War-game modeling and simulation system have been developed and applied to virtual tactical training both inside and outside of country However, most existing models have been developed for individual purpose based on the simple platform modeling such as physical modeling, visual modeling, and conceptual modeling. Thus, those modeling and simulation system cannot support the interoperability, expensively, variety and reusability. To deal with these problems, the paper propose an integrated design methodology for the War-game systems based on the DEVS/HLA.
Rathika, Chinniah;Murali, Vijayan;Dhivakar, Mani;Kamaraj, Raju;Malini, Ravi Padma;Ramgopal, Sivanadham;Balakrishnan, Karuppiah
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제17권5호
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pp.2491-2497
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2016
Background: Human leukocyte antigen (HLA) genes have been implicated in cervical cancer in several populations. Objectives: To study the predispositions of HLA alleles/haplotypes with cervical cancer. Materials and Methods: Clinically diagnosed and PAP smear confirmed cervical cancer patients (n 48) and age matched controls (n 47) were genotyped for HLA-A,-B,-DRB1* and DQB1* alleles by PCR-SSP methods. Results: The frequencies of alleles DRB1*04 (OR=2.57), DRB1*15 (OR=2.04), DQB1*0301 (OR=4.91), DQB1*0601 (OR=2.21), B*15 (OR=13.03) and B*07 (OR=6.23) were higher in cervical cancer patients than in the controls. The frequencies of alleles DRB1*10 (OR=0.22) and B*35 (OR=0.19) were decreased. Strong disease associations were observed for haplotypes DRB1*15-DQB1*0601 (OR=6.56; p< $3.5{\times}10^{-4}$), DRB1*14-DQB1*0501 (OR=6.51; p<0.039) and A*11-B*07 (OR=3.95; p<0.005). The reduced frequencies of haplotypes DRB1*10-DQB1*0501 (OR=0.45), A*03-B*35 (OR=0.25) and A*11-B*35 (OR= 0.06) among patients suggested a protective association. HLA-C* typing of 8 patients who possessed a unique three locus haplotype 'A*11-B*07-DRB1*04' (8/48; 16.66%; OR=6.51; p<0.039) revealed the presence of a four locus haplotype 'A*11-B*07-C*01-DRB1*04' in patients (4/8; 50%). Amino acid variation analysis of susceptible allele DQB1*0601 suggested 'tyrosine' at positions ${\beta}9$ and ${\beta}37$ and tyrosine-non-tyrosine genotype combination increased the risk of cervical cancer. Conclusions: Strong susceptible associations were documented for HLA alleles B*15, B*07, DRB1*04, DRB1*15, DQB1*0301, DQB1*0601 and haplotypes DRB1*15-DQB1*0601 and DRB1*14-DQB1*0501. Further, protective associations were evidenced for alleles B*35 and DRB1*10 and haplotypes A*11-B*35 and DRB1*10-DQB1*0501 with cervical cancer in South India.
본 논문에서는 항공 교전 시뮬레이션을 위한 모델을 구축함에 있어서 분산 시스템 상의 합성전장환경 기반으로 구성되는 시스템 구축을 위한 프레임워크를 제안한다. 제안된 프레임워크는 HLA (High Level Architecture)/RTI (Run-Time Infrastructure) 기반의 분산 시스템 상에서 합성전장환경을 구축하여 항공 교전 시뮬레이션 모델에 환경의 영향을 반영하기 위한 시스템을 설계한다. 항공 전투에서 환경은 탐지체계 및 기동체계 등에 영향을 주기 때문에 시뮬레이션에서 그 영향을 반영할 필요가 있다. 그러나 교전급 시뮬레이션에서 요구하는 무기체계의 복합적 운용에 관련된 프레임워크 연구는 기존에 미흡하였고, 이로 인해 환경 데이터를 기반으로 시뮬레이션에 환경 영향을 반영하는 교전급 시뮬레이션 시스템의 구축은 난해함을 갖는다. 본 논문은 이와 같은 난해함을 해결하기 위한 프레임워크를 제안하고, 제안된 프레임워크를 기반으로 예제 시스템을 구축하는데 목적을 둔다.
줄기세포를 임상에 적용하기 위해서는 체외에서 증식 과정이 필수적이다. 그러나 배아줄기세포와는 달리 성체줄기세포는 체외에서 증식할 경우 일정시간이 지나면 줄기세포의 특성을 잃기 때문에 임상사용에 있어 제한점을 가지고 있다. 이러한 문제점을 극복하기 위해 줄기세포의 특성을 잃지 않게 세포를 보존하는 방법이 필요하며, 본 연구에서는 탯줄 유래 줄기세포를 동결 보존한 후 해동시켜 줄기세포의 특성을 분석하였다. 사람의 탯줄 유래 세포를 분리하여 체외에서 배양한 후 2번째 또는 3번째 계대의 세포를 25% FBS와 10% DMSO가 첨가된 냉동배양액에 넣어 $-196^{\circ}C$에서 동결보존한 후, 6개월 뒤에 해동시켜 세포의 성장 속도와 유전자 및 단백질 발현을 살펴보았다. 냉동 보존한 후 세포를 해동시킨 결과 74%의 생존율을 보였으며, 이 세포를 체외에서 배양하였을 경우, 냉동보존하기 전의 세포와 유사하게 방추사 모양의 섬유 아세포의 형태를 나타냈다. 또한, 성장 속도 역시 냉동보존하기 전의 세포와 똑같이 10번째 계대까지 배양되었으며, 42번 분열 능력을 나타냈다. RT-PCR 결과, 냉동 전후 세포 모두에서 Oct-4, nanog, SCF, NCAM, nestin, GATA4, BMP4, HLA-1 유전자는 모두 발현하였으며, Brachyury와 HLA-DR은 발현하지 않았다. 면역세포 화학 염색 결과, 배아줄기세포 단백질로 알려진 SSEA-3, -4, Oct-4 그리고 중간엽줄기세포 단백질인 Thy-1은 모두 발현하였으며, vimentin, fibronectin, HLA-1, HCAM, ICAM 모두 발현하였다. 그러나 SSEA-4과 Thy-1, vimentin, fibronectin, HLA-1는 냉동보존한 후 배양된 탯줄질의 발현은 냉동보존하기 전후의 탯줄 유래 세포에서 큰 차이가 없었다. 냉동 보존된 탯줄 유래 세포는 세포의 분열능력과 유전자 및 단백질의 발현이 냉동 보존 전 세포와 유사한 것으로 나타났다. 이러한 결과는 냉동보존법이 임상적으로 세포 치료 시 적절한 세포의 수나 시간을 맞추는데 효과적인 방법이 될 수 있을 것으로 기대된다.
최근 국방 소프트웨어 산업은 다양한 무기체계 사업을 통해 모델링 및 시뮬레이션 기술을 적용한 시뮬레이션 시스템 개발을 늘리고 있으며, 특히 이기종 시뮬레이터 간 이식성 및 상호 연동성 확보를 위해서 분산 시뮬레이션 표준 프레임워크인 HLA(High Level Architecture)의 적용을 규정하고 있다. HLA는 분산 환경에서 시뮬레이터간 데이터 교환 및 순서화를 제공하기 위한 서비스를 정의하며, HLA 규칙, Federate 인터페이스 표준 그리고 객체 모델 템플릿의 주요 컴포넌트로 구성된다. RTI(Run-Time Infrastructure)는 Federate 인터페이스 표준을 구현한 소프트웨어로써 Federation 환경에 참여 중인 Federate들이 정보를 교환할 수 있도록 기능을 제공한다. RTI 기술은 워 게임, 가상 시뮬레이션, 훈련 및 무기체계 소프트웨어 연동과 같은 다양한 분야에서 사용되고 있다. 하지만 국내에서 개발된 사례가 없어 모두 외산 제품에 의존하고 있는 실정이다. 본 논문은 국내에서 개발된 IEEE1516.1-2000 표준의 RTI 구현을 소개한다. 특히, Federate 간 데이터 교환 성능을 높이기 위해서 서버-클라이언트 방식과 단대단 방식을 혼합한 하이브리드 데이터 통신 방식의 적용 방법을 기술하고, 상용 RTI와 데이터 처리율 및 네트워크 지연 시간의 비교를 통해 성능이 개선되었음을 보인다.
Muhammad Ma'ruf;Justitia Cahyani Fadli;Muhammad Reza Mahendra;Lalu Muhammad Irham;Nanik Sulistyani;Wirawan Adikusuma;Rockie Chong;Abdi Wira Septama
Genomics & Informatics
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제21권2호
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pp.26.1-26.9
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2023
Stevens-Johnson syndrome (SJS) produces a severe hypersensitivity reaction caused by Herpes simplex virus or mycoplasma infection, vaccination, systemic disease, or other agents. Several studies have investigated the genetic susceptibility involved in SJS. To provide further genetic insights into the pathogenesis of SJS, this study prioritized high-impact, SJS-associated pathogenic variants through integrating bioinformatic and population genetic data. First, we identified SJS-associated single nucleotide polymorphisms from the genome-wide association studies catalog, followed by genome annotation with HaploReg and variant validation with Ensembl. Subsequently, expression quantitative trait locus (eQTL) from GTEx identified human genetic variants with differential gene expression across human tissues. Our results indicate that two variants, namely rs2074494 and rs5010528, which are encoded by the HLA-C (human leukocyte antigen C) gene, were found to be differentially expressed in skin. The allele frequencies for rs2074494 and rs5010528 also appear to significantly differ across continents. We highlight the utility of these population-specific HLA-C genetic variants for genetic association studies, and aid in early prognosis and disease treatment of SJS.
현대 사회에서는 새로운 기술이나 가설을 증명하기 위해 시뮬레이션을 사용한다. 특히, 군사 훈련을 진행하거나 전쟁상황을 예측하기 위하여 국방 Modeling & Simulation(M&S)을 사용한다. 국방 M&S는 실제 환경에서 진행하는 Live Simulation, 가상환경에서 진행하는 Virtual Simulation, 그리고 워 게임과 같은 Constructive Simulation으로 이루어지며 각각을 L체계, V체계, C체계라고 한다. L체계는 실제 환경을 전제하기 때문에 현실성이 높지만 예산 효율성이 떨어진다. 이와 반대로 V와 C체계는 현실성이 떨어지지만 예산 효율성을 높인다. 이러한 각 체계의 장단점을 바탕으로 세 가지 체계를 모두 연동한 L-V-C 통합 환경을 구축한다면 시뮬레이션의 질을 향상시킬 수 있다. 본 논문에서는 L-V-C 통합 환경을 구축하기 위해 이기종 시뮬레이션 미들웨어 간 연동하는 방안을 제시하고 서로 다른 미들웨어간의 연동 테스트 결과를 보인다.
Alzheimer's disease (AD) related genes have been elucidated by advanced genetic techniques. Familial autosomal dominant AD genes founded by linkage analyses are APP, PSEN1, PSEN2, ABCA7, and SORL1. Genome-wide association studies have found risk genes such as ABCA7, BIN1, CASS4, CD33, CD2AP, CELF1, CLU, CR1, DSG2, EPHA1, FERMT2, HLA-DRB5-HLA-DRB1, INPP5D, MEF2C, MS4A6A/MS4A4E, NME8, PICALM, PTK2B, SLC24A4, SORL1, and ZCWPW1. ABCA7, SORL1, TREM2, and APOE are proved to have high odds ratio (>2) in risk of AD using next generation sequencing studies. Thanks to the promising genetic techniques such as CRISPR-CAS9 and single-cell RNA sequencing opened a new era in genetics. CRISPR-CAS9 can directly link genetic knowledge to future treatment. Single-cell RNA sequencing are providing useful information on cell biology and pathogenesis of diverse diseases.
KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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제13권11호
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pp.5446-5463
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2019
Parallel computing system components should be harmonized, and this harmonization is kept existent using synchronization time. Synchronization time affects the system in two ways. First, if we have too little synchronization time, some tasks face the problem of harmonization, as they need appropriate time to update and synchronize with the system. Second, if we allocate a large amount of time, stall system created. Random allocation of synchronization time for parallel systems slows down not only the booting time of the system but also the execution time of each application involved in the system. This paper presents a simulator used to test and allocate appropriate synchronization time for distributed and parallel heterogeneous systems. The simulator creates the parallel and heterogeneous system to be evaluated, and lets the user vary the synchronization time to optimize the booting time. NS3-cGEM5 simulator in this paper is formed by HLA-RTI federation integration of the two independent architecture and network simulators - NS3 and cGEM5. Therefore, nodes created on these simulators need synchronizations for harmonized system performance. We tested and allocated the appropriate synchronization time for our sample parallel system composed of one x86 server and three ARM clients.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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