HOTAIR is an lncRNA that has been known to have an oncogenic role in different cancers. There is limited knowledge of genetic and epigenetic elements and their interactions for the gene encoding HOTAIR. Therefore, understanding the molecular mechanism and its regulation remains to be challenging. We used different in silico analyses to find genetic and epigenetic elements of HOTAIR gene to gain insight into its regulation. We reported different regulatory elements including canonical promoters, transcription start sites, CpGIs as well as epigenetic marks that are potentially involved in the regulation of HOTAIR gene expression. We identified repeat sequences and single nucleotide polymorphisms that are located within or next to the CpGIs of HOTAIR. Our analyses may help to find potential interactions between genetic and epigenetic elements of HOTAIR gene in the human tissues and show opportunities and limitations for researches on HOTAIR gene in future studies.
Background: This study investigated the influence of curcumin on HOX transcript antisense RNA (HOTAIR)-mediated migration of cultured renal cell carcinoma (RCC) cells. Materials and Methods: Five RCC cell lines (769-P, 769-P-vector, 769-P-HOTAIR, 786-0, and Kert-3 ) were maintained in vitro. The expression of HOTAIR mRNA was determined by quantitative real-time PCR and cell migration was measured by transwell migration assay. The effects of different concentrations of curcumin (0 to $80{\mu}mol/L$) on cell proliferation was determined by the CCK-8 assay and influence of non-toxic levels (0 to $10{\mu}M$) on the migration of RCC cells was also determined. Results: Comparison of the 5 cell lines indicated a correlation between HOTAIR mRNA expression and cell migration. In particular, the migration of 769-P-HOTAIR cells was significantly higher than that of 769-P-vector cells. Curcumin at $2.5-10{\mu}M$ had no evident toxicity against RCC cells, but inhibited cell migration in a concentration-dependent manner. Conclusions: HOTAIR expression is correlated with the migration of RCC cells, and HOTAIR may be involved in the curcumin-induced inhibition of RCC metastasis.
Wang, Bo;Su, Yun;Yang, Qun;Lv, Decheng;Zhang, Weiguo;Tang, Kai;Wang, Hong;Zhang, Rui;Liu, Yang
Molecules and Cells
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제38권5호
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pp.432-440
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2015
Human osteosarcoma usually presented a high tendency to metastatic spread and caused poor outcomes, however, the underlying mechanism was still largely unknown. In the present study, using a series of in vitro experiments and an animal model, we investigated the roles of HOX antisense intergenic RNA (HOTAIR) during the proliferation and invasion of osteosarcoma. According with our results, HOTAIR was commonly overexpressed in osteosarcoma, which significantly correlated with advanced tumor stage, highly histological grade and poor prognosis. In vitro and in vivo experiments demonstrated that knockdown of HOTAIR could notably suppress cellular proliferation, inhibit invasion and decrease the secretion of MMP2 and MMP9 in osteosarcoma. Collectively, our results suggested that HOTAIR might be a potent therapeutic target for osteosarcoma.
Avazpour, Niloofar;Hajjari, Mohammadreza;Yazdankhah, Saeed;Sahni, Azita;Foroughmand, Ali Mohammad
Genomics & Informatics
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제16권4호
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pp.25.1-25.5
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2018
Coronary artery disease (CAD) is one of the leading causes of death and disability all around the world. Recent studies have revealed that aberrantly regulated long non-coding RNA (lncRNA) as one of the main classes of cellular transcript plays a key regulatory role in transcriptional and epigenetic pathways. Recent reports have demonstrated that circulating lncRNAs in the blood can be potential biomarkers for CAD. HOTAIR is one of the most cited lncRNAs with a critical role in the initiation and progression of the gene expression regulation. Recent research on the role of the HOTAIR in cardiovascular disease lays the basis for the development of new studies considering this lncRNA as a potential biomarker and therapeutic target in CAD. In this study, we aimed to compare the expression of HOTAIR lncRNA in the blood samples of patients with CAD and control samples. The expression level was examined by semi-quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction technique. Our data shows that expression of HOTAIR is up-regulated in blood samples of patients with CAD.
더덕을 생식 원료로 동결건조 및 열풍건조를 통하여 생식을 제조하여 제조된 생식의 이화학적 및 관능적 특성, 기능성 성분의 함량 조사를 통하여 합리한 제조방법을 찾고자 하였다. 수분, 단백질, 탄수화물, 지방, 회분 등 일반성분 함량은 동결건조 및 열풍건조를 실시한 시험구들 사이에 변화가 없는 것으로 나타났고 색도는 동결건조는 실시한 시험구가 열풍건조를 실시한 시험구에 비해 L값은 높게, b값은 낮게 나타났다. 식이섬유 함량은 열풍건조를 실시한 시험구가 동결건조를 실시한 시험구보다 높게 나타났고 총 페놀성 화합물과 조 사포닌 함량은 동결건조를 실시한 시험구가 높게 나타났다. 관능검사 결과 동결건조를 실시한 시험구가 색, 맛, 향, 전체적 기호도 등에서 모두 열풍건조를 실시한 시험구 보다 높게 나타났다. 위의 결과로부터 더덕을 원료로 생식을 제조 시 동결건조 방법을 사용하는 것이 적절하다고 생각된다.
토란분말의 가공 활용도를 높이기 위해서 열풍건조, 동결건조, 건조 후 로스팅 및 증자 후 건조 처리하는 가공공정을 이용하여 토란분말을 제조하였으며, 이들의 영양성분 및 이화학적 특성의 변화를 관찰하여 가공적성을 검토하였다. 토란분말의 수분함량과 식이섬유 함량은 열풍건조 온도가 높아질수록 감소하였고 비타민 C 함량은 동결 건조한 토란분말에서 가장 높았다. 건조 후 로스팅하거나 증자 후 건조 처리한 토란분말의 식이섬유 함량은 열풍 건조나 동결 건조한 분말에 비해 감소하였다. 수분흡수지수는 상대적으로 증자 후 건조 처리한 분말에서 높게 나타났고 수분용해 지수는 열풍건조 및 동결 건조한 토란분말에서 높게 나타났다. DSC를 이용한 토란분말의 호화 중 열역학적 특성은 열풍건조와 동결 건조한 토란분말에서 유의성 있는 차이를 보이지 않았으며, 건조 후 로스팅 처리 온도가 높아질수록 호화개시온도와 최대호화온도는 감소하였다. RVA 특성에서는 열풍 건조 시 온도가 높아질수록 호화개시온도가 점차 낮아지고 최고점도는 증가하였으며 전분입자가 붕괴되기 쉬운 정도를 나타내는 breakdown과 냉각 후 노화의 정도를 나타내는 setback의 수치도 높게 나타났다. 반면 증자후 건조 처리한 토란분말은 최고점도가 높게 나타났으나 breakdown 및 setback의 수치는 낮게 나타났다. 이상의 결과를 종합하여 볼 때, 열풍 건조한 토란분말의 경우 식이섬유 함량이 높으며, 호화 시 점도가 높아 반죽제품의 점도부여에 적합할 것으로 판단되며, 증자 후 건조 처리한 토란분말의 경우 수분흡수지수가 다른 처리분말에 비해 높고 호화 시 점도가 높으면서 노화를 지연시키는 작용을 하기 때문에 죽이나 후레이크 같은 분말제품이나 dough의 첨가제로 활용할 수 있을 것으로 기대된다.
과열증기 건조처리 후 열풍 건조한 인삼의 건조율이 열풍 건조만으로 건조한 인삼에 비하여 약 40%의 빠른 건조율을 나타내었다. 일반성분의 함량에 있어서 조지방, 조단백질, 조섬유 및 회분 함량의 경우 두처리구간 큰 차이가 없었다. 무기질 및 유리당 함량의 경우에 있어서도 두 처리구간 큰 차이를 나타내지 않았다. 조사포닌 함량의 경우 과열증기 처리 후 열풍건조한 인삼분말의 조사포닌 함량은 5.43% 그리고 열풍건조만 한 인삼분말의 조사포닌 함량은 5.4%로 두시료간 큰 차이가 없었다. 색깔의 경우 적색도를 나타내는 a값에서 과열증기 건조 후 열풍건조 처리한 인삼분말이 열풍건조한 인삼분말에 비하여 약간 높은 결과를 나타내었다. 인삼분말의 미생물 수의 경우 과열증기 건조 후 열풍 건조한 인삼분말이 열풍건조한 인삼분말에 비하여 일반세균 및 효모곰팡이가 약 2 log 정도 감소하였고 대장균군의 경우는 약 1 log 정도 감소한 결과를 나타내었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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