• Title/Summary/Keyword: Highly pathogenic avian influenza virus

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Novel reassortants of clade 2.3.4.4 H5N6 highly pathogenic avian influenza viruses possessing genetic heterogeneity in South Korea in late 2017

  • Lee, Yu-Na;Cheon, Sun-Ha;Kye, Soo-Jeong;Lee, Eun-Kyoung;Sagong, Mingeun;Heo, Gyeong-Beom;Kang, Yong-Myung;Cho, Hyun-Kyu;Kim, Yong-Joo;Kang, Hyun-Mi;Lee, Myoung-Heon;Lee, Youn-Jeong
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제19권6호
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    • pp.850-854
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    • 2018
  • Novel H5N6 highly pathogenic avian influenza viruses (HPAIVs) were isolated from duck farms and migratory bird habitats in South Korea in November to December 2017. Genetic analysis demonstrated that at least two genotypes of H5N6 were generated through reassortment between clade 2.3.4.4 H5N8 HPAIVs and Eurasian low pathogenic avian influenza virus in migratory birds in late 2017, suggesting frequent reassortment of clade 2.3.4.4 H5 HPAIVs and highlighting the need for systematic surveillance in Eurasian breeding grounds.

조류독감 방제전략 (Control and Prevention Strategies of Avian Influenza)

  • 송창선;권지선;이현정;이중복;박승용;최인수;이윤정;김재홍;모인필
    • 한국가금학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.129-136
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    • 2004
  • Avian influenza viruses infect humans, horses, swine, other mammals, and a wide variety of domesticated and wild birds. Modem poultry industries worldwide are at risk of infection with avian influenza. Low pathogenic avian influenza can easily change to highly pathogenic form especially when introduced into areas of high density commercial poultry. Outbreaks of highly pathogenic avian influenza are becoming progressively more expensive to control according to the growth of the poultry industry worldwide. Future strategies for avian influenza control and prevention should involve a combination of early detection and characterization of virus using advanced molecular biologic techniques, quarantine, selective depopulation and vaccination of flocks.

2016년 한국 야생조류에서 분리한 H7N7 조류인플루엔자 바이러스 유전자 분석 (Genetic Analysis of H7N7 Avian Influenza Virus Isolated From Waterfowl in South Korea in 2016)

  • 베리훈;서상희
    • 생명과학회지
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    • 제28권8호
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    • pp.962-968
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    • 2018
  • A형 인플루엔자바이러스는 야생조류에 존재하며, 사람, 돼지, 가금 및 다른 포유류등 다양한 숙주를 감염한다. 본 연구에서는, 2016년 한국 서쪽의 철새도래지에서 채취한 철새 분변에서 재조합된 새로운 H7N7 조류인플루엔자를 분리하였으며 이 바이러스의 8개 유전자를 분석하였다. 분리된 A/waterfowl/Korea/S017/2016(H7N7) 바이러스의 유전자 분석 결과 이 바이러스는 야생조류 및 가금 오리에서 유래한 조류인플루엔자로 구성된 재조합된 유전자를 가지고 있었다. 계통 분석결과 이 바이러스는 유럽과 아시아계에 속하였다. 조류인플루엔자 바이러스가 계속 진화를 하고 H7 형 조류인플루엔자는 고 병원성 조류인플루엔자로 변하여 사람과 동물에게 커다란 위협이 될 수 있기에 계속 된 역학조사가 필요하다.

고위험성 조류인플루엔자(HPAI) 확산 방지를 위한 GAN 기반 가상 데이터 생성 (Generating GAN-based Virtual data to Prevent the Spread of Highly Pathogenic Avian Influenza(HPAI))

  • 최대우;한예지;송유한;강태훈;이원빈
    • 한국빅데이터학회지
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    • 제5권2호
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    • pp.69-76
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    • 2020
  • 이 연구는 2019년도 정부(과학기술정보통신부)의 재원으로 정보통신기술진흥센터의 지원을 받아 수행된 연구이다. 고병원성조류인플루엔자(Highly Pathogenic Avian Influenza, HPAI)는 병원성이 높은 조류인플루엔자 바이러스 감염에 의하여 발생하는 조류의 급성 전염병으로 닭, 오리 등 가금류에서 피해가 심각하게 나타난다. 고병원성 조류인플루엔자(HPAI)는 연중으로 발생하기보다는 겨울철에 집중하여 발생되는 양상을 보이며, 특정 기간에는 아예 발생하지 않는 경우가 있다. 이와 같은 HPAI의 특성으로 인해 충분한 양의 실제 데이터가 축적되지 못하는 문제점이 있다. 본 논문 연구에서는 GAN 네트워크를 활용하여 결측치를 포함하고 있는 실제와 유사한 데이터를 생성하였으며 해당 과정을 소개한다. 본 연구 결과는 HPAI가 발생하지 않은 특정 시기에 대하여 실제와 유사한 시뮬레이션 데이터를 생성하여 위험도를 측정하는데 이용될 수 있다.

빅데이터를 활용한 HPAI Virus 확산 예방 및 추적 (Prevent and Track the Spread of Highy Pathogenic Avian Influenza Virus using Big Data)

  • 최대우;이원빈;송유한;강태훈;한예지
    • 한국빅데이터학회지
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    • 제5권2호
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    • pp.145-153
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    • 2020
  • 이 연구는 2018년도 정부(농림축산식품부)의 재원으로 농림식품기술기획평가원의 지원을 받아 수행된 연구이다. 고병원성 조류인플루엔자(Highly Pathogenic Avian Influenza, HPAI)는 해외로부터 철새를 통해 유입되고 있으나 어떤 경로를 통해 농가에 확산하는지 정확히 밝혀진 바 없다. 그리고 발생 농가에서 유입되는 농가 간의 전이도 차량이 주요 원인이라고 추정할 뿐, 전파 주요 원인이 정확히 밝혀진 것은 아니다. 하지만 가장 빈번하게 농가에 방문하는 차량의 방문유형이 가축 운반 및 사료 운반과 같은 농가와 시설 간의 방문이기 때문에 발생 농가에 들른 차량과 시설의 관계를 분석할 필요가 있다. 본 논문 연구에서는 농림축산검역본부에서 제공하는 KAHIS(Korea Animal Health Integrated System) 데이터를 기반으로, HPAI Virus 전이의 주요 원인을 확인하고자 한다.

Identification of Differentially Expressed Genes in Ducks in Response to Avian Influenza A Virus Infections

  • Ndimukaga, Marc;Won, Kyunghye;Truong, Anh Duc;Song, Ki-Duk
    • 한국가금학회지
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    • 제47권1호
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    • pp.9-19
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    • 2020
  • 본 연구는 고병원성 조류 인플루엔자 바이러스(high pathogenic avian influenza virus; HPAIV)와 저병원성 조류인플루엔자 바이러스(low pathogenic avian virus; LPAIV)가 감염된 오리의 폐세포에서 보고된 기존 전사체 데이터를 재분석하여 조류 인플루엔자 감염에 대응하는 숙주의 공통 전사체를 발굴하고, 생물정보 분석을 실시하여 바이오 마커로서 가능성을 제시하기 위하여 수행하였다. 이전 연구에서 생산된 microarray 데이터 세트를 재분석하여, HPAIV와 LPAIV가 각각 감염된 오리의 폐세포에서 각각 총 731 및 439개의 차등발현 유전자를 발굴하였다. 이들 차등발현 유전자 중에서, 227개의 유전자가 HPAIV와 LPAIV가 감염된 세포에서 공통적으로 조절되어, 193개의 유전자는 발현이 증가한 반면, 34개의 유전자는 발현이 감소하였다. 생물정보 분석을 통하여 차등발현 유전자들의 기능에 대한 주석달기를 실시하여, 리보솜과 단백질 대사 및 유전자 발현 관련 GO가 풍부해짐을 확인하였다. REACTOME 분석을 통하여 단백질 및 RNA 대사 경로 및 콜라겐 생합성과 변형을 포함한 조직 복구 경로가 조절됨을 확인하였다. 보다 구체적으로, 번역 및 RNA 품질 관리 경로에 관여하는 단백질을 코딩하는 유전자는 HPAIV 및 LPAIV 감염에 반응하여 발현의 증가 또는 감소하는 방향으로 조절되어 AIV가 숙주 번역 기계를 억제함으로써 숙주 방어 시스템을 회피할 수 있거나 번역을 위해 세포질로 내보내기 전에 AIV가 억제될 수 있음을 시사한다. AIV 감염은 바이러스 감염으로 인한 조직의 병변 형성을 조절하는 경로를 활성화시킬 수 있음을 시사한다.

조류인플루엔자 재난대응훈련 시뮬레이션 기술연구 (A Study on the Simulation and Analysis of the Emergency Response Training for Highly Pathogenic Avian Influenza)

  • 강민식
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제14권1호
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    • pp.19-26
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    • 2019
  • 전 세계적으로 가상현실(VR)의 이슈화를 따라 많은 분야에서 가상현실(VR) 기술을 접목하여 새로운 콘텐츠를 개발하고 있다. 가상현실은 가상의 공간에서도 인간이 가진 감각을 그대로 인지할 수 있도록 해주는 기술이며, 이는 현실적인 공간의 제약을 받지 않고 가상의 공간에서 사용자가 직접 체험 할 수 있다는 점에서 차세대 기술로 주목 받고 있다. 가상현실기술은 게임, 의학, 교육 등 다양한 분야에서 활용되고 있으며 특히 가상현실을 활용한 시뮬레이션이 주목받고 있다. 가상현실을 활용한 시뮬레이션도 운동, 교육, 재난 모의 훈련 등 다양한 분야에서 응용되고 활용되고 있지만 바이러스 전염에 의한 질병에 관한 연구는 미미한 실정이다. 본 연구에서는 조류인플루엔자 재난 대응 훈련 시뮬레이션에 대한 기술검토 및 분석연구를 진행하였다. 우리나라에서 해마다 발생하고 있는 조류인플로엔자는 매년 되풀이되지만, 정작 막아줄 수 있는 해결책이나 예방법은 아직 부족한 실정이다. 조류인플루엔자는 사회적으로 큰 파장을 일으키고 경제적으로 막대한 피해를 가져올 수 있다. 조류인플루엔자나 구제역과 같은 가축전염병은 농가에 미치는 피해 범위가 크기 때문에 사전 예방이 중요하다. 따라서 본 연구에서는 제시하는 조류인플루엔자 재난 대응 시뮬레이션을 통해 예방 할 수 있는 콘텐츠를 제시하고 분석하였다.

Molecular Characterization of an H5N3 Influenza Virus Isolated from Spot-Billed Duck

  • Lee, Jin Hwa;Kwon, Hyuk Moo;Sung, Haan Woo
    • 한국가금학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.243-252
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    • 2013
  • Among the 16 hemagglutinin (HA) subtypes of avian influenza virus (AIV), only the H5 and H7 subtypes have caused highly pathogenic avian influenza (HPAI) in poultry. However, most H5 or H7 subtype viruses are categorized as low pathogenic avian influenza (LPAI). Some AIVs, including the H5 and H7 HPAI viruses, have shown the ability to infect humans directly. In this study, we describe the biological and molecular characterization of an H5N3 AIV (SBD/KR/KNU SYG06/06) isolated from spot-billed duck (Anas poecilorhyncha) in Korea. A phylogenetic analysis of the eight viral genes showed that the SBD/KR/KNU SYG06/06 isolate belongs to the Eurasian lineage and that the SBD/KR/KNU SYG06/06 isolate was clearly different from HPAI H5N1 strains, including human isolates and the Italian HPAI H5N2 strains. Additionally, no relationship was found between SBD/KR/KNU SYG06/06 and the Korean HPAI H5N1 isolates. The SBD/KR/ KNU SYG06/06 isolate had avian specific receptor binding site residues in the HA protein and the four C-terminal amino acids in the NS1 protein. The HA protein of the SBD/KR/KNU SYG06/06 isolate exhibited the typical LPAI motif at the cleavage site and this virus produced no cytopathic effects in MDCK cells without trypsin. Given these results, we suggest that the H5N3 AIV isolated from the spot-billed duck should be considered an LPAI virus and should have no pathogenic effect in humans.

Genetic and biological characteristics of recent Korean isolates of avian influenza virus subtype H9N2

  • Acharya, Madhav Prasad;Kwon, Hyuk-Joon;Kim, Il-Hwan;Lee, Youn-Jeong;Kim, Jae-Hong
    • 대한수의학회지
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    • 제52권4호
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    • pp.223-230
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    • 2012
  • The worldwide distribution and continuing genetic mutation of avian influenza virus (AIV) has been posed a great threat to human and animal health. A comparison of 3 isolates of AIV H9N2, A/chicken/Korea/KBNP-0028/00 (H9N2) (KBNP-0028), A/chicken/Korea/SNU8011/08 (H9N2) (SNU 8011) and an inactivated oil vaccine strain A/chicken/Korea/01310/01 (H9N2) (01310), was performed. The former 2 AIVs were isolated from field cases before and after the application of an inactivated H9N2 vaccine in 2007, respectively. The antigenic relationship, viral shedding, tissue tropism and genetic analysis were examined. The comparison of virus shedding from the cloaca and the oropharynx revealed that both isolates were more frequently isolated from the upper respiratory tract (90~100%) 1 day post inoculation (DPI) compared with isolation 5 DPI from gastrointestinal tracts (10~60%). Moreover, the isolate KBNP-0028 were recovered from all organs including bone marrow, brain and kidneys, indicating higher ability for broad tissue dissemination than that of SNU 8011. KBNP-0028 replicated earlier than other strains and with a higher titer than SNU 8011. In full-length nucleotide sequences of the NA gene and a partial sequence of the HA gene of SNU 8011, we found that there might be significant changes in tissue tropism, virus replication and genetic mutation in AIV H9N2 isolates.