• 식물분류학회지
• /
• 제52권3호
• /
• pp.156-172
• /
• 2022

Campsis grandiflora (Thunb.) K. Schum is an ornamental species with various useful biological effects. The chloroplast genome of C. grandiflora isolated in Korea is 154,293 bp long (GC ratio: 38.1%) and has four subregions: 84,121 bp of large single-copy (36.2%) and 18,521 bp of small single-copy (30.0%) regions are separated by 24,332 bp of inverted repeat (42.9%) regions including 132 genes (87 protein-coding genes, eight rRNAs, and 37 tRNAs). One single-nucleotide polymorphism and five insertion and deletion (INDEL) regions (40-bp in total) were identified, indicating a low level of intraspecific variation in the chloroplast genome. All five INDEL regions were linked to the repetitive sequences. Seventy-two normal simple sequence repeats (SSRs) and 47 extended SSRs were identified to develop molecular markers. The phylogenetic trees of 29 representative Bignoniaceae chloroplast genomes indicate that the tribe-level phylogenic relationship is congruent with the findings of previous studies.

• 한국어업기술학회:학술대회논문집
• /
• 한국어업기술학회 2000년도 춘계수산관련학회 공동학술대회발표요지집
• /
• pp.533-534
• /
• 2000

In general, intertidal gastropods display a considerable amount of intraspecific shell variation (De Wolf et al., 1998). Particularly, thaisid species, including Thais clavigera(=T.c.), have been shown a variety of shell variation in the world ocean (e.g. T, emerginata in Kitching, 1976). Nomura (1926) noted local variation of shell morphology based on five Japanese populations. Ahe (1985) classified Japanese T.c. into two forms (Form-C ＆. -P). In the Korean waters, a strong variation in nodule shape of T.c, shell has also been noted by Choe ＆ Park (1997). Taxonomy of T.c. is controversial so far. (omitted)

• 생명과학회지
• /
• 제22권11호
• /
• pp.1470-1476
• /
• 2012

본 연구는 유럽에서 식용버섯으로 선호도가 높은 Lepista nuda (민자주방망이버섯)에 대하여 random amplified polymorphic DNA (RAPD)와 internal transcribed spacer (ITS) 염기서열을 이용하여 종내 및 종간의 유전적 변이를 분석하였다. RAPD 분석 결과 40개의 random primer 중 다형성을 나타내는 primer는 22개 였으며, 증폭된 밴드는 355개, DNA 단편의 크기는 200~4,000 bp의 사이에 위치하였다. RAPD band들을 marker로 하여 Nei-Li's의 방법을 이용한 비유사도 지수행렬을 조사한 결과 L. nuda 종내 유전적 변이는 0~21.60%로 나타났으며, L. nuda와 L. sordida의 종간에는 16.93~24.82%, L. irina와는 20.62~25.54%로 나타났으며, L. sordida와 L. irina와의 종간 변이는 23.49%로 나타났다. ITS I 과 II 영역의 673 bp의 염기서열을 분석하여 비유사도 지수행렬을 조사한 결과, L. nuda의 종내 변이는 1.58~11.47%였으며, L. nuda와 L. sordida와는 3.83~12.88%로 나타났다. 그리고 L. nuda와 L. irina는 7.11~15.61%였으며, L. sordida와 L. irina와의 종간 변이는 4.79%로 나타났다. 본 실험결과 RAPD와 ITS실험을 통해 확인된 primer와 연기서열은 Lepista속의 종을 검색 및 분류 시 유전적 표지 marker로서 이용 할 수 있을 것으로 생각된다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제39권2호
• /
• pp.61-66
• /
• 2023

Through a taxonomic study on solitary corals collected from subtidal zones of South and East Seas from 2019 to 2022, Paracyathus rotundatus, an unrecorded species belonging to family Caryophylliidae, is newly added to the anthozoan fauna of Korea. In addition, comparing partial 16S rRNA sequences with a length of 269 bp according to color variation clarified that there were no sequence differences among specimens with color variation, indicating that the color variation is due to intraspecific variation. As a result of this study, a total of 7 genera and 8 species belonging to the Caryophylliidae family have been reported in Korean waters so far.

• 식물분류학회지
• /
• 제44권3호
• /
• pp.202-207
• /
• 2014

섬괴불나무(Lonicera insularis Nakai)는 인동과(Caprifoliaceae) 인동속(Lonicera L.) 에 속하는 관목으로 울릉도와 독도의 해안가 지역에 분포하는 한국특산식물이다. 섬괴불나무와 인동속의 근연종인 괴불나무, 청괴불나무, 각시괴불나무, 길마가지나무, L. morrowii, 병꽃나무 7분류군과의 유연관계를 밝히고, 섬괴불나무의 종내 변이를 확인하기 위해 엽록체 DNA 5개 영역의 염기서열을 분석하였다. 분석결과 전체 3.2kb의 염기서열이 결정되었고, 섬괴불나무와 L. morrowii 에서 2개의 엽록체 DNA haplotype(CP01-02)이 결정되었다. 섬괴불나무는 한 개의 염기치환으로 CP01 type과 CP02 type으로 구별되었으며, 일본의 L. morrowii와는 CP02 type을 공유하였다. 섬괴불나무에서 확인 된 두 개의 CP type은 1) 진화적으로 뚜렷한 두 개 이상의 계통을 가지며, 이는 하나 이상의 유입경로를 통해 울릉도로 유입되었을 가능성을 높게 지지한다. 그리고, 2) 형태학적으로 구별되는 섬괴불나무와 L. morrowii의 CP type의 공유는 두 종의 지리적인 장벽에 의한 이소적종분화의 결과로 추론할 수 있다. 본 연구에서 확인된 울릉도와 독도의 섬괴불나무의 종내 변이 및 다양성에 관한 결과는 울릉도 및 독도 식물의 분자생물지리학적 연구로 대양섬의 생물학적 진화양상과 종 분화 과정에 중요한 기초 자료로 활용될 것이다.

• Journal of Ecology and Environment
• /
• 제31권3호
• /
• pp.207-211
• /
• 2008

We investigated the leaf demography of a temperate woody liana, Akebia trifoliata, in a temperate forest in Japan, Akebia is semi-evergreen: some leaves are shed before winter, while others remain through the winter. Previous studies of semi-evergreen species found that variation in leaf life span was caused by variation in the timing of leaf emergence, Leaves that appeared just before winter over-wintered, while leaves appearing earlier were shed, However, it is unclear whether leaves of the same cohort (i.e., leaves that appear at the same time within a single site) show variation in life span under the effect of strong seasonality. To separate variation in life span among the leaves in each cohort from variation among cohorts, we propose a new method - the single leaf diagram, which shows the emergence and death of each leaf. Using single leaf diagrams, our study revealed that Akebia leaves within a cohort showed substantial variation in life span, with some over-wintering and some not. In addition, leaves on small ramets in the understory showed great variation in life span, while leaves on large ramets, which typically reach higher positions in the forest canopy, have shorter lives, As a result, small ramets were semi-evergreen, whereas large ramets were deciduous, The longer lives of leaves on small ramets can be interpreted as a shade-adaptive strategy in understory plants.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제35권4호
• /
• pp.182-185
• /
• 2019

In this study, cytochrome c oxidase subunit I(COI) sequences of 17 individuals from six Korean diogenid species(i.e., 2 Areopaguristes japonicus, 4 A. nigroapiculus, 3 Paguristes digitalis, 4 P. ortmanni, 3 Diogenes edwardsii, and 1 Ciliopagurus kempfi) were determined and analyzed. The DNA barcoding results of this study were consistent with the morphological identification of these six species. Interspecific variations of COI sequences within six Korean diogenid species exceeded the minimum interspecific variation of diogenid hermit crabs in previous studies. Little intraspecific variation exists except for P. digitalis. This study should facilitate further molecular taxonomy of East Asian diogenids.

• 한국어업기술학회:학술대회논문집
• /
• 한국어업기술학회 2001년도 추계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
• /
• pp.303-304
• /
• 2001

The family Ulvaceae species are difficult to distinguish from one another on the basis of morphological and cytological criteria alone. ITS2 sequences are hewn to evolve quickly and have been reported to be useful for the study of intraspecific and interspecific variation and biogeography in algae (Bakker et al., 1992). We will here describe the basic characteristics of the ITS2 sequences in Ulva and Effteromorpha to compare our result with the above previous studies. (omitted)

• Mycobiology
• /
• 제39권2호
• /
• pp.125-128
• /
• 2011

Enzyme activities of Cenococcum geophilum isolates were examined on enzyme- specific solid media. Deoxyribonuclease, phosphatase, and urease were detected in all isolates, whereas cellulase was not detected in any of the isolates. Variations in enzyme activities of amylase, caseinolysis, gelatinase, lipase, and ribonuclease were observed among isolates.

• 식물분류학회지
• /
• 제40권3호
• /
• pp.157-162
• /
• 2010

우리나라의 울릉도와 독도에 분포하는 한국특산종인 섬기린초는 해안암석지대를 터전으로 넓게 분포하여 울릉도 생태계의 중요한 부분을 차지하고 있다. 본 연구는 섬기린초에 대한 엽록체 DNA의 trnL/F intergenic spacer 염기서열을 총 32개체에 대하여 조사하였다. 그 결과, 정렬된 염기서열 중 하나의 6-bp indel (-ATTCAC-)에 의하여 두 개의 type (TYPE01: 297bp과 TYPE02: 291bp)을 확인하였다. 확인된 두 개의 엽록체 DNA type은 울릉도와 독도에서 뚜렷한 지리적 분포양상을 보여주었다. TYPE01은 울릉도(15개체)에서만 관찰되었고 TYPE02는 울릉도(12개체)와 독도(5개체)에서 확인되었다. 섬기린초는 하나의 6-bp indel에 의하여 서로 다른 두 개의 엽록체 DNA haplotype이 확인되고 뚜렷한 지리적 분포양상을 보여주기 때문에, 울릉도와 독도에 자생하는 개체군 내에 진화적으로 서로 다른 두 개의 계통이 있음을 추정할 수 있고 울릉도와 독도 간 원거리 분산 기작의 가능성을 지지하였다.