• 제목/요약/키워드: Human DNA

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인간 Poly(ADP-ribose) Synthetase cDNA의 클로닝 및 대장균에서의 발현 (Molecular Cloning and Expression of Human Poly (ADP-ribose) Synthetase cDNA in E. Coli)

  • 이성용;김완주;이태성;박상대;이정섭;박종군
    • 한국동물학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.248-256
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    • 1996
  • 본 연구의 목적은 인간의 Poly(ADP-ribose) synthetase (PARS)의 cDNA를 클로닝하여 발현시키기 위해 수행하였다. 먼저, 인간의 PARS cDNA 전체를 포함한 pPARS3.1을 pGEM-7Zf(+) 등의 발현 벡터 클로닝하였다. 이 결과로 생성된 재조합 플라스미드 pPARS6.1이 인간의 PARS cDNA 전체를 포함하고, 올바른 방향으로 삽입되었는지를 확인하기 위해 제한효소 지도를 작성하였고, random primed DNA probe을 이용한 Southern blot 분석에 의해서 PARS가 클로닝되었다는 것을 확인하였다. 또한, 염기서열 분석 결과, 단백질 합성이 시작되는 유전 암호가 정확한 순서로 위치하고 있음을 확인하였다. 재조합된 pPARS6.1의 발현을 위해 배양시 0.4 mM IPTG로 처리하여 만들어진 인간의 PARS 단백질이 10% SDS-PAGE에서 120 kDa 위치에 이동하였다는 것을 nick-translated된 DNA를 probe로 이용하여 확인하였고, Southwestern blot 실험 결과 120 kDa과 98kDa에 위치하는 단백질이 DNA와 결합함을 알 수 있었다.

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아산시 명암리 출토 인골의 미토콘드리아 DNA 분석 (Mitochondrial DNA Analysis of Human Skeletal Remains Excavated from Myungam-ri site in Asan, Korea)

  • 김윤지;김수훈;조은민;이정원
    • 보존과학연구
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    • 통권36호
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    • pp.33-48
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    • 2015
  • 본 연구는 충청남도 아산시 탕정면 명암리 유적 9지점에서 발굴조사 된 고려 말에서 조선시대 초기 분묘 출토 인골 27개체를 대상으로 고유전학적 연구를 수행한 결과를 보고한 것이다. 실리카 추출 방법에 의하여 출토 인골로 부터 DNA를 추출한 후, 미토콘드리아 DNA(mtDNA)의 과변이지역을 9지역으로 나누어 PCR법에 의해 부분 증폭을 실시하였다. 증폭산물에 대한 염기서열 분석을 통하여 과변이지역의 변이형을 동정하였다. 그 결과 18개체의 mtDNA 분석이 가능하였으며, 아멜로제닌 유전자 분석에 의한 성결정은 M-26, M-29, M-37(L), M-49(R)의 4개체만이 분석되었고 모두 여성인 것으로 확인되었다.

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Computer-based screening for novel inhibitors of human topoisomerase I with FlexiDock docking protocol

  • Choi, In-Hee;Kim, Choon-Mi
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2
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    • pp.315.1-315.1
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    • 2002
  • DNA topoisomerases I (topo I) and II are essential enzymes that relax DNA supercoiling and relieve torsional strain during DNA processing. including replication. transcription. and repair. Topo I relaxes DNA by cleaving one strand of DNA by attacking a backbone phosphale with a catalytic lyrosine (Tyr723. human topo I). This enzyme has recently been investigated as a new target for antineoplastic drugs. Inhibitors to the enzyme intercalate between the DNA base pairs. interfering religation of cleaved DNA, therefore inhibit the activity of topo I. (omitted)

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Flexible docking of novel antitumor agents into human topoisomerase I-DNA complex with FlexiDock

  • Woo , Su-Na;Kim, Choon-Mi
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2
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    • pp.314.2-314.2
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    • 2002
  • DNA topoisomerases catalyze changes in DNA topology through cycles of transient DNA strand breakage and religation. During this process. the active site tyrosine in human DNA topoisomerase Ⅰ(Top Ⅰ) becomes covalently linked to the 3'-ends of a single-stranded nick in the DNA duplex, Stabilization of the Top Ⅰ-DNA cleavable complex is the common initial event leading to the cytotoxicity of top 1 inhibitors. (omitted)

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배양 인체 백혈구의 chromosome replication에 미치는 DNA hypomethylation의 영향 (Hypomethvlation of DNA with 5-Azacvtidine Alters Chromosome Replication Patterns in Cultured Human Lvmphocvtes)

  • 원태웅;이석우김우갑
    • 한국동물학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.437-477
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    • 1994
  • The DNA replication of human Iyrnphocvtes was studied using Bromodeo3fyuridine incorporation. The characteristic patterns of dvnamlc banding were analysed. Human chromosomal ONA was synthesized in a segmental but highly coordinated fashion. Each chromosome replicates according to its innate pattern of chromosome structure (bandinsl. R-positive bands are demonstrated as the initiation sites of DNA synthesis, and G-bnads initiate replication after it has been completed in the autosomal R-bands. Many researchers demonstrated that developmental or induced methvlation of DNA can inactivate the associated gene loci. Such DNA methylation can be reversed and specific genes reactivated by treatment with 5-azacvtidine. We treated the hvpomethvlating agent 5-azacvtidine and tested for changes of DNA replication pattern. Treatment with 5-azacytidine causes an advance in the time of replication. These observed changes in timing of replication suggest that DNA methvlation may modify regional groups of genes in concert.

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Paraquat에 의한 사람 임파구 DNA 손상에 대한 환원전리수의 보호효과 (Protective Effect of Electrolyzed Reduced Water on the Paraquat-induced Oxidative Damage of Human Lymphocyte DNA)

  • 박은주;류근걸;이윤배;이종권;이미영
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제48권2호
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    • pp.155-160
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    • 2005
  • 본 연구에서는 매우 낮은 음의 산화환원전위를 나타내는 환원전리수가 paraquat에 의한 사람 임파구 DNA의 손상에 미치는 영향을 Comet assay를 사용하여 조사하였다. 환원전리수 처리에 의해서 paraquat에 의해 산화적으로 손상된 DNA가 회복되는 정도를 손상된 DNA로 인한 꼬리부분의 형광광도의 %비율로 나타내었다. Comet assay는 개별 세포의 DNA의 산화적 손상을 측정하는데 널리 사용되고 있다. 사람 임파구에 다양한 농도의 paraquat을 $37^{\circ}C$에서 30분간 처리한 후, 환원전리수를 첨가하여 30분간 반응시켰다. 그 결과 paraquat에 의한 임파구 DNA의 손상은 paraquart 농도증가에 의존적으로 증가하였다. 그러나 환원전리수를 처리한 결과 DNA의 산화적 손상이 paraquat 미처리 대조군 수준으로 거의 다 복구되었다.

치주인대세포 및 치은섬유아세포의 증식능에 대한 Epidermal growth factor의 영향 (The Effect of EGF on Proliferation Rate of the Human Periodontal Ligament Cells and Human Gingival Fibroblasts)

  • 김선우;이재목;서조영
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제26권4호
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    • pp.841-858
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    • 1996
  • Epidermal growth factor(EGF) is one of polypeptide growth factors. EGF has been reported as a biological mediator which regulates activities of wound healing process including the cell proliferation, migration and metabolism. The purposes of this study is to evaluate the effects of EGF on the human periodontal ligament cells and human gingival fibroblast cells that promote regeneration of periodntal tissue. The mitogenic effects of epidermal growth factor on human periodontal ligament cells and human gingival fibroblasts were evaluated by determining the incorporation of 5-Bromo-2'-deoxy-uridine into DNA of the cells in a dose dependent manner. The prepared cells were the primary cultured gingival fibroblast and periodontal ligament cells from humans, the fourth or sixth subpassages were used in the experiments. Cells were seeded in DMEM containing 10% FBS. 1, 10, 50, 100, $200{\eta}g/ml$ and epidermal growth factor were added to the quiescent cells for 24 hours, 48 hours and 72 hours. They were labeled with $10\{mu}l/200{\mu}l$ 5-Bromo-2'-deoxy-uridine for the last 6 hours of each culture. The results of the five determinants were presented as mean and S.D.. The results were as follows : The DNA synthetic activity of human gingival fibroblasts were increased dose dependently by epidermal growth factor at 24 hours, 48 hours and 72 hours. The mitogenic effects were similar at the 24 and 48 hours of epidermal growth factor, but the DNA synthetic activity of human gingival fibroblasts generally decreased at 72 hours. The DNA synthetic activity of human periodontal ligament cells were increased dose dependently by epidermal growth factor at 24 hours but the DNA synthetic activity decreased at $200{\eta}g/ml$ of each hour. Generally the maximum mitogenic effects were observed at the 48 hours application of epidermal growth factor. The DNA synthetic activity of human periodontal ligament cells generally decreased lower at 24, 72 hours than at 48 hours the application of epidermal growth factor. In the comparison of DNA synthetic activity between human gingival fibroblasts and human periodontal ligament cells, human periodontal ligament cells had slightly higher proliferation activity than human gingival fibroblasts for a longer time at the high dosage of the epidermal growth factor. In conclusion, epidermal growth factor have important roles in the stimulation of DNA synthesis in human periodontal ligament cells and human gingival fibroblasts, and thus may be useful for clinical applications in periodontal regenerative procedures.

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임산부의 혈중 엽산과 호모시스틴 수준이 태반세포의 DNA 메틸화에 미치는 영향 (Folate and Homocysteine Levels during Pregnancy affect DNA Methylation in Human Placenta)

  • 박보현;김영주;이화영;하은희;민정원;박종순;박혜숙
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제38권4호
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    • pp.437-442
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    • 2005
  • Objectives : DNA methylation is one of the best characterized epigenetic mechanisms that play a regulatory role in genome programming and imprinting during embryogenesis. In this present study, we investigated the association between DNA methylation in the human placenta and the maternal folate and homocysteine concentrations on the Methylenetetrahydrofolatereductase (MTHFR) genetic polymorphism during pregnancy. Methods : We investigated 107 pregnant women who visited Ewha Woman's University Hospital for prenatal care during their $24{\sim}28$ weeks-period of gestation. During the second trimester, we measured the serum homocysteine and folate concentrations . The MTHFR 677 genetic polymorphism was determine by performing PCR-RFLP assay. The expression of DNA methylation in the human placentas was estimated by using immunohistochemistry method. Results : Serum folate was negatively correlated with the serum homocysteine concentration for all the MTHFR genotypes. We found positive correlation between the folate concentrations and the DNA methylation in the human placenta (p<0.05). An increasing concentration of homocysteine was associated with reduced DNA methylation in the human placenta. The coefficient value was -2.03 (-3.77, -0.29) on the regression model (p<0.05). Conclusion : These findings suggest that the maternal folate and homocysteine levels along with the MTHFR 677 genetic polymorphism during pregnancy affect the DNA methylation in the human placenta.

DNA Transfection in SK-N-BE(2)C Human Neuroblastoma Cells

  • Lee, Myung-Koo
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제16권2호
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    • pp.155-157
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    • 1993
  • DNA transfection conditions were investigated by calcium phosphate-DNA co-precipitation in SK-N-BE(2)C human neuroblastoma cells. The DNA plasmid of TH2400CAT was used in which rat tyrosine hydroxylase gene was inserted into chloramphenicol acetyltransferase reporter gent. The transfection efficiency was 25-30% and the method was simple and reproducible. So, the method will be a good tool for transient transfection analysis.

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분묘 유적지 출토 인골에 대한 고고유전학 연구 (Archaeogenetic Research of Excavated Human Bones from the Ancient Tombs)

  • 지상현;정용재;서민석
    • 헤리티지:역사와 과학
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    • 제41권1호
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    • pp.99-108
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    • 2008
  • 1980년대 이후 전 세계적으로 발굴지에서 출토되는 인골 분석에 대한 고고학적 중요성이 증가하면서 인골의 자연과학적 연구가 활발히 진행되고 있다. 국내에서도 출토 인골의 고고유전학 연구가 점차 활성화 되어감에 따라 고대 DNA 연구를 위한 주요 방법 및 기술적 지식의 축적이 이루어지고 있다. 인골의 보존 상태는 매장환경과 밀접하게 연관되어 있는데 국내에서 출토되는 인골, 동물 뼈 등과 같은 생물유체의 보존 상태가 좋지 못한 주요 원인은 우리나라의 토성(土性) 및 기후적인 특성 때문이다. 그러나 조선시대 회곽묘(灰槨墓)에서는 대체로 보존 상태가 좋은 인골이 출토되고 있는데, 이는 회곽의 구조적 화학적 특성에서 기인된 것이다. 이것은 묘제(墓制)와 장법(葬法)이 피장자(埋葬者)의 매장 환경을 조절함으로써 인골이 잘 보존 될 수 있음을 보여주는 좋은 사례이다. 인골의 미생물에 의한 오염, 물리 화학적 손상 등 다양한 원인은 고대 DNA 분석에 많은 영향을 미치기 때문에 이를 효과적으로 제거할 수 있는 DNA 분석법이 요구된다. 특히, 고대 DNA가 사람 DNA에 의하여 오염되지 않았음을 증명하기 위한 실험 절차가 체계적으로 검증되어야만 연구결과의 신뢰성을 확보할 수 있다. 우리나라 고대 인류의 이동과 그들의 문화를 이해하기 위하여 고대 DNA 분석과 더불어 안정동위원소를 이용한 인골의 골화학 분석 등 인골에 대한 자연과학적 분석이 종합적으로 병행되어야 한다. 더불어 출토 인골의 고고유전학 연구는 형질인류학, 고고학과 같은 인문사회학적 연구와 동시에 수행될 때 가장 좋은 양질의 결과를 얻을 수 있으며 이러한 학제 간 연구는 더욱더 활성화 되어야 한다. 본고는 출토 인골 연구의 학문적 가치와 종합연구의 필요성을 자연과학적 연구의 입장에서 강조하였다. 또한 출토 인골의 DNA 연구 방법과 그 결과를 예로 소개함으로써 고고유전학 연구에 대한 이해를 돕고자 하였다.