• Journal of Animal Science and Technology
• /
• 제65권2호
• /
• pp.473-477
• /
• 2023

Lactobacillus amylovorus CACC736 was originated from swine feces in Korea. The complete genome sequences of the strain contained one circular chromosome (2,057,809 base pair [bp]) with 38.2% guanine-cytosine (GC) content and two circular plasmids, namely, pCACC736-1 and pCACC736-2. The predicted protein-coding genes, which are encoding the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated proteins, biosynthesis of bacteriocin (helveticin J), and the related proteins of the bile, acid tolerance. Notably, the genes related to vitamin B-group biosynthesis (riboflavin and cobalamin) were also found in L. amylovorus CACC736. Collectively, the complete genome sequence of the L. amylovorus CACC736 will aid in the development of functional probiotics in the animal industry.

• Journal of Animal Science and Technology
• /
• 제65권6호
• /
• pp.1341-1344
• /
• 2023

In this study, we report the complete genome sequence of Lactiplantibacillus plantarum L55, a probiotic strain of lactic acid bacteria isolated from kimchi. The genome consists of one circular chromosome (2,077,416 base pair [bp]) with a guanine cytosine (GC) content of 44.5%, and two circular plasmid sequences (54,267 and 19,592 bp, respectively). We also conducted a comprehensive analysis of the genome, which identified the presence of functional genes, genomic islands, and antibiotic-resistance genes. The genome sequence data presented in this study provide insights into the genetic basis of L. plantarum L55, which could be beneficial for the future development of probiotic applications.

• Journal of Interdisciplinary Genomics
• /
• 제5권2호
• /
• pp.29-31
• /
• 2023

Pseudohypoparathyroidism (PHP) is very rare and shows heterogeneity with impaired genetic components. PHP is characterized by parathyroid hormone resistance to target organ, related with a GNAS (guanine nucleotide-binding protein α-subunit) mutation and epimutation. PHP receptor is coupled with the stimulatory G protein which activates cyclic adenosine monophosphate formation. PHP type 1A is caused by inactivating mutations on the maternal allele of the GNAS whereas paternal allele mutations cause pseudopseudohypoparathyroidism. PHP type 1B is caused by abnormal patterns of methylation in differentially methylated region which can be divided into partial or complete. This disease has some difficulties to diagnose according to these different molecular alterations caused by complex genetic and epigenetic defects. According to this different molecular alterations, genetic confirmation must be done to discriminate their etiology.

• Journal of Korean Neurosurgical Society
• /
• 제67권3호
• /
• pp.265-269
• /
• 2024

Pediatric central nervous system (CNS) vascular malformations are a group of abnormal blood vessel formations within the brain or spinal cord in children. The most crucial point of pediatric CNS vascular malformation is that no golden standard classifications exist. In addition, there is a big gap in knowledge and the viewpoint of clinicians, radiologists, and pathologists. In addition, many genes associated with pediatric CNS vascular malformation, such as Sturge-Weber-Dimitri syndrome with guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha (GNAQ) gene mutation, and cavernous malformations with cerebral cavernous malformations 1 (CCM1), CCM2, and CCM3 gene mutation, were recently revealed. For proper therapeutic approaches, we must understand the lesions' characterizations in anatomical, morphological, and functional views. In this review, the author would like to provide basic pediatric CNS vascular malformation concepts with understandable diagrams. Thus, the author hopes that it might be helpful for the proper diagnosis and treatment of CNS pediatric vascular malformations.

• 생명과학회지
• /
• 제28권9호
• /
• pp.1100-1117
• /
• 2018

Ras superfamily에 속하는 monomeric small GTPase는 현재까지 170여 종이 알려져 있으며 이들은 세포 신호전달에 있어서 분자 스위치(molecular switch)로 작용하고 있다. Ras GTPase는 guanosine diphosphate (GDP)와 결합하여 불활성화 되거나 혹은 guanosine triphosphate (GTP)와 결합하여 활성화되는 guanosine nucleotide 결합단백질로서 세포내의 수많은 생리작용을 조절하고 있다. 즉, 쉬고 있던 불활성화 상태의 Ras-GDP는 외부 신호에 반응하여 활성화 된 guanine nucleotide exchange factor (GEF)에 의하여 활성형인 Ras-GTP상태로 전환되어 그 하류로 신호를 전달하는 효과기로 작용하게 된다. 신호전달을 마친 Ras-GTP는 다시 불활성형인 Ras-GDP로 전환되어야 하는데 Ras 자체의 GTPase 활성이 미약하여 RasGTPase activating protein (RasGAP)의 도움을 받아야만 한다. 이와 같이 Ras GTPase는 GEF와 GAP의 활성으로 세포 안의 스위치를 켜고 끄게 된다. 현재까지 알려진 인간 암(cancer)의 30% 이상이 돌연변이를 포함하는 Ras switch의 비정상적인 작동에 기인한다는 점이 밝혀져 있으므로 Ras GTPase의 구조와 생리적 기능에 대한 최근의 연구결과들을 요약하였다. 나아가 GTPase activating protein으로서의 기능을 상실한 RasGAP분자의 돌연변이는 세포 안의 Ras 스위치를 계속 켜 두는 상태인 Ras-GTP 상태를 유발함으로서 종국에는 암의 발생을 촉발하게 된다. 이에, 본고에서는 최근에 와서 tumor suppressor로서 알려지면서 암의 치료 표적단백질로 떠오르게 된 RasGAP의 인체생리학적 기능을 고찰하였다. 인간 게놈 안에는 RASA1, NF1, GAP1 family 및 SynGAP family 등에 속하는 14종의 RasGAP 분자들이 존재하는데 이들 GAP분자들의 이상과 인간 질병의 연관성에 대한 최근의 연구결과들에 대해 고찰하였다.

• 대한화학회지
• /
• 제44권1호
• /
• pp.45-51
• /
• 2000

안트라센 유도체-합성DNA의 결합형태를 여러 가지 분광학적인 방법들을 통해서 알아보았다. Methylamine과 methylethylenediamine, 즉, 길이가 다른 곁사슬을 가지는 안트라센 유도체들이 poly[d(A-T)2]와 $poly[d(G-C)_2]$의 이중나선에 결합했을 때의 분광학적인 특성은 흡광, 원편광스펙트럼에서 봉우리의 장파장으로 이동, 흡광도의 감소를 볼 수 있으며, 선편광스펙트럼에서는 DNA흡광 영역에서 강한 음의 봉우리가 나타나는 것으로 요약할 수 있다. 이러한 현상들은 안트라센·유도체들이 위의 두 가지 DNA의 염기쌍 사이에 삽입이 되어있다는 것을 증명한다. 곁사슬의 길이에 따른 분광학적인 특성에는 별 차이가 없는 것으로 보아 곁사슬의 길이는 결합형태에 영향을 미치지 앓는다는 것을 알 수 있다. 또한, 강한 에너지의 전달이 $pdy[d(A-T)_2]$와 $poly[d(I-C)_2]$에는 일어나지만 $poly[d(G-C)_2]$에는 일어나지 않는 것으로 보아 $poly[d(G-C)_2]$의 작은 흠쪽에 돌출해 있는 아민기가 DNA염기로부터의 에너지의 전달을 방해하고 있는 것으로 판단된다.

• 대한약리학회지
• /
• 제30권2호
• /
• pp.153-165
• /
• 1994

In this study, we tested the influences of several ${\kappa}$ opioid ligands on the $[^3H]diprenorphine$ binding in rat and guinea pig cortex membrane preparations. Using paradigm to block ${\mu}\;and\;{\delta}$ opioid receptors with $DAMGO(1{\mu}M)$ and $DPDPE(1{\mu}M)$, $[^3H]diprenorphine$ labeled ${\kappa}$ sites. Competition analysis in both rat and guinea pig cortex has shown a single population of $[^3H]diprenorphine$ binding site with different Kd values, respectively. There is a significant difference in Ki values of (-) WIN44441 and (+)WIN44441 in both rat and guinea pig cortex. Bremazocine, (-)ethylketocyclazocine, (-)cyclazocine, nor-binaltorphimine effectively inhibited the $[^3H]diprenorphine$ binding with different Ki values in rat and guinea pig cortex. U-69,593, U-50,488H and dynorphine-A (1-8) did not inhibit the $[^3H]diprenorphine$ binding in rat but in guinea pig cortex. Nor-binaltorphimine was a ligand discriminate the ${\kappa}_1$, and ${\kappa}_2$ receptor most effectively. We, also, examined the influence of Na ion and $GTP{\gamma}S$, a nonhydrolyzable guanine nucleotide analog, on the inhibition of $[^3H]diprenorphine$ binding by diprenorphine, (-)ethyl-ketocyclazocine, U-69,593 and bremazocine. By the replacement of NaCl with N-methy-D-glucamine or addition of $GTP{\gamma}S$, Ki values of diprenorpnine were not changed and that of ethylketocyclazocine were changed significantly in both rat and guinea pig cortex. The Ki value of bremazocine was decreased by removal of Na ion, and increased by $GTP{\gamma}S$, however, was not changed by any one of either. These results suggest that there are 2 kinds of subtypes of ${\kappa}$ opioid receptor, ${\kappa}_1$, and ${\kappa}_2$, showing different Ki values for various ${\kappa}$ opioid ligands, also, bremazocine possess the antagonistic property at ${\kappa}_2$ site which is dominant subtype of K receptor in rat cortex.

• 한국약용작물학회지
• /
• 제14권3호
• /
• pp.178-182
• /
• 2006

둥굴레 유전자원의 유연관계를 위한 기초 자료를 얻고자 둥굴레속 식물 수집종 10종에서 18S ribosomal RNA를 암호화하는 18S rDNA 영역의 염기서열을 결정하고 그 특성을 분석한 결과를 요약하면 다음과 같다. 둥굴레속 10종의 18S rDNA 영역 전체의 길이는 $913{\sim}914bp$로 비슷하였으나, 총 8개 지점에서 염기의 치환 및 결실에 의한 변이가 발생하였다. 전위는 $T{\rightarrow}C$전위가 4개 지점에서 발생하였고, $A{\rightarrow}G$ 전위가 1개 지점에서 발생하였으며, 전좌는 $C{\rightarrow}A$ 전좌가 1개 지점에서 발생하여 전위가 전좌보다 5배 만큼 발생하였다. 결실은 2개 지점에서 발생하였다. 18S rDNA의 염기의 조성은 adenine $23.09{\sim}23.33%$, guanine $23.33{\sim}23.52%$, thymine $25.60{\sim}25.85%$, cytosine $27.38{\sim}27.79%$로 pyrimidine계가 purine계보다 많았다. 18S rDNA의 A + T 함량은 $48.80{\sim}49.18%$로 평균 48.99%였고, G+C 함량은 $50.82{\sim}51.20%$로 평균51.01%였다. 다중 정렬에 의해 염기서열을 비교한 결과 $99.7{\sim}100%$ 일치하여 종간에 차이가 적었다.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제7권3호
• /
• pp.119-125
• /
• 1979

(l) 핵산관련물질 생산균주의 분리를 위한 변이 유기제와 최적 처리조건은 UV; 30 cm, 1 min, NTG; 200 $\mu\textrm{g}$/ml, 20min, DES; 0.32 %, 90 min, EMS; 5%, 60 min 이었으며 이때 변이솔는 각각 0.083 %, 0.67%, 1.1 %, 및 0.45%로 DES가 가장 양호하였다. (2) Purine 영양요구변이주 239 strain 중 5'-IMP 생산균주는 모두 6 strain이었으며 이중 adenine-guanine 동시요구주 D-2150이 4.8mg/ml로 가장 우수하였다. (3) D-21530 strain의 배양액에서 얻은 결정을 paper chromatogram의 Rf치, 자외선 및 적외선 흡수 spectum 비교, 가수분해에 의한 hypoxanthine 생성량 및 orcinol 반응에 의한 D-ribose의 생성량을 검토한 결과 5'-IMP로 동정되었다. 이 연구을 할때 협력하여 주신 제일제당주식회사 김홍집 상무, 그리고 핵산의 정량분석을 하여준 문화식 씨에게 감사드립니다.

• 대한약리학회지
• /
• 제29권2호
• /
• pp.245-252
• /
• 1993

Amiloride는 $Na{^+}$ channels를 선택적으로 억제하는 potassium sparing diuretic이다. 본 연구에서는 amiloride와 아데노신 수용체의 상호작용을 밝히고자, 흰쥐에서 얻은 crude adipocytic membrane fractions의 adenylyl cyclase activity를 여러 조건하에서 측정하였다. 우선 GTP가 isoproterenol-stimulated adenylyl cyclase activity에 미치는 영향을 조사함으로서 $G_i$ protein (inhibitory guanine nucleotide binding protein)의 기능을 알아보았다. 그 결과 amiloride는 높은 GTP 농도에서 isoproterenol-stimulated adenylyl cyclase의 활성을 억제하는 것을 관찰할 수 없었다. 이와는 대조적으로 amiloride 존재 하에서 2-chloroadenosine을 사용하여 아데노신 수용체를 경유한 isoproterenol-stimulated adenylyl cyclase activity가 억제되는 정도를 측정하였을 때, 2-chloroadenosine의 농도에 따라 큰 변화 없거나 오히려 억제 효과가 더욱 크게 나타났다. 그러나 위와 같은 조건하에서 propranolol에 의한 isoproterenol-stimulated adenylyl cyclase activity의 억제는 amiloride에 의해서 유의하게 변하지 않는 것으로 보아서, 수용체를 매개로 한 $G_s$ protein의 기능은 amiloride에 의해 영향을 받지 않는 것으로 생각된다. 그리고 amiloride에 의해 증가된, 2-chloroadenosine-mediated adenylyl cyclase의 억제 효과는 150mM NaCl 존재 하에서도 그대로 유지되었다. 이러한 결과로 보아 amiloride는 아데노신 수용체와 결합하여 $G_i$ proteins과의 coupling을 용이하게 할 뿐만 아니라, $G_i$ protein을 선택적으로 변화시켜 $G_i$ protein의 GTP 의존적인 adenylyl cyclase의 억제 기능을 제거하는 두 작용을 갖는 것으로 사료된다.