• 농업과학연구
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• 제39권3호
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• pp.357-364
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• 2012

Genomic breeding value (GEBV) has recently become available in the beef cattle industry. Genomic selection methods are exceptionally valuable for selecting traits, such as marbling, that are difficult to measure until later in life. One method to utilize information from sparse marker panels is the Bayesian model selection method with RJMCMC. The accuracy of prediction varies between a multiple SNP model with RJMCMC (0.47 to 0.73) and a least squares method (0.11 to 0.41) when using SNP information, while the accuracy of prediction increases in the multiple SNP (0.56 to 0.90) and least square methods (0.21 to 0.63) when including a polygenic effect. In the multiple SNP model with RJMCMC model selection method, the accuracy ($r^2$) of GEBV for marbling predicted based only on SNP effects was 0.47, while the $r^2$ of GEBV predicted by SNP plus polygenic effect was 0.56. The accuracies of GEBV predicted using only SNP information were 0.62, 0.68 and 0.73 for CWT, EMA and BF, respectively. However, when polygenic effects were included, the accuracies of GEBV were increased to 0.89, 0.90 and 0.89 for CWT, EMA and BF, respectively. Our data demonstrate that SNP information alone is missing genetic variation information that contributes to phenotypes for carcass traits, and that polygenic effects compensate genetic variation that whole genome SNP data do not explain. Overall, the multiple SNP model with the RJMCMC model selection method provides a better prediction of GEBV than does the least squares method (single marker regression).

• 응용통계연구
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• 제22권6호
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• pp.1239-1247
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• 2009

인간의 질병 또는 가축의 경제적인 특성에 관한 유전자의 규명은 매우 중요한 관심사이며, 우리나라 축산업을 대표하는 한우의 유전자원 보존과 능력향상은 매우 중요한 과제이다. 이를 연구하기 위해 기존 EST_based SNP 연관지도를 사용하여 발굴한 유전자로 연구되어왔으나 이는 통계학적 모델에 기반한 연관지도 작성법으로 실제 위치와는 차이가 있을 수 있다. 따라서 Lee (2009)에 의해 EST_based SNP 연관지도와 염기서열 분석으로 작성되어지는 Gene on sequence를 함께 고려하여 한우의 경제형질 연관 후보 DNA marker들이 발견되었다. 한편, 통계모형의 상호작용 효과를 고려할 때, 유전자와 같은 범주형 data에서 범주가 많을 경우 상호작용의 조합이 많아지므로 종종 모수들의 상호작용에 대한 해석과 모형을 결정하는 것이 어려울 수 있다. 그래서 비모수적인 방법으로 다중인자 차원축소방법 (MDR)을 사용해왔으며, 사례_대조 데이터에만 적용가능 MDR방법을 연속형 데이터에도 적용하기 위해 CART알고리즘을 적용한 확장된 다중인자 차원축소방법(E-MDR)이 제안되었다. 본 연구에서는 새롭게 발견된 단일염기다형성 (SNP)으로부터 E-MDR방법을 적용하여 한우의 경제형질(일당중체량, 근내지방도)에 영향을 주는 우수 유전자 단일염기다형성을 규명하였다.

• 한국토양비료학회지
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• 제45권5호
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• pp.787-791
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• 2012

펩타이드는 Asp, Glu, Leu을 주요 구성 아미노산으로 하는 한우 혈청을 단백질 분해효소로 분해 후 한외여과를 거쳐 제조하였다. 단백질 분해효소는 alcalase, esperase, flavourzyme, protamex를 이용하였고 alcalase가 가장 좋은 분해력을 나타내어 폡타이드 생산을 위한 혈청 분해에 활용하였다. 한우 혈청으로부터 분리한 펩타이드와 킬레이트 결합한 칼슘 (chelate-Ca)과 게르마늄 (chelate-Ge)을 방울토마토에 적용하여 흡수 변화를 확인하고자 시험을 수행하였다. Chelate Ca을 500, 1,000, 2,000배로 희석하여 방울토마토 재배에 적용한 결과, 처리 농도 및 횟수 증가에 따라 엽과 과실의 칼슘함량이 다소 증가하여 대조처리 Calciolid Ca-300 (3409.1, $67.5mg\;kg^{-1}$)이 Chelate Ca-200 (3781.1, $78.0mg\;kg^{-1}$) 보다 처리농도가 높음에도 불구하고 그 함량이 낮아 킬레이트 칼슘의 흡수율이 더 많았다. Chelate Ge을 50, 100, 200배로 희석하여 적용한 결과, 방울토마토 엽의 게르마늄 함량이 처리 농도가 높을수록 많아져 대조구와 Ge $132^{(R)}$-20 보다 모든 처리구에서 2배 이상의 높은 함량을 나타내었다. 본 연구를 통해 펩타이드와 킬레이트 결합한 칼슘과 게르마늄을 방울토마토에 시용할 경우 그 흡수율이 증가되는 것을 확인하였다.

• 한국수정란이식학회지
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• 제20권2호
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• pp.89-95
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• 2005

본 연구에서는 한우 체외수정란의 이식에 있어서 수정란 측 요인들이 수란우의 임신과 유산에 미치는 영향을 검토하였다. 이식에 제공하는 배반포의 수량에 따른 임신율은 1개, 2개 및 3개 이식 군에서 각각 32, 44 및 $32\%$였고, 유산율은 $6.3\~13.6\%$로서 2개 이식군의 임신율과 유산율이 가장 높았으나 유의차는 인정되지 않았다. 배반포 등급에 따른 임신율은 $40.8\~44.2\%$, 유산율은 $9.4\~16.3\%$로서 유사한 경향이었다. 배반포의 발생 단계에 따른 임신율은 $39.1\%\~45.3\%$로서 비슷하였으나, 유산율은 HB군$(20.8\%)$이 LB군의 $9.0\%$에 비해서는 유의하게 높았다(p<0.05). 배반포의 발생일령에 따른 임신율은 배반포 $7\cdot7$일째와 $7\cdot8$일째가 각각 $47.1\%$와 $53.9\%$로서 $9\cdot9$일 및 $8\cdot9$일째(29.8 및 $R27.7\%$)에 비해 유의하게 높았다(p<0.05). 유산율은$8\cdot9$일령이 $30.8\%$로 가장 높았고 $7\cdot7$일령의 $10.1\%$와는 유의차가 인정되었다.

• 한국축산시설환경학회지
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• 제5권3호
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• pp.157-170
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• 1999

This study was conducted to investigate the effects of Scoria, Quartz porphyry and Oak charcoal powder feeding by 1% level of concentrate on the fattening cross bred bulls(5/8 Korean Native Cattle, 2/8 Charolais, 1/8 Brahman germ plasma) Feeding trial was conducted with 4 treatment groups which were T1(Full feeding of concentrate and roughage for 12 months), T2(T1 and Scoria addition), T3(T1 and Quartz porphyry addition) and T4(Oak charcoal addition) for 360 days, consisting of 32 heads whose initially weights were about 299.7kg. The results obtained are summarized as follows; 1. During the over-all period, average daily gains by T3, T4, T2 and T1 were 1.024, 0.987, 0.977kg and 0.964, respectively, without a significant difference by treatments. 2. Concentrate intakes per body weight and TDN intakes required per unit of kilogram gain were lower in addition agent groups than in control, and in all the treatments feed efficiency was higher at early stage for 360 fattening day than at end stage. 3. Carcass weight, dressing percent, back-fat thickness and loin eye muscle area by treatments were 330.9 to 348.4kg(average 340.3kg), 55.2~56.2(average 55.8%), 0.41~0.55(average 0.46cm)and 76.0~80.9$\textrm{cm}^2$(average 77.6$\textrm{cm}^2$), respectively, and were improved in addition agent groups than in control. 4. Meat quality grade is higher in addition agent groups than in control, and heads of 1st grade by treatments was 3, 2, 1 and none in T4, T2, T3 and T1, respectively. 5. Incidence heads of diseases by treatment were not apparently different, but diseases of digestive system was decreased in addition agent groups than in control. 6. The nitrate nitrogen content of fattening bull dung which collected in rectum were 0.082~0.089% (average 0.084%), and the content in addition agent groups was smaller than in controll. 7. Income was higher in order of T4, T3, T2, and T1 and incomes of treatment groups were grater than that of control group by 21.4 to 33.5 percent. According to the above results it may be concluded that fattening bulls may be required to feed no more than 1% of Scoria, Quartz porphyry and Oak charcoal powder based on the concentrate feeding level during the fattening period(12 to 24 month of age) to produce high quality meat and increase income.

• 한국수정란이식학회지
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• 제20권3호
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• pp.255-269
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• 2005

축산연구소에서 사육중인 비거세우와 거세우를 대상으로 혈청내에 있는 호르몬 및 대사물질 농도가 채혈시기, 사육지역, 거세 여부 등에 따라 어떻게 변하며 경제형질과 어느 정도 상관이 있는지 그리고 이들에 대한 유전변이의 크기는 어느 정도이며 이들의 유전상관계수는 어느 정도인지를 파악하기 분석한 결과는 다음과 같다 1. 혈청 호르몬 및 대사물질의 분산분석 결과 testosterone과 globulin을 제외한 나머지 혈청성분은 사육지역에 따라 차이가 있었고 출생년도 및 계절에 따라 차이가 나타나는 혈청성분 cortisol, total protein, globulin 및 creatinine을 제외한 혈청들이었고 거세 여부에 따라 차이가 있는 혈청들은 total protein과 BUN을 제외한 혈청들이었으며 그리고 tstosterone을 제외한 나머지 혈청들은 종모우의 영향을 비교적 크게 받는 것으로 나타나 종모우의 효과가 인정되므로 이들 성분들의 농도 변이에 상가적 유전자 작용이 어느 정도 관여하고 있음을 시사한다. 2. 도체 형질은 도체중과 등지방두께 및 육량지수는 사육 지역의 효과가 인정되나, 도체율, 근내지방도, 배최장근단면적, 생체중 및 수송 감량은 $5\%$수준에서 유의성이 인정되지 않았다. 종모우의 효과는 대부분의 형질에서 유의적인 효과가 있었고 특히 도체율과 근내지방도에는 큰 영향을 미치는 것으로 나타났다. 3. 월령별 체중을 분산분석 결과 사육지역의 효과는 9개월령을 제외한 모든 연령에서 체중에 대한 유의적인 영향을 미쳤고, 거세 여부는 6개월령 체중을 제외한 나머지 월령별 체중에 대해 유의적인 영향을 미쳤으며, 종모우효과는 모든 월령별 체중에서 유의적인 영향을 미쳤다. 4. 혈청 성분 농도들의 사육연도, 계절 및 거세여부별 최소자승평균치는 대관령에서 사육한 소는 남원에서 사육한 소들에 비해 testosterone 농도가 낮았으나 유의성은 인정되지 않았고, 거세우는 비거세우에 비해 cotisol과 creatinine 및 triglyceride농도가 높았고 IGF-1 및 glucose농도가 낮았으며 testosterone 농도는 비거세우의 약 $5.2\%$에 불과했다. 5. Sire Model을 적용하여 제한 최대우도법으로 추정한 혈청성분의 유전력은, 0.07${\~}$0.58 범위로 추정되었는데 이중 단백질 성분인 total protein, albumin 및 globulin의 유전력은 각각 0.53, 0.54 및 0.42로 비교적 높았고 cotisol과 creatinine 및 BUN은 각각 0.45, 0.58 및 0.54로 높게 추정된 반면 calcium은 0.07, testosterone 0.15 및 IGF-1은 0.12로 아주 낮은 편이었다. 6. 도체 형질에 대한 유전력은 도체중 0.39, 등 지방두께 0.45, 육량지수 0.30 및 배최장근단면적 0.13으로 추정되었으나 근내지방도는 0.93으로 아주 높게 추정되었다. 월령별 체중에 대한 유전력은 18개월령 0.78, 12개월령 0.76, 9개월령 0.62, 6개월령 0.58, 24개월령 0.58 순위였고 기간별 일당 증체량의 유전력추정치는 6${\~}$12개월령이 0.80, 12${\~}$18개월령이 0.75, 그리고 18${\~}$24개월령은 0.19로 육성기와 비육전기에 비해 비육말기는 유전력 추정치가 낮았다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권10호
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• pp.1383-1391
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• 2016

Bovine embryonic stem cells have potential for use in research, such as transgenic cattle generation and the study of developmental gene regulation. The Nanog may play a critical role in maintenance of the undifferentiated state of embryonic stem cells in the bovine, as in murine and human. Nevertheless, efforts to study the bovine Nanog for pluripotency-maintaining factors have been insufficient. In this study, in order to understand the mechanisms of transcriptional regulation of the bovine Nanog, the 5'-flanking region of the Nanog was isolated from ear cells of Hanwoo. Results of transient transfection using a luciferase reporter gene under the control of serially deleted 5'-flanking sequences revealed that the -134 to -19 region contained the positive regulatory sequences for the transcription of the bovine Nanog. Results from mutagenesis studies demonstrated that the Sp1-binding site that is located in the proximal promoter region plays an important role in transcriptional activity of the bovine Nanog promoter. The electrophoretic mobility shift assay with the Sp1 specific antibody confirmed the specific binding of Sp1 transcription factor to this site. In addition, significant inhibition of Nanog promoter activity by the Sp1 mutant was observed in murine embryonic stem cells. Furthermore, chromatin-immunoprecipitation assay with the Sp1 specific antibody confirmed the specific binding of Sp1 transcription factor to this site. These results suggest that Sp1 is an essential regulatory factor for bovine Nanog transcriptional activity.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제21권3호
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• pp.387-395
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• 2010

인간의 질병 및 가축의 특성치에 관한 유전자 규명은 매우 중요한 과제이다. 유전자원 보존과 유전능력향상을 위한 기술 개발 역시 매우 중요한 관심사로써 이와 관련된 많은 연구들을 진행해왔다. 통계모형의 상호작용 효과를 분석하기 위해 로지스틱 회귀분석과 같은 전통적인 방법과 비모수적인 방법들이 개발되었지만 이들은 상호작용에 영향을 준 양적형질위치들의 하위 집단의 유전자형에 대해서 고려하지 않은 문제점이 있다. 따라서 많은 양적형질위치들을 한 번에 비교하여 특성치에 영향을 주는 양적형질위치의 상호작용과 그 하위집단인 유전자형을 규명하는 방법으로 유전자형 행렬 맵핑이 개발되었다. 본 연구에서는 EST_based SNP 연관지도에 의해 선정된 17개의 후보 단일염기다형성을 대상으로 유전자 행렬 맵핑을 활용하여 한우의 주요 경제형질인 일당증체량, 도체중, 등심단면적, 근내지방도에 영향을 주는 우수 유전자형 조합을 선별한다. 그리고 선별된 조합에 대해 유전자 행렬 맵핑 방법에서 적용되지 않은 순열검정을 도입함으로써 우수유전자형 조합에 대한 통계적인 유의성을 확인한다.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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• pp.108-108
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• 2017

The objective of this study was to know prospect and present state of new variety breeding of Forage and Grassland in South Korea. The industry of forage in Korea is going up to expend through utilization of good quality forage, Italian ryegrass, forage corn and oat rather than rice straw. Especially, since 2007, Italian ryegrass(IRG) had been very important major winter forage crop in South Korea and developed 13 varieties including very early maturity variety (three varieties), early maturity variety (three varieties), medium maturity variety (one variety) and late maturity variety (six varieties). But the disadvantage of Italian ryegrass was weak winter hardness and drought but has good advantage of forage nutritive value, high-yielding and high sugar content, and like livestock as like hanwoo, dairy cattle, goat so on. The Ko-variety (Korea developed variety) of Italian ryegrass has high cold-tolerant and adaptability more than any other country developed variety, and expend to cultivation area from southern area (below Daejeon) to middle-northern area (upper Han river). Although the cultivation area of Italian ryegrass of South Korea was 21,700 ha in 2007, right now, that of Italian ryegrass is about 123,600ha due to expend cultivation area and know famer to good forage crop and have a various maturity varieties (very early, early, medium, late) according to local situation (before-crop harvesting stage or double cropping system). The seed market of Italian ryegrass in South Korea becoming extended to around 100 million Korean won and seed export get nearer to foreign country. We are going to develop of new variety for stress tolerant and high yield and quality forage variety, good adaptability to the Korean environmental conditions including reclaimed area, make self-sufficiency system for forage seed (Italian ryegrass), export our seed to foreign countries.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제24권1호
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• pp.151-159
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• 2013

최근 인간의 질병과 관련된 유전자 연구가 많이 진행 되고 있다. 인간의 질병에 관련된 유전자는 단일효과보다 상호작용에 의한 효과가 중요하다고 한다. 무수히 많은 유전자들 중에서 상호작용을 찾기 위해서 선형모형 등의 통계적 방법을 이용할 시에는 계산의 복잡성 및 비용등 여러 단점이 생긴다. 따라서 이런 수많은 유전자들 중 주요 유전자 상호작용을 찾는 방법으로 SNPHarvester가 개발되었다. 본 연구에서는 최근에 밝혀진 한우의 지방산과 경제형질에 관련된 32개의 우수 단일 염기 다형성(SNP)를 이용하여 주요 유전자 조합을 SNPHarvester방법에 적용하여 분석한 결과를 시각적으로 쉽게 확인하기위해 방사형 그래프로 나타냄으로써 한우의 맛과 육질을 높일 수 있는 단일 염기 다형성 조합을 시각적으로 찾아내고, 각 형질별 단일효과와 상호작용 효과의 차이를 비교하여 단일효과보다 상호작용에 의한 효과가 더 큰 차이를 시각적 효과로 규명하였다.