• 제목/요약/키워드: Genetic evaluation

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Microsatellite marker 분석을 이용한 명태(Theragra chalcogramma) 5 집단의 유전적 다양성 및 유연관계 분석 (Genetic Diversity and Relationship of the Walleye Pollock, Theragra chalcogramma Based on Microsatellite Analysis)

  • 동춘매;강정하;변순규;박기영;박중연;공희정;안철민;김군도;김은미
    • 생명과학회지
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    • 제26권11호
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    • pp.1237-1244
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    • 2016
  • 한류성 어종인 명태는 우리나라 동해를 비롯한 일본, 러시아 북부의 오호츠크해, 베링해, 알래스카 등지에 서식하는 중요한 수산자원으로, 우리나라에서는 그 어획량이 매년 감소하고 있어, 그 자원량의 회복과 보존 및 관리가 필요한 대표적 어종이다. 그러나, 이러한 중요성에도 불구하고 국내에서 명태의 유전학적 집단 분석에 관한 연구는 많이 수행되지 않은 실정이다. 본 연구에서는 우리나라 동해, 러시아, 미국 명태 집단 및 일본 명태 집단과의 유전적 다양성과 유연관계를 분석하여 명태자원의 보존과 관리를 위한 과학적 자료를 제공하기 위해 유전적 다양성 및 계군 분석에 널리 사용되고 있는 microsatellite marker (msDNA) 8개를 사용하여 명태 집단의 유전자형을 분석하였다. 우리나라 동해, 러시아, 미국 및 일본 집단에서 채집된 총 186개체를 분석한 결과, 대립유전자수는 최소 7.13개에서 최대 10.63개로 나타났고, 평균 대립유전자의 수는 9.05개로 나타났다. 기대치와 관찰치 이형 접합율은 각각 0.698과 0.732로 조사되어, 현재 확보된 명태 집단의 유전적 다양성은 비교적 잘 유지되고 있는 것으로 나타났다. 유전학적 유연관계 분석을 위한 유전적 거리, Pairwise FST값, UPGMA와 주성분분석, AMOVA test 분석 결과, 우리나라 동해, 러시아, 미국의 명태 집단 간 유전적 차이는 거의 없었으나 일본 명태 집단과는 낮은 수치이지만 유의한 유전적 차이가 있음을 확인하였다(p<0.05). 본 연구에서 확인된 유전학적 분석을 통한 명태집단의 유전적 특성 및 주변국 집단과의 유연관계 분석결과는 우리나라 동해의 중요한 수산유전자원으로서의 명태에 대한 중요한 과학적인 근거자료가 될 것이며, 앞으로 명태 자원의 보존, 평가 및 이용에 활용 가능한 정보를 제공할 것이다.

육질개량을 위한 한우번식우의 유전능력평가 (Evaluation of Genetic Ability for Meat Quality in Hanwoo Cow)

  • 원정일;김종복;이정구
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제52권4호
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    • pp.259-264
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    • 2010
  • 본 연구는 강원도내 농촌지역 1개 군 관내 사육농가에서 사육되어 2004년 12월부터 2008년 6월까지 43개월 동안 강원도와 강원도 인근에 소재한 도축장 3개소에서 도축된 한우 거세우 6,431두의 성적과 한국종축개량협회에서 관리중인 한우 등록우 데이터베이스로부터 이들의 혈통자료 14,957두를 활용하여 도체형질에 대한 유전모수와 육종가를 추정하였다. 연구 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 각 도체형질에 대한 평균과 표준편차는 근내지방도, 등지방두께, 배최장근단면적, 냉도체중 및 육량지수에서 각각 $5.57{\pm}2.01$, $10.87{\pm}4.06mm$, $87.87{\pm}9.07cm^2$, $426.75{\pm}49.27kg$$65.80{\pm}3.80$으로 나타났다. 2. 단형질 분석을 통한 도체형질의 유전력 추정치는 근내지방도, 등지방두께, 배최장근단면적, 냉도체중 및 육량지수에서 각각 0.36, 0.35, 0.24, 0.29 및 0.40으로 나타났다. 3. 근내지방도는 등지방두께, 배최장근단면적, 냉도체중, 및 육량 지수와 각각 -0.21, 0.30, -0.21, 0.30의 유전상관 계수가 추정 되었으며, 등지방두께는 배최장근단면적, 냉도체중, 및 육량지수와 각각 -0.12, 0.57, -0.97의 유전 상관계수가 추정되었다. 4. 배최장근단면적은 냉도체중 및 육량지수와 각각 0.32, 0.27의 유전상관 계수가 그리고 냉도체중은 육량지수와 -0.62의 유전 상관계수가 추정되었다. 5. 근내지방도가 등지방 두께나 도체중과 음의 유전상관관계를 보이고 있는 점을 고려할 때 근내지방도가 양호한 방향으로 선발을 진행할 경우 등지방두께를 낮추는 간접선발 효과가 있을 것으로 기대된다. 그러나 근내지방도에 대한 선발은 도체중을 증가시키는데 장애를 초래할 수 있을 것으로 판단된다.

배추 SSR 마커를 이용한 무의 육성 계통 및 수집종의 유전적 다양성 분석 (Analysis of the Genetic Diversity of Radish Germplasm through SSR Markers Derived from Chinese Cabbage)

  • 박수형;최수련;이정수;뉴엔 반단;김성길;임용표
    • 원예과학기술지
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    • 제31권4호
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    • pp.457-466
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    • 2013
  • 국립원예특작과학원에서는 무의 품종 육성 기반 확장을 위해 다양한 무 품종을 수집하여 재배한 후 원예적 특성이 양호한 자원을 선발하여 계통으로 육성하는 작업을 1980년대 초반부터 지속적으로 수행하여 왔다. 유전적 다양성은 작물의 개량에 있어 주요 소재이기에 자원의 수집을 통한 변이의 확보는 매우 중요하다. 자원 수집과 더불어 확보한 자원간의 다양성 정도를 측정함으로써 자원의 활용도를 높이고 자원확보의 방향성을 재고하는데 도움을 줄 수도 있다. 이런 연구를 위하여 이미 배추에서 개발된 SSR 마커를 이용하여 계통분류학상 가까운 관계에 있는 무에 적용이 가능한지를 검토하기 위해 본 실험을 실시하였다. 무 육성 계통과 도입자원 중에서 44점의 보유 유전자원을 재료로 하여 22종의 선발한 마커로 유전형을 분석하였으며, 이 중에서 'cnu_m139'와 'cnu_m289' 등이 다형성 검증에 유용한 마커임을 확인할 수 있었다. 무 유전자원의 유전적 유연관계 분석 결과, 무는 지역적 유래에 따라 차이를 보였으며, 품종 육성 연도에 따라 일부 그룹을 형성함을 알 수 있어, 최근 육성되고 있는 품종들과 기존의 품종과의 차이를 보여주는 것으로 나타났다. 또한 각 그룹에 해당하는 계통들의 특성을 제시함으로써 차후 연구결과의 활용도를 높이고자 하였다. 비교적 적은 수의 마커로 분석했음에도 30년 이전에 육성종과 근래에 육성한 2000년대에 육성종을 구분하고, 한 그룹 내에서 비교적 형태적으로 유사한 개체들이 그룹을 구성하는 대부분을 나타낸 결과는 SSR 마커가 무에 성공적으로 적용 가능함을 시사한다고 할 수 있다. 본 연구결과를 통해 배추에서 개발한 SSR 마커를 이용하여 무에 대한 유전적 다양성 및 유연관계 분석(유전자원 식별)에 적용이 가능한 것으로 판단된다.

진화알고리즘을 이용한 선취적 다목표 양면조립라인 밸런싱 (Two-Sided Assembly Line Balancing with Preemptive Multiple Goals Using an Evolutionary Algorithm)

  • 송원섭;김여근
    • 한국경영과학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.101-111
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    • 2009
  • This paper considers two-sided assembly line balancing with preemptive multiple goals. In the problem, three goals are taken into account in the following priority order : minimizing the number of mated-stations, achieving the goal level of workload smoothness, and maximizing the work relatedness. An evolutionary algorithm is used to solve the multiple goal problems. A new structure is presented in the algorithm, which is helpful to searching the solution satisfying the goals in the order of the priority. The proper evolutionary components such as encoding and decoding method, evaluation scheme, and genetic operators, which are specific to the problem being solved, are designed in order to improve the algorithm's performance. The computational results show that the proposed algorithm is premising in the solution quality.

문제영역 지식을 활용한 감성기반 IGA 의상 디자인 시스템의 평가 (Evaluation of an Emotion-based IGA Fashion Design System Using Domain Knowledge)

  • 김희수;조성배
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 1999년도 가을 학술발표논문집 Vol.26 No.2 (2)
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    • pp.116-118
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    • 1999
  • 일반적으로 컴퓨터를 이용한 디자인 지원 시스템은 많은 양의 수집된 데이터에 기반하기 때문에 계속해서 변화하는 유행에 대처할 수 없을 뿐만 아니라 개인의 취향을 반영하기도 어렵다. 이같은 문제점을 해결하기 위해 이 논문에서는 대화형 유전자 알고리즘(Interactive Genetic Algorithm : IGA)을 이용한 디자인 지원 시스템을 제안한다. IGA는 상호작용에서 얻어지는 사용자의 평가를 적합도 함수로 사용하는 유전자 알고리즘의 하나로, 일반적인 적합도 함수를 결정하기 어려운 디자인이나 예술 등의 문제 해결에 사용될 수 있다. 이때, 몇 개의 부분적인 곡선으로 의상의 디자인을 표현하였던 기존의 방법들과는 달리 전체 디자인을 목과 몸통, 팔과 소매, 치마와 허리선의 세 가지 부분 디자인으로 나누어 표현하는 문제영역 지식을 활용함으로써 좀 더 현실적인 여성복을 디자인할 수 있었다. 시스템의 인터페이스를 보완하기 위해 OpenGL이 사용되었으며, 실험 결과 지식기반 인코딩을 통한 IGA 의상디자인 시스템이 유용함을 알 수 있었다.

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Evaluation of Nonanchored Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) Marker to Detect DNA Damage in Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) Exposed to Acrylamide

  • Enan, Mohamed R.
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제24권2호
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    • pp.61-68
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    • 2008
  • Acrylamide is present as a contaminant in heated food products, predominantly from the precursor asparagine. Nonanchored inter simple sequence repeats (ISSRs) are arbitrary multiloci markers produced by PCR amplification with a microsatellite primer. In order to assess the feasibility of microsatellite primers as markers for DNA damage, the study was conducted on common bean (Phaseolus vulgaris L.) exposed to different concentrations of acrylamide. Polymorphisms were abundant among plant samples treated with acrylamide in comparison to control (untreated one) tested with 4- tri-nucleotide, 2 tetra-nucleotide, and 3- dinucelotide primers. The primer (CCG)4 was the best tested primer to generate polymorphism between the DNA of plants treated or not by acrylamide. Polymorphisms became evident as the presence and absence of DNA fragments in treated samples compared with the untreated one. The highest number of DNA variation on ISSR patterns was observed at the micromollar concentrations of acrylamide. Acrylamide was able to induce DNA damage in non concentration-dependent manner with effectiveness at micromollar concentrations. This study demonstrated that ISSR markers can be highly reliable for identification of DNA damage induced by acrylamide.

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꽃게 방류사업의 경제성 분석 (Economic Analysis of Swimming Crab (Portunus trituberculatus) Fry Releasing Program)

  • 김봉태;김대영
    • Ocean and Polar Research
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    • 제39권3호
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    • pp.213-219
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    • 2017
  • In this study, we analyzed the economic feasibility of the swimming crab (Portunus trituberculatus) fry releasing program in the West Sea of Korea. The catch rate of released fry in 2010, measured by genetic markers, was applied to the economic surplus method to estimate benefits. As a result of our analysis, the B/C ratio, as an indicator of economic evaluation, was determined to be 2.168, which means that the releasing program was economically feasible. And it was shown that the benefits to consumers is six times greater than the benefits to producers, confirming the necessity of the releasing program as a public work.

Phylogenetic Evaluation of Stereoid Fungi

  • Yoon, Sung-Il;Kim, Seon-Young;Lim, Young-Woon;Jung, Hack-Sung
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권3호
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    • pp.406-414
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    • 2003
  • Phylogenetic relationships of stereoid fungi were examined by comparing nuclear small subunit ribosomal RNA gene sequences. Stereoid taxa were scattered into several groups and the traditional Stereaceae proved to be polyphyletic. Srereum and Xylobolus were classified in the Stereaceae as the core group of stereoid fungi, and Amylostereum was grouped with Echinodontium of the Echinodontiaceae. Chondrostereum and Cystosrereum were clustered in the Stereaceae sensu Donk and Cymatoderma and Podoscypha in the Podoscyphaceae Reid. Columnocystis abietinum and C. ambigua were grouped with Meripilus giganteus and proved to be not included in the Chaetodermataceae sensu Nakasone. Lopharia cinerascens and L. mirabilis were grouped together but L. spadicea was unrelated to them, indicating that Lopharia is heterogeneous at a generic level.

Enumeration and Recovery of Bacterial Isolates from Ruminants Fed with Different Dietary Regimes and Their Antibacterial Activity

  • Pattnaik, P.;Grover, Sunita;Batish, V.K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제14권6호
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    • pp.811-815
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    • 2001
  • The study evaluated different synthetic and semisynthetic media for maximal recovery of rumen bacteria and expression of their antibacterial activity. Rumen Glucose Cellobiose Agar (RGCA) medium was found to be the best for recovery of rumen bacteria. However, L-10 medium was the best for expression of antibacterial activity of ruminal isolates followed by Easy, M-10, RGCA and M-98-5 medium. The present study recommends the use of L-10 medium as the medium of choice for screening of antibacterial activity of ruminal isolates. Comparative evaluation of bacterial counts on different dietary regimes indicated significant difference between different growth media on a specific diet and between diets on specific growth media within a species. However, there is no overall significant difference between total bacterial counts obtained from rumen liquor of cattle and buffalo with respect to either the feeding regime or growth media. Feeding straw based diet to the animal is the best for high recovery of rumen bacteria.