Background: Many studies have investigated the association between glutathione S-transferase T 1 (GSTT1) null genotype and risk of prostate cancer, but the impact of GSTT1 null genotype in Asians is still unclear owing to inconsistencies across results. Thie present meta-analysis aimed to quantify the strength of the association between GSTT1 null genotype and risk of prostate cancer. Methods: We searched the PubMed, Embase and Wangfang databases for studies of associations between the GSTT1 null genotype and risk of prostate cancer in Asians and estimated summary odds ratio (OR) with their 95% confidence interval (95% CI). Results: A total of 11 case-control studies with 3,118 subjects were included in this meta-analysis, which showed the GSTT1 null genotype to be significantly associated with increased risk of prostate cancer in Asians (random-effects OR = 1.49, 95% CI 1.15-1.92, P = 0.002), also after adjustment for heterogeneity (fixed-effects OR = 1.45, 95% CI 1.23-1.70, P < 0.001). No evidence of publication bias was observed. Conclusions: This meta-analysis of available data suggested the GSTT1 null genotype does contribute to increased risk of prostate cancer in Asians.
Background: Many studies have focused on possible associations between the glutathione S-transferase M 1 (GSTM1) null genotype and risk of renal cell carcinoma (RCC), but the impact remains unclear owing to obvious inconsistencies among the findings. The present study aimed to quantify the strength of any association in a meta-analysis. Methods: We searched the PubMed, Embase and CBM databases for studies concerning the association between the GSTM1 null genotype and risk of RCC. We estimated the summary odds ratio (OR) with its 95% confidence intervals (95% CI) to assess the association. Results: The meta-analysis showed the GSTM1 null genotype was not associated with risk of RCC overall (OR = 1.04, 95% CI 0.92-1.18, P = 0.501). For Caucasians, the GSTM1 null genotype was also not associated with risk of RCC (OR=1.02, 95% CI 0.90-1.16, P = 0.761). The cumulative meta-analyses showed a trend of no obvious association between GSTM1 null genotype and risk of RCC as information accumulated. Sensitivity analyses by omitting those studies also did not materially alter the overall combined ORs. No evidence of publication bias was observed. Conclusion: Meta-analyses of available data show that the GSTM1 null genotype is not significantly associated with risk of renal cell carcinoma.
Background: Chronic hepatitis B virus (HBV) infection related hepatocellular carcinoma (HCC) is a major health problem in the Asia-Pacific region including Thailand. Several factors have been proposed as contributing to hepatocarcinogenesis. This study was aimed to investigate the impact of CYP2C19 genotypic polymorphism in HCC related to chronic HBV infection in Thailand. Materials and Methods: A cross-sectional study was performed between April 2014 and January 2015. Chronic HBV patients with HCC (n=50) and without HCC (n=50) were included. Clinical information and blood samples of all patients were collected. The CYP2C19 genotype was determined by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method, and was classified as rapid metabolizer (RM), intermediate metabolizer (IM) or poor metabolizer (PM). Results: The CYP2C19 genotype frequencies of RM, IM and PM in HBV patients were found to be 19/50 (38%), 25/50 (50%) and 6/50 (12%), respectively. The CYP2C19 genotype frequencies of RM, IM and PM in HBV with HCC patients were 21/50 (42%), 25/50 (50%) and 4/50 (8%), respectively. The distribution of CYP2C19 genotype was not different between patients with and without HCC. Interestingly, among HBV with HCC patients, the RM genotype of CYP2C19 tended to increase risk of aggressive manifestation (OR=2.89, 95%CI=0.76-11.25, P-value=0.07), compared with non RM genotype carriers. Conclusions: CYP2C19 genotype IM was the most common genotype in Thai patients with chronic HBV infection. In addition, genotype RM could be an associated factor for aggressive presentation in HCC related to chronic HBV infection.
Oxidative stress leads to the induction of cellular oxidative damage, which may cause adverse modifications of DNA, proteins, and lipids. The production of reactive species during oxidative stress contributes to the pathogenesis of many diseases. Antioxidant defenses can neutralize reactive oxygen species and protect against oxidative damage. The aim of this study was to assess the antioxidant status and the degree of DNA damage in Korean young adults using glutathione s-transferase (GST) polymorphisms. The GSTM1 and GSTT1 genotypes were characterized in 245 healthy young adults by smoking status, and their oxidative DNA damage in lymphocytes and antioxidant status were assessed by GST genotype. General characteristics were investigated by simple questionnaire. From the blood of the subjects, GST genotypes; degree of DNA damage in lymphocytes; the erythrocyte activities of superoxide dismutase, catalase, and glutathione peroxidase; plasma concentrations of total peroxyl radical-trapping potential (TRAP), vitamin C, ${\alpha}$- and ${\gamma}$-tocopherol, ${\alpha}$- and ${\beta}$-carotene and cryptoxanthin, as well as plasma lipid profiles, conjugated diene (CD), GOT, and GPT were analyzed. Of the 245 subjects studied, 23.2% were GSTM1 wild genotypes and 33.4% were GSTT1 wild genotype. No difference in erythrocyte activities of superoxide dismutase, catalase, or glutathione peroxidase, and the plasma TRAP level, CD, GOT, and GPT levels were observed between smokers and non-smokers categorized by GSTM1 or GSTT1 genotype. Plasma levels of ${\alpha}$- and ${\gamma}$-tocopherol increased significantly in smokers with the GSTT1 wild genotype (p < 0.05); however, plasma level of ${\alpha}$-carotene decreased significantly in non-smokers with the GSTM1 wild genotype (p < 0.05). DNA damage assessed by the Comet assay was significantly higher in non-smokers with the GSTM1 genotype; whereas DNA damage was significantly lower in non-smokers with the GSTT1 genotype. Total cholesterol and LDL cholesterol levels were significantly higher in non-smokers with the GSTT1 genotype than those with the GSTT1 wild genotype (p < 0.05). In conclusion, the GSTM1 genotype or the GSTT1 wild genotype in non-smokers aggravated their antioxidant status through DNA damage of lymphocytes; however, the GSTT1 wild type in non-smokers had normal plasma total cholesterol and LDL-cholesterol levels. This finding confirms that GST polymorphisms could be an important determinant of antioxidant status and plasma lipid profiles in non-smoking young adults. Further study is necessary to clarify the antioxidant status and/or lipid profiles of smokers with the GST polymorphism and to conduct a study with significantly more subjects.
Jang, Gwang Il;Kim, Bo Sung;Oh, Yun Kyeong;Hwang, Jee Youn;Kwon, Mun Gyeong;Kim, Sumi
Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
/
v.54
no.5
/
pp.698-702
/
2021
Yellow head virus (YHV) is a rod-shaped positive-sense single-stranded RNA virus, classified into the genus Okavirus, family Roniviridae, and order Nidovirales. In this study, 200 fleshy prawns (Fenneropenaeus chinensis) collected from the vicinity of Narodo in Goheung-gun, Korea, were screened for the presence of yellow head complex viruses and related genotype such as YHV genotype 8. The detection rate of YHV genotype 8 among the 200 fleshy prawns, determined using nested RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reation), was 39.0%. Phylogenetic analysis of the ORF1b gene of YHV showed that eight distinct genetic lineages were detected. The four strains of YHV genotype 8 obtained in this study formed a robust clade with the YHV genotype 8 group that was first isolated from fleshy prawns in China suspected to have acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND).
Park, Mi Seon;Yang, Young-Mo;Park, Ki Hyun;Yoon, Hyonok;Kim, Ju Sin;Choi, Eun Joo
Korean Journal of Clinical Pharmacy
/
v.32
no.3
/
pp.191-203
/
2022
Background: Direct-acting antivirals are recommended for the treatment of chronic hepatitis C virus in Korea. However, evaluation of direct-acting antiviral regimens in a real-world setting is limited. The aims of this study were to investigate the effectiveness and safety of direct-acting antiviral treatment in Korean patients infected with chronic hepatitis C virus genotype 1b or 2 at a tertiary care hospital. Methods: This was a retrospective study conducted with patient data obtained between August 2015 and August 2019 at Jeonbuk National University Hospital. The primary effectiveness endpoint was sustained virological response 12 weeks post-treatment (SVR12) via intention-to-treat (ITT) and modified intention-to-treat (mITT) analyses. Results: Of the 270 patients, 47.0% were infected with genotype 1b and 53.0% with genotype 2. ITT analysis revealed that SVR12 was achieved in 78.9% of all patients, 77.2% in genotype 1b patients, and 80.4% in genotype 2 patients. Of the 21.1% of all patients who did not achieve SVR12, the majority of treatment failures were non-virologic failures (19.7%). mITT analysis revealed that SVR12 was achieved in 98.2% of all patients, 98.0% in genotype 1b patients, and 98.3% in genotype 2 patients. Almost half of all patients experienced one or more adverse events (43.3%), leading to 2.6% discontinuing scheduled treatment. The most common adverse event was anemia. Conclusions: Direct-acting antiviral-based treatment regimens showed high effectiveness and safety. Non-virological factors, such as premature treatment discontinuation due to adverse events or loss of follow-up, were the major disruptors in achieving SVR12.
Plasma fibrinogen is risk factor of vascular disease including stroke, ischemic heart disease, atherosclerosis and thrombosis. Many studies have confirmed that high plasma fibrinogen levels are related with age, obesity, cholesterol, alcohol consumption, and genotype. This study was carried out to investigate the effect of fibrinogen genotype and other characteristics on the plasma fibrinogen levels in the elderly Koreans. For this study the blood samples were collected from 178 healthy elderly Koreans (102 males and 76 females, $55{\sim}80$ year olds). The blood samples were analyzed by smoking status, cholesterol levels, genotype, age, exercise, drinking, and gender. The plasma fibrinogen was assayed by clotting method, cholesterol being assayed by cholesterol oxidase method. The $\beta$-fibrinogen genotype was detected by PCR of relevant region and digestion with Alu I. The alleres with the restriction site and the non cleavable alleres were designated $A_1$ and $A_2$. In conclusion, genotype $A_1A_2$ and exercise are increased and associated with plasma fibrinogen levels. But, there were no significant differences by smoking, gender, age, drinking and cholesterol.
The rhizobacterium NJ134, showing strong $in$$vitro$ antifungal activity against $Fusarium$$oxysporum$, was isolated from field grown tomato plants and identified as $Pseudomonas$ sp. based on 16S ribosomal DNA sequence and biochemical analyses. The antifungal compound purified by gas chromatography-mass spectrometry, infrared, and nuclear magnetic resonance analyses from NJ134 cultures was polyketide 2,4-diacetylphloroglucinol (DAPG). Analysis of the sequence of part of one of the genes associated with DAPG synthesis, $phlD$, indicated that the DAPG producer NJ134 was a novel genotype or variant of existing genotype termed O that have been categorized based on isolates from Europe and North America. A greenhouse study indicated that about $10^8$ CFU/g of soil NJ134 culture application was required for effective biocontrol of Fusarium wilt in tomato. These results suggest that a new variant genotype of a DAPG-producing strain of $Pseudomonas$ has the potential to control Fusarium wilt under the low disease pressure conditions.
Tall fescue (Schedonorus phoenix Scop.) is resistant to abiotic and biotic stresses through a symbiotic relationship with Neotyphodium coenophialum. However, this endophyte has been considered detrimental since it produces toxic alkaloids to animals. It is vital to understand mutuality between these two to maximize positive impact of the endophyte on agri-ecosystem. Little research has been conducted on endophyte transmission mechanism in planta. To provide basic information related to endophyte transmission, an experiment was conducted to examine the effect of endophyte genotype and water stress on endophyte transmission by imposing soil moisture deficits at different stages of panicle development. There was water stress effect on endophyte frequency but not on concentration, whereas endophyte genotype significantly influenced endophyte concentration in pseudostem of tall fescue at boot stage. Reproductive tillers showed greater endophyte frequency and concentration. Endophyte frequency in florets or seeds depended on position within panicle. There was no drought effect on endophyte concentration, but showed the effect of endophyte genotype on endophyte concentration in florets and seeds. Overall endophyte concentration in seeds was higher. From this study, we may conclude that although water stress reduced endophyte frequency in vegetative tiller, water stress does not have effect on endophyte transmission, suggesting that drought is not an important factor controlling the endophyte transmission from plant to seed. Endophyte genotype and seed position in a panicle affected endophyte transmission, indicating that these two factors are involved in endophyte transmission and may determine seed transmission of endophyte in tall fescue.
Ahmad, Dilshad;Bakairy, Abdul Karieem;Katheri, Abdull Malika;Tamimi, Waleed
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.16
no.9
/
pp.4057-4060
/
2015
Cigarette smoke contains oxidants and free radicals which are carcinogens that can induce mutations in humans. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the most frequent genetic alterations found in the human genome. In the present study, we have examined the ability of the murine double minute 2 (Mdm2) (rs769412) A>G polymorphism in cigarette smokers to predict risk of cancers. Our results showed that of smokers, 87% were found with AA genotype, 10% with heterozygous AG genotype, and 3% with GG genotype. The heterozygous AG genotype was observed in a lower percentage of smokers (10%) as compared to non-smokers (18%), whereas, homozygous AA genotype was observed in lower percentage of non-smokers (81%) as compared to the smokers (87%). The results from present study support the association with an allele and AG genotype in non-smokers. However, further studies are required to establish the role of Mdm2 (rs769412) C>T in cigarettes smokers and diseases.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.