Moreira, Raphael Patrick;Pinto, Luis Fernando Batista;Valloto, Altair Antonio;Pedrosa, Victor Breno
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제32권4호
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pp.459-466
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2019
Objective: This study assessed the possible existence of genotype by environment interactions for milk, fat and protein yields in Holstein cattle raised in one of the most important milk production basins in Brazil. Methods: Changes in the genetic parameters and breeding values were evaluated for 57,967 animals from three distinct regions of southern Brazil, divided according to differences in climate. The genotype by environment interaction was determined by genetic correlations between regions, estimated by the restricted maximum likelihood, considering the animal model. Bull rankings were investigated to verify the ratio of coincident selected animals between regions for each trait. Results: The estimates of heritability coefficients were similar between two regions, but were lower in the third evaluated area, for all traits. Genetic correlations between regions were high, ranging from 0.91 to 0.99 for milk, fat and protein yields, representing the absence of a genotype by environment interaction for productive traits. The percentage of selection error between regions for the top 10% of animals ranged from 0.88% to 2.07% for milk yield, 0.99% to 2.46% for fat yield and 0.59% to 3.15% for protein yield. Conclusion: A slight change in genotype between areas was expected since no significant genotype by environment interactions were identified, facilitating the process of selecting Holstein cattle in southern Brazil.
The use of genomic information in genomic selection programs for dairy and beef cattle breeds has become a reality in recent years. In this investigation, we analyzed single-nucleotide polymorphisms (SNPs) for Hanwoo (n=50) and Holstein (n=50) breeds using the Illumina Bovine SNP50 BeadChip to facilitate genomic selection and utilization of the Hanwoo breed in Korea. Analysis of the entire genomes showed different spectra of SNP frequencies for Hanwoo and Holstein cattle. The study revealed a highly significant (p<0.001) difference between Hanwoo and Holstein cattle in minor allele frequency (MAF). The average MAFs were $0.19{\pm}0.16$ and $0.22{\pm}0.16$ for Hanwoo and Holstein, respectively. From the total of 52,337 SNPs that were successfully identified, about 72% and 79% were polymorphic in Hanwoos and Holsteins, respectively. Polymorphic and fixed SNPs were not distributed uniformly across the chromosomes within breeds or between the two breeds. The number of fixed SNPs on all chromosomes was higher in Hanwoo cattle, reflecting the genetic uniqueness of the Hanwoo breed. In general, the rate of polymorphisms detected in these two breeds suggests that the SNPs can be used for different applications, such as whole-genome association and comparative genetic studies, and are a helpful tool in developing breed identification genetic markers.
Mulim, Henrique Alberto;Pinto, Luis Fernando Batista;Valloto, Altair Antonio;Pedrosa, Victor Breno
Animal Bioscience
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제34권4호
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pp.499-505
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2021
Objective: The objective of this study was to evaluate the genetic behavior of a population of Holstein cattle in response to the variation of environmental temperature by analyzing the effects of genotype by environment interaction (GEI) through reaction norms for the somatic cell score (SCS). Methods: Data was collected for 67,206 primiparous cows from the database of the Paraná Holstein Breeders Association in Brazil, with the aim of evaluating the temperature effect, considered as an environmental variable, distinguished under six gradients, with the variation range found being 17℃ to 19.5℃, over the region. A reaction norm model was adopted utilizing the fourth order under the Legendre polynomials, using the mixed models of analysis by the restricted maximum likelihood method by the WOMBAT software. Additionally, the genetic behavior of the 15 most representative bulls was assessed, in response to the changes in the temperature gradient. Results: A mean score of 2.66 and a heritability variation from 0.17 to 0.23 was found in the regional temperature increase. The correlation between the environmental gradients proved to be higher than 0.80. Distinctive genetic behaviors were observed according to the increase in regional temperature, with an observed increase of up to 0.258 in the breeding values of some animals, as well as a reduction in the breeding of up to 0.793, with occasional reclassifications being observed as the temperature increased. Conclusion: Non-relevant GEI for SCS were observed in Holstein cattle herds of southern Brazil. Thus, the inclusion of the temperature effect in the model of genetic evaluation of SCS for the southern Brazilian Holstein breed is not required.
This study was performed to investigate the ophthalmic diseases in 269 Holstein dairy cattle of 10 farms in Kyunggido, Korea. The acerage prevalence rate of ophthalmec diseases was 25.7%, ranging of from 4.8% to 47.6%. The highest incidence age was between 3 and 4 years old, 41.9% and then in order of between 5 and 6 years, between 2 and 3 years, over 6 years, between 4 and 5 years, between 1 and 2 years, and up to 1 year were shown the incidence of 33.3%, 29.4%, 27.7%, 23.8%, 19.8% and 12.5%, respectively. The prevalence rate of cataracts was higher than any other ophthalmic diseases, 10.4% and then in order of chorioretinitis, iris posterior synechiae, corneal scar, conjunctivitis, blindness, third eyelid carcinoma and globe anomaly were diagnosed as the incidence of 4.1%, 3.0%, 1.7%, 1.3%, 0.4%, 0.2% and 0.2%, respectively.
Mao, W.H.;Albrecht, E.;Teuscher, F.;Yang, Q.;Zhao, R.Q.;Wegner, J.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제21권5호
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pp.640-647
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2008
Breed differences in adult animals are determined during fetal development. If interventions are to be developed that influence growth of muscle and fat, it is important to know at which time during gestation breed differences appear and are fixed. The objective of this study was to characterize fetal development in cattle of different breeds. Pregnant cows of 4 cattle breeds with different growth impetus and muscularity were slaughtered under normal processing conditions and the fetuses were removed. German Angus, a typical beef cattle; Galloway, a smaller, environmentally resistant beef type; Holstein Friesian, a dairy type; and Belgian Blue, an extreme type for muscle growth were used. Fetuses of each breed were investigated at 3, 6, and 9 mo of gestation. Fetuses were weighed and dissected into carcass, organs, and muscles. Body fat weight was obtained using the Soxhlet extraction method. Fetal weight increased most rapidly in the third trimester of gestation mainly due to the accelerated muscle and fat deposition. The organ weight to body weight (BW) ratios decreased and the muscle and fat weight to BW ratios increased. At 3 mo of gestation, Galloway fetuses had the significantly smallest BW, half-carcass weight, leg weight, organ weight, muscle weight and shortest leg length. In contrast, Holstein fetuses had the significantly greatest BW, liver, kidney, and lung weights and significantly longest leg length among the 4 breeds, but no differences between Holstein Friesian and Belgian Blue were detected in half-carcass and leg weight. Indeed, Belgian Blue fetuses had the significantly greatest half-carcass weight, leg weight, and muscle weight at 9 mo of gestation, and Galloway had a significantly greater body fat to BW ratio than Holstein Friesian and Belgian Blue. These differences were not evident at 3 and 6 mo of gestation. These data show that the profound increase of tissue and organ weights occurred in later gestation in cattle fetuses even though breed differences were evident as early as 3 mo of gestation. Depending on the tissue of interest, impacting fetal growth likely needs to occur early in gestation before the appearance of breed-specific differences.
The experiment involved observations of 2,514 Holstein-Friesian cows to determine the effects of environmental factors (cow's age, calving season, weight and sex of calves, housing system) and genetic factors on gestation length in dairy cattle and the correlation between gestation length and other reproductive traits (calving ease, stillbirth rates and placental expulsion). Genetic parameters were estimated based on the sires of calved cows (indirect effect) and the sires of live-born calves (direct effect). The following factors were found to contribute to prolonged gestation: increasing cow's age, male fetuses and growing fetus weight. Optimal gestation length was determined in the range of 275-277 days based on calving ease and stillbirth rates. The heritability of gestation length was estimated at 0.201-0.210 by the direct effect and 0.055-0.073 by the indirect effect. The resulting genetic correlations suggest that the efforts to optimize (prolong) gestation length could exert an adverse influence on the breeding value of bulls by increasing perinatal mortality and calving difficulty. The standard errors of the investigated parameters were relatively high, suggesting that any attempts to modify gestation length for the purpose of improving calving ease and reducing stillbirth rates should be introduced with great caution.
본 연구는 젖소의 분만 후 난소 주기 재개의 이상이 번식 성적에 미치는 영향을 구명하기 위해 수행하였다. 정상적인 난소 주기가 진행이 되면 배란된 날에 난소 주기가 재개된 것으로 간주하였다. 공시우의 58.8%(l14/194)가 정상적인 난소 주기의 재개를 하였고 41.2%의 소에서 난소 주기의 재개가 지연되었다. 배란 후 황체기가 20일 이상 유지되는 난소 주기의 재개지연 I형(17.5%)과 분만 후 40일 이전에 첫 배란이 나타나지 않는 난소 주기의 재개지연 II형(22.7%)이 난소 주기 재개 지연의 일반적인 형태였다. 정상적인 난소 주기를 가진 개체와 비교해 보면, 황체기가 연장된 소들의 분만 후 100일 이내의 인공수정 공시율, 수태율과 임신율은 더 낮고(각각 84.2 대 40.0%; p<0.01, 24.0 대 21.4%, 20.2 대 11.1%) 분만 후 첫 수정 일수와 공태 일수가 더 길다(각각 $64.7{\pm}2.79$ 대 $105.7{\pm}7.48$일; p<0.01, $105.1{\pm}7.16$ 대 $133.7{\pm}11.17$일). 정상우와 무배란우를 비교해 보면, 100일 이내의 수태율과 임신율이 낮고(각각 24.0대 20.0%, 20.2 대 16.3%) 분만 후 첫 수정 일수과 공태 일수가 더 길다(각각 $64.6{\pm}2.79$ 대 $72.6{\pm}4.45$일, $105.1{\pm}7.16$ 대 $120.8{\pm}12.33$일). 결론적으로 젖소의 분만 후 비정상적인 난소 주기는 인공수정 공시율, 임신율, 첫 수정 일수와 공태 기간을 포함하는 번식 성적의 저하를 유발시킨다.
Genetic gains and inbreeding coefficients in a Holstein MOET breeding population were predicted under different conditions relating to the distribution of the number of transferable embryos collected per flush using Monte Carlo simulation. The numbers of transferable embryos collected per flush were determined using five distributions (distributions 1, 3, 5, 7 and 9) with different aspects and similar means. Distributions 1, 3, 5, 7 and 9 were assumed to have gamma distribution's parameters ($\alpha$ and $\beta$) of (1 and 4.4), (3 and 1.47), (5 and 0.88), (7 and 0.63) and (9 and 0.49), respectively. Inbreeding rates were statistically significantly different among distributions but genetic gains were not. Relationships between inbreeding rates and variances of family size could be were clearly distinguished. The highest inbreeding coefficients were predicted in distribution 1 with the largest variance of family size, while distributions 5, 7 and 9 with smaller variance of family size had lower inbreeding coefficients.
Records of 490,767 cows collected from 1990 to 2012 by dairy herd milk test of National Agriculture Cooperative Federation The pedigree of dairy cattle were provided by Korea Animal Improvement Association. The data were used to analyze the longevity of dairy cows with the life traits such as days in milk, number of lactation, productive life, and life span. The data were also used to investigate genetic relationship of these longevity traits with profitability of dairy cows, including heritability and genetic correlation. The profitability was calculated with simulation of milk income and production costs for individual cows. Days in milk among the traits had -0.287, -0.572 and -0.536 of genetic correlation with number of lactations, productive life and lifespan, respectively. The heritabilities of life span, number of lactations, productive life, and days in milk were found to be 0.045, 0.047, 0.059 and 0.081, respectively. Genetic correlations of profit with productive life, number of lactations, and days in milk were identified as 0.072, 0.080, 0.098 and 0.101. These results suggested that days in milk was most desirable traits to represent longevity of Holstein dairy cattle. In general, since longevity and profitability were close genetic relationship each other, genetic improvement of longevity is necessary for better profitable cows.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제28권3호
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pp.597-604
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2017
본 연구는 홀스타인 젖소, 923두에 대한 단일염기다형성 (SNP) 42,201개를 이용하여 국내 젖소집단의 유전적 특성 및 유효집단크기를 조사하고자 실시하였다. 염색체별 인접 단일염기다형성간의 평균 연관불평형 ($r^2$)은 0.22로 추정되었으며, 14번 염색체 (0.26)에서 가장 높은 반면, 27번 염색체 (0.17)에서 가장 낮게 나타났다. SNP간의 물리적 거리가 25Kb 미만인 경우에서 $r^2$은 $0.31{\pm}0.33$으로 추정되었으며, SNP간 물리적 거리가 증가할수록 $r^2$은 현저히 감소하였다. SNP간 물리적 거리가 2.5Mb 이상에서의 $r^2$은 0.04로 25Kb 미만인 경우와 비교할 때 0.27 (87.1%) 감소하였다. 국내 홀스타인 젖소의 유효집단크기는 세대수와 비례하여 감소하는 경향을 나타내었으며, 1~5세대에서 110두로 추정되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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