• 제목/요약/키워드: Infection biology

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독도 자생식물 번행초로부터 분리한 바실러스 속 식물생장촉진근권 세균에 의한 식물병 저항성 유도 (Induced Systemic Resistance in plants by Bacillus sp. Isolated from Dok-do Islands)

  • 김승건;손진수;권덕기;김사열
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.596-602
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    • 2019
  • 본 연구는 독도에서 서식하는 자생식물인 번행초와 번행초의 근권에서 미생물들을 분리하였다. 분리 균의 식물생장 촉진 특성을 확인하였으며, 식물 병에 대한 저항성을 유도효과를 가진 균 중 범용성이 좋은 바실러스 속 세균에 초점을 두어 실험을 진행하였다. 번행초의 분리 균들은 근권환경에 52종, 식물체 내생 환경에서 51종, 식물체 표면에서 35종으로 총 138종의 분리 균이 확보되었다. 분리 균의 식물생장촉진특징을 확인하여 보기 위하여, 식물 성장에 필요한 난용성인 가용화와 철의 결합에 사용되는 siderophore의 생산능, 식물생장호르몬인 옥신 생산능을 확인하여 각각의 비율을 확인하였고, 3가지 특성을 모두 가진 균의 비율을 확인하였다. 또한 분리 균을 담배에 처리하여 병원균에 대한 유도전신저항성을 확인하였고, 그 중 효과가 좋았던 균 35종을 부분 동정한 결과, 바실러스 속은 KUDC6588, KUDC6597, KUDC6606, KUDC6614, KUDC6615, KUDC6619로 나타났다. 6종의 바실러스 속 세균들은 모두 저항성 향상에 좋은 효과를 보였으며, 특히 KUDC6619의 경우 현재 화학항생물질인 BTH와도 비슷한 효과를 보였다. KUDC6619는 대표적인 식용작물인 고추에서도 유도전신저항성의 향상에 대한 좋은 결과를 나타내었다. 따라서 사람과 동물에 대한 안전성, 식물 병원성 등 다양한 테스트를 진행한 후, 안정성이 확보된다면, KUDC6619는 식물의 ISR을 야기하는 생물농약 으로서의 높은 산업적 가치가 있을 것으로 보인다.

국내 연구원들의 생물안전 개념에 대한 현황 (Laboratory Biosafety Status of Researchers in Korea)

  • 김대식;김미경
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제50권1호
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    • pp.71-76
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    • 2018
  • 본 연구는 2017년 1월 3일~3월 25일까지 실험실 연구자를 대상으로 생물 안전성에 대한 현황 연구를 목적으로 한다. 국내 감염병 병원체 취급대학 및 의과대학 소속 실험실에서 병원성 미생물을 취급하는 실험실 연구자 총 500명을 설문 조사하여 실시되었다. 조사 결과에 따르면 응답자는 높은 수준의 인지도를 보였으나 전반적인 생물 안전성 규칙 및 규정을 준수하지는 않았다. 실험실의 생물안전 시설의 등급 여부에 관한 문항에 관한 질문에는 '알고 있다'가 55.8%,'모른다'가 44.2%로 나타났다. 연구자들은 적절한 안전 조치가 개인을 보호 할 수 있으며, 안전 장비와 생물 안전 계획이 충분하지 않음에도 실험실이 안전하다고 믿었다. 생물안전 교육에 관련된 조사에서 연구자의 80%는 실험실 안전에 대한 교육을 받은 경험이 있었고 20%는 안전교육을 받은 적이 없었다. 생물안전교육에 대한 필요성은 66%, 교육내용에 대한 만족도는 46%로 나타났다. 이러한 결과는 연구자들은 이미 생물안전교육을 받은 경험이 있지만 지속적인 교육이 필요한 것으로 생각하였다. 또한 생물 안전성 수준을 향상시키는데 있어 가장 중요한 것은 훈련 프로그램 및 교육시스템을 강화하는 것이라는 의견이 있었다. 결론적으로 실험실에서 일어날 수 있는 위험에 대비하기 위한 실험실 생물 안전에 대한 보다 개선된 교육 시스템을 개발할 필요가 있다.

최근 문제시 되는 수박 과일썩음병에 대한 방제효과 분석 (Analysis of Control Efficacy of Bacterial Fruit Blotch Caused by Acidovorax avenae subsp. citrulli in Recent Issues)

  • 백창기;이성찬;박미정;한경숙;김홍기;이윤수;박종한
    • 농약과학회지
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    • 제20권1호
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    • pp.41-46
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    • 2016
  • Acidovorax avenae subsp. citrulli에 의해 발생하는 수박 과일썩음병은 수박재배지역에 문제병해이다. 수박 과일썩음병 방제를 위해 시판되는 살세균제로 방제효과 조사하였다. 고체배지를 이용한 생장억제효과를 검정한 결과, 옥솔린산 수화제, 옥시테트라사이클린 수화제 등에서 과일썩음병균 생장억제효과가 나타났다. 총 4종의 살세균제를 사용하여 종자침지, 유묘기에 발생한 수박 과일썩음병 방제효과를 검정한 결과, 종자침지에서는 옥시테트라사이클린 수화제가 90% 이상의 방제효과를 보였고, 유묘기에 발생한 수박 과일썩음병 방제에는 아시벤졸라-에스-메틸+만코제브 수화제가 90% 이상의 방제효과를 보였다. 온탕침지 처리법으로도 병든 수박종자에 발생하는 수박 과일썩음병 감염율을 효과적으로 낮출 수 있는데, 그 처리조건은 $50{\sim}55^{\circ}C$에서 20~30분간 처리하는 것이다. 이러한 결과들은 수박재배농가와 육묘재배인이 사용 가능한 방법으로 수박 과일썩음병의 효율적인 방제법이 확립되는데 도움이 될 것으로 판단된다.

RNAi and miRNA in Viral Infections and Cancers

  • Mollaie, Hamid Reza;Monavari, Seyed Hamid Reza;Arabzadeh, Seyed Ali Mohammad;Shamsi-Shahrabadi, Mahmoud;Fazlalipour, Mehdi;Afshar, Reza Malekpour
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권12호
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    • pp.7045-7056
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    • 2013
  • Since the first report of RNA interference (RNAi) less than a decade ago, this type of molecular intervention has been introduced to repress gene expression in vitro and also for in vivo studies in mammals. Understanding the mechanisms of action of synthetic small interfering RNAs (siRNAs) underlies use as therapeutic agents in the areas of cancer and viral infection. Recent studies have also promoted different theories about cell-specific targeting of siRNAs. Design and delivery strategies for successful treatment of human diseases are becomingmore established and relationships between miRNA and RNAi pathways have been revealed as virus-host cell interactions. Although both are well conserved in plants, invertebrates and mammals, there is also variabilityand a more complete understanding of differences will be needed for optimal application. RNA interference (RNAi) is rapid, cheap and selective in complex biological systems and has created new insight sin fields of cancer research, genetic disorders, virology and drug design. Our knowledge about the role of miRNAs and siRNAs pathways in virus-host cell interactions in virus infected cells is incomplete. There are different viral diseases but few antiviral drugs are available. For example, acyclovir for herpes viruses, alpha-interferon for hepatitis C and B viruses and anti-retroviral for HIV are accessible. Also cancer is obviously an important target for siRNA-based therapies, but the main problem in cancer therapy is targeting metastatic cells which spread from the original tumor. There are also other possible reservations and problems that might delay or even hinder siRNA-based therapies for the treatment of certain conditions; however, this remains the most promising approach for a wide range of diseases. Clearly, more studies must be done to allow efficient delivery and better understanding of unwanted side effects of siRNA-based therapies. In this review miRNA and RNAi biology, experimental design, anti-viral and anti-cancer effects are discussed.

Inhibition of HBV replication and gene expression in vitro and in vivo with a single AAV vector delivering two shRNA molecules

  • Li, Zhi;He, Ming-Liang;Yao, Hong;Dong, Qing-Ming;Chen, Yang-Chao;Chan, Chu-Yan;Zheng, Bo-Jian;Yuen, Kwok-Yung;Peng, Ying;Sun, Qiang;Yang, Xiao;Lin, Marie C.;Sung, Joseph J.Y.;Kung, Hsiang-Fu
    • BMB Reports
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    • 제42권1호
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    • pp.59-64
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    • 2009
  • Hepatitis B virus (HBV) infection is highly prevalent worldwide. The major challenge for current antiviral treatment is the elevated drug resistance that occurs via rapid viral mutagenesis. In this study, we developed AAV vectors to simultaneously deliver two or three shRNAs targeting different HBV-related genes. These vectors showed markedly better antiviral effects than ones that delivered a single shRNA in vitro. A dual shRNA expression vector (AAV-157i/1694i), which simultaneously expressed two shRNAs targeted the S and X genes of HBV, reduced HBsAg, HBeAg and HBV DNA levels by $87{\pm}4$, $80.3{\pm}2.6$ and $86.2{\pm}7%$ respectively, eight days post-transduction. In a mouse model of prophylactic treatment, HBsAg and HBeAg were reduced to undetectable levels and the serum HBV DNA level was reduced by at least 100 fold. These results indicate that AAV-157i/1694i generates potent anti-HBV effects and that the strategy of constructing multi-shRNA expression vectors may lead to enhanced anti-HBV efficacy and overcome the evading mechanism of the virus and thus the development of drug resistance.

Seroprevalence of Toxoplasmosis with ELISA and Rapid Diagnostic Test among Residents in Gyodong-do, Inchon city, Korea: A Four-Year Follow-up

  • Kim, Yeong Hoon;Lee, Ji hoo;Ahn, Seong kyu;Kim, Tong-Soo;Hong, Sung-Jong;Chong, Chom-Kyu;Ahn, Hye-Jin;Nam, Ho-Woo
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제55권3호
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    • pp.247-254
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    • 2017
  • ELISA has been used for the diagnosis of toxoplasmosis, but it is being gradually replaced by a rapid diagnostic test (RDT). We compared and analyzed ELISA and RDT results using the sera collected during 4 consecutive years from residents of Gyodong-do (Island), Incheon-city, Korea. Sera from 921, 993, 940, and 838 adult residents were collected on a yearly basis (2010-2013). ELISA was performed by using a crude extract of T. gondii RH strain antigen and IgG/IgM RDT mounted with recombinant fragment of major surface antigen (SAG1), GST-linker-SAG1A, were applied to the sera. Comparison between groups was analyzed by the Student's t-test. The positive seroprevalence surged from 14.7% (135/921, 2010), 23.1% (231/993, 2011), 23.6% (222/940, 2012), and 32.1% (269/838, 2013) by ELISA. In contrast, RDT showed a more moderate increasing trend from 21.7% (200/921, 2010), 25.5% (253/993, 2011), 28.9% (272/940, 2012) and 33.1% (277/838, 2013). Discrepancies between ELISA and RDT were noted near the cut-off value. At the OD 0.15-0.24 range, RDT could detect 16.1% (169/1051) more positives, which suggests an early or acute toxoplasmosis, but at the OD 0.25-0.34 range, ELISA could detect 35.9% (92/256) more positives of possible chronic infections. Over the OD > 0.35 ELISA and RDT agreed in the majority of the cases. This surge in seroprevalence may be caused by the organic agriculture in addition to eating behavior or increase in pets among Koreans. These facts may be applied on a full-scale national survey using RDT to supplement ELISA to define the characteristics of the infection.

답리작 상치 시설재배지에서의 균핵병 발생생태에 관한 연구 (Ecological Studies on Lettuce Drop Disease Occurring under Controlled Cultivation Conditions in Drained Paddy Fields)

  • 신동범;이준탁
    • 한국식물병리학회지
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    • 제3권4호
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    • pp.252-260
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    • 1987
  • 답후작으로 시설재배되는 상치에 발생한 균핵병의 발생생태에 대하여 조사연구한 결과, 상치 균핵병은 전생육기간을 통하여 발생하였는데, 특히 유묘기에 피해가 심하였다. 후병지$(30\times30\times5cm)$내의 균핵수는 유묘기에 22.0개, 수확기에는 5.3개가 검출되었다. 이상치 균핵병 (S. sclerotiorum)의 균사생장적온은 $25^{\circ}C$였고, $15^{\circ}C$이하의 온도에서는 $20^{\circ}C$이상의 온도에서보다 균핵의 형성수는 적었으나 큰 균핵을 형성하였고 건물중도 높았다. 토양깊이 및 시기별로 균핵을 매몰하였을 때 3월, 4월 9월의 매몰구에서는 토양깊이 3cm구까지 자양반을 형성하였으나, 6월, 12월의 매몰구에서는 90일간의 조사기간내에는 자 반을 형성하지 않았다. 그리고 중력수만 제거한 토양과 담수토양내에서 균핵을 $25^{\circ}C$$30^{\circ}C$로 5주간 처리하였을 때 $100\%$의 균핵이 사멸하였다. 고압멸균된 상치 식물체절편과 함께 균핵을 상치에 접종하였을 때 균핵의 균사형성에 의한 감염이 일어났으며, 포장주위식물에 대한 병원성 조사에서는 조사식물 9과 31종중 화본료 식물을 제외한 8과 25종의 식물에 병원성을 나타냈다. 그러므로 답리작으로 시설재배되는 상치에 발생한 균핵병의 전염원은 포장주위의 기주식물에 형성된 균핵이라고 생각된다.

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대하 Penaeidin 3-2 유전자의 동정 및 발현 (Characterization and Expression of Penaeidin 3-2 from Fleshy Prawn Fenneropenaeus chinensis)

  • 박은미;조현국;홍경은;남보혜;김영옥;김우진;이상준;한현섭;이재용;김종식;장인권;정재훈;최태진;공희정
    • 한국해양바이오학회지
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    • 제2권1호
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    • pp.34-39
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    • 2007
  • Penaeidins은 새우류에 존재하는 항미생물성펩티드의 한 종류로서 새우의 외부 병원체에 대한 방어기작을 구성하는 중요한 인자이다. 본 연구에서는 대하 혈구세포의 cDNA library로부터 분리된 EST 클론을 분리 동정하였다. 아미노산 염기서열 분석과 계통수 분석을 통하여 본 연구에서 분리한 EST 클론이 대하의 Penaeidin 3-2 유전자와 아미노산 수준에서 동일함을 밝혔다. 대하의 Penaeidin 3-2는 signal peptides로 예상되는 19개 아미노산 잔기를 포함하여 전체 71개의 아미노산 잔기로 이루어져 있고, C-말단에는 3개의 이중황화결합을 형성할 수 있는 6개의 cysteine가 존재하였다. 대하 Penaeidin 3-2 전사체는 혈구세포, 간췌장, 근육 조직에서 발현되었으며, 특히 혈구세포에서 주로 많이 발현되었다. 흰반점바이러스의 인위감염 실험에서 바이러스 감염 후 대하 Penaeidin 3-2의 발현이 증가하였다. 이상의 결과들로부터 대하 Penaeidin 3-2가 자체 방어 작용에서 중요한 역할을 할 것으로 예상된다.

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참깨의 모자이크 증상에서 분리한 수박${\cdot}$모자이크 바이러스에 관한 연구 (A virus disease of sesame (Sesamum idicum L.) caused by watermelon mosaic virus (WMV))

  • 장무웅;이창은
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.193-198
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    • 1980
  • 참깨, 호박, 오이의 모자이크 증상주에서 전자현미경 및 즙액접종에 의하여 분리한 바이러스에 대하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 본 바이러스를 즙액접종 하였을 때 P. vutgaris, P. sativum, S. indicum, C. melo, C. maxima, C. pepo는 전신감염, C. amaranticolar는 국부감염 되었다. 2. 본 바이러스는 M. persicae로 쉽게 전반되었고, 종자전염은 하지 않았다. 9. 조즙액중의 물리성은 내열성이 $55\~60^{\circ}C$(10분), 희석성이 $10^{-3}\~10^{-4}$, 내보존성이 $10\~14$$(22^{\circ}C)$이었다. 4. 본 바이러스의 형태는 길이 $750\~800nm$의 사상립자이고, 본 바이러스의 감염에 의해 세포질내에서 세포질봉입체가 만들어진다는 것이 확인되었다. 5. 본 바이러스에 감염된 S. indicum, C. amaranticolor의 병엽초박절편을 전자현미경으로 관찰하였던바, 각종세포의 세포질내에 사상립자가 병행배열 또는 산재해 있고, 또 사상립자와 함께 반드시 세포질내입체(pinwheel, boundles, laminated aggregates)가 확인되었다. 6. 이상의 결과를 종합해서 참깨 모자이크병의 병원바이러스를 Watermelon mosaic virus(WMV)로 동정하였다.

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감나무애매미충, Zorka sp. (매미목: 애매미충아과)에 의한 감 (Diosprosi kaki) 피해 보고 (Report on Zorka sp. (Homoptera: Typhlocybinae) as a Pest of Persimmon (Diosprosi kaki) in Korea)

  • 황인천;임태헌;이석준;박정규;추호렬;이동운
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.479-484
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    • 2009
  • 2008년 6월 15일 경북 상주의 상주둥시 감나무 (Diospyrosi kaki)에서 매미충이 채집되었다. 매미충은 감나무 잎에 심각한 피해를 주고 있었으며 Zorka속의 신종으로 확인되었다. 피해 잎은 앞면쪽에 1 mm 이하의 흰색 반점이 엽맥 주위부에 형성되었고, 피해가 심해지면 잎 전체에 반점이 형성되었다. 엽당 4마리 밀도로 접종 시 4일 후부터 피해 흔적이 확인되었다. 2008년과 2009년 6월에서 8월 사이 6개도 11개 시 군 감나무 과원에서 Zorka sp.에 의한 피해지역을 조사하였다. 조사과원 중 15.4%인 22개 과원에서 피해가 확인되었다. 충북 영동지역에서는 40.7%의 과원이 피해를 받고 있었고, 전북 완주지역에서는 33.3%가 피해를 받고 있었다. 반면 남부지역인 경남과 제주지역에서는 피해 과원이 없었다. 피해과원이 많았던 충북 영동지역의 경우 11개 피해 과원 중 9개 과원이 포도밭과 인접해 있었다.