• 제목/요약/키워드: Gly-Gly-His

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콩고오지 제조중(製造中)의 peptide에 관(關)한 연구(硏究) -제3보(第三報) 콩고오지 제조중(製造中)에 생성(生成)되는 저급(低級) peptide의 구조(構造)- (Studies on peptide during soybean-koji preparation -Part III Amino acid sequence of oligopeptides formed during soybean-koji preparation-)

  • 김재욱
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제6권
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    • pp.107-117
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    • 1965
  • (1) 콩고오지 제조중(製造中) 생성(生成)되는 저급(低級) peptde의 종류(種類)를 구명(究明)하는 동시(同時)에 겸(兼)하여 Aspergillus soya protease의 작용(作用) specificity를 구명(究明)하기 위(爲)하여 콩고오지 제조중(製造中) 생성(生成)되는 저급(低級) peptide의 N-terminal 및 C-terminal을 동정(同定)하고 dipeptide 및 tripeptide에 대(對)하여서는 amino acid sequence를 결정(決定)하여 다음과 같은 결과(結果)를 얻었다. Gly, Glu. Ala. Ser. Glu. Ser. Ala. Val (Cys, Glu, Ser, Ala, Arg, Try, Leu or Ileu) Asp. Phe (His, Arg, Cys, Asp, Ser, Ala, Leu or Ileu) Glu. Ala (Cys, Gly, Met) Glu. Ala (Asp, Glu,) Gly. Met (Asp, Glu, Ala, Tyr, Leu or Ileu, Lys,) Gly. Leu or Ileu (His, Asp, Glu, Gly, Ser, Lys, Thr, Phe,) Cys. Gly (Asp, Tyr,) Glu. Pro (Asp, Glu, Ser, Gly, Thr, Ala, Val, Leu or Ileu) Try. Ser (Gly, Glu, Arg, Ala, Met, Leu or Ileu,) Asp. Met (Asp, Glu, Ala, Try, Pro, Leu or Ileu,) His Thr (Ser, Gly, Tyr, Pro, Leu or Ileu,) Glu. Gly (Asp, Ala, Ser, Glu,) Leu or Ileu (2) Aspergillus soya protease의 작용(作用) specificity는 비교적(比較的) 광범위(廣範圍)하며 carboxyl기(基)를 가진 amino acid가 acidic amino acid일 때 잘 작용(作用)하는 것으로 보인다.

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Pseudomonas mandelii의 lipase 유전자 클로닝, 발현 및 정제 (Cloning, Expression, and Purification of a Lipase from Psychrotrophic Pseudomonas mandelii)

  • 김준성;이창우
    • 생명과학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.306-311
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    • 2012
  • 내냉성 세균인 Pseudomonas mandelii로부터 lipase 유전자(lipT)를 클로닝하고 염기서열을 분석하였다. 열린해독틀 (open reading frame)은 1,686 bp로 구성되어 있고, 562개의 아미노산을 코딩한다. 서열분석 결과 많은 세린 효소에서 발견되는 Gly-X-Ser-X-Gly 모티프가 존재한다(Gly-His-Ser-Leu-Gly). 재조합 LipT 단백질은 대장균에서 주로 inclusion body 형태로 발현되었다. 니켈 친화성 크로마토그라피 방법으로 LipT 단백질을 분리하였으며 소량의 LipT 단백질이 refold 되었다. 이 효소는 p-nitrophenyl butyrate (C4)과 p-nitrophenyl octanoate (C8)에 대해 기질 특이성을 나타내었다.

금속펩타이드를 이용한 Pseudomonas alcaligenes의 5S rRNA의 구조 연구 (Study on the Structure of 5S rRNA from Pseudomonas alcaligenes by Metallotripeptides)

  • 김희정;김시욱;고문주
    • 대한화학회지
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    • 제46권1호
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    • pp.46-51
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    • 2002
  • $Ni(II){\cdot}Gly$-Gly-His(Arg)COOH와 $Cu(II){\cdot}Gly$-Gly-His(Arg)COOH 형태의 금속펩타이드를 이용하여 P. alcaligenes에서 얻은 5S rRNA의 구조를 조사하였다. 그 결과 금속 펩타이드들은 5S rRNA의 줄기-고리 구조에서 염기쌍을 이루지 않거나 불안정하게 이루는 부분을 선택적으로 변형시켰다. 금속펩타이드의 선택성은 중심 금속이 Ni(II)인 경우와 Cu(II)인 경우에 차이가 거의 없었다. 금속펩타이드를 이용한 절단 결과를 금속 착물 M(II)CR을 이용한 결과와 비교하면 금속펩타이드에 의한 선택성이 더 크게 나타났다. 금속펩타이드와 금속착물을 이용한 절단 결과로부터 P. alcaligenes에서 얻은 5S rRNA의 이차구조를 살펴보았다.

Characterization of Glycerol Dehydrogenase from Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 and GGG Motif Identification

  • Wang, Liangliang;Wang, Jiajun;Shi, Hao;Gu, Huaxiang;Zhang, Yu;Li, Xun;Wang, Fei
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권6호
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    • pp.1077-1086
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    • 2016
  • Glycerol dehydrogenases (GlyDHs) are essential for glycerol metabolism in vivo, catalyzing its reversible reduction to 1,3-dihydroxypropranone (DHA). The gldA gene encoding a putative GlyDH was cloned from Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 (TtGlyDH) and expressed in Escherichia coli. The presence of Mn2+ enhanced its enzymatic activity by 79.5%. Three highly conserved residues (Asp171, His254, and His271) in TtGlyDH were associated with metal ion binding. Based on an investigation of glycerol oxidation and DHA reduction, TtGlyDH showed maximum activity towards glycerol at 60℃ and pH 8.0 and towards DHA at 60℃ and pH 6.0. DHA reduction was the dominant reaction, with a lower Km(DHA) of 1.08 ± 0.13 mM and Vmax of 0.0053 ± 0.0001 mM/s, compared with glycerol oxidation, with a Km(glycerol) of 30.29 ± 3.42 mM and Vmax of 0.042 ± 0.002 mM/s. TtGlyDH had an apparent activation energy of 312.94 kJ/mol. The recombinant TtGlyDH was thermostable, maintaining 65% of its activity after a 2-h incubation at 60℃. Molecular modeling and site-directed mutagenesis analyses demonstrated that TtGlyDH had an atypical dinucleotide binding motif (GGG motif) and a basic residue Arg43, both related to dinucleotide binding.

치어기 조피볼락에 있어서 사료내 합성아미노산 첨가 효과 (Effects of Dietary Synthetic Amino Acid Supplementation in Korean Rockfish Fry Sebastes schlegeli)

  • 김강웅;박건준;옥임호;배승철;최영준;신인수
    • 한국양식학회지
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    • 제15권3호
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    • pp.157-163
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    • 2002
  • 본 실험은 섭취촉진물질로 알려져 있는 사료내 13종의 아미노산들이 치어기 조피볼락에 있어 성장 및 체조성에 어떠한 영향을 미치는지 알아보고자 실시하였다 실험어는 평균무게 0.64 g인 조피볼락 치어를 사용하였으며, 기초실험 사료내에 유인효과가 있을 것으로 여겨지는 아미노산 13가지(Arg, Ala, Na-Glu, Gly, His, Ile, Lys, Met, Phe, Pro, Thr, Trp 및 Val)를 사료내 각각 0.3% 씩 첨가하여 총 13 실험구를 2반복으로 나누어 6주간 사육하였다. 6주간의 사육실험 결과, 성장률(WG)과 일간 성장률(SGR)에서는 Pro, Thr, Met 및 Gly 실험구가 다른 실험구에 비해 유의적으로 높았으나(P<0.05), 이들 실험구간에는 유의적인 차이가 없었다(P>0.05). 그리고, 사료전환효율(FE)에서는 Pro 실험구가 Met과 Gly 실험구보다 유의적으로 높았으며(P<0.05), Pro 실험구와 Thr 실험구 사이에는 유의적인 차이가 없었다(P>0.05). 그리고 Thr, Met 및 Gly 실험구간에도 유의적인 차이가 없었다(P>0.05). 단백질전화효율에 있어서 Pro 실험구가 모든 실험구에 있어서 유의적으로 가장 높았으며(P<0.05), Thr 실험구와 비교하여 유의적으로 차이가 나지 않았다(P>0.05). 그리고, 비만도(condition factor)는 Thr 실험구가 유의적으로 가장 높았으며(P<0.05), Val 실험구는 가장 낮게 나타났다(P>0.05). 간중량지수(HSI)는 모든 실험구간에서 유의적인 차이가 나지 않았다(P>0.05). 전어체의 단백질, 수분 및 회분에 있어서는 모든 실험구에 있어서 유의적인 차이가 나지 않았다(P>0.05). 지질함량은 Met, Pro 및 Thr 실험구가 Glu, Gly, Lys, Trp 및 Val 실험구보다 유의적으로 낮았다(P>0.05). 상기 결과를 토대로, 조피볼락 사료용 사료섭취촉진물질로서 아미노산을 검색한 결과 사료내 0.3% Pro, Thr, Met 및 Gly을 첨가했을 때 사료섭취촉진 효과가 나타났으며, 이것들 중 Gly을 제외하고는 전어체의 지질 함량을 감소시키는 결과를 나타내었다.

Gly-His-Lys 펩타이드가 결합된 키토산과 그의 세포증식 효과에 관한 연구 (Gly-His-Lys Conjugated Chitosan and its Cell Proliferation Effects)

  • 하병조;이윤식;박수남
    • 대한화장품학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.399-404
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    • 2004
  • 새로운 Gly-His-Lys (약자로 GHK)가 결합된 키토산을 $N^{\alpha}-Fmoc$ 아미노산과 BOP 커플링 시약을 사용한 고상법에 의해 제조하였다. 이를 위해 키토산 마이크로 비드를 W/O 에멀젼 상분리법으로 평균 입자크기 70 마이크로미터로 얻었다. GHK 펩타이드는 순차적으로 고상법에 의해 키토산 마이크로비드 위에 커플링 하였다. 아미노산 분석을 실시한 결과 Gly, His, kys의 비율이 1.02:1.13:0.96의 비율로 나타나 이론치와 거의 일치함을 확인할 수 있었다. GHK 펩타이드가 결합된 마이크로비드의 세포증식 효과는 MTT 분석으로 측정하였다. 측정결과 GHK 펩타이드가 결합된 키토산 마이크로비드는 대조군인 펩타이드가 결합되지 않은 키토산 마이크로비드 자체에 비해 높은 세포증식 효과를 보였다.

Chirality Conversion of Dipeptides in the Schiff Bases of Binol Aldehydes with Multiple Hydrogen Bond Donors

  • Park, Hyun-Jung;Hong, Joo-Yeon;Ham, Si-Hyun;Nandhakumar, Raju;Kim, Kwan-Mook
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권2호
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    • pp.409-414
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    • 2009
  • Novel binol aldehydes derivatized at 2' hydroxy position with both uryl and acetamide groups (2), and diuryl groups (3) have been synthesized. Both were designed for streospecific binding and chirality conversion of general dipeptides with support of multiple hydrogen bonding donor sites in the receptors. The receptors, 2 and 3, converted the chirality of N-terminal amino acids of peptides such as Ala-Gly, Met-Gly, Leu-Gly and His-Gly with stereoselectivity on D-form over L-form. The stereoselectivity ratios were in the range of 5-11, somewhat higher than those of the binol receptor with mono uryl group (1). The DFT calculation at the B3LYP/6-31G$^*$//MPWB1K/6-31G$^*$ level revealed that 3-D-Ala-Gly was 2.2 kcal/mol more stable than 3-L-Ala-Gly. The considerable steric hindrance between the methyl group of the alanine and the imine CH moiety of the receptor seems to be the main contributing factor for the thermodynamic preference.

청국장(淸國醬)메주 발효과정중(醱酵過程中)의 질소화합물(望素化合物)의 소장(消長)에 관(關)한 연구(硏究)(II) -저급(低級) peptide와 구성(構成)아미노산(酸)에 관(關)하여- (Studies on the N-Compounds during Chung-Kook-Jang Meju Fermentation -Amino acids of oligopeptides formed during Chung-Kook-Jang Fermentation-)

  • 박계인
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제15권2호
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    • pp.111-142
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    • 1972
  • 청국장(淸國醬)메주 발효과정중(醱酵過程中) 경시적(輕時的)인 시료(試料)를 체취(採取)하여 cross linkage가 각각(各各) 다른 5개(個)의 Dowex-50 resin을 충전(充塡)한 column을 통과(通過)시켜 얻은 Dowex-50의 X-16 fraction의 저급(低級) peptide의 종류(種類)를 구명(究明)하는 동시(同時)에 청국장(淸國醬)메주발효과정중(醱酵過程中)에 생성(生成)되는 저급(低級) peptide의 N-terminal amino acid 와 C-terminal amino acid를 동정(同定)하고 각(各) peptide 군(群)의 구성(構成) amino acid의 종류(種類)를 결정(決定)하여 다음과 같은 결과(結果)를 얻었다. 1. 각(各) peptide군(群)의 N 및 C-terminal amino acid 와 구성(構成)아미노산(酸은) 다음과 같다. [P]-I. Pro (Cys Ala Asp Trp Ile Val) Glu [P]-II. Val (His Arg Glu Thr Ala Met) Asp [P]-III. Glu (Cys Lys Asp Thr Met) Ala [P]-IV. Glu(His Ser Ala) Met) [P]-V. Ile (Cys Asp Arg Gly Pro T.p Phe) His [P]-VI. Gly(Asp ser) Lys [P]-VII. Thr(Pro Tyr Phe) Asp [P]-VIII. Phe(Tyr Leu Ile) Val [P]-IX. Trp (Phe lle) Thr [P]-X. Ile (Arg Leu) Phe [P]-XI. Asp (Lys His Ser Gly Glu Pro) Ala [P]-XII. Glu (Cys Asp Gly) Ser [P]-XIII. Ala (Arg Tyr) Glu [P]-XIV. Met (Glu Ala) His 2. 청국장(淸國醬)메주 발효과정중(醱酵過程中)의 경시적(輕時的)인 시료(試料)의 각저급(各低級) peptide 군(群)에는 2종(種), 3종(種) 및 6종(種)의 아미노산(酸)으로 되어있는 peptidessm 찾아볼 수 없으며 구성(構成) 아미노산(酸)도 $4{\sim}9$종의 아미노산(酸)으로 결합(結合)되어 있는 peptide 군(群)들의 혼합물(混合物)로 되어 있다. 3. Bacillus Subtilis K-27 균주(菌株)의 protease는 그 작용(作用) specificity가 Aspergillus soya 나 pepsin, chymotrypsin 및 trysin 보다 넓다.

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