• 제목/요약/키워드: Genetic evaluation

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미농무성 NTEP(Nat'l Turfgrass Evaluation Program) 자료를 이용한 Creeping Bentgrass(Agrostis palustris Huds.) 품종의 특성 평가 (Evaluation of the Qualitative Characteristics of Creeping Bentgrass(Agrostis palustris Huds.) Cultivars Using NTEP Data)

  • 장덕환;주영규
    • 아시안잔디학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.1-7
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    • 2007
  • 미농무성 NTEP의 자료를 이용하여 한국 기후에 적합한 creeping bentgrass 품종의 특성을 평가하였다. 벤트그래스 품종들 중에서 'L-93' 품종이 전체 평균 잔디품종 평가에서 가장 우수하였다. 특히 발아세 및 여름철의 피복율이 가장 높게 나왔다. 질감의 경우엔 'Penn A-1'과 'Penn A-2'가 높게 나왔지만 겨울철 내한성이 다른 품종들에 비하여 상당히 낮게 나왔다. 대취의 축적량은 잎 밀도가 상대적으로 낮은 'Penncross'를 비롯하여 'Pennlinks', 'Crenshaw', 'L-93' 품종들은 적은 반면, 잎 밀도가 높은 'Penn A'와 'Penn G' 계통의 품종들이 많았다. 이끼의 침입에 대한 저항성 정도는 'Penn A' 계통이 높았고 'Penncross' 품종은 가장 낮게 나타났는데, 이런 경향을 보인 것은 잎의 밀도와 시각적 잔디품질, 대취 축적량, 이끼 저항성은 밀접한 관계가 있는 것으로 판단되었다. 회색 설부병에 저항성을 보인 것은 'Penn A' 계통의 품종들이었으며 브라운팻취 내병성은 'Penncross'와 'Penn A' 계통이 높았다. 피시움병에서는 'Penncross', 'Pennlinks'가 높게 나왔다. 달라 스팟의 경우 'L-93'이 가장 높게 나와서 이 병에 대한 강한 저항성을 보였으나 피시움병에 대한 내병성은 낮은 것으로 분석되었다. 따라서 각 골프코스에서는 지금까지 널리 알려진 'Penncross' 그린의 관리방식과 달리 골프코스에 식재된 bentgrass의 품종에 잔디관리 방식을 적용하여야 할 것으로 판단된다.

구강 악안면 영역의 암종 진단에 있어서 $[^{18}F]$-Fluorodeoxyglucose를 이용한 양전자방출 단층촬영의 임상적 연구 (CLINICAL STUDY OF POSITRON EMISSION TOMOGRAPHY WITH $[^{18}F]$-FLUORODEOXYGLUCOSE IN MAXILLOFACIAL TUMOR DIAGNOSIS)

  • 김재환;김경욱;김용각
    • Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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    • 제26권5호
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    • pp.462-469
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    • 2000
  • Positron Emission Tomography(PET) is a new diagnostic method that can create functional images of the distribution of positron emitting radionuclides, which when administered intravenously in the body, makes possible anatomical and functional analysis by quantity of biochemical and physiological process. After genetic and biochemical changes in initial stage, malignant tumor undergoes functional changes before undergoing anatomical changes. So, early diagnosis of malignant tumors by functional analysis with PET can be achieved, replacing traditional anatomical analysis, such as computed tomography(CT) and magnetic resonance image(MRI), etc. Similarly, PET can identify malignant tumor without confusion with scar and fibrosis in follow up check. In the Korea Cancer Center Hospital(KCCH) from October 1997 to September 1999, clinical study was performed in 79 cases that underwent 89 times PET evaluation with [18F]-Fluorodeoxyglucose for diagnosis of oral and maxillofacial tumors, and the data was analysed by Bayesian $2{\times}2$ Classification Table. The results were as follows : Evaluation for initial diagnosis with FDG-PET (P<0.005) 1. Agreement rate or accuracy rate is 88.9%. 2. Sensitivity is 95.2%, and specificity 66.7%. 3. Positive predictive rate is 90.9%, and negative predictive rate 80.0%. 4. In consideration of tumor stage, diagnostic rate in less than stage II was 90% and in greater than stage III 100%. 5. In consideration of tumor size, diagnostic rate in less than T2 was 92.3% and in greater than T3 100%. After primary treatment, evaluation for follow up check with FDG-PET (P < 0.001) 1. Agreement rate or accuracy rate is 85.4%. 2. Sensitivity is 87.5%, and specificity 82.4%. 3. Positive predictive rate is 87.5%, and negative predictive rate 82.4%. 4. In 24 recurred cases, 6 had distant metastasis, and 5 of them were diagnosed with FDG-PET, resulting in diagnostic rate of FDG-PET of 83.3%. From the above results, Positron Emission Tomography with [18F]- Fluorodeoxyglucose appears to be more sensitive and accurate for detecting the presence of oral and maxillofacial tumors, and has various clinical applications such as early diagnosis of tumor in initial and follow up check and detection of distant metastasis.

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구강 편평세포암종에서 p53 단백과 Cyclin D1발현에 대한 면역조직화학적 연구 (THE IMMUNOHISTOCHEMICAL STUDY ON THE EXPRESSION OF p53 PROTEIN AND CYCLIN D1 IN ORAL SQUAMOUS CELL CARCINOMAS)

  • 김종엽;김경욱;이재훈;김창진
    • Maxillofacial Plastic and Reconstructive Surgery
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    • 제21권2호
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    • pp.139-148
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    • 1999
  • Oral cancer is a common neoplasm in humans and etiologic mechanism is not well known, so treatment and evaluation of oral cancer is difficult problem. Traditional TNM classification between prognosis of tumors and classification of histopathologic differentiation has problem like lack of objectivity through operators. In molecular biology, cancer is developed by alteration of activation of oncogene and/or inactivation of tumor suppressor gene. The p53 gene, one of the tumor suppresor genes, is believed to play an important role through mutation and overexpression in the progression of human cancers. The p53 mutation is most frequent genetic disorder in humans. The Cyclin D1 has tumor suppresion activity by regulation of cell cycle. The Cyclin D1 regulate activity of Rb tumor suppresor gene by stimulation of CDK4 The purpose of this study was to observe the expression of p53 protein and Cyclin D1 in oral squamous cell carcinoma, and to get expectation of the malignancy and prognosis of oral squamous cell carcinoma. Using the 15 cases of squamous cell carcinoma and the microscopic H&E and immunohistochemical stain. We divided it into 3 groups according to the stain extent, clinical stage and histologic differentiation. The results were as follows1.In the features of immunohistochemical stain of 15 cases of squamous cell carcinoma, positive reaction of p53 was identified in 8 cases (53.3%) and positive reaction of cyclin D1 was identified in 3 cases (20%). Both positive reaction of p53 protein and Cyclin D1 was show in only one case. 2.8 of p53 positive cases were linked in 87.5% of the end stage tumor, 62.5% of neck node involvement, 87.5% of poorly and moderately histopathplogic differentiation. 3. All 3 of Cyclin D1 positive cases were linked in the end stage tumor, neck node involvement, poorly and moderately histopathologic differentiation. From above results, expression of p53 protein was identified in 53.3% of 15 cases and these results mean oral squamous cell carcinoma was drived by mutation of p53 protein. Especially, highly positive reaction of p53 protein and Cyclin D1 was identified in cases that involvement of neck lymph node and the end stage tumors and it means that the evaluation of p53 protein and Cyclin D1 was useful for evaluation of malignant tumor as specific tumor marker.

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Genomic selection through single-step genomic best linear unbiased prediction improves the accuracy of evaluation in Hanwoo cattle

  • Park, Mi Na;Alam, Mahboob;Kim, Sidong;Park, Byoungho;Lee, Seung Hwan;Lee, Sung Soo
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권10호
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    • pp.1544-1557
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    • 2020
  • Objective: Genomic selection (GS) is becoming popular in animals' genetic development. We, therefore, investigated the single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP) as tool for GS, and compared its efficacy with the traditional pedigree BLUP (pedBLUP) method. Methods: A total of 9,952 males born between 1997 and 2018 under Hanwoo proven-bull selection program was studied. We analyzed body weight at 12 months and carcass weight (kg), backfat thickness, eye muscle area, and marbling score traits. About 7,387 bulls were genotyped using Illumina 50K BeadChip Arrays. Multiple-trait animal model analyses were performed using BLUPF90 software programs. Breeding value accuracy was calculated using two methods: i) Pearson's correlation of genomic estimated breeding value (GEBV) with EBV of all animals (rM1) and ii) correlation using inverse of coefficient matrix from the mixed-model equations (rM2). Then, we compared these accuracies by overall population, info-type (PHEN, phenotyped-only; GEN, genotyped-only; and PH+GEN, phenotyped and genotyped), and bull-types (YBULL, young male calves; CBULL, young candidate bulls; and PBULL, proven bulls). Results: The rM1 estimates in the study were between 0.90 and 0.96 among five traits. The rM1 estimates varied slightly by population and info-type, but noticeably by bull-type for traits. Generally average rM2 estimates were much smaller than rM1 (pedBLUP, 0.40 to0.44; ssGBLUP, 0.41 to 0.45) at population level. However, rM2 from both BLUP models varied noticeably across info-types and bull-types. The ssGBLUP estimates of rM2 in PHEN, GEN, and PH+ GEN ranged between 0.51 and 0.63, 0.66 and 0.70, and 0.68 and 0.73, respectively. In YBULL, CBULL, and PBULL, the rM2 estimates ranged between 0.54 and 0.57, 0.55 and 0.62, and 0.70 and 0.74, respectively. The pedBLUP based rM2 estimates were also relatively lower than ssGBLUP estimates. At the population level, we found an increase in accuracy by 2.0% to 4.5% among traits. Traits in PHEN were least influenced by ssGBLUP (0% to 2.0%), whereas the highest positive changes were in GEN (8.1% to 10.7%). PH+GEN also showed 6.5% to 8.5% increase in accuracy by ssGBLUP. However, the highest improvements were found in bull-types (YBULL, 21% to 35.7%; CBULL, 3.3% to 9.3%; PBULL, 2.8% to 6.1%). Conclusion: A noticeable improvement by ssGBLUP was observed in this study. Findings of differential responses to ssGBLUP by various bulls could assist in better selection decision making as well. We, therefore, suggest that ssGBLUP could be used for GS in Hanwoo proven-bull evaluation program.

말에서 Dopamine Receptor D4 유전자의 변이 특성 분석 (Characterization of Dopamine Receptor D4 Gene Polymorphisms in Horses)

  • 최재영;최연주;이종안;신상민;윤민중;강용준;신문철;유지현;김현아;조인철;양병철;김남영
    • 생명과학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.29-35
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    • 2022
  • 본 연구는 여러 말 품종에서 Dopamine Receptor D4 (DRD4)의 유전적 다형성 및 Jeju crossbred에서의 기질특성과의 연관성을 분석하였다. DRD4 유전자의 다형성은 인간을 포함한 다양한 포유동물에서 기질과 연관된 후보 유전자이다. 말의 DRD4의 엑손 3번 영역에 있는 SNP G292A는 Thoroughbred에서 호기심과 경계와 관련이 있는 것으로 보고 되었다. 세 가지 말 품종에서 DRD4 유전자 내 존재하는 변이들의 다형성을 확인하기 위해 Sanger sequencing을 활용하였다. 제주마에서 각각의 빈도는 타 품종과 큰 차이를 보였다. 말의 품성 평가는 Jeju crossbred를 이용하여 수행하였으며, 기질 평가와 접촉 평가를 활용하여 각각 5개 항목과 2개 항목을 점수화 하였다. 품성 평가 결과 각 항목 간의 높은 상관관계를 확인하였다. 말의 DRD4 유전자 내 변이와 품성 평가 결과를 비교한 결과 대립유전자 A를 가지고 있을 때 기질 평가 5개 항목에서 모두 점수가 낮은 경향을 보이는 것을 확인하였으나 유의성은 없었다. Jeju crossbred의 G292A의 SNP과 혈액 내 도파민 수치를 비교한 결과 GA형이 GG형보다 약 2.87배 높은 결과를 확인하였다. 이번 연구를 통하여 DRD4 유전자 다형성과 말의 기질을 평가하기 위한 여러 평가 방법 및 신경전달물질과의 연관성을 확인할 수 있었다. 추가적인 연구를 통하여 품성 평가를 위한 유전자 마커로서 활용 가능할 것으로 사료된다.

증가된 글루타민에 의해 초래되는 뇌신경질환의 초파리 모델에 대한 연구 (Expression of Expanded Polyglutamine Disease Proteins in Drosophila (Drosophila Polyglutamine Disease Models))

  • 신상민;백경훈;진동규
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제48권4호
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    • pp.425-432
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    • 2005
  • 목 적 : 폴리글루타민 질환은 해당 발현단백질의 연속되는 글루타민 아미노산 서열이 신장되기 때문에 일어나는 질환군이다. 현 연구는 폴리글루타민 질환 형질전환 초파리 모델들이 환자들 에서와 유사한 장애를 나타내는지 확인하기 위해 수행되었다. 방 법 : 폴리글루타민 질환 (SCA3) 형질전환 초파리를 대상으로 벽을 기어오르는 운동 능력을 검사하였다. 또한 유전학적인 방법을 통해서 아폽토시스를 억제하는 bcl-2 유전자와 화학적 샤페론이 뇌신경의 퇴행에 어떤 영향을 미치는지 확인하였으며 향후의 연구를 위해 척수소뇌 운동실조증 타입 2 (SCA2) 질환을 발현하는 형질전환 초파리를 생산하였다. 결 과 : SCA3 형질전환 초파리에서 신장된 폴리글루타민 배열을 지니는 질환성 초파리의 경우 신경계에서 해당 단백질을 발현하였을 경우 전형적인 운동 능력 상실을 나타냈다. 아폽토시스를 억제하는 유전자인 bcl-2를 함께 발현했을 경우, 신장된 단백질의 유독한 영향을 약화시키지 못했지만, 화학적 샤페론인글리세롤의 경우 적어도 눈에서의 유독한 영향은 억제하는 것으로 보인다. 본 연구진에 의해 개발된 SCA2 형질전환 초파리의 경우 유해 단백질의 발현 정도가 낮아서 정확한 분석이 어려웠다. 결 론 : SCA3 형질전환 초파리는 환자들에서 발견되는 운동실조증을 보였다. 글리세롤과 같은 화학적 샤페론이 현재 치료가 전무한 이 종류의 질환군의 치료에 효과적일 것으로 사료된다.

Evaluation of mango saponin in broilers: effects on growth performance, carcass characteristics, meat quality and plasma biochemical indices

  • Zhang, Y.N.;Wang, J.;Qi, B.;Wu, S.G.;Chen, H.R.;Luo, H.Y.;Yin, D.J.;Lu, F.J.;Zhang, H.J.;Qi, G.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권8호
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    • pp.1143-1149
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    • 2017
  • Objective: The objective of the present study was to determine whether mango saponin (MS) could be used as a feed additive in broiler chicks by evaluating growth performance, carcass characteristics, meat quality, and plasma biochemical indices. Methods: A total of 216 1-d-old Arbor Acres male broiler chicks were randomly assigned into three dietary treatments supplemented with 0 (control), 0.14% (MS 0.14%), or 0.28% (MS 0.28%) MS. Each treatment had six replicates (cages) with 12 chicks each. The feeding trial lasted for six weeks. Results: Compared with the control, dietary supplemented with 0.14% or 0.28% MS increased average daily weight gain of chicks in the grower (22 to 42 d) and the whole (1 to 42 d) phases, and the final body weight of chicks on d 42 was higher in MS supplemented groups (p<0.05). Lower $L_{45min}{^{\star}}$ (lightness) and $L_{24h}{^{\star}}$ values, lower $b_{24h}{^{\star}}$ (yellowness) value, and higher $a_{45min}{^{\star}}$ (redness) and $a_{24h}{^{\star}}$ values of the breast muscle were observed in chicks fed with 0.28% MS on d 42 (p<0.05). The total antioxidant capacity in plasma increased in MS 0.14% group on d 21 (p<0.001). Lower contents of plasma total cholesterol and triglyceride were observed in chicks fed with 0.28% MS on d 21 and d 42, whereas the group supplemented with 0.14% MS only decreased plasma triglyceride content on d 21 (p<0.05). The glucose content in plasma decreased in MS 0.28% group on d 42 (p<0.001). Conclusion: Overall, MS could be used as a feed additive in broiler chicks, and the supplemental level of 0.28% MS in diet could improve growth performance, meat quality, and plasma lipid metabolism in broiler chicks.

고속철도차량 1차 구동장치에 대한 완전분해정비의 최적 주기 평가 (Evaluation of Optimal Time Between Overhaul Period of the First Driving Devices for High-Speed Railway Vehicle)

  • 정진태;김철수
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제16권12호
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    • pp.8700-8706
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    • 2015
  • 고속철도차량 동력대차의 1차 구동장치는 모터 감속기와 견인전동기로 구성한다. 모터 감속기와 견인전동기는 기계적으로 일체형 결합 구조이지만, 상이한 기술 요구사항으로 인하여 이들의 완전 분해정비 주기는 서로 다르다(모터 감속기의 완전 분해정비 주기: $1.8{\times}10^6km$, 견인전동기의 완전 분해정비 주기: $2.5{\times}10^6km$). 따라서 불필요한 정비 횟수를 감소하기 위하여 신뢰성 중심 유지보수 관점에서 최적의 완전 분해정비 주기의 산정이 중요하다. 본 연구에서는 실제 유지보수 정비이력으로부터 두 구성품들에 대한 고장 결함나무 분석을 수행하고 각 하부부품들의 치명도를 고려한 고장률을 각각 평가하였다. 두 구성품에 대한 최적의 동일한 완전분해 정비주기는 기존의 총 예방정비 비용을 감소하기 위하여 유전자 알고리즘으로 부터 얻었다. 이 알고리즘에서 각 개체를 구성하는 유전자는 최소 예방 정비주기이며, 이의 조합으로 구성된 세대별 개체의 적합도함수는 총 정비비용의 역수로 공식화하여 얻는다. 최소공배수에 의한 방법은 기존 대비 4%만 감소하지만, 유전자 알고리즘에 의한 최적의 동일 완전분해 정비주기는 225만km로서 기존 방법의 총비용과 비교하여 약 14% 감소하였다.

표준화 지수를 이용한 환경수목의 오존 내성 결정 (Determination of Ozone Tolerance on Environmental Tree Species Using Standard Index)

  • 한심희;김두현
    • 한국농림기상학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.3-12
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    • 2009
  • 수목의 오존 내성을 단기 노출 후 나타난 생리적 피해와 생화학적 반응들의 표준화 지수로 결정하였다. 모감주나무, 벽오동, 때죽나무, 물푸레나무, 백당나무를 150ppb 오존 노출 시킨 후, 광합성 특성, MDA 함량 및 항산화효소의 활성을 측정하여 피해지수는 광합성 파라미터와 MDA 함량 변화를 이용하여 계산하였으며, 내성지수는 항산화효소의 활성 변화를 측정하여 산출하였다. 순양자수율, 탄소고정효율, 광호흡속도는 오존 노출시간에 따라 감소하여, 스트레스 평가지표로 적당한 것으로 판단되었다. 항산화효소의 활성은 수종, 노출시간 및 효소 종류에 따라 다양한 결과를 보여 주었다. 모감주나무 SOD 활성은 오존 노출시간에 따라 증가하였고, 물푸레나무의 SOD 활성은 오존 노출 6 시간 후에 증가하였으며, 벽오동의 CAT 활성은 무처리보다 낮았다. 표준화 지수를 기초로 한 5개 수목의 오존 내성은 두 내성 수종(물푸레나무>모감주나무)과 세 민감성 수종(때죽나무>벽오동>백당나무)으로 구분되었다.

Evaluation of the Genetic Toxicity of Synthetic Chemicals (XI) - a Synthetic Sulfonylurea Herbicide, Pyrazosulfuron-ethyl-

  • Ryu, Jae-Chun;Kim, Eun-Young;Kim, Young-Seok;Yun, Hye-Jung
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.33-39
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    • 2004
  • To validate and to estimate the chemical hazard playa very important role to environment and human health. The detection of many synthetic chemicals including agrochemicals that may pose a genetic hazard in our environment is of great concern at present. Since these substances are not limited to the original products, and enter the environment, they have become widespread environmental pollutants, thus leading to a variety of chemicals that possibly threaten the public health. Pyrazosulfuron-ethyl [Ethyl-5-(4,6-dimethoxypyrimidin-2-ylcarbamoylsulfamoyl)-1-methylpyrazole-4-carboxylate, $C_{14}H_{18}N{6}O_{7}S,$ M.W. =414.39, CAS No. 93697-74-6], is one of well known rice herbicide belong in the sulfonyl urea group. To clarify the genotoxicity of this agrochemical, Ames bacterial reversion assay, in vitro chromosomal aberration assay with Chinese hamster lung (CHL) fibroblast and bone marrow micronucleus assay in mice were subjected. In Ames assay, although pyrazosulfuron-ethyl revealed cytotoxic at 5,000-140 $\mug/plate$ in Salmonella typhimurium TA100, no dose-dependent mutagenic potential in 4.4~70 $\mug/plate$ of S. typhimurium TA 98, TA 100, TA1535 and TA 1537 both in the absence and presence of S-9 metabolic activation system was observed. Using CHL fibroblasts, the 50% cell growth inhibition concentration $(IC_{50})$ of pyrazosulfuron-ethyl was determined as 1,243 $\mug/mL,$ and no chromosomal aberration was observed both in the absence and presence of S-9 mixture in the concentration range of 311-1,243 $\mug/mL.$ And also, in vivo micronucleus assay using mouse bone marrow, pyrazosulfuron-ethyl revealed no remarkable induction of MNPCE (micronucleated polychromatic erythrocytes/1000 polychromatic erythrocytes) in the dose range of 625-2,500 mg/kg body weight when administered orally. Consequently, Ames bacterial gene mutation with Salmonella typhimurium, in vitro chromosome aberration with mammalian cells and in vivo bone marrow micronucleus assay revealed no clastogenic potential of pyrazosulfuron-ethyl in this study.

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