The interconversion barriers between two twisted conformers of four oxygen-containing cyclohexene analogues have been investigated utilizing a periodic hindered pseudorotational model, molecular mechanics (MM3) calculations, and previously reported far-infrared spectra. The six-fold pseudorotational potential energy function satisfactorily fits the observed bending transitions. The interconversion barrier heights calculated from the pseudorotational model show excellent agreement with those determined from two-dimensional potential energy surfaces for the ring-bending and ring-twisting vibrations. The barriers to interconversion range from 3350 $cm^{-1}$ (9.6 kcal/mol) to 3890 $cm^{-1}$ (11.1 kcal/mol) for four oxygen-containing cyclohexene analogues.
The gas phase structures, energetics, and interconversion pathways of five lowest energy conformers of acetylcholine were examined employing the B3LYP, MP2, and CCSD(T) methods in conjunction with diverse basis sets including the correlation consistent aug-cc-pVDZ and aug-cc-pVTZ basis sets. It is found that use of adequate basis set containing proper polarization and diffuse functions capable of describing the floppy potential energy surface of acetylcholine is important in correctly predicting the relative stability of these conformers. The interconversion pathways and barrier heights between these conformers were elucidated by examining the potential energy surface for torsional motion, which also manifested the presence of chiral conformations of acetylcholine corresponding to the original conformations. On the basis of high level electronic energy calculations and thermal contribution analysis, four lowest energy conformers appear to be populated in the energy range of less than 1 kcal/mol at room temperature.
Rate constants for photolytic reactions of p-substituted 2-diazopropiophenones were determined in acetonitrile. The reactions show a comparatively low value of activation energy and activation enthalpy to alkylcarbenes or other arylcarbenes. The transition state corresponds to the step of a new carbonyl bond formation. The high negative ρ -values are shown in Hammett plots. The kinetics results and EPR spectrum are in accord with a phenomenon that occurs in interconversion between singlet and triplet carbenes.
Pharmacokinetics of prednisolone and prednisone undergoing reversible interconversion were analyzed from the model including this metabolic process. Blood samples were drawn serially upto 12 hours after I,V. bolus injection of 1 mg/kg prednisolone sodium phosphate and prednisone into 8 dogs as a crossover manner. Plasma concentrations of those two steroids were simultaneously measured with the method of HPLC. After injection, plasma concentrations of administered prednisolone and prednisone were declined with a biexponential pattern and their metabolic partner was rapidly formed. Plasma concentrations of those metaboite were decayed in parallel with their parent steroids throught the elimination phase. Apparent clearances of prednisolone and prednisone were $11.1{\pm}2.0\;ml/min/kg$ and $45.9{\pm}6.4\;ml/min/kg$, and they were underestimated by 29.4% and 33.6% compared to their real clearances$(15.7{\pm}4.4\;and\;69.2{\pm}17.7\;ml/min/kg)$ estimated using reversible interconversion model. Apparent volume of distribution of prednisolone$(1.32{\pm}0.43\;L/kg)$ and prednisone$(4.81{\pm}2.75\;L/kg)$ were overestimated by 53.5 and 52.7% and were compared to the real volumes $(0.86{\pm}0.30\;and\;3.15{\pm}2.13\;L/kg)$. Mean residence time of prednisolone$(2.0{\pm}0.61\;h)$ and prednisone$(1.74{\pm}0.74\;h)$ were much longer than the real sojourn time$(0.93{\pm}0.26\;and\;0.88{\pm}0.54\;h)$. Essential clearances In the reversible interconversion were greater as following orders: $Cl_{21}$(44.3 ml/min/kg) > $Cl_{20}$(24.2 ml/min/kg) > $Cl_{12}$ (7.9 ml/min/kg) > $Cl_{10}$(7.8 ml/min/kg). Estimated mean values of RF, EE, $%X^1_{ss}$ and $RHO^2_1$ were $0.31{\pm}0.10$, $1.49{\pm}0.23$, $69.3{\pm}16.7%$ and $0.65{\pm}0.10$, respectively. These results suggested that true pharmacokinetic parameters estimated from the model including reversible interconversion were significantly different from the apparent parameters estimated from the conventional mamillary model, and disposition of these two steroids seemed to be well explained by the model including reversible interconversion.
Journal of the Korean Society for Industrial and Applied Mathematics
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v.3
no.2
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pp.5-16
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1999
We introduce a new projector for accelerating convergence of a symmetric eigenvalue problem Ax = x, and devise a power/Lanczos hybrid algorithm. Acceleration can be achieved by removing the hard-to-annihilate nonsolution eigencomponents corresponding to the widespread eigenvalues with modulus close to 1, by estimating them accurately using the Lanczos method. However, the additional Lanczos results can be obtained without expensive matrix-vector multiplications but a very small amount of extra work, by utilizing simple power-Lanczos interconversion algorithms suggested. Numerical experiments are given at the end.
The conformational study on neutral and zwitterionic L-alanines (N-Ala and Z-Ala, respectively) and the transition state (TS) for their interconversion is carried out using ab initio HF and density functional B3LYP methods with the self-consistent reaction field method in the gas phase and in solution. At both the HF and B3LYP levels of theory, the local minimum N1 for N-Ala is found to be most preferred in the gas phase and a weak asymmetric bifurcated hydrogen bond between the amino hydrogens and the carbonyl oxygen appears to play a role in stabilizing this conformation. The local minima N2a and N2b are found to be the second preferred conformations, which seem to be stabilized by a hydrogen bond between the amino nitrogen and the carboxylic hydrogen. The relative stability of the local minimum N2b is remarkably increased in solution than that in the gas phase. The local minimum N2b becomes more stable than the local minimum N2a in most of the solution. On the whole the relative free energies of Z-Ala and TS become more lowered, as the solvent polarity increases. N-Ala prevails over Z-Ala in aprotic solutions but Z-Ala is dominantly populated in ethanol and water. In aprotic solutions, the population of Z-Ala increases somewhat with the increase of solvent polarity. The barrier to Z-Ala-to-N-Ala interconversion increases on the whole with the increase of solvent polarity, which is caused by the increase of stability for Z-Ala.
Since the days of early Confucianism, the nature(性) and the emotion(情) have been the methodological tool to explain the original nature of the human being, by dividing the human mind into the nature and the emotion. This study examines the interconversion(相成相資) theory of the nature and the emotion mentioned in the "Sadanron(四端論)" chapter of "Dong-uisusebowon." We have contemplated how Gi(氣) of sadness and anger mutually create each other, that of pleasure and enjoyment do as well, transforming sad nature[哀性] of the Taeyang-in(太陽人) into anger emotion, anger nature of the Soyang-in(少陽人) into sad emotion[哀情], pleasure nature[喜性] of the Taeuemin(太陰人) into enjoy emotion[樂情], enjoy nature[樂性] of the Soeumin(少陰人) into pleasure emotion[喜情] considering the circumstances in which the nature changes into the emotion based on the original texts of "Dong-uisusebowon", "Sasang-uihakchobon-gwon(四象醫學草本卷)" and "Gyeokchigo(格致藁)".
The branched-chain ${\alpha}$-keto acid dehydrogenase (BCKAD) complex is a rate limiting enzyme which catalyzes the oxidative decarboxylation of branched-chain ${\alpha}$-keto acids. Numerous studies have suggested that BCKAD is subject to covalent modification in vitro via phosphorylation and dephosphorylation, which are catalyzed by a specific kinase and phosphatase, respectively. The biggest difficulty in the assay of BCKAD activity is to arrest the interconversion between the active and inactive forms. BCKAD activity was determined from fresh rat heart and liver tissues using homogenizing and assay buffers containing inhibitors of phosphatase and kinase. The results suggest that a radiochemical assay using ${\alpha}$-keto[1-$^{14}C$]-isovalerate as a substrate for the enzyme can be applied as a reliable method to determine in vitro enzyme activity with arrested interconversion between the active and inactive forms of the BCKAD complex.
Complexation of cesium ion by p-tert-butylcalix[6]arene ethyl ester was studied by NMR spectroscopy in nonpolar $CDCl_3$ and polar acetone-$d_6$ and the results were compared with each other. Analysis of temperature dependent $^1H$ spectra and titration curves reveals that both solvents result in a 1 : 1 cone-form complex with nonpolar $CDCl_3$yielding a more tightly bound one than acetone-$d_6$. Unexpectedly, at very low temperature, we have found that two phenyl ring proton peaks of equal intensity appear both in $CDCl_3$and in acetone-$d_6$ solution which gradually collapse and eventually coalesce into a single line as temperature is raised. This observation could be interpreted in terms of the chemical exchange through direct and/or indirect interconversion between two equivalent conformations possible the complex in both solvents over the temperature range observed. And broadening of $^{133}Cs$ (I = 7/2) nmr line with increasing temperature has also been observed, indicating the exchange of $^{133}Cs$ ion between the complex and the solvent. From numerical fitting of lineshape changes for one-dimensional $^1H$ and $^{133}Cs$ spectra, the exchange rate constants and other relevant parameters for this conformational interconversion and the complex-solvent exchange were deduced.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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