• 제목/요약/키워드: HLA

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Relationship between Poor Immunogenicity of HLA-A2-Restricted Peptide Epitopes and Paucity of Naïve $CD8^+$ T-Cell Precursors in HLA-A2-Transgenic Mice

  • Choi, Yoon Seok;Lee, Dong Ho;Shin, Eui-Cheol
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제14권4호
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    • pp.219-225
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    • 2014
  • We examined the immunogenicity of H-2 class I-restricted and HLA-A2-restricted epitopes through peptide immunization of HLA-A2-transgenic mice that also express mouse H-2 class I molecules. All four of the tested epitopes restricted by H-2 class I robustly elicited T-cell responses, but four of seven epitopes restricted by HLA-A2 did not induce T-cell responses, showing that HLA-A2-restricted peptide epitopes tend to be poorly immunogenic in HLA-A2-transgenic mice. This finding was confirmed in HLA-A2-transgenic mice infected with a recombinant vaccinia virus expressing hepatitis C virus proteins. We examined the precursor frequency of epitope-specific naïve $CD8^+$ T cells in HLA-A2-transgenic and conventional C57BL/6 mice and found that the poor immunogenicity of HLA-A2-restricted peptide epitopes is related to the paucity of naïve $CD8^+$ T-cell precursors in HLA-A2-transgenic mice. These results provide direction for the improvement of mouse models to study epitope repertoires and the immunodominance of human T-cell responses.

Polymerase Chain Reaction-Sequence Specific Primer를 이용한 HLA-A 유전자의 DNA 다형성 조사 (Genotyping of HLA-A by Polymerase Chain Reaction-Sequence Specific Primer)

  • 장순모
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제40권2호
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    • pp.94-97
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    • 2008
  • The human leukocyte antigen (HLA) is the name of the major histocompatibility complex (MCH) in humans. The superlocus contains a large number of genes related to immune system function in humans. This group of genes resides on chromosome 6. and encode cell surface antigen-presenting proteins and many other genes. HLA class I antigen (A, B & C) present peptides from inside the cell. These peptides are produced from digested proteins that are broken down in the lysozymes. Most expressed HLA loci exhibit a remarkable degree of allelic polymorphism, which derives from sequence differences predominantly localized to discrete hypervariable regions of the amino terminal domain of the molecule. In this sutdy, the HLA-A genotypes were determined in twenty students unrelated koreans using the PCR-SSP (Polymerase Chain Reaction-Sequence Specific Primer) technique. Several specific primer pairs in assigning the HLA-A gene were used (A*0201, A*33, A*2401). The results of PCR-SSP, the HLA-A*0201 primer was detected eleven (55%), the HLA-A*33 were detected seven (35%) and the HLA-A*2401 were detected seven (35%). This study shows that the PCR-SSP technique is relatively simple, fast and a practical tool for the determination of the HLA-A genotypes.

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DEVSimHLA를 이용한 시뮬레이터 연동 (Simulator Interoperation Using DEVSimHLA)

  • 김재현;김탁곤
    • 한국시뮬레이션학회:학술대회논문집
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    • 한국시뮬레이션학회 2002년도 추계학술대회 논문집
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    • pp.79-83
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    • 2002
  • High Level Architecture (HLA)는 이기종 시뮬레이터 간의 연동을 위한 미들웨어이다. 본 논문에서는 Discrete Event System Specification (DEVS) 형식론을 바탕으로 한 DEVS 모델의 시뮬레이션을 HLA 기반에서 수행하는 방법에 대하여 제시한다. DEVS 시뮬레이션 메시지를 HLA의 서비스를 사용하여 변환하여 기존의 시뮬레이션 알고리즘을 그대로 사용하여 분산 시뮬레이션 할 수 있는 방식에 대하여 기술한다. 또한 모델 사이의 연결 정보를 HLA 환경에서 이용하는 방식에 대하여 기술한다. 제안된 방식을 구현한 DEVSimHLA 시뮬레이션 환경의 구조 및 동작 방식에 대하여 알아보고 이를 이용한 간단한 예제를 보인다.

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SMART-P 안전해석 전산 코드인 TASS/SMR 의 HLA 적용에 관한 연구 (A Study on the Application of TASS/SMR for SMART-P in Compliance with HLA)

  • 김희경;김희철;지성균;김현수
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2005년도 한국컴퓨터종합학술대회 논문집 Vol.32 No.1 (B)
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    • pp.373-375
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    • 2005
  • 본 논문에서는 최근에 각광을 받고 있는 HLA의 연구 현황을 파악하고 HLA의 기본 개념, 구성 요소, HLA를 이용한 시뮬레이션의 개발 방법 등에 대하여 조사하였다. 그리고 SMART-P 안전해석 전산코드인 TASS/SMR을 HLA에 적용하기 위한 방법에 대하여 기술하였으며 랩퍼 (Wrapper)를 사용하여 TASS/SMR을 HLA에 적용하여 보았다. 이러한 연구 결과로 TASS/SMR을 HLA에 적용, 구현하여 실행됨을 확인하였으며 그 결과로 레거시 코드를 HLA에 적용할 수 있는 방향을 제시하였다.

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HLA Application 개발을 위한 CASE Tool (CASE Tool For HLA Application)

  • 박민호;김재형;정창성
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2001년도 가을 학술발표논문집 Vol.28 No.2 (1)
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    • pp.415-417
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    • 2001
  • HLA(High Level Architecture)는 차세대 DIS(Distributed Interactive Simulation)를 이어 네트워크 분산 시뮬레이션의 기반이 되는 표준 아키텍쳐이다. 이 HLA 시스템의 개발 과정에서 FEDEP(Federation Development and Execution Process) Model이 제안되었는데, FEDEP의 목적은 federation 개발자가 application의 요구를 충족시킬 수 있도록 federation 개발 및 실행에 대한 guideline을 정하는 것이다. FEDEP의 일련의 process들 중에서 노동집약적인 과정은 CASE(Computer Aided Software Engineering) tool을 사용함으로써 보다 강화되고 능률적으로 이루어질 수 있다. 본 논문에서 소개하는 HLA Application Builder 는 federate 와 federation을 자동적으로 생성하는 CASE tool 로서, 자동적인 FED(Federation Execution Data)file 및 C++ source code를 생성함으로써 HLA Federation 개발에 있어서의 인력(manpower)을 크게 줄일 수 있다. 본 논문에서는 HLA에 대한 배경지식과 HLA Application Builder 개발의 필요성과 구현, 그리고 실제 예를 들어서 HLA Application Builder가 어떻게 federation 개발에 사용되는지에 대해서 설명한다.

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양극성 장애환자에서 HLA 대립형의 빈도와 질병연관성 (The Frequencies and Disease-Association of HLA Alleles in Bipolar Patients)

  • 전태연
    • 생물정신의학
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    • 제1권1호
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    • pp.79-87
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    • 1994
  • For the purpose of evaluating the human leukocyte antigen(HLA) disease-association with bipolar disorder, HLA class I and class II allelic frequencies were assessed in 37 bipolar patients and were compared to the data from normal population. HLA class 1 typing was performed with microlymphocytotoxicity method while class II(DRB1) genotyping with reverse dot blot hybridization and sandwich method. Statistical analysis consisted of relative risk, Haldane's modified relative risk, Fisher's exact test and Bonferoni's corrected P. The results were as follows : 1) Bipolar patients showed increased allelic frequency of HLA A3 which has statistical significance. 2) Allelic frequencies of HLA B7, B14 and B54 were higher, while those of B51 and B55 were lower in bipolar patients, but they were not statistically significant. 3) Both of increased frequencies of DR2 in bipolar patients and DR15 in normal controls had statistical significance. The results of the present study suggested that some of HLA allelic types might be associated with bipolar disorder. To clarify the genetic influence of HLA to bipolar disorder, we should do consecutive study of bipolar disorder with new information about HLA system including alleles.

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IEEE 1516 HLA/RTI 표준을 만족하는 시간 관리 서비스 모듈의 설계 및 구현 (Design and Implementation of Time Management Module for IEEE 1516 HLA/RTI)

  • 홍정희;안정현;김탁곤
    • 한국시뮬레이션학회논문지
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    • 제17권1호
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    • pp.43-52
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    • 2008
  • HLA는 이기종 시뮬레이터간의 연동을 위한 상위레벨 개념으로서 IEEE 1516 표준이며 Run-Time Infrastructure(RTI)는 이를 구현한 라이브러리 형태의 소프트웨어이다. RTI의 시간 관리 서비스를 개발함에 있어 효율적인 설계와 GALT 계산 알고리즘은 반드시 고려해야 하는 사항이다. 그러나 기존의 많은 RTI의 시간 관리 서비스는 수정과 확장이 용이하지 않다. 몇몇 RTI가 이러한 단점을 극복하기 위하여 모듈화 설계방안을 제안하고 있지만 이들은 IEEE 1516 HLA/RTI에 적합하도록 설계 및 구현된 것이 아니라 HLA 1.3을 위한 것이었다. 많은 RTI는 GALT 계산 알고리즘으로 분산 시뮬레이션에서 널리 알려진 Mattern의 알고리즘을 이용하고 있다. 그러나 Mattern의 알고리즘을 IEEE 1516 HLA/RTI에 적용시키기에는 몇 가지 제약사항이 존재한다. 본 논문은 IEEE 1516 HLA/RTI를 만족하는 시간 관리 서비스의 모듈화 설계를 제안하고 이를 바탕으로 구현한다. 시간 관리 서비스 모듈을 TIME 모듈과 GALT 모듈로 나누는 설계방안을 제안하고 GALT 계산 알고리즘으로는 Mattern의 알고리즘을 수정 보완하였다. 그리고 제안한 설계방안대로 구현한 시간 관리 서비스 모듈의 성능을 살펴보기 위하여 실험을 수행하고 그 결과를 분석하였다.

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Human Leukocyte Antigen-DQ Genotyping in Pediatric Celiac Disease

  • Stuti Pareek;Raj Kumar Gupta;Abhinav Sharma;Sandhya Gulati
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제26권1호
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    • pp.50-57
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    • 2023
  • Purpose: The purpose of this study was to determine the pattern of human leukocyte antigen (HLA)-DQ genotype in children diagnosed with celiac disease (CD) (biopsy proven), and to compare this with a control group; and secondarily, to correlate HLA genotypes with clinical profiles of CD. Methods: This cross-sectional comparative observational study included 26 controls and 52 patients diagnosed with CD who presented at Sir Padampat Mother and Child Health Institute, Jaipur, from May, 2017 to October, 2018. HLA DQ genotype was assessed for each patients and correlated with clinical profiles. Results: HLA DQ2/DQ8 genotypes were significantly more common in CD (present in 100.0% cases) than in controls (23.1%) in Northern India (Rajasthan). When HLA DQ2.5 and DQ8 were present together, individuals had significantly more atypical presentations and severe findings on duodenal biopsy. Similarly, patients with the HLA DQ 2.5 genotype were also predisposed to more severe endoscopic findings, while HLA DQ2.2 predisposed them to less severe biopsy findings. HLA DQ8 was significantly associated with later age at diagnosis (>5 years) and shorter stature. The highest HLA DQ relative risk (RR) for CD development was associated with HLA DQ2.5 and DQ2.2 in combination, followed by HLA DQ2.5 and DQ8 in combination, while HLA DQx.5 and HLA DQ2.2 together had the lowest risk. Conclusion: HLA DQ2/DQ8 genotypes are strongly associated with pediatric CD patients in northern India. These genotypes and their combinations may be associated with different clinical presentations of CD, and may help predict severity of CD.

급성 전염성 단핵구증 환아에서 Epstein-Barr 바이러스의 감염형과 사람 백혈구 항원형 연구 (A Study of Epstein-Barr Virus, and Human Leukocyte Antigen Typing in Children with Acute Infectious Mononucleosis)

  • 한승훈;신완식;한훈;강진한
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제46권5호
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    • pp.467-473
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    • 2003
  • 목 적 : EBV는 전 세계적으로 다양한 질환을 일으키고, EBV는 지역과 EBV에 노출된 사람의 면역 또는 병적 상태에 따라 감염형이 달라 EBV 감염형에 관한 연구는 EBV의 역학연구와 EBV 관련 질환의 병인연구에 제일 기본적이다. EBV의 잠복감염 유전인자들에 의한 세포독성 T 림프구 면역상태는 EBV에 의한 다양한 질환의 병인적 역할이 있으며 HLA에 의하여 유발되어지는 것으로 알려져 있다. 과거에 시행한 많은 연구에서 EBV 감염과 HLA형과의 연관성은 객관적으로 입증되지 않았으나, HLA II형에 속한 항원이 EBV의 인체 내 침투에 관여한다는 사실이 최근에 보고됨으로써 이에 대한 관심이 재조명되고 있다. 이에 저자들은 EBV 감염에 의한 국내 급성 전염성 단핵구증 환아에서 주된 EBV 감염형의 분포를 확인하고, 급성 전염성 단핵구증의 발생이 HLA형과 연관성이 있는 지를 분자생물학적 분류법으로 알아보고자 이 연구를 실시하였다. 방 법 : 연구 대상은 6세에서 13세 사이의 급성 전염성 단핵구증으로 확진된 24명의 환아 이었다. 감염형의 비교 대조군은 건강한 정상 소아 중 면역혈청학적 검사로 EBV 노출이 확인된 동일한 연령의 58명이었고, HLA형 분류의 비교 대조군은 연구대상 환아와 동일한 연령의 정상 소아 200명을 대상으로 실시하였다. EBV에 의한 급성 전염성단핵구증 환아에서 중합 효소 연쇄반응법으로 EBV 감염형을 분류하여 주된 감염형을 확인하고, ARMs PCR법으로 HLA-A, B, C 항원형을, PCR-SSOP법으로 HLA-DRB 항원형을 분류하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 결 과 : 1) EBV 감염형 결과 : 연구 대상 환아 24명에서 EBV A형이 20명(83.3%)이었고, B형은 4명(16.7%)이었다. 비교 대조군의 경우에는 58명 중 14명(24.1%)이 EBV가 검출되고 이들 중 A형은 11명(78.6%)이었고, B형이 3명(21.%)이었다. 2) HLA 형 분류 결과 : HLA I형 결과는 HLA-A24형에서 비교 대조군 200명 소아 중 69명이 양성이었고, 연구 대상 환아 24명 중 14명이 양성을 보여 RR치가 3.5724, chi-square치가 5.26, P<0.05으로 통계적 유의성을 보였다. 그러나 HLA-B, C항원형에서는 통계적으로 유의한 결과가 없었다. HLA II형 결과는 HLA-DRB1*07형에서 비교 대조군 200명 소아 중 18명이 양성이었고, 연구 대상 환아 24명 중 8명이 양성을 보여 RR치가 5.6173, chi-square치가 9.73, P<0.01로 통계적 유의성을 보였다. 결 론 : 위의 연구 결과를 통하여 국내 급성 전염성 단핵구증 환아의 EBV 감염형은 정상 비교 대조군의 소아에서 주된 감염형인 A형과 동일한 감염형임을 확인하였다. 그리고 HLA형 연구에서 HLA-A24형과 HLA-DRB1*07형이 정상 대조군과 비교하여 통계적 유의성을 보여 EBV에 의한 급성 전염성단핵구증 발생이 HLA형과 연관성이 있음을 추정하였다.

한국인 790명을 대상으로 한 HLA-A 및 HLA-DR 대립유전자 빈도 및 일배체형 연관성에 대한 종합적 분석 (A Comprehensive Analysis of HLA-A and HLA-DR Allele Frequencies and Haplotype Associations in a Korean Population of 790 Individuals)

  • 한희경;김미현;정성수;김동권;김영택;황준연;강성산;양승민;이슬;백수정;나광민;이채영;한유진;박소영;홍민희;이기쁨;임선민;김재환;표경호;조병철
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제56권3호
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    • pp.236-247
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    • 2024
  • Human leukocyte antigen (HLA) 시스템은 주조직 적합성 복합체(major histocompatibility complex, MHC)의 일부분으로, 자가 세포와 비자가 세포 및 항원을 구분하여 면역 반응에서 중요한 역할을 한다. HLA allele의 다양한 변이는 질병감수성과 면역 반응에 영향을 미치며, 이는 각기 다른 인구 집단에서 차이가 난다. 특히, HLA-A와 HLA-DRB1 allele은 다양한 면역 관련 질환과 연관되어 있어, 이러한 유전자의 빈도와 haplotype의 연관성을 이해하는 것이 유전학적 및 면역학적 연구에서 매우 중요하다. 한국인에서 이러한 특성의 분포를 조사하기 위해, 서울중앙혈액원에 헌혈한 자원자들의 혈액에서 peripheral blood mononuclear cell을 분리하고, 790명의 샘플에 대해 HLA 유전자형 분석을 수행하였다. 연구 결과, HLA-A와 HLA-DRB1 allele은 한국인 집단에서 널리 분포하고 있으며, HLA-A*24:02 (21.7%)와 HLA-DRB1*09:01 (9.9%)이 가장 빈번하게 나타났다. 특정 HLA-A와 HLA-DRB1 allele 간의 중요한 haplotype 연관성이 카이제곱 검정을 통해 확인되었으며, 이는 특정 유전자 조합이 질병 발병에 영향을 미칠 수 있음을 시사한다. 이러한 통찰은 질병에 대한 예측 및 예방전략 개발에 기여할 수 있다. 한국인 집단의 독특한 유전적 특성은 이 그룹에서 HLA allele과 haplotype 분포를 연구하는 것이 질병 감수성을 이해하는 중요한 지표임을 강조한다.