Rusty root, the browning disease on ginseng, decreases quality and value. Recent studies indicated that endophytic bacteria could be a possible cause of rusty root. Actinomycetes antagonistic to the rusty-root-causing bacteria were isolated from soil. Twenty nine out of 932-isolates of Actinomycetes from soil showed antibacterial activity against Agrobacterium tumefaciens and Pseudomonas veronii an endophytic isolate in ginseng. The strongest antibacterial strain(ATO4O104) was classified based on 16S rDNA sequence. The Actinomycetes strain, ATO4O104, isolated in soil of USA volcano national park was identified as Streptomyces adephospholyticus. To test plant toxicity, radish seeds were sprouted with the culture of S. adephospholyticus and it did not show any harmful effect. The butanol partition out of n-hexane, ethyl acetate, butanol, and water partions showed the highest antibacterial activity.
From each sediments collected at Chudong(static) and Hoenam(streaming) site of Lake Daechung on May 18(before rainy season) and on August 24 in 1998(after rainy season), different strains of Actinomycetes were isolated and identified to genus level. For comparison, the genus diversity of Actinomycetes in control soils such as grass land around lake, lake shore, and shallow(5-10cm) lake was also investigated. In consequence, the isolation of Streptomyces from the sediments of Lake Daechung was the most copious(41 strains) at the streaming site before rainy season and the least(27 strains) at the static site before rainy season, which were 2.4- and 1.6-fold larger than the average(17 strains) of control soils, respectively. In addition, the isolation of rare Actinomycetes from the sediments of Lake Daechung was the most copious(23 strains) at the streaming site before rainy season and the least(12 strains) at the static site after rainy season, which were 3.2-and 1.6-fold larger than the average(17 strain) of controls, respectively. Therefore, it is considered that lake sediments exhibit higher diversity of Streptomycete as well as rare Actinomycetes than general soils, and thereby can be utilized as useful sources to isolate diverse Actinomycetes.
Identification of the Actinomycetes isolate strain No. 1372, a producer of Actinomycin X$_{2}$ was performed by using ISP method.l The strain, designated as No. 1372, was identified as Streptomyces floridae based on its morphological, physiological and biochemical characteristics. The highest production of the antibiotics by the strain was achieved in a fermentation medium containing soluble starch, yeast extract, (NH$_{4}$)SO$_{4}$, K$_{2}$HPO$_{4}$, NaCl$_{2}$, CaCO$_{3}$, and trace element.
The aim of the present study was to develop strains of actinomycetes producing low molecular weight cathepsin B inhibitor. Among 700 isolates from soil samples, a strain of Streptomyces sp. SMF30 producing cathepsin B inhibitor showing specificity and heat stability was selected by an economical and effective screening method. 50 units characteristics for major cluster analysis and 34 units characteristics for minor cluster were tested and the data were analyzed numerically using the TAXON program. The Isolate SMF30 was identified as a strain of Streptomyces aburabiensis
An anti-fungal material produced by actinomycetes was isolated from domestic soil. This actinomycetes was identified as Streptomyces albogriseus by 16S rDNA sequence. YEME (yeast extract 4 g, malt extract 10 g, glucose 4 g, D.W 1l, pH 7.00.2) medium was used for production of anti-fungal materials. S. albogriseus was cultured in a shaking incubator for 2 weeks at 150 rpm and $25^{\circ}C$. An anti-fungal material produced by S. albogriseus was identified at 340 nm by uv/vis- spectrometer and it showed powerful anti-fungal activity. This is the first report that secondary metabolite produced by S. albogriseus showed an activity against phytopathogenic fungi such as Collectrichum coccodes, Botrytis cinerea, Cladosporium cucumerinum, Didymella bryoniae.
본 연구에서는 생리활성물질을 생성하는 해양미생물을 분리하기 위하여 연근해역의 해면을 조사하였다. 해면 중의 미생물은 $1.2{\times}10{\sim}2.1{\times}10^3/g$ 범위에 있었고, 이들 중 방선균은 $0.01{\sim}0.5\%$(data 생략)로 나타났다. 분리된 미생물은 각각 배양하여 항균물질을 검토하였으며, 검토하던 중에 비교적 강한 항균물질을 생산하는 균주 No. 101을 분리, 선발하였다. 선발된 균의 특징은 sclerotia로 형태가 다양하였고, 다양한 배지에서 생육이 가능하였고, 기균사의 색깔은 회백색, 배면의 색깔은 주로 회백색에서 갈색으로 나타났으며, 젤라틴 액화능과 전분 분해능을 가지나 myo-inositol은 이용하지 못하였다. 이 균의 배양학적 특성은 최적 pH 및 온도가 $6.5{\sim}7.0$ 및 $30^{\circ}C$였으며, 탄소원으로는 starch가 30g/l, 질소원으로는 casamino acid 10g/l가 적합한 것으로 나타났다. 방선균 No. 101의 균체 및 균배양액의 추출물에 대한 항균 및 항진균성에서는 Staphylococcus aureus와 Bacillus subtilis에서 강한 항균력을, 효모와 곰팡이에 대하여는 낮은 항진균성을 나타내었다.
Anti-fungal materials producing bacteria were isolated from soil by bennett's agar and actinomycete isola-tion agar medium. The bacterla were identified as synonym of Actinomycetes. Based on the data obtained from its morphological and colony characteristics. The medium for production of anti-fungal materials was YEME (yeast extract 4 g, malt extract l0g, glucose 4 g, D.W 1ι, pH 7.0${\pm}$0.2). The culture conditions were 30$^{\circ}C$, 7 days and 200 rpm in shaking incubator. No. 13, No. 15 and No.28 strains were produced anti-fungal materials against fungal plant pathogens. Specially, The No. 28 strain showed a powerful biopesticide activity and broad spectrum effects of anti -fungal materials on Collectrichum coccodes, Botrytis cinerea, Cladosporium cucumerinum, Didymella bryoniae.
The polyene antibiotics are a family of most promising antifungal polyketide compounds, typically produced by actinomycetes species. Using the polyene CYP-specific PCR screening with served actinomycetes genomic DNAs, Pseudonocardia autotrophica strain was identified to contain a unique polyene-specific CYP gene. The genomic DNA library screening using the polyene-specific CYP gene probe revealed the positive cosmid clone containing an approximately 34.5 kb DNA fragment revealed a total of seven complete and two incomplete open reading frame (ORFs), which are highly homologous but unique to previously-known polyene biosynthetic genes. These results suggest that the polyene-specific screening approach should be an efficient way of isolating potectially-valuable cryptic polyene biosynthetic gene cluster from various rare actinomycetes.
The aim of the present research program was to isolate a strain of actinomycetes producing antifungal substance. Soil samples were collected from various sites in Korea and a number of actinomycetes were isolated from the soil samples by applying selective agar for actinomycetes. Among isolates, a strain (NA -52) producing antifungal substance against Pyricularia oryzae was selected. Chemotaxonomic and numerical identification were carried out for the isolate. Fifty taxonomic unit characters were tested and the data were analyzed numerically using TAXON program. The isolate was identified as a synonym of streptomyces diastaticus belong to cluster No. 19 (Streptomyces diastaticus). But it showed a low similarity to S. diastaticus in simple matching coefficients, hence it was considered as one new species in Streptomyces.
국내 토양에서 분리한 방선균에서 살충성물질을 선발하는 연구과정 중 no. 2077 균주가 생산하는 살충성물질을 분리하였다. 살충성물질 SR2077은 UV, $^1H-NMR$, $^BC-NMR$, C-H COSY 등의 방법으로 구조분석한 결과 albocycline으로 동정되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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