• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권12호
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• pp.1716-1721
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• 2003

Steroid hormones and their receptors play an important role in reproductive process. Estrogen is intimately involved with pregnancy and its function is mediated through the estrogen receptor which has been chosen as a candidate gene to study litter size in pigs. In this study, we report that two estrogen receptor variants, designated pER-1 and pER-2 were co-expressed in the uteri of normal cycling Lan-Yu pig (Sus vittatus; a small-ear miniature in Taiwan) with the pER-1 expression level appeared to be several times higher than that of pER-2. These receptor variants were isolated using reverse transcription-PCR from the pig uteri and their sequences were determined. The pER-1 and pER-2 sequences, which are homologous to those found in other mammalian estrogen receptors, encode putative proteins consisting of 574 and 486 amino acids, respectively. A deletion in exon I was identified in both sequences, with deletion lengths of 63 bp in pER-1 and 327 bp in pER-2. The deletion in pER-1 is internal to that in pER-2 and both deletions resulted in a truncation of the B domain, which confers the transactivating activity of estrogen receptor protein. This result describes the existence of estrogen receptor variants with a deletion in exon I and implies the possibility that physiological functioning of an estrogen receptor may not require the presence of an intact B domain.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제55권1호
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• pp.88-97
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• 2003

연구배경 : 90% 정도의 만성폐쇄성 폐질환(COPD) 환자들이 흡연력이 있으나 흡연자의 15~20%에서만 COPD가 발생하는 것은 유전자 감수성 등 다양한 다른 인자들의 영향이 있음을 암시한다. 담배 연기 속에 포함된 epoxide를 가수 분해하는 효소인 microsomal epoxide hydrolase(mEPHX)의 효소 활성은 두 개의 유전자 다형성 양상에 따라 서로 다르므로 이 다형성의 양상에 따라, 그리고 활성화된 유독 물질을 대사시키는 glutathione Stransferase의 M1 subunit 유전자 (GSTM1)의 homozygous deletion 여부에 따라 COPD의 발생 위험도 다를 것으로 예측된다. 대상 및 방법 : 전남 대학교 병원 호흡기 내과에 내원한 58예의 COPD군과 이와 연령이 비슷한 폐결핵 환자 59례 및 정상인들 20례로 구성된 대조군(79예)의 말초혈액 백혈구로부터 추출한 DNA를 이용하여 mEPHX 유전자의 다형성과 GSTM1 유전자의 결손 여부 그리고 임상 양상과의 관계를 관찰하였다. mEPHX 유전자의 exon 3과 exon 4를 각각 두 쌍의 primer를 이용하여 증폭하여 제한 효소 절단 양상으로 유전자 다형성 위치의 염기를 확인하였고 일부에서는 염기 서열을 직접 확인 하였다. 또한 GSTM1 유전자의 exon 4와 exon 5 부위를 PCR 증폭하여 homozygous deletion 여부를 혈액응고인자 V를 양성대조로 이용하여 확인하였다. 결 과 : COPD와 대조군 양군 간에 연령 ($63.7{\pm}10.9$ vs $60.4{\pm}8.1$세)은 차이를 보이지 않았고 흡연자는 COPD군(33/40, 82.5%)이 대조군(38/71, 53.5%)에 비하여 많았다(p<0.01). GSTM1은 73예가 결손되어 53.3%의 결손율을 보였는데 COPD군(32/58, 55.2%)과 대조군(41/79, 51.9%) 사이에 유의한 차이는 없었다. mEPHX는 29예(21.2%)가 slow, 73예(53.3%)가 normal, 32예(23.4%)가 fast enzyme activity를 보이는 유전자형이었는데, slow enzyme activity를 보이는 유전자형의 빈도가 COPD군(7/57, 12.3%)에서 대조군(22/77, 28.6%)보다 유의하게 낮았다(p<0.05). COPD 발생의 비교 위험도는 mEPHX의 낮은 효소 활성을 보이는 유전자형이 0.32 (95% 신뢰구간 0.14-0.75, p<0.01)를 보였으나, 흡연자들만을 이용하여 비교하였을 때는 mEPHX의 유전자형에 따른 COPD의 빈도는 차이가 없었다. 결 론 : 소수의 집단을 대상으로 한 본 연구에서 GSTM1 결손이나 mEPHX의 유전자형은 COPD 발생의 유의한 위험인자는 아니었다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제43권4호
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• pp.684-691
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• 2019

Background: We have reported that defective nef and gag genes are induced in HIV-1-infected patients treated with Korean Red Ginseng (KRG). Methods: To investigate whether KRG treatment and highly active antiretroviral therapy (HAART) affect genetic defects in the pol gene, we amplified and sequenced a partial pol gene (p-pol) containing the integrase portion (1.2 kb) by nested PCR with sequential peripheral blood mononuclear cells over 20 years and compared it with those patients at baseline, in control patients, those taking ginseng-based combination therapy (GCT; KRG plus combinational antiretroviral therapy) and HAART alone. We also compared our findings to look for the full-length pol gene (pol) (3.0-kb) Results: Twenty-patients infected with subtype B were treated with KRG for $116{\pm}58months$ in the absence of HAART. Internal deletion in the pol gene (${\Delta}pol$) was significantly higher in the KRG group (11.9%) than in the control group and at baseline; its detection was significantly inhibited during GCT as much as during HAART. In addition, the ${\Delta}pol$ in p-pol significantly depended on the duration of KRG treatment. In pol, the proportion of ${\Delta}pol$ was significantly higher in the KRG group (38.7%) than in the control group, and it was significantly inhibited during GCT and HAART. In contrast, the proportion of stop codon appeared not to be affected by KRG treatment. The PCR success rate was significantly decreased with longer GCT. Conclusion: The proportion of ${\Delta}pol$ depends on template size as well as KRG treatment. HAART decreases the detection of ${\Delta}pol$.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제58권1호
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• pp.25-30
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• 2005

목 적 : ACE 유전자 다형성에 따라 폐를 포함한 여러 조직에서 ACE 활성 및 농도 등에 차이를 나타내고 이러한 차이가 COPD 등의 만성 호흡기 질환에서 질환의 발생 및 임상 표현형의 차이를 유발할 것으로 추정되어 지고 있다. 따라서 이 연구는 ACE 유전자 다형성이 COPD 환자에게서 동반될 수 있는 기도 과민반응 등의 기관지 천식 요소의 발현 유무와 연관성이 있는지 알아보고자 하였다. 방 법 : 100명의 COPD 환자들을 대상으로 기도 과민성의 동반 유무에 따라 두 군으로 분류하였고, PCR 방법을 통하여 ACE 유전자형을 검사하여 두 군 간의 차이를 알아보았다. 결 과 : COPD 환자에서 기도 과민반응 유무에 따른 ACE 유전자형의 분포에 차이는 없었고, COPD의 임상적 단계에 따른 각 군 간의 의미 있는 차이도 보이지 않았다. 결 론 : 이러한 연구 결과는 ACE 유전자 다형성에 따른 차이가 COPD 환자에게서 나타나는 기도 과민성 등의 천식 요소의 발현과 연관이 없음을 시사하는 소견이라 할 수 있다.

• 대한한방내과학회지
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• 제28권3호
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• pp.453-463
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• 2007

Backgrounds : Glutathione-s-transferase (GST) is a kind of phase II metabolism enzyme and plays an important role in the detoxification of various toxic chemicals. It was reported that the genetic polymorphism of GSTM1 and GSTT1 genes may be responsible for asthma development and susceptibility to allergy. Traditional oriental medicine uses a unique diagnostic technique. differentiation-syndrome. to analyze signs and symptoms of patients synthetically. Through differentiation-syndrome. asthma patients can be divided into two groups: the deficiency syndrome group (DSG) and the excess syndrome group (ESG). Objectives : The purpose of this study was to investigate the possible association of GST gene polymorphism with clinical phenotype by differentiation-syndrome of bronchial asthma patients. Materials and Methods : One hundred and ten participants were evaluated by pulmonary function test. Patients with 53 DSG and 31 ESG by differentiation-syndrome were assessed for genetic analysis. GSTM1 and GSTT1 deletion polymorphism was performed by polymerase chain reaction (PCR). Results : GSTM1 gene deletion was detected in 43.4% of individuals in the DSG and in 38.71 % in the ESG. The distribution of GSTM1 polymorphism between DSG and ESG was not significantly different [$x^2$=0.1767, p=0.6742; OR(95% CI)=1.2139(0.4915-2.9979)]. The proportion of GSTT1 null genotypes was 41.51% in the DGS and 45.16% in the ESG. The distribution of GSTT1 polymorphism between DSG and ESG was also not significantly different [$x^2$=0.1065, p=0.7442; OR(95% CI)=0.8618(0.3525-2.1065)]. In the combined analysis of GSTM1 and GSTT1 genes, the frequency of both null type of GSTM1/GSTT1 genes was not significantly different from both positive type of GSTM1/GSTT1 genes[$x^2$=0.0768, p=0.7817; OR(95% CI)=1.2000(0.3303-4.3602)] Conclusions : These results indicate that polymorphism of the GST gene might not be associated with the symptomatic classification of DSG and ESG by differentiation-syndrome in Korean asthmatics.

• 혜화의학회지
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• 제12권2호
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• pp.177-197
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• 2004

1. The values of Cronbach's alpha for the Taeyang, Taeum, Soyang and Soeum questionnaire were 0.7955, 0.7776, 0.8545, and 0.8601 respectively. These results indicate a highly satisfactory level of internal consistency for the questionnaire. 2. If the deletion of an item increases Cronbach's alpha then what that means is that the deletion of that item improves reliability. Therefore, any items that result in substantially greater values of alpha than the overall alpha may need to be deleted from the questionnaire to improve its reliability. 3. Factor analysis was performed on the 81 questionnaires. Based on the scree plot and the number and decrement of eigen values greater than one, three to four factor solution was most significant. 4. The hierarchical cluster analysis was performed on the 81 Sasang constitution questionnaire. These results suggested that two or four clusters identified with homogeneous groups 5. The hierarchical cluster analysis was performed on the 1046 responders. These results suggested that two, three, or four clusters might identified with homogeneous groups. Furthemore, there were statistically significant difference among the each group by ANOVA(P<0.0001).

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제39권4호
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• pp.313-318
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• 2001

The identification , characterization and quantification of Plasmodium sp. genetic polymorphism are becoming increasingly important in the vaccine development. We investigated polymorphism of Plasmodium vivax GAM-1 (PvGAM-1) gene in 30 Korean isolates. The polymorphic region of the PvGAM-1 gene, corresponding to nt 3792-4029, was amplified using polymerase chain reaction (PCR) followed by sequencing. All of the P. viuax Korean isolates were one type of GAM-1 gene, which were identical to that of the Belem strain. It is suggested that PvGAM-1 could not be used as a genetic marker for identifying or classifying P. vivax Korean isolates. It revealed that the polymorphic pattern as acquired basically by duplication and modification or deletion event of a 33 bp-motif fragment ended by poly guanine (G) and that there were at least three complete and one partial 33 Up-motif sequences within the polymorphic region in the longest cases such as those of South Korean and Belem isolates. In addition, we clustered P. vivax isolates with parsimonious criteria on the basis of PvGAM- 1 polymorphic patterns (insertion/deletion patterns) .

• BMB Reports
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• 제29권5호
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• pp.481-483
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• 1996

In competitive PCR, which is used to quantify target DNA an internal standard is needed. Here we present a simple method to construct homologous competitive standards. The method, which is based upon deletion of a portion of the target DNA, does not require any additional primers. This is the simplest method developed thus far to construct a competitive standard. The whole procedure. from construction of a competitive standard to quantitation by PCR, can be completed within a single day.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제46권2호
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• pp.241-250
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• 1999

연구배경: ACE 억제제는 고혈압 및 신장질환의 치료제로서, 투약 중 발생하는 건성 기침은 이 약제의 사용을 제한하는 부작용으로 알려져 있다. ACE 억제제로 인한 건성 기침의 발생 빈도는 ACE의 활성도가 낮은 사람에서 높고, 그 활성도는 ACE 유전자의 다형성과 관계가 있다는 가설이 있으나, 그간의 국내외 임상 연구들은 그에 대해 각각 상이한 보고를 하고 있다. 이에 본 연구는 국내의 ACE 억제제를 투약 받고 있는 신장 질환 환자들을 대상으로, 건성 기침의 발생 반도와 ACE의 활성도를 결정하는 유전자 다형성과의 관계를 고찰하고자 하였다. 방 법: 1998년 8월 현재, 외래에서 ACE 억제제를 투약 받고 있는 339명의 환자들을 대상으로, 투약 중 건성 기침을 호소하고, 약제 중단 후 기침이 소실된 환자들을 기침 발생군, 기침을 호소하지 않은 환자들을 기침 미발생군으로 하였다. 환자들의 병력, 투약력, 증상 등의 임상적 특성은 의무기획을 이용하여 조사하였고, ACE 유전자 다형성은 환자들의 말초 혈액에서 얻은 DNA 의 종합효소 연쇄반응기법 (PCR) 과 전기영동(electrophoresis)으로 결정하였다. 결 과: 기침 발생군은 37명으로, 빈도는 10.9% 이었고, 미발생군은 302명이었다. 양군간에 연령, 기저 질환, ACE 억제제의 종류 및 용량에 있어서 유의한 차이는 없었으나, 남녀 비는 기침 발생군에서 M : F=24.3% : 75.7%, 미발생군에서는 49.7% : 50.3%로, 기침 발생군에서 여성의 비율이 유의하게 높았다(p=0.004). ACE 유전자 다형성의 유전자형의 비는 기침발생군에서 I:I : I/D : D/D=16.2% : 18.9% : 64.9%, 미발생군에서 18.9% : 18.2% : 62.9%로 양군간에 유의한 차이가 없었으며(p= 0.926), I allele과 D allele의 비도 기침 발생군에서 I : D=25.7% : 74.3%, 미발생군에서 28.0% : 72.0%로 유의한 차이를 보이지 않았다 (p=0.676). 결 론: ACE 억제제를 사용하고 있는 환자에서, 건성 기침의 발생 빈도는 10.9%이었고, 여성에서 유의하게 높았으며, ACE 억제제에 의한 기침과 ACE 유전자 다형성과는 관련성이 없었다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제48권2호
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• pp.155-165
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• 2000

연구배경: Nramp1 단백은 NRAMP1 유전자에 의하여 합성되며, 이 유전자의 다형성은 결핵균에 대한 숙주의 선천적 내성을 감소시킨다. 본 연구에서는 일차 감염에 의한 결핵성 흉막염 환자에서 NRAMP1 유전자 다형성과 결핵의 일차 감염과의 관계를 고찰하였다. 방 법: 특별한 병력 없이 흉막 조직 검사를 통해 진단된 56명의 결핵성 흉막염군과 건강한 45명의 건강 대조군을 대상으로 인트론 4의 G/C 접돌연변이(469+14G/C, INT4), 543번 코돈의 aspartic acid(Asp)에서 asparagine(Asn)으로의 변이(D543N), 및 3' 비해독 영역의 TGTG 결손(1729+55del4, 3'UTR) 등의 NRAMP1 유전자 다형성의 반도를 중합효소 연쇄반응기법(PCR)과 중합효소 연쇄반응-제한효소 절단 길이 다형성(PCR-RFLP)을 이용하여 조사하였다. 결 과: 흉막염군과 건강 대조군에서의 NRAMP1 유전자 다형성의 빈도는, INT4 와 3'UTR 다형성의 경우 흉막염군에서 변이형의 빈도가 유의하게 높았으나(p=0.001, p=0.023), D543N 의 경우는 양군에서 유의한 차이가 없었다(p=0.079). 야생형과 변이형 유전자형의 교차비(odds ratio)는, INT4, 3'UTR의 경우 흉막염 환자가 변이형의 유전자형일 확률이 건강 대조군에 비해 통계적으로 유의하게 높았으나, D543N의 경우는 유의하지 않았다. INT4와 3'UTR의 결합 분석(combined analysis) 결과, 흉막염 환자가 INT4C 대립 형질을 포함할 확률과 INT4 C 대립 형질과 3'UTR del 대립 형질을 모두 포함할 확률이 통계적으로 유의하게 높았다. 결 론: 결핵성 흉막염 환자에서, 결핵 이환과 NRAMP1 유전자 다형성 중 INT4와 3'UTR과는 유의한 상관 관계가 있었으나, D543N과는 유의성이 없었으며, 흉막염 환자가 변이형 유전자형일 확률도 INT4 및 3'UTR의 경우 통계적으로 유의하게 높았으나. D543N의 경우는 높지 않았다. INT4와 3'UTR의 결합 분석결과 흉막염 환자가 INT4 C 대립 형질용 포함할 확률과 INT4 C와 3'UTR del 대립 형질을 모두 포함할 확률이 통계적으로 유의하게 높았다.