Yip, CH;Bhoo-Pathy, N;Daniel, JM;Foo, YC;Mohamed, AK;Abdullah, MM;Ng, YS;Yap, BK;Pathmanathan, R
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.17
no.3
/
pp.1077-1082
/
2016
Background: The three standard biomarkers used in breast cancer are the estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR) and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2). The Ki-67 index, a proliferative marker, has been shown to be associated with a poorer outcome, and despite absence of standardization of pathological assessment, is widely used for therapy decision making. We aim to study the role of the Ki-67 index in a group of Asian women with breast cancer. Materials and Methods: A total of 450 women newly diagnosed with Stage 1 to 3 invasive breast cancer in a single centre from July 2013 to Dec 2014 were included in this study. Univariable and multivariable logistic regression was used to determine the association between Ki-67 (positive defined as 14% and above) and age, ethnicity, grade, mitotic index, ER, PR, HER2, lymph node status and size. All analyses were performed using SPSS Version 22. Results: In univariable analysis, Ki -67 index was associated with younger age, higher grade, ER and PR negativity, HER2 positivity, high mitotic index and positive lymph nodes. However on multivariable analysis only tumour size, grade, PR and HER2 remained significant. Out of 102 stage 1 patients who had ER positive/PR positive/HER2 negative tumours and non-grade 3, only 5 (4.9%) had a positive Ki-67 index and may have been offered chemotherapy. However, it is interesting to note that none of these patients received chemotherapy. Conclusions: Information on Ki67 would have potentially changed management in an insignificant proportion of patients with stage 1 breast cancer.
Cho, Young-Il;Jiang, Wenzhu;Chin, Joong-Hyoun;Piao, Zhongze;Cho, Yong-Gu;McCouch, Susan R.;Koh, Hee-Jong
Molecules and Cells
/
v.23
no.1
/
pp.72-79
/
2007
Demand for low-input sustainable crop cultivation is increasing to meet the need for environment-friendly agriculture. Consequently, developing genotypes with high nutrient use efficiency is one of the major objectives of crop breeding programs. This study was conducted to identify QTLs for traits associated with physiological nitrogen use efficiency (PNUE). A recombinant inbred population (DT-RILs) between Dasanbyeo (a tongil type rice, derived from an indica ${\times}$ japonica cross and similar to indica in its genetic make-up) and TR22183 (a Chinese japonica variety) consisting of 166 $F_8$ lines was developed and used for mapping. A frame map of 1,409 cM containing 113 SSR and 103 STS markers with an average interval of 6.5 cM between adjacent marker loci was constructed using the DT-RILs. The RILs were cultivated in ordinary-N ($N-P_2O_5-K_2O=100-80-80kg/ha$) and low-N ($N-P_2O_5-K_2O=50-80-80kg/ha$) (100 kg/ha) conditions. PNUE was positively correlated with the harvest index and grain yield in both conditions. Twenty single QTLs (S-QTLs) and 58 pairs of epistatic loci (E-QTLs) were identified for the nitrogen concentration of grain, nitrogen concentration of straw, nitrogen content of shoot, harvest index, grain yield, straw yield and PNUE in both conditions. The phenotypic variance explained by these S-QTLs and E-QTLs ranged from 11.1 to 44.3% and from 16.0% to 63.6%, respectively. The total phenotypic variance explained by all the QTLs for each trait ranged from 35.8% to 71.3%, showing that the expression of PNUE and related characters depends signify- cantly upon genetic factors. Both S-QTLs and E-QTLs may be useful for marker-assisted selection (MAS) to develop higher PNUE genotypes.
Morphologically, nine different slow-growing protoclones were screened from regenerated protoplasts of heterokaryotic Agaricus bisporus. As such, the present study is the first report on differentiating homo- and heterokaryotic protoclones using random amplified polymorphic DNA (RAPD) and inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Among 80 primers tested, the seven ISSR and seven RAPD primers selected for the analysis generated a total of 94 ISSR and 52 RAPD fragments, respectively. The ISSR fingerprinting also detected more polymorphic loci (38.29%) than the RAPD fingerprinting (34.61%). A principal coordinate analysis (PCA) was employed to evaluate the resolving power of the markers as regards differentiating protoclones. As a result, the mean polymorphism information content (PIC) for each marker system (i.e., 0.787 for RAPD and 0.916 for ISSR) suggested that ISSR is more effective for determining polymorphisms. The dendrograms constructed using RAPD, ISSR, and an integrated RAPD and ISSR marker system were highly correlated with one another as revealed by a high Mantel correlation (r= 0.98). The pairwise similarity index values also ranged from 0.64 to 0.95 (RAPD), 0.67 to 0.98 (ISSR), and 0.67 to 0.98 (RAPD and ISSR), whereas the mean similarity index values of 0.82, 0.81, and 0.84 were obtained for the RAPD, ISSR, and combined data, respectively. As there was a good correspondence between the RAPD and ISSR similarity matrices, ISSR would appear to be an effective alternative to RAPD in the genetic diversity assessment and accurate differentiation of homo- and heterokaryotic protoclones of A. bisporus.
Khan, Sami Ullah;Mahjabeen, Ishrat;Malik, Faraz Arshad;Kayani, Mahmood Akhtar
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.15
no.18
/
pp.7603-7609
/
2014
Glutathione is a thiol compound that plays an important role in the antioxidant defense system of the cell and its deficiency leads to an increased susceptibility to oxidative stress and, thus, progression of many disease states including head and neck cancer. In the present study, alterations of glutathione levels were investigated in study cohort of 500 samples (cohort 1 containing 200 head and neck cancer blood samples along with 200 healthy controls and cohort II with 50 head and neck squamous cell carcinoma tissue samples along with 50 control tissues) by high performance liquid chromatography. The results indicated that mean blood glutathione levels were significantly reduced in head and neck cancer patients (p<0.001) compared to respective controls. In contrast, the levels of glutathione total (p<0.05) and glutathione reduced (p<0.05) were significantly elevated in head and neck squamous cell carcinoma tissues compared to the adjacent cancer-free control tissues. In addition to this, pearson correlation performed to correlate different tissue glutathione levels (GSH) with clinical/pathological parameters demonstrated a significant negative correlation between pT-stage and GSH level ($r=-0.263^{**}$; p<0.01), C-stage and GSH level ($r=-0.335^{**}$; p<0.01), grade and GSH ($r=-0.329^{**}$; p<0.01) and grade versus redox index ($r=-0.213^{**}$; p<0.01) in HNSCC tissues. Our study suggests that dysregulation of glutathione levels in head and neck cancer has the potential to predict metastasis, and may serve as a prognostic marker.
Correlation of microsatellite heterozygosity with performance or heterosis was reported in wild animal populations and domestic animal populations, but the correlation with heterosis in a crossbreeding F$_1$ pig population remained uncertain. To explore this, we had random selected and mated Yorkshire${\times}$Meishan (F, n = 82) and their reciprocal (G, n = 47) to F$_1$, and used the two straightbreds as control groups (Yorkshire = 34, Meishan = 55), and observed the heterosis of birth weight (BWT), average daily gain (ADG) and feed and meat ratio (FMR). Two Kinds of measurement-individual heterozygosity (IH) and individual mean d$^2$ (lg value, ID) were used as index of heterozygosity and variance from 39 microsatellite marker loci to perform univariate regression analysis against heterosis. We detected significant correlation of IH with BWT in all of F$_1$ (F+G) and in F. We observed significant correlation of ID with ADG in all of F$_1$ (F+G), and with FMR in all of F$_1$ (F+G) and in F. There was significant maternal effect on heterosis, which was indicated by significant difference of means and distribution of heterosis between F and G. This difference was consistent with distributions of IH and ID, and with difference of means in F and G. From this study, it would be suggested that the two kinds of genetic index could be used to explore the genetic basis of heterosis in crossbreeding populations but could not determine which is better.
Kim, Hyunsuk;Choi, Gwang Ho;Shim, Kwang Eon;Lee, Jung Hoon;Heo, Nam Ju;Joo, Kwon-Wook;Yoon, Jong-Woo;Oh, Yun Kyu
Kidney Research and Clinical Practice
/
v.37
no.4
/
pp.393-403
/
2018
Background: This study compared nutritional parameters in hemodialysis (HD) subjects and controls using bioimpedance analysis (BIA) and investigated how BIA components changed before and after HD. Methods: This cross-sectional study included 147 subjects on maintenance HD from two hospitals and 298 propensity score-matched controls from one healthcare center. BIA was performed pre- and post-HD at mid-week dialysis sessions. Results: Extracellular water/total body water (ECW/TBW) and waist-hip ratio were higher in the HD patients; the other variables were higher in the control group. The cardiothoracic ratio correlated best with overhydration (r = 0.425, P < 0.01) in HD subjects. Blood pressure, hemoglobin, creatinine, and uric acid positively correlated with the lean tissue index in controls; however, most of these nutritional markers did not show significant correlations in HD subjects. Normal hydrated weight was predicted to be higher in the pre-HD than post-HD measurements. Predicted ultrafiltration (UF) volume difference based on pre- and post-HD ECW/TBW and measured UF volume difference showed a close correlation ($r^2=0.924$, P < 0.01). Remarkably, the leg phase angle increased in the post-HD period. Conclusion: The estimated normal hydrated weight using ECW/TBW can be a good marker for determining dry weight. HD subjects had higher ECW/TBW but most nutritional indices were inferior to those of controls. It was possible to predict UF volume differences using BIA, but the post-HD increase in leg phase angle, a nutritional marker, must be interpreted with caution.
The aim of this study was to estimate the influence of 37 bp insertion/deletion (I/O) poly-morphism of the low density lipoprotein receptor-related protein-associated protein 1 (LRPAP1) gene on anthropometrical or biochemical parameters in korean general population. To determine the frequency of the genotype, we analyzed 244 samples of Korean origin. The frequency of the I allele was 0.55 in men and 0.56 in women, which were significantly higher than the frequency (0.26) that was reported in Czech population of Caucasian origin. In addition, the I allele of this polymorphism was significantly associated with higher value of body mass index (BMI) in our subjects by ANOVA test (P<0.05), and this association was maintained after controlling for age and gender by ANCOVA test (P<0.05). Thus, our results suggest that the I/O polymorphism of the LRPAP1 gene may be useful as a genetic marker for obesity in Korean general population.
Tumor necrosis factor-$\alpha$ (TNF-$\alpha$) exhibits cytotoxicity towards various tumor cells in vitro and induces apoptotic necrosis in transplanted tumors in vivo. It also shows severe toxicity when used systemically for the treatment of cancer patients, hampering the development of TNF-$\alpha$ as a potential anticancer drug. In order to understand the structure-function relation of TNF-$\alpha$ with respect to receptor binding, we selected four regions on the bottom of the TNF-$\alpha$ trimer that are in close contact with the receptor and carried out mutagenesis studies and computational modeling. From the study, various TNF-$\alpha$ muteins with a high therapeutic index were identified. These results will provide a structural basis for the design of highly potent TNF-$\alpha$ for therapeutic purposes. By conjugating TNF-$\alpha$ muteins with a high therapeutic index to a fusion partner, which targets a marker of angiogenesis, it could be possible to develop TNF-$\alpha$ based anticancer drugs.
Journal of the Korean Society of Physical Medicine
/
v.18
no.4
/
pp.19-27
/
2023
PURPOSE: This investigation in the study aimed to assess to determine proportion and susceptibility makers of sarcopenia in Korean younger female aged 30 to 39 years. METHODS: To address the complex sampling design of Korea National Health and Nutrition Examination Surveys, appropriate individual weights were incorporated into the analysis. The data employed a stratified, clustered, multistage probability sampling design. A total of 2,098 participants were enrolled and categorized into two groups based on their skeletal muscle mass index scores. One hundred and twenty-four individuals were placed in the sarcopenia group, while 2,024 were allocated to a normal group. The study examined various markers as variables, including age, height, weight, body mass index waist circumference, skeletal muscle mass index, systolic and diastolic blood pressure, fasting glucose, triglyceride, and total cholesterol levels, and smoking and drinking habits. RESULTS: The study found that proportion of sarcopenia in this population was 3.78% (CI: 2.89-4.94) in sarcopenia group and 96.22% (CI: 95.06-97.11) in normal with weighed values. Several susceptibilities including height, weight, BMI, waist circumference, diastolic blood pressure, and total cholesterol levels were risk factor for sarcopenia (p < .05), exhibited significant differences between the sarcopenia and normal groups. CONCLUSION: This investigation provides the proportion of sarcopenia and identifies relevant susceptibility markers among community dwelling younger women in Korea.
Objectives: The aim of this study was to examine the levels of serum 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) and evaluate their association with age, body mass index, smoking, military record-based variables, and estimated exposure to Agent Orange in Korean Vietnam veterans. Methods: Serum levels of TCDD were analyzed in 102 Vietnam veterans. Information on age, body mass index, and smoking status were obtained from a self-reported questionnaire. The perceived exposure was assessed by a 6-item questionnaire. Two proximitybased exposures were constructed by division/brigade level and battalion/company level unit information using the Stellman exposure opportunity index model. Results: The mean and median of serum TCDD levels was 1.2 parts per trillion (ppt) and 0.9 ppt, respectively. Only 2 Vietnam veterans had elevated levels of TCDD (>10 ppt). The levels of TCDD did not tend to increase with the likelihood of exposure to Agent Orange, as estimated from either proximity-based exposure or perceived self-reported exposure. The serum TCDD levels were not significantly different according to military unit, year of first deployment, duration of deployment, military rank, age, body mass index, and smoking status. Conclusions: The average serum TCDD levels in the Korean Vietnam veterans were lower than those reported for other occupationally or environmentally exposed groups and US Vietnam veterans, and their use as an objective marker of Agent Orange exposure may have some limitations. The unit of deployment, duration of deployment, year of first deployment, military rank, perceived self-reported exposure, and proximity-based exposure to Agent Orange were not associated with TCDD levels in Korean Vietnam veterans. Age, body mass index and smoking also were not associated with TCDD levels.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.