for the Kaplan-Meier OS analysis. Results: EGFR protein levels ranged from 0 to 772.6 pmol/g (n=246) for all gastric cancer patients. A poor correlation was observed between quantitated EGFR levels and immunohistochemistry scores with ρ=0.024 and P=0.717 in Spearman's correlation analysis. EGFR was identified as an independent negative prognostic biomarker for gastric cancer patients only through absolute quantitation, with a hazard ratio of 1.92 (95% confidence interval, 1.05-3.53; P=0.034) in multivariate Cox regression OS analysis. A cutoff of 208 pmol/g was proposed to stratify patients with a 3-year survival probability of 44% for patients with EGFR levels above the cutoff versus 68% for those below the cutoff based on Kaplan-Meier OS analysis (log rank test, P=0.002). Conclusions: A QDB-based assay was developed for gastric cancer specimens to measure EGFR protein levels absolutely, quantitatively, and objectively. This assay should facilitate clinical trials aimed at evaluation of anti-EGFR therapies retrospectively and prospectively for gastric cancer.
우리 주위를 살펴보면 한 번 사용하고 버리는 일회용품이 많다. 폭죽이나 탄약과 같은 일회용품이 대표적인데 이들 일회용품은 제조 후 한 동안 저장되어 있다가 필요한 때 사용하고 나면 폐기처분하게 된다. 하지만 이런 일회용품은 일반 운영장비와 달리 신뢰성평가가 제대로 이루어지지 못했다. 이에 본 연구에서는 일회용품 중에서 탄약에 대한 저장탄약신뢰성프로그램을 통해 탄약의 경우 신뢰성 확보를 위해 정부에서 어떤 일을 하는지 먼저 살펴본다. 이어서 통계분석적인 측면에서 탄약과 같은 일회용품에 대한 신뢰성분석 방안으로 어떤 것이 있는지 알아본다. 구체적으로 통계학에서 로트의 품질수준을 파악하는 샘플링검사를 활용하여 일정한 시기에 생산된 탄약에 대한 신뢰성의 수준을 파악할 수 있다. 본 연구에서는 KS Q0001인 계수규준형 1회 샘플링검사표를 이용할 수 있음으로 보여준다. 다음으로 탄약의 저장신뢰도를 파악할 수 있는 방법으로 비모수적인 방법과 모수적인 방법을 소개한다. 비모수적인 방법중에서 특히 Kaplan-Meier 방법은 중도중단데이터가 포함된 경우에도 활용될 수 있다. 마지막으로 모수적인 방법 중에는 신뢰성분석에 많이 활용되는 와이블분포가 탄약의 저장신뢰도를 파악하는 데에도 활용될 수 있다.
본 논문은 중도중단 데이터가 포함된 생존데이터의 경우 적용할 수 있는 기계학습 방법에 대해 살펴보았다. 우선 탐색적인 자료분석으로 각 특성에 대한 분포, 여러 특성들 간의 관계 및 중요도 순위를 파악할 수 있었다. 다음으로 독립변수에 해당하는 여러 특성들과 종속변수에 해당하는 특성(사망여부) 간의 관계를 분류문제로 보고 logistic regression, K nearest neighbor 등의 기계학습 방법들을 적용해본 결과 적은 수의 데이터이지만 통상적인 기계학습 결과에서와 같이 logistic regression보다는 random forest가 성능이 더 좋게 나왔다. 하지만 근래에 성능이 좋다고 하는 artificial neural network나 gradient boost와 같은 기계학습 방법은 성능이 월등히 좋게 나오지 않았는데, 그 이유는 주어진 데이터가 빅데이터가 아니기 때문인 것으로 판명된다. 마지막으로 Kaplan-Meier나 Cox의 비례위험모델과 같은 통상적인 생존분석 방법을 적용하여 어떤 독립변수가 종속변수 (ti, δi)에 결정적인 영향을 미치는지 살펴볼 수 있었으며, 기계학습 방법에 속하는 random forest를 중도중단 데이터가 포함된 생존데이터에도 적용하여 성능을 평가할 수 있었다.
Background: Assessments of air leaks are usually performed subjectively, precluding the use of air leaks as an evaluation factor. We aimed to identify objective parameters as predictive factors for prolonged air leak (PAL) and air leak cessation (ALC) from air flow data produced by a digital drainage system. Methods: Flow data records of 352 patients who underwent lung lobectomy were reviewed, and flow data at designated intervals (1, 2, and 3 hours postoperatively [POH] and 3 times a day thereafter [06:00, 13:00, 19:00]) were extracted. ALC was defined by flow less than 20 mL/min over 12 hours, and PAL was defined as ALC after 5 days. Cumulative incidence curves were obtained using Kaplan-Meier estimates of time to ALC. Cox regression analysis was performed to determine the effects of variables on the rate of ALC. Results: The incidence of PAL was 18.2% (64/352). Receiver operating characteristic curve analysis showed cut-off values of 180 mL/min for the flow at 3 POH and 73.3 mL/min for the flow on postoperative day 1; the sensitivity and specificity of these values were 88.9% and 82.5%, respectively. The rates of ALC by Kaplan-Meier analysis were 56.8% at 48 POH and 65.6% at 72 POH. Multivariate Cox regression analysis revealed that the flow at 3 POH (≤80 mL/min), operation time (≤220 minutes), and right middle lobectomy independently predicted ALC. Conclusion: Air flow measured by a digital drainage system is a useful predictor of PAL and ALC and may help optimize the hospital course.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제8권1호
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pp.99-109
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1997
The estimation procedure of mean residual life function has been placed an important role in the study of survival analysis. In this paper, the product limit estimator on left truncated and right censoring model is proposed with asymptotic properties. Also, the small sample properties are investigated through the Monte Carlo study and the proposed product limit type estimator is compared with ordinary Kaplan-Meier type estimator.
목적: 보철물 수명 연구에서 가장 중요한 것은 보철물을 객관적이고 일관성 있게 평가하는 것이다. 대한치과보철학회에서는 이 필요성을 충족시키기 위해 보철물 수명연구를 위한 대한치과보철학회의 표준 방안을 마련하기로 하였다. 본 연구의 목적은 보철물 수명 연구의 통일된 표준을 마련하기 위한 보철물 평가 흐름도와 보철물 평가 기록지를 제작하는 데 있다. 재료 및 방법: 기존에 사용되었던 보철물 평가 방법을 문헌 고찰을 통해 알아본 후 직관적이며, 사용하기 쉽고, 보철물의 상태를 객관적으로 구분할 수 있는 평가 기준을 개발한다. 또한 이 기준을 시범 사용하여 문제점과 개선점을 파악한다. 결과: 고정성 보철물 30 증례, 가철성 보철물 25증례, 그리고 임플란트 보철물 13 증례로 시범 사용하여 Kaplan-Meier 생존율 분석을 시행한 결과 고정성 보철물의 평균수명 추정치는 12.82년, 가철성 보철물은 5.96년, 임플란트 보철물은 4.82년의 결과를 얻었다. 또한 조사자들에게 시범 사용 후의 문제점을 수렴하여 수정, 보완한 후 보철물 평가흐름도 및 보철물 평가 기록지를 완성하였다. 결론: 보철물 수명 평가를 위한 대한치과보철학회 표준 방안 마련을 위해 개발된 보철물 평가 흐름도와 보철물 평가 기록지를 통해 보다 객관적이고 통일된 자료 수집이 가능하였다. 향후 본 표준 방안을 이용한 보철물 수명연구가 시행될 것이다.
목적: 이 연구의 목적은 새롭게 개발된 대한치과보철학회의 보철물 평가 기준을 적용하여 고정성, 가철성 그리고 임플란트 보철물의 성공과 실패를 평가함으로써 보철물의 수명과 이에 관련된 요인을 분석하는 데 있다. 대상 및 방법: 전국 13개 대학/종합병원 보철과에 내원한 환자들을 대상으로 구강내 사용중인 보철물을 평가하였다. 대한치과보철학회의 기준에 따라, 수는 성공, 우, 양, 가는 실패로 규정하고, 실패한 보철물의 평균 사용기간과 실패와 관련된 요인을 분석하였다. Kaplan-Meier 분석에 의한 성공률을 분석하였다. 결과: 고정성 보철 810 증례, 가철성 보철 519 증례, 그리고 임플란트 보철 475 증례, 총 1,804 증례가 연구에 포함되었다. 검사 시점에 실패로 판정된 보철물의 평균 사용기간은 고정성 보철물은 $11.41{\pm}0.30$년, 중간값은 10년이었고, 가철성 보철물은 $8.18{\pm}0.29$년, 중간값 7년이었으며, 임플란트 보철물은 $7.99{\pm}0.30$년, 중간값은 7년이었다. 실패와 관련있는 요인 중 고정성보철물은 유닛 수, 지대치 수, 근관치료된 지대치 수, 치태지수였고, 가철성 보철물의 경우 대합치였으며 임플란트 보철의 경우 임플란트 개수, 사용기간, 치태지수였다. 결론: 대한치과보철학회의 기준으로 보철물을 평가한 결과, 실패한 보철물의 평균수명은 고정성 11.41년, 가철성 8.18년, 그리고 임플란트 보철물은 7.99년이었다.
Background: Previous studies have showed that argonaute 2 is a potential factor related to genesis of several cancers, however, there have been no reports concerning gliomas. Methods: Paraffin specimens of 129 brain glioma cases were collected from a hospital affiliated to Binzhou Medical University from January 2008 to July 2013. We examined both argonaute 2 mRNA and protein expression by real-time quantitative PCR (qRT-PCR), Western blot analysis, and immunohistochemistry (IHC). The survival curves of the patients were determined using the Kaplan-Meier method and Cox regression, and the log-rank test was used for statistical evaluations. Results: Both argonaute 2 mRNA and protein were upregulated in high-grade when compared to low-grade tumor tissues. Multivariate analysis revealed that argonaute 2 protein expression was independently associated with the overall survival (HR=4.587, 95% CI: 3.001-6.993; P=0.002), and that argonaute 2 protein expression and WHO grading were independent prognostic factors for progression-free survival (HR=4.792, 95% CI: 3.993-5.672; P<0.001, and HR=2.109, 95% CI: 1.278-8.229; P=0.039, respectively). Kaplan-Meier analysis with the log-rank test indicated that high argonaute 2 protein expression had a significant impact on overall survival (P=0.0169) and progression-free survival (P=0.0324). Conclusions: The present study showed that argonaute 2 expression is up-regulated in gliomas. Argonaute 2 might also serve as a novel prognostic marker.
Background: MicroRNAs are a class of noncoding RNAs which regulate multiple cellular processes during tumor development. The purpose of this report is to investigate the clinicopathological and prognostic significance of miR-218 in human gliomas. Materials and Methods: Quantitative RT-PCR (qRT-PCR) was conducted to detect the expression of miR-218 in primary normal human astrocytes, three glioma cell lines and 98 paired glioma and adjacent normal brain tissues.Associations of miR-218 with clinicopathological variables of glioma patients were statistically analyzed. Finally, a survival analysis was performed using the Kaplan-Meier method and Cox's proportional hazards model. Results: The expression level of miR-218 in primary normal human astrocytes was significantly higher than that in glioma cell lines (p<0.01). Also, the expression level of miR-218 in glioma tissues was significantly downregulated in comparison with that in the adjacent normal brain tissues (p<0.001). Statistical analyses demonstrated that low miR-218 expression was closely associated with advanced WHO grade (p=0.002) and low Karnofsky performance score (p=0.010) of glioma patients. Kaplan-Meier analysis with the log-rank test showed that patients with low-miR-218 expression had poorer disease-free survival and overall survival (p=0.0045 and 0.0124, respectively). Multivariate analysis revealed that miR-218 expression was independently associated with the disease-free survival (p=0.009) and overall survival (p=0.004) of glioma patients. Conclusions: Our results indicate that miR-218 is downregulated in gliomas and that its status might be a potential valuable biomarker for glioma patients.
Background: The interaction between tumor cells and inflammatory cells has not been systematically investigated in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). The aim of the present study was to evaluate whether preoperative the lymphocyte-monocyte ratio (LMR), the neutrophil-lymphocyte ratio (NLR), and the platelet-lymphocyte ratio (PLR) could predict the prognosis of ESCC patients undergoing esophagectomy. Materials and Methods: Records from 218 patients with histologically diagnosed ESCC who underwent attempted curative surgery from January 2007 to December 2008 were retrospectively reviewed. Besides clinicopathological prognostic factors, we evaluated the prognostic value of the LMR, the NLR, and the PLR using Kaplan-Meier curves and Cox regression models. Results: The median follow-up was 38.6 months (range 3-71 months). The cut-off values of 2.57 for the LMR, 2.60 for the NLR and 244 for the PLR were chosen as optimal to discriminate between survival and death by applying receiver operating curve (ROC) analysis. Kaplan-Meier survival analysis of patients with low preoperative LMR demonstrated a significant worse prognosis for DFS (p=0.004) and OS (p=0.002) than those with high preoperative LMR. The high NLR cohort had lower DFS (p=0.004) and OS (p=0.011). Marginally reduced DFS (p=0.068) and lower OS (p=0.039) were found in the high PLR cohort. On multivariate analysis, only preoperative LMR was an independent prognostic factor for both DFS (p=0.009, HR=1.639, 95% CI 1.129-2.381) and OS (p=0.004, HR=1.759, 95% CI 1.201-2.576) in ESCC patients. Conclusions: Preoperative LMR better predicts cancer survival compared with the cellular components of systemic inflammation in patients with ESCC undergoing esophagectomy.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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