• 제목/요약/키워드: INDICATOR SPECIES ANALYSIS

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Characterization of a Novel Cucumber mosaic virus Isolated from Petunia hybrida

  • Han, Kyung-Sook;Choi, Gug-Seoun;Chung, Bong-Nam;Cho, Jeom-Duk;Cho, In-Sook;Kim, Kee-Hong;Kim, Su;Yoon, Ju-Yeon;Choi, Seung-Kook
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권3호
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    • pp.299-305
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    • 2012
  • Petunia hybrida is commonly used in landscapes and interiors for its attractive flower. Virus-like foliar symptoms, including a mosaic with dark green islands surrounding the veins and chlorosis on the leaf margins, were observed on a petunia plant from Icheon, Gyeonggido, Korea. Cucumber mosaic virus (CMV) was identified in the symptomatic petunia by serological testing for the presence of CMV coat protein (CP) with a direct antibody-sandwich-enzyme-linked immunosorbent assay. An agent was mechanically transmitted to indicator plant species including Chenopodium quinoa. Examination of the inoculated plant leaves by RT-PCR analysis and electron microscopy revealed the presence of specifically amplified CP products and spherical virions of approximately 28 nm in diameter, respectively, providing confirmation of a CMV infection. Analysis of CP sequences showed that CMV petunia isolate (CMVYJC) shared 82.5-100% amino acid sequence identity with CPs of representative CMV strains. Phylogenetic analysis of CPs supports that CMV-YJC is a member of CMV subgroup IA (CMV-IA) and has biological properties of CMV-IA on host species. To our knowledge, this is the first report of CMV from P. hybrida in Korea.

덕유산 일대 천연림의 산림형 분류와 천이경향 (Forest Type Classification and Successional Trends in the Natural Forest of Mt. Deogyu)

  • 황광모;정상훈;김지홍
    • 한국산림과학회지
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    • 제105권2호
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    • pp.157-166
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    • 2016
  • 덕유산 백암봉 일대의 천연림을 대상으로 산림형을 구분하고, 각 산림형별 생태적 특성을 파악하여 천이경향을 제시하였다. 사분각법을 이용하여 225개의 표본점에서 식생자료를 수집하였으며, 다양한 다변량 통계분석(Cluster분석, 지표종분석, 다중판별분석 등)을 실시하여 산림형을 구분하였다. 그 결과, 연구대상지는 5개의 산림형으로 분류되었고, 상층의 우점비율 및 입지환경에 따라 능선부에서는 신갈나무림, 계곡부에서는 들메나무-물푸레나무-층층나무림과 들메나무림, 사면하부에서는 졸참나무-소나무-신갈나무림, 소나무림 등이 분포하여 입지조건에 따라 수종구성 차이가 뚜렷한 것으로 나타났다. 산림유형별 생태적, 환경적 특성을 근거로 천이경향을 추정한 결과, 현재의 산림형은 신갈나무림, 들메나무림, 중생혼합림, 참나무-서어나무림 등으로 천이가 진행될 것으로 예상되었다.

지시종을 이용한 수도권 광화학 오존의 민감도 분석 (The Use of Indicator Species for Photochemical Ozone Sensitivity Analysis)

  • 김경렬;백성욱;이강웅;이동수;이미혜;조석연;이종범;이석조;한진석
    • 한국대기환경학회:학술대회논문집
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    • 한국대기환경학회 2003년도 춘계학술대회 논문집
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    • pp.137-138
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    • 2003
  • 광화학 오존의 생성에 필수적인 3가지 요소 중에서 인위적으로 조절가능한 부분은 질소화합물과 유기화합물의 배출량이다. 하지만 배출량 감소를 유도하여 이들의 대기 중 농도를 줄일 경우 오존 발생이 저감될 지의 여부는 매우 다양하고 복잡한 화학반응들을 평가한 결과 단순한 상관 관계가 아닐 수 있다는 것이 밝혀져 있다. 이는 어떤 경우 이들 오염물질의 배출량 감소에도 불구하고 오존의 농도는 오히려 증가할 수 있는 가능성을 지시한다. 결국 오존발생에 관여하는 질소 화합물과 휘발성유기화합물의 정확한 정량적인 평가가 우선되어야 한다. (중략)

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남한지역 향나무림의 군락생태학적 특성 (Community Ecological Characteristics of Juniperus chinensis L. Forest in South Korea)

  • 신재권;김혜진;신학섭;정재민;윤충원
    • 한국산림과학회지
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    • 제102권4호
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    • pp.587-600
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    • 2013
  • 남한 자생 향나무의 산림식생 관리방안을 위해 ZM 식물사회학적 방법에 의해 군락단위 및 그 하위단위를 분류하고, 식생유형별 피도값을 이용하여 NMS와 지표종분석을 실시하였다. 향나무군락군은 총 2개 군락과 4개 군 및 6개의 소군으로의 분류체계를 가졌으며 총 7개의 식생단위로 분류되었다. NMS 분석결과 설명률이 높은 1축(13.8%) 및 2축(69%) 으로 나타내었으며, 종합설명력은 31%로 나타났으며, 내륙(동강)지역, 동해안지역과 울릉도지역이 명확하게 구분되어 나타났다. 식생단위별 지표종을 분석한 결과 89종이 유의성 있게 분석되었다. 식생단위별 종 다양도, 균재도, 종내경쟁 등을 분석한 결과 종다양도에서는 회양목군락 굴참나무군의 하위단위인 개박달나무소군이 1.17로 가장 높게 나타났고, 곰솔군락 쥐똥나무소군의 하위단위인 전형소군이 0.67로 가장 낮게 나타났다. 종간 경쟁지수에서는 분꽃나무군이 0.46으로 가장 작았고, 섬벚나무소군이 0.80으로 가장 높게 나왔으며, 전체적으로 0.7내외로 나타났다.

가막만 양식장과 자연 서식지에서의 대형저서다모류 군집구조 차이 (Differences in the Community Structures of Macrobenthic Polychaetes from Farming Grounds and Natural Habitats in Gamak Bay)

  • 장소윤;신현출
    • 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.297-309
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    • 2016
  • 본 연구는 가막만에 위치하는 양식장과 자연 서식지(비양식장해역)에서의 저서환경과 저서다모류군집의 차이를 비교하기 위하여 실시하였다. 자연 서식지에서의 조사 정점은 가막만 전 해역에 고르게 분포시켰으며, 양식장 해역은 가막만의 대표적인 양식장인 담치양식장, 굴양식장, 피조개양식장을 대상으로 선정하였다. 자연 서식지 해역과 양식장해역의 퇴적상은 대부분 니질 퇴적상을 보였으며, 평균 유기물함량은 자연 서식지에 비해 양식장해역에서 높게 나타났다. 그리고 양식장해역보다 자연 서식지 해역에서 저서다모류군집의 출현종수와 평균서식밀도가 상대적으로 높게 나타났다. 최우점종은 양식장과 자연 서식지 모두 잠재적 유기물오염지표종인 Lumbrineris longifolia로 나타났으나, 나머지 주요 우점종은 지역간에 약간의 차이를 보였다. 집괴분석 및 nMDS를 이용한 군집구조 분석 결과 지연 서식지 해역은 지역적으로 그룹이 나뉘었으나, 양식장해역의 경우 북서 내만역의 무생물정점을 제외하고 대부분의 정점이 한 그룹으로 묶였다. 또한 상관분석 및 PCA 분석 결과, 자연서식지의 경우 퇴적환경과 저서다모류군집간에 비교적 높은 상관관계를 보였으나, 양식장의 경우에는 낮은 상관관계를 보였다. 즉 가막만 양식장해역에 형성되어 있는 저서다모류군집은 다량의 유기물 유입과 같은 비정상적인 조건 하에 놓여 있음을 의미한다. 따라서 가막만은 생물상이 극히 빈약한 북서내만역과 함께 양식장해역 역시 지속적인 모니터링을 통한 환경 개선 노력이 필요하다고 생각된다.

내장산국립공원의 자생버섯 분포상 (Distribution of mushrooms spontaneously growing in Naejangsan National Park)

  • 고평열;박혜성;이승학;전용철
    • 한국버섯학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.208-217
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    • 2022
  • 내장산국립공원 내 자생하는 버섯류를 2021년 5월부터 9월까지 5개월 동안 조사하였다. 이 기간 동안 총 4문, 9강, 25목, 72과 171속 381분류군의 버섯류가 확인되었고 기후변화지표종은 3분류군이 관찰되었다. 주름버섯목이 24과, 62속, 170분류군으로 가장 많이 발견되었다. 그 중 무당버섯속이 30분류군으로 가장 많았고 그 다음으로 광대버섯속이 27분류군이 관찰되었다. 조사한 12 지점 중, F5 지역에서 서로 다른 버섯이 56분류군 발견되어 가장 종이 다양한 것으로 조사되었다. 특히, 외근균에 속하는 무당버섯속과 젖버섯속이 많이 발견되었다. 이 지역은 경사가 완만할 뿐 아니라 조릿대 발생이 적어 버섯류가 자생하기에 적합한 환경이 조성된 것으로 판단된다. 실제로 경사가 가파르고 조릿대가 많이 발견된 다른 조사 지점인 F6, F8 그리고 F10에서는 19분류군만 관찰되었다. 그 외에 DNA 염기서열 분석을 통해 확인한 결과 표본 NJ21064는 Chlorophyllum hortense로 국내 미기록종으로 동정되었다.

양산시 화엄늪의 산지화 진행실태 및 예방관리 방안 (Analysis Actual Conditions of Arid Progress and Prevention Management of Hwaeom Wetland in Yangsansi)

  • 이수동;김선희;김지석
    • 한국환경생태학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.498-511
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    • 2012
  • 산지습지는 멸종위기야생동식물 II 급인 끈끈이주걱과 지표종인 이삭귀개, 잠자리난초, 물매화, 진퍼리새 등이 분포하여 중요성은 높으나, 자연적 또는 인위적인 과정에 의해 건조화가 빠르게 진행되고 있어 시급한 관리가 필요한 실정이다. 본 연구는 정확한 자연생태계 현황 및 건조화 진행 실태를 파악하여 습지생태계 보존대책과 건조화 관리 방안을 제시하고자 한다. 화엄늪은 경사도 $10^{\circ}$ 미만(86.1%), 해발 750~810m(87.4%)로 산지습지의 적지라고 할 수 있으나 하부에 깊이 1.6m, 폭 0.8m인 수로가 형성되어 이탄층 유실, 수위저하 등으로 인한 건조화 진행이 우려되었다. 습지보호지역 내 식생은 진퍼리새 등 습윤지성 식생이 분포하는 면적이 6.7%로 협소한 반면, 참억새, 미역줄나무 등 산림성 목본 및 건조지성 초본이 우점하여 방치시 숲생태계로의 천이가 예상된다. 건조화를 예방하고 양호한 생태계의 지속적인 보존을 위해 식생의 생태적 특성을 고려한 보존 및 관리지역 설정, 습지보호를 위해 천이에 영향을 미치는 주연부 식생 관리, 핵심지역 보호를 위한 완충지역 설정을 제안하였다. 관리에 있어서는 습지훼손 요인관리를 위하여 수계로의 과도한 지하수 유출 억제를 통한 물고임 습지 안정화와 산지습지 지표종에 대한 보호 및 관리식물 지정, 습지의 산림화를 유발 촉진할 수 있는 건조지성 수목을 관리해야 할 것이다.

Characterization and gene expression of heat shock protein 90 in marine crab Charybdis japonica following bisphenol A and 4-nonylphenol exposures

  • Park, Kiyun;Kwak, Ihn-Sil
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제29권
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    • pp.2.1-2.7
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    • 2014
  • Objectives Heat shock protein 90 (HSP90) is a highly conserved molecular chaperone important in the maturation of a broad spectrum of protein. In this study, an HSP90 gene was isolated from Asian paddle crab, Charybdis japonica, as a bio-indicator to monitor the marine ecosystem. Methods This work reports the responses of C. japonica HSP90 mRNA expression to cellular stress by endocrine disrupting chemicals (EDCs), such as bisphenol A (BPA) and 4-nonylphenol (NP) using real-time. reverse transcription polymerase chain reaction. Results The deduced amino acid sequence of HSP90 from C. japonica shared a high degree of homology with their homologues in other species. In a phylogenetic analysis, C. japonica HSP90 is evolutionally related with an ortholog of the other crustacean species. The expression of HSP90 gene was almost distributed in all the examined tissues of the C. japonica crab but expression levels varied among the different body parts of the crabs. We examined HSP90 mRNA expression pattern in C. japonica crabs exposed to EDCs for various exposure times. The expression of HSP90 transcripts was significantly increased in C. japonica crabs exposed to BPA and NP at different concentrations for 12, 24, 48 and 96 hours. The mRNA expression of HSP90 gene was significantly induced in a concentration- and time-dependent manner after BPA or NP exposures for 96 hours. Conclusions Taken together, expression analysis of Asian paddle crab HSP90 gene provided useful molecular information about crab responses in stress conditions and potential ways to monitor the EDCs stressors in marine environments.

강원 남부지역 분비나무림의 식생구조 및 특성 분석 (Vegetation Structure and Characteristics Analysis of Abies nephrolepis Forest in Southern Region of Gangwon-do, Korea)

  • 신동빈;오승환
    • 한국산림과학회지
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    • 제111권2호
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    • pp.224-233
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    • 2022
  • 멸종위기 고산 침엽수종인 분비나무가 생육하는 임분 식생의 종조성과 구조를 파악하기 위해 강원 남부지역을 대상으로 현장 식생조사와 식물사회학적 군집분류를 실시하였다. 약 400 m2 규격의 총 192개소를 대상으로 Z-M 식물사회학적 방법에 따른 현장조사를 실시하였고, 이원지표종분석(TWINSPAN)과 표조작법을 이용하여 식생유형을 분류하고 각 식생단위별 중요치와 종다양도를 산출하였다. 군락 유형을 분류한 결과, 강원 남부지역 분비나무 분포지의 산림 식생유형은 분비나무-당단풍나무군락, 분비나무-관중군락, 분비나무 전형군락으로 구분되며, 분비나무-당단풍나무군락은 4개의 아군락과 2개의 변군락으로 구분되었다. 목본성 수종의 중요치 분석 결과 분비나무, 신갈나무, 사스래나무, 마가목, 피나무, 당단풍나무 등이 높은 생태적 지위를 띠고 있는 것이 확인되었다.

2009년 봄, 여름철 광양만 지역 오존의 광화학적 특성 분석 (Photochemical Analysis of Ozone Levels in the Gulf of Gwangyang in the Spring and Summer of 2009)

  • 손장호;송상근;이강웅
    • 한국대기환경학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.161-176
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    • 2010
  • We examined high ozone episodes observed during the intensive measurement periods (11 May~21 June and 30 July~11 August 2009) in the Gulf of Gwangyang. During that period, there were a few events (or days) in which 1 hr averaged ozone concentrations were greater than 100 ppbv. The analysis of ozone budget and photochemical characteristics related to the ozone production was carried out using a photochemical box model. Ozone sensitivity to $NO_x$ and VOCs was also examined in the study area during the measurement period. Diurnal variation of ozone during the episodes was similar to that of odd hydrogen radicals ($HO_2,CH_3O_2$, and $RO_2$), suggesting significant correlation with photochemical production of ozone during the episodes. In general, ozone concentration in the study area during the measurement period was sensitive to VOCs, whereas ozone was sensitive to $NO_x$ under certain conditions. Ozone sensitivity assessment using a radical budget analysis and $NO_x$/VOCs-control strategy was consistent with that using indicator species ($H_2O_2/HNO_3$ ratio).