• 제목/요약/키워드: IMP-6

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Generation and Expression in Plants of a Single-Chain Variable Fragment Antibody Against the Immunodominant Membrane Protein of Candidatus Phytoplasma Aurantifolia

  • Shahryari, F.;Safarnejad, M.R.;Shams-Bakhsh, M.;Schillberg, S.;Nolke, G.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권8호
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    • pp.1047-1054
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    • 2013
  • Witches' broom of lime is a disease caused by Candidatus Phytoplasma aurantifolia, which represents the most significant global threat to the production of lime trees (Citrus aurantifolia). Conventional disease management strategies have shown little success, and new approaches based on genetic engineering need to be considered. The expression of recombinant antibodies and fragments thereof in plant cells is a powerful approach that can be used to suppress plant pathogens. We have developed a single-chain variable fragment antibody (scFvIMP6) against the immunodominant membrane protein (IMP) of witches' broom phytoplasma and expressed it in different plant cell compartments. We isolated scFvIMP6 from a naïve scFv phage display library and expressed it in bacteria to demonstrate its binding activity against both recombinant IMP and intact phytoplasma cells. The expression of scFvIMP6 in plants was evaluated by transferring the scFvIMP6 cDNA to plant expression vectors featuring constitutive or phloem specific promoters in cassettes with or without secretion signals, therefore causing the protein to accumulate either in the cytosol or apoplast. All constructs were transiently expressed in Nicotiana benthamiana by agroinfiltration, and antibodies of the anticipated size were detected by immunoblotting. Plant-derived scFvIMP6 was purified by affinity chromatography, and specific binding to recombinant IMP was demonstrated by enzyme-linked immunosorbent assay. Our results indicate that scFvIMP6 binds with high activity and can be used for the detection of Ca. Phytoplasma aurantifolia and is also a suitable candidate for stable expression in lime trees to suppress witches' broom of lime.

임상에서 분리된 Metallo-β-lactamase 생성 Pseudomonas aeruginosa의 분자역학 (Molecular Epidemiology of Metallo-β-lactamase Producing Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates)

  • 최명원
    • 생명과학회지
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    • 제22권9호
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    • pp.1268-1276
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    • 2012
  • 사람의 감염증 치료에 사용되는 carbapenem계 약제에 대한 내성균의 출현 및 확산은 감염증 치료를 제한할 뿐만 아니라 집단 발병의 원인이 될 수 있다. 이에 본 연구에서는 ${\beta}$-lactam 약제에 내성을 갖는 Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa)를 대상으로 metallo-beta-lactamase (MBL)의 유전형을 규명함으로써 내성세균의 감염증 치료지침 및 확산방지책 마련에 기초 자료를 제공하고자 하였다. 본 연구의 대상이 된 254개의 임상 검체 중에서 42주의 P. aeruginosa 를 분리하여 imipenem 혹은 meropenem에 내성을 나타내는 Hodge 변법과 EDST에서 각각 28주와 23주가 양성반응을 보였다. DNA의 염기서열 분석결과 $bla_{IMP-6}$ 유전자 보유균이 8주, $bla_{VIM-2}$ 유전자 보유균이 17주로 59.5%(25/42)가 MBL을 생성하는 것으로 나타났다. $bla_{IMP-6}$의 유전자 환경은 $bla_{IMP-6}$-qac-aacA4-$bla_{OXA-1}$-aadA1 유전자 배열을 지니고 있었다. 또한 ERIC PCR 결과 IMP-6과 VIM-2를 생성하는 일부 균주에서 역학적 연관성이 있음이 확인되었다. 본 연구에서 분리한 carbapenem계 항균제 내성 P. aeruginosa가 보유한 $bla_{IMP-6}$ 유전자는 대구지역에서 발병이 보고된 유전자의 gene cassette와 일치하는 것으로 확인되었다. 따라서 이들 세균이 지역사회에 정착하고 있고 이들을 보유한 세균에 의한 감염증 치료시 치료약제에 대한 선택압을 증가시킬 것으로 우려된다. 그러므로 항균제 내성 검사를 통하여 적절한 항균제를 선택하고, 항균제 내성균들의 출현과 확산을 막는 연구가 계속되어야 할 것으로 생각된다.

Brevibacterium ammoniagenes의 영양구성 변리주에 의한 5 -IMP 생성 (Production of 5-IMP by Auxotroph of Brevibacterium ammoniagenes)

  • 이별나
    • 한국식품영양학회지
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    • 제1권2호
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    • pp.37-42
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    • 1988
  • In attempts to obtain IMP Producting strains, Brevibacterium ammoniagenes ATCC 6872 was treated wilts N.1.6. Adenine-guanine requiring mutants were obtained from Brevibacterium ammoniagenes ATCC 6872, and then a strain of them was selected for production of IMP and named Brevibacterium ammoniagenes No.9(ade', gu'). The production of IMP by Brevibacterium ammoniagenes nuts No.9 was about 3mg/ml for 4 day of culture. The optimal concentration of adenine and guanine was 150mg/mg.

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HPLC에 의한 시판수산건제품의 ATP분해생성물의 신속정량법 (A Rapid Method for Determination of ATP and Its Related Compounds in Dried Fish and Shellfish Products Using HPLC)

  • 이응호;구재근;안창범;차용준;오광수
    • 한국수산과학회지
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    • 제17권5호
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    • pp.368-372
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    • 1984
  • 보다 간편하게 핵산관련물질을 정량할 목적으로 고속액체크로마토그래피를 이용한 정량법을 검토하였으며, 이 방법을 이용하여 시판 수산건제품의 ATP분해생성물의 함량을 정량하였다. 장치는 HPLC/ALC-244(Waters Associates Inc.)를, 칼럼은 ${\mu}-Bondapak\;C_{18}$ stainless steel column($3.9mm\;i.d.{\times}30.0cm$)을, 검출기는 UV검출기(254nm)를, integrator는 Yanagimoto system-1000을 각각 사용하였으며, 이동상(移動相)으로서는 $1\%$ triethylamine${\codt}$phosphoric acid 혼액 (pH 6.5, $1\%$ triethylamine 용액을 phosphoric acid로써 pH조절)을 사용하고 2ml/min로 용리시키는 것이 가장 분리능이 좋았다. 용리되는 순서는 hypoxanthine, IMP, inosine, AMP, ADP 및 ATP의 순이었으며, retention time 20분이내에 분석이 완료되었다. 그러나 5'-IMP와 5'-GMP는 분리되지 않았다. 자건품(煮乾品)은 이노신산(IMP) 함량이 전반적으로 많았는데, 그 중에서도 벤뎅이가 가장 함량이 많았다. 소건품(素乾品)에는 inosine, hypoxanthine 함량이 많았으며, 조미건제품(調味乾製品)도 소건품과 비슷한 양상이었으나 IMP 함량이 비교적 높은 것은 조미할 때 핵산계조미료가 첨가되었기 때문이라고 볼 수 있었다.

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대전지역의 입원환자에서 분리된 Carbapenem 내성 Pseudomonas aeruginosa의 분자역학조사(2008년에서 2014년까지) (Molecular Analysis of Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa Isolated from Patients Hospitalized in Daejeon between 2008 and 2014 Years)

  • 조혜현
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제50권4호
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    • pp.406-413
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    • 2018
  • 최근 P. aeruginosa의 carbapenem에 대한 내성은 전 세계적으로 증가하고 있는 실정이다. 특히 $metallo-{\beta}-lactamases$ (MBLs)는 carbapenem의 고도 내성에 관여하고 있는 것으로 보고되고 있다. 한편, Sequence type 235 (ST235)는 다제내성 클론으로써 국제적으로 보고되고 있으며, IMP-6와 VIM-2 유전자의 확산에도 관여하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 2008년 3월부터 2014년 6월까지, 대전지역의 3차 병원에서 분리된 carbapenem 내성 P. aeruginosa에서 MBL 유전자를 분석하고 이에 대한 역학관계를 조사하고자 하였다. 항균제 감수성 양상은 디스크 확산법으로 확인하였고, MBL 유전자의 분석을 위해 PCR과 염기서열분석을 수행하였다. 더불어, 역학 관계를 조사하기 위해 multilocus sequence typing (MLST)를 실시하였다. 110 균주의 carbapenem 내성 P. aeruginosa 중, 32균주(29.1%)가 MBL를 생성하였고, IMP-6 (29균주, 90.6%)가 주요하게 확인되었다. VIM-2는 3균주(9.4%)에서 확인되었으며, 모두 ST357로 확인되었다. IMP-6를 생성하는 P. aeruginosa는 모두 다제내성을 보였고, ST235로 확인되었다. ST235 (55균주, 50.0%)는 가장 높은 비율로 확인된 클론이며 7년 동안 지속적으로 확인되었다. 이러한 다제내성 ST235의 확산을 방지하기 위해, carbapenem의 과도한 사용을 제한하고, 지속적으로 모니터링하는 전략이 개발되어야 할 것으로 사료된다.

사료 내 nucleotide 첨가가 틸라피아(Oreochromis niloticus)의 성장, 사료효율 및 비특이적 면역력에 미치는 영향 (Effects of Dietary Supplementation with Nucleotide on Growth Performance, Feed Utilization, and Non-Specific Immune Responses of Nile Tilapia Oreochromis niloticus)

  • 송진우;임세진;오대한;차지훈;이경준
    • 한국수산과학회지
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    • 제45권6호
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    • pp.648-653
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    • 2012
  • The present study examined the effects of dietary supplementation with nucleotide (inosine monophosphate product, IMP) on the growth performance, feed utilization, and non-specific immune responses of juvenile tilapia Oreochromis niloticus. Triplicate groups of tilapia (initial body weight, $7.4{\pm}0.04$ g) were fed experimental diets containing 0%, 0.05%, 0.1%, and 0.2% IMP. Fish were fed six times a day until apparent satiation for 13 weeks. At the end of the feeding trial, final body weight and food utilization of fish fed 0.1% IMP were significantly higher than those of fish fed the control diet. Results of hematological parameters were not affected by dietary IMP. However, blood protein level was significantly higher in the 0.05% treatment, as compared to that of the control and 0.2% IMP diets. Myeloperoxidase activity was higher in fish fed 0.1% IMP than in fish fed the control and 0.2% IMP diets. These results suggest that dietary supplementation with IMP can enhance the growth performance, feed utilization, and innate immune response of juvenile tilapia. The optimal IMP supplementation level appears to be 0.1% in practical feed formulations for tilapia.

사료 내 Nucleotides 첨가가 참돔P(agrus major)의 성장, 사료효율, 혈액성상 및 비특이적 면역반응에 미치는 영향 (Effects of Dietary Nucleotide Supplementation on the Growth Performance, Feed Utilization, Hematological Parameters and Innate Immunity in Red Seabream Pagrus major)

  • 송진우;이경준
    • 한국수산과학회지
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    • 제46권6호
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    • pp.785-792
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    • 2013
  • Two studies were conducted to investigate the effects of dietary nucleotides (NT) on the growth performance, hematological parameters, and innate immune responses of red seabream Pagrus major. In Expt I, six experimental diets were formulated: a control, four that contained each NT at a level of 0.15% (inosine monophosphate, IMP; adenosine monophosphate, AMP; guanosine monophosphate, GMP; and uridine monophosphate, UMP), and one with a 1:1:1:1 mixture of NTs (IMP, AMP, GMP, and UMP). In Expt II, five experimental diets were formulated that contained 0, 0.1, 0.2, 0.4, and 1.0% IMP (commercial product). Triplicate groups of juvenile (initial body weight 33.1 g) and growing (initial body weight 120 g) red seabream were fed one of the experimental diets to apparent satiation for 8 weeks in Expt I and 12 weeks in Expt II. In Expt I, fish fed diets with NT had higher growth performance than the control group. The nitroblue tetrazolium and lysozyme activities were higher in fish fed the mixed-NT diet, and lowest in the control group. In Expt II, the final body weight and feed utilization of fish fed the 0.1% IMP diet were significantly higher than those of fish fed the control or 1.0% IMP diets. Diet palatability was improved significantly when 0.1% IMP was added. The lysozyme activity was higher in fish fed diets with 0.4-1.0% than in the control group. These results suggest that supplementation of 0.15% IMP and Mixed-NTs in diet can enhance the growth and immune responses in juvenile red seabream. The optimum IMP level appears to be 0.2% in practical feed formulation for growing red seabream.

각종 효소를 이용한 맥주 폐효모로부터 효모추출물 제조 (Preparation of Yeast Extract from Waste Brewer's Yeast using Various Enzymes)

  • 이옥환;이성갑;손종연;김경임;김현덕;이부용
    • 한국식품과학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.867-872
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    • 2002
  • 정미성이 높은 효모 추출물을 얻고자 각종 효소의 사용에 대한 최적 조합 및 공정법을 알아보기 위하여 맥주 폐효모박을 각종 효소로 처리하여 효모추출물 중의 정미성분(IMP, GMP 및 유리아미노산)을 측정하여 비교, 분석하였다. Glucanase(0.5%) 처리에 의한 효모추출물중의 조단백질 함량은 33.6% 이었다. Tunicase(1%) 28.0% 와 무처리구 21.1%에 비해 최고 1.6배의 증가를 보였다. 단백질 분해효소처리에 의한 조단백질의 함량은 bromelin(1%), protamex(1%) 처리에서 각각 30.8%, 29.8%로 무처리구에 비해 최고 1.4배의 증가를 보였다. 효소 복합처리에 의한 상승효과는 glucanase(0.5%)+protamex(1%) 처리구에서 조단백질의 함량이 34.4%로 나타나 glucanase 단독처리구의 33.6%보다 높은 함량을 나타냈다. IMP+GMP 총함량은 glucanase + phophodiesterase + adenyldeaminase (G+P+A) 혼합 처리구에서 1,066 mg/100 g, glucanase + ptotamex + phophodiesterase + adenyldeaminase (G+Pro+P+A) 혼합 처리구에서는 1,047 mg/100 g으로 비슷하였다. 유리아미노산의 함량은 protamex가 첨가된 G+Pro+P+A 혼합처리구에서 2,302 mg/100 g으로 가장 높게 나타났다. 따라서 IMP, GMP 및 유리아미노산의 함량을 모두 고려해 볼 때 세포벽 분해효소 (gulcanase 0.5%, 12시간), 단백질 분해효소 (protamex 1%, 3시간), 핵산 분해효소 (phosphodiesterase 0.1%, 3시간) 및 핵산 전이효소 (adenyldeaminase 1%, 1.5시간)를 순차적으로 적용시켜 가수분해시키는 것이 효모 추출물의 정미성을 높이는 최적의 효소 복합 사용공정으로 판단되었다.

국내 대학병원에서 분리된 Metallo-β-Lactamase (MBL) 생성 Acinetobacter spp. 분리주의 높은 출현율과 유전형 특징 (High Prevalence and Genotypic Characterization of Metallo-β-Lactamase (MBL)-Producing Acinetobacter spp. Isolates Disseminated in a Korean Hospital)

  • 염종화
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.444-452
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    • 2019
  • 주요 획득성 metallo-β-lactamase (MBL) 유전자에 의해 매개되는 carbapenem 내성, 특히 Acinetobacter spp. 균종의 임상 분리주에 대한 보고가 증가하고 있다. 본 연구에서 임상에서 비 중복으로 분리된 carbapenem 비감수성 Acinetobacter spp. 191주 중 125 (65.4%)주가 imipenem 혹은 meropenem-Hodge 변법시험에 양성이었고, 49 (25.7%)주가 imipenem-EDTA+SMA double disk synergy (DDS) 시험에 양성이었다. blaVIM-2 allele와 blaIMP-2 allele 검출을 위한 중합효소연쇄반응과 염기서열분석을 시행한 결과, A. baumannii와 A. calcoaceticus에서 각각 29주와 1주가 blaVIM-2를 갖고 있었고, A. baumannii 16주와 A. calcoaceticus 2주가 blaIMP-1을 갖고 있었다. A. genomospecies 3는 blaVIM-2와 blaAIM-1을 동시에 갖고 있었다. 이들 MBL 유전자는 모두 class 1 integron에 있었다. blaVIM-2 혹은 blaIMP-6를 갖는 class 1 integron의 크기는 A. baumannii 분리주에서는 2.8 kb에서 3.2 kb이었고, A. genomospecies 3 분리주에서는 3.2 kb에서 3.5 kb이었다. blaVIM-2는 대부분 class 1 integron에 첫번째 혹은 두번째에 위치하였고, aacA4를 흔히 가지고 있었다. 다양한 내성 유전자를 가질 수 있는 MBL 생성 Acinetobacter spp.뿐 아니라 다양한 내성 유전자를 가질 수 있는 integron의 전파로 imipenem이나 meropenem과 같은 carbapenem 내성을 포함하여 다제 내성 그람음성 세균의 증가가 예상된다. 또한, 위중한 Acinetobacter spp. 감염증 치료를 위한 새로운 항균제 개발이 필요하다.

접합가능한다제내성녹농균의출현 (Emergence of Conjugative Multidrug-Resistant Pseudomonas aeruginosa)

  • 이미영
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.517-525
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    • 2023
  • 다제내성 P. aeruginosa (MRPA)의 출현과 확산은 전 세계적으로 심각한 문제가 되었다. 특히 metallo-β-lactamases (MBLs)의 carbapenem 고도내성 관여 정도는 심각한 수준이며, 특히 P. aeruginosa는 장내세균 속 균종과는 달리 새로운 클론들이 지속적으로 나타나고 기존에 확산되었던 우세 클론을 대체하는 과정이 매우 빠르게 진행되고 있다. 이에 본 연구에서는 2017년 9월부터 2019년 9월까지 부산의 한 종합병원에서 다양한 의료용 시료로부터 분리된 18균주의 P. aeruginosa 균주에 대한 항균제 내성 유전자 분석과 DNA 염기서열 분석을 통한 Integron의 유전자 카세트 분석 및 접합에 의한 Plasmid 전달 분석을 수행하며 이에 대한 역학관계를 조사하고자 하였다. 18균주 모두 XDR 표현형을 보이는 균주였으며, Colistin(100%)을 제외한 대부분의 항생제에 내성을 나타냈으나, aztreonam(22.2%), ceftazidime(16.6%)에 일부 감수성을 보였다. 균주의 66.7%는 다양한 항균제 내성을 나타내는 Class1 integron을 가지고 있었으며, 접합에 의한 Plasmid전달도 성공적으로 이루어졌다(83.3%). 이는 이전의 장내세균에 대한 연구결과보다 25.8% 상향한 결과를 보여 공중보건에 대한 심각한 역학관점의 고찰을 필요로 한다. 특히, IMP-6 ST235 (66.7%)가 주를 이루며, VIM-2 ST357 (16.7), IMP-1 ST446 (16.7)이 확인되었다. 흥미롭게도, 국내에서는 아직까지 보고된 바가 없는 IMP-1 생성 ST446의 확인은 또 다른 MRPA 고위험 클론의 생성과 유행이라는 관점에서 주목할 만하다.