• 제목/요약/키워드: Gln3

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Synthesis, Radiolabeling and Gastrin Releasing Peptide Receptor Binding Affinity of a Novel Bombesin Antagonist-Based Peptide, DOTA-Ala(SO3H)-Aminooctanoyl-Gln-Trp-Ala-Val-N methyl Gly-His-Statine-Leu-NH2

  • Lim, Jae Cheong;Choi, Sang Mu;Cho, Eun Ha;Kim, Jin Joo
    • 방사선산업학회지
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    • 제7권2_3호
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    • pp.127-134
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    • 2013
  • Bombesin receptors are overexpressed in many kinds of human tumors. In particular, the gastrin releasing peptide receptor (GRPR) which is also called bombesin receptor subtype 2, has been identified in prostate cancer. In the present study, we developed a bombesin antagonist-based $^{177}Lu$-labeled peptide, $^{177}Lu$-DOTA-$Ala(SO_3H)$-Aminooctanoyl-Gln-Trp-Ala-Val-N methyl Gly-His-Statine-Leu-$NH_2$ (DOTA-sBBNA). DOTA-sBBNA was prepared using a solid phase synthesis method. It was labeled with $^{177}Lu$ by a high radiolabeling yield (>98%), and its Log P value was -2.05. The radiolabeled peptide was highly stable in serum incubation at $37^{\circ}C$ for 48 hr. A competitive displacement of $^{125}I-[Tyr^4]$-Bombesin on the PC-3 human prostate carcinoma cells revealed that the $IC_{50}$ value of the peptide was 6.76 nM indicating a highly nanomolar binding affinity for GRPR. These results suggest that $^{177}Lu$-DOTA-sBBNA can be a potential candidate for targeting prostate cancer, and further studies to evaluate its biological characteristics are needed.

Novel Bombesin Analogues Conjugated with DOTA-Ala(SO3H)-4 aminobenzoic acid and DOTA-Lys(glucose)-4 aminobenzoic acid: Synthesis, Radiolabeling, and Gastrin Releasing Peptide Receptor Binding Affinity

  • Lim, Jae Cheong;Choi, Sang Mu;Cho, Eun Ha;Kim, Jin Joo
    • 방사선산업학회지
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    • 제7권2_3호
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    • pp.191-200
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    • 2013
  • In this study, a novel bombesin (BBN) analogues, DOTA-Ala($SO_3H$)-4 aminobenzoyl-Gln-Trp-Ala-Val-Gly-His-Leu-Met-$NH_2$ (DOTA-sBBN) and DOTA-Lys(glucose)-4 aminobenzoyl-Gln-Trp-Ala-Val-Gly-His-Leu-Met-$NH_2$ (DOTA-gluBBN), were synthesized and radiolabeled, and their binding affinities were evaluated. Peptides were prepared by a solid phase synthesis method and their purities were over 98%. DOTA is the chelating agent for $^{177}Lu$-labeling, and the DOTA-conjugated peptides were radiolabeled with $^{177}Lu$ by a high radiolabeling yield (>98%). The Log P values of DOTA-sBBN and DOTA-gluBBN were -2.20 and -2.79, respectively. 50.41% of $^{177}Lu$-DOTA-sBBN and 72.97% of $^{177}Lu$-DOTA-gluBBN were left undegraded by the serum incubation at $37^{\circ}C$ for 48 hr. A competitive displacement of $^{125}I-[Tyr^4]$-BBN on the PC-3 human prostate carcinoma cells revealed that 50% inhibitory concentration ($IC_{50}$) were 1.46 nM of DOTA-sBBN and 4.67 nM of DOTA-gluBBN indicating a highly nanomolar binding affinity for GRPR. Therefore, it is concluded that $^{177}Lu$-DOTA-sBBN and $^{177}Lu$-DOTA-gluBBN can be potential candidates as a targeting modality for the Gastrin-releasing peptide receptor (GRPR)-over-expressing tumors, and further studies to evaluate their biological and pharmacological characteristics are needed.

DNA Repair Gene Polymorphisms at XRCC1, XRCC3, XPD, and OGG1 Loci in the Hyderabad Population of India

  • Parine, Narasimha Reddy;Pathan, Akbar Ali Khan;Bobbarala, Varaprasad;Abduljaleel, Zainularifeen;Khan, Wajahatullah;Alanazi, Mohammed
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권12호
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    • pp.6469-6474
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    • 2012
  • Background: DNA repair is one of the crucial defense mechanism against mutagenic exposure. Inherited SNPs of DNA repair genes may contribute to variation in DNA repair capacity and susceptibility to cancer. Due to the presence of these variants, inter-individual and ethnic differences in DNA repair capacity have been established in various populations. India harbors enormous genetic and cultural diversity. Materials and Methods: In the present study we aimed to determine the genotypes and allele frequencies of XRCC1 Arg399Gln (rs25487), XRCC3 Thr241Met (rs861539), XPD Lys751Gln (rs13181), and OGG1 Ser326Cys (rs1052133) gene polymorphisms in 186 healthy individuals residing in the Hyderabad region of India and to compare them with HapMap and other populations. Results and Conclusions: The genotype and allele frequency distribution at the four DNA repair gene loci among Hyderabad population of India revealed a characteristic pattern. Comparison of these gene polymorphisms with other populations revealed a distinctiveness of Hyderabad population from the Deccan region of India. To the best of our knowledge, this is the first report of such DNA repair gene polymorphisms in the Deccan Indian population.

EPG5 유전자 변이가 확인된 Vici 증후군 1례 (Vici Syndrome with Novel Compound Heterozygous Mutations in EPG5)

  • 신제희;이현주;이영목
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.50-54
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    • 2020
  • Vici 증후군은 18q12.3 염색체에 위치하는 EPG5 유전자의 돌연변이로 인해 발생하는 상 염색체 열성 증후군이다. EPG5 유전자는 리소좀 형성에 관여하는 자가 포식 경로의 중요한 조절자를 암호화하므로 이에 대한 돌연변이로 인해 다양한 임상증상을 나타나게 된다. 주요한 임상증상으로는 뇌량 무형성, 백색증, 백내장, 심근 병증, 중증 정신 운동 지체, 발작, 면역 결핍 등이 있으며 다양한 임상증상을 나타내는 만큼 다른 질환들과 임상적으로 구분하기가 어렵다. 저자들은 Vici 증후군으로 진단된 3세 남자 환아의 증례를 보고하고자 한다. 환아는 생후 2개월 경 근긴장 저하와 수유 곤란을 주소로 내원하였으며 이후 Vici 증후군에서 나타나는 특징적인 임상 증상들을 나타내었다. 임상증상들의 감별 진단을 위해 시행한 Whole-exome sequencing (WES) 결과, EPG5 유전자에서 c.2254 C>T (p.Gln752Ter)와 c.5511-5518+2 del TATGCAAAGT 새로운 변이가 이형접합체로 확인되었다. Vici 증후군과 같이 임상적으로 구분이 어려우며 다양한 신체기관에 걸쳐 영향을 미치는 질환의 진단 시에는 Whole-exome sequencing (WES)가 유용하게 사용될 수 있다. 이 증례는 한국에서 확인된 첫 Vici 증후군 case로써 의의가 있다.

콩나물의 Asparagine 생합성(生合成)에 관(關)한 연구(硏究) (Asparagine Biosynthesis in Soybean Sprouts)

  • 변시명;허남응;이춘영
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제20권1호
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    • pp.33-42
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    • 1977
  • 콩나물에 많이 존재하는 Asn의 생합성(生合成)에 관하여 연구하고자 콩나물 생육기간중(生育其間中) 수분함량(水分含量) 및 Asn 함량을 조사한 결과 10일째 수분(水分)은 $85{\sim}90%$에 달했으며 Asn은 6일째부터 급격히 증가하여 10일째는 건물량(乾物量)의 22.7%에 달하였다. 콩나물 100 g에서 Asn을 추출(抽出)한 결과 2.29g을 얻었고 재결정하여 1.62 g을 얻었다. 콩나물 생육시(生育時) $NH_4Cl,\;(NH_4)_2SO_4$ 및 urea를 살포하여 질소화합물에 대한 영향을 고찰하였던 바 $NH_4Cl$$(NH_4)_2SO_4$구(區)는 Asn이 control보다 약간 증가하였으나 urea구(區)는 10일째 29.5%로 증가하였다. 콩나물에서 asparagine synthetase를 $(NH_4)_2SO_4$ fractionion 및 Sephadex G-150에 의해 정제하여 8.6배 정제하였다. 이 효소는 매우 불안정(不安定)하였으나 glycerol, mercaptoethanol 및 기질(基質)인 ATP, $Mg^{++}$이온에 의해 보호를 받았으며 이 산소(酸素)에 의해 최고(最高)의 Asn이 생성(生成)되는 ATP, Gln(또는 ${NH_4}^+$)의 농도는 표준반응 용액에서 각각의 구성농도를 변화시키면서 측정하였을 때 ATP 10 mM, ${NH_4}^+$는 50 mM, Gln은 10 mM이었다. $Mg^{++}$이온 대신 $Mn^{++}$, $Zn^{++}$, 및 $Fe^{++}$로 대치할수 없었으며 Asp에 대한 Km값은 3.1 mM이었고 효소작용의 최적(最適) pH는 7.5이었다. Amide donor로서 $NH_2OH$로 대치한 결과 ${\beta}-aspartyl$ hydroxamate가 생성(生成)되어, 효소의 열불안성(熱不安性), amide donor로서 Gln 이용 및 SH기(基)에 의한 효소안정성을 비추어 보아, 같은 두과식물(荳科植物)인 완두와 비슷하게 asparagine synthetase는 ${\beta}-aspartyl$ adenylate의 중간반응(中間反應)을 거치는 기작(機作)에 의해 Asn을 생합성(生合成)하는 것을 알았다.

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대장균에서 Bacillus subtilis glutamyl-tRNA synthetase의 과발현 및 정제 (Overexpression and Purification of Bacillus subtilis Glutamyl-tRNA Synthetase in Escherichia coli)

  • 오종신;윤장호;홍광원
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제45권4호
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    • pp.190-194
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    • 2002
  • Bacillus subtilis의 glutamyl-tRNA synthetase(GluRS)는 대장균에서 발현될 때 숙주세포의 $tRNA_1^{Gln}$에 glutamate를 잘못 아실화하여 독성을 나타내는 것으로 추정되고 있다. 이러한 B. subtilis GluRS를 대장균에서 과발현 시키기 위하여 B. subtilis 168 균주의 chromosomal DNA에서 GluRS의 유전자(gltX)를 PCR을 이용하여 증폭하고 T7 promoter에 의해 발현이 조절되는 pET11a expression vector에 클로닝하였다. 이 재조합된 pEBER plasmid DNA로 T7 RNA polymerase를 갖는 대장균 NovaBlue(DE3)에 형질전환하였다. 형질전환된 대장균에 IPTG를 처리하여 과량 생성된 GluRS 단백질은 ammonium sulfate 분별침전 후 EPLC를 이용한 Source Q column anion exchange chromatography, Superdex 200 column gel filtration, Mono Q column anion exchange chromatography로 정제하였다. 정제된 B. subtilis의 GluRS 분자량은 약 55 kDa이었으며 효소의 활성도는 조효소액에 비해 18배로 증가하였다.

인체 뇌 대사물질에서의 In vitro 2D-COSY와 2D-NOESY 스펙트럼 분석 평가 (Evaluations of Spectral Analysis of in vitro 2D-COSY and 2D-NOESY on Human Brain Metabolites)

  • 최보영;우동철;김상영;최치봉;이성임;김은희;홍관수;전영호;정재준;김상수;임향숙
    • Investigative Magnetic Resonance Imaging
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    • 제12권1호
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    • pp.8-19
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    • 2008
  • 목적 : 본 연구에서는 인체 뇌 대사물질에 대하여 2D MR 기술인 correlation spectroscopy (COSY) 와 nuclear Overhauser effect/enhancement spectroscopy (NOESY)를 직접 적용하고, 데이터를 획득하여 인체 뇌대사물질들간의 스칼라 짝지움 (coupling)과 쌍극자 (dipolar) 상호작용- NOE에 대한 분석을 통하여 결합연결관계 및 공간연결관계에 대한 정보를 획득하고자 하였다. 대상 및 방법 : 모든 2-D (dimensional) MR 실험 (즉, COSY와 NOESY)은 z축 능동차폐 펄스경사자장, 삼중공명 동결탐침기가 장착된 Bruker Avance 500 (11.8 T) 장비에서 298 K에 수행되었다. MRS상에서 뇌 대사물질과 유사하도록만든 희석액을 만들었고, 최종 MRS 샘플은 10% $D_2O$를 이용하였다. 2-D 스펙트라는 2048 복합 (complex) 데이터 포인트로서 총 320개 의 free induction decay (FID)를 평균화 (averaging)하였고, $H_2O$에서 얻어진 스펙트라는 8012 Hz 였다. 반복지연 (repetition delay) 시간은 2초, 각각의 FID는 4개의 평균화를 선택하였다. 얻어진 2D-COSY, 2D-NOESY 데이터는 Top Spin 2.0 소프트웨어에서 후 처리기법 (post-processing)에 의해 분석되었다. 분석 대상 대사물질은 N-acetyl aspartate (NAA), creatine (Cr), choline (Cho), glutamine (Gln), glutamate (Glu), myo-inositol (Ins), lactate (Lac)로서 총 7 가지 화학물로서 주요 목표 피크로 정했다. 결과 : 인체 뇌 대사물질에 대한 대칭형태의 2D-COSY와 2D-NOESY 스펙트럼을 획득하였고, COSY 스펙트럼상에서는 오직 1.0-4.5 ppm 사이에서만 교차피크들이 생성된 반면 NOESY 스펙트럼상에서는 1.0-4.5 ppm 외에도 7.9 ppm에서 공명 교차피크를 발견할 수 있었다. COSY 스펙트럼을 통하여 lactate에서 메틸 프로톤과 CH 프로톤의 COSY 크로스피크가 발견되었고, NAA에서 메틸렌 프로톤들간과 메틸렌 프로톤과 NH프로톤의 크로스피크가 발견되었고, Ins에서 CH 프로톤 들간의 크로스피크가 발견되었다. NOESY 스펙트럼을 통하여 NAA 분자내 NH 프로톤과 메틸 (-CH3) 프로톤과의 NOESY 크로스피크가 발견되었고, lactate에서 메틸 프로톤과 CH 프로톤과의 크로스피크가 발견되었고, Cr에서 메틸 프로톤과 메틸렌 프로톤과의 크로스피크가 발견되었고, Glu에서 메틸렌 프로톤 들간과 또한 메틸렌 프로톤과 CH 프로톤과의 크로스피크가 발견되었고, Gln에서 메틸렌 프로톤과 CH 프로톤과의 크로스피크가 발견되었고, Ins에서 CH 프로톤 들간의 크로스피크가 발견되었다. 결론 : 본 연구에서는 in vitro 상태의 인체 뇌 대사물질에 2D-COSY와 2D-NOESY 기술을 직접 적용하고, 결합연결관계 및 공간연결관계에 대한 정보를 성공적으로 획득하여 분석하여 보았다. 본 연구 결과물은 향후 인체 내 in vivo 2D-COSY를 이용한 뇌 대사물질 연구에 매우 유용하리라 사료된다.

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In Vitro Evolution of Lipase B from Candida antarctica Using Surface Display in Hansenula polymorpha

  • Kim, So-Young;Sohn, Jung-Hoon;Pyun, Yu-Ryang;Yang, In-Seok;Kim, Kyung-Hyun;Choi, Eui-Sung
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권8호
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    • pp.1308-1315
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    • 2007
  • Lipase B from Candida antarctica (CalB) displayed on the cell surface of H. polymorpha has been functionally improved for catalytic activity by molecular evolution. CalB was displayed on the cell surface by fusing to a cell-wall anchor motif (CwpF). A library of CalB mutants was constructed by in vivo recombination in H. polymorpha. Several mutants with increased whole-cell CalB activity were acquired from screening seven thousand transformants. The two independent mutants CalB 10 and CalB 14 showed an approximately 5 times greater whole-cell activity than the wild-type. When these mutants were made as a soluble form, CalB 10 showed 6 times greater activity and CalB 14 showed an 11 times greater activity compared with the wild-type. Sequence analyses of mutant CALB genes revealed amino acid substitutions of $Leu^{278}Pro$ in CalB10 and $Leu^{278}Pro/Leu^{219}Gln$ in CalB14. The substituted $Pro^{278}$ in both mutants was located near the proline site of the ${\alpha}$10 helix. This mutation was assumed to induce a conformational change in the ${\alpha}$10 helix and increased the $k_{cat}$ value of mutant CalB approximately 6 times. Site-directed mutagenized CalB, LQ ($Leu^{219}Gln$) was secreted into the culture supernatant at an amount of approximately 3 times more without an increase in the CalB transcript level, compared with the wild-type.

Purification and Characterization of Substance P-related Peptide from the Body of the African Lungfish, Protopterus dolloi

  • Kim, Chan-Hee;Kim, Eun-Jung;Go, Hye-Jin;Lee, Hyung-Ho;Hong, Yong-Ki;Kim, Hyung-Rak;Chung, Joon-Ki;Park, Jang-Su;Muneoka, Yojiro;Park, Nam-Gyu
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제27권7호
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    • pp.1015-1019
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    • 2006
  • The peptide with structural similarity to mammalian substance P (M-SP) has been isolated from extract of the body of the African lungfish, Protopterus dolloi, using the rectum of the newt as the bioassay system. The primary structure of the SP-related peptide was identified as Lys-Pro-Arg-Pro-Asp-Gln-Phe-Tyr-Gly-Leu-Met-NH2 (L-SP) and contained four substitutions ($Lys^{1}\rightarrow $ Arg, $Arg^{3}\rightarrow$ Lys, $Asp^{5}\rightarrow$ Gln, and $Tyr^{8}\rightarrow$ Phe) compared with M-SP; this structure is identical to that of the peptide isolated from the gut of the Australian lungfish. Circular dichroism spectra showed that L-SP had an unordered structure in the buffer solution and phospholipid bilayers. This peptide was found to have an excitatory effect on rectal muscle tissues of newt, quail, and fish. L-SP also had a more potent vasodilatory effect on the guinea-pig aorta than that of M-SP. The identification of the peptide provides evidence that SP family, hitherto confined to mammals, have a widespread occurrence in lungfish.

Novel Compound Heterozygote Mutations of the SLC25A13 Gene in an Infant with Neonatal-onset Type II Citrullinemia Detected by Newborn Mass Screening

  • Lim, Ho-Seop;Kim, Ho;Kim, Sung-Shin;Kim, Gu-Hwan;Yoo, Han-Wook;Shin, Young-Lim
    • Neonatal Medicine
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    • 제18권2호
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    • pp.370-373
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    • 2011
  • Citrin deficiency는 염색체 7q21.3의 SLC25A13 유전자 돌연변이에 의해 발생하는 상염색체 열성질환으로 neonatal-onset type II citrullinemia (CTLN2) 및 adult-onset CTLN2로 분류된다. 생후 16일된 여아가 신생아 대사 검사에서 citrullinemia (CTLN)가 의심되었고 혈중 아미노산 분석에서 CTLN 및 고암모니아혈증을 보였고, SLC25A13 유전자 분석 결과 c.221C>T in exon4 and c.1645C in exon16 (p.[Ser74Phe]+[Gln549X]) 의 새로운 돌연변이가 발견되어 neonatal-onset CTLN2로 진단되었다. 저자들은 신생아 대사 검사에서 citrullinemia를 보이는 영아들에서 확진을 위한 유전자 검사 및 혈중 아미노산 분석이 필요하다고 생각한다.