• 제목/요약/키워드: Genetic correlation

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한국이 후방가장자리 개체군인 넓은잎제비꽃(Viola mirabilis L.)의 분포특성과 지속가능성 (Distributional Characteristics and Population Substantiality of Viola mirabilis L.; Rear edge Population in Korea)

  • 채현희;김영철;안원경;곽명해;남기흠;이규송
    • 한국환경생태학회지
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    • 제33권4호
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    • pp.422-439
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    • 2019
  • 후방가장자리 개체군은 전형적으로 고도의 고립된 분포에 따라 개체군의 유전적다양성이 낮고 절멸의 위험이 높다고 평가한다. 그러나 유전적다양성이 낮음에도 불구하고 오랜 기간에 걸쳐 개체군의 지속이 관찰된다. 따라서 개체군의 지속에 관여하는 생태적인 과정에 대한 이해가 필요하다. 넓은잎제비꽃은 세계적인 분포에서 한국이 후방가장자리개체군에 해당한다. 한반도의 중부 내륙에 제한적인 분포를 나타내는 넓은잎제비꽃의 지속에 관여하는 요인을 알아보기 위해 먼저 분포현황을 조사하였다. 다음으로 식생 및 토양환경, 식물계절학, 자가화합성 여부, 개체군 구조 그리고 분포지에서 관찰되는 위협요인을 조사하고 평가하였다. 넓은잎제비꽃은 석회암지대의 낙엽활엽수림 하부, 낙엽침엽수와 낙엽활엽수 식재림의 하부, 관목림의 하부 그리고 초원에 걸쳐 분포하였다. 개체군내에서 유묘의 재정착이 관찰되었고 대부분 안정적인 개체군 구조로 나타났다. 개방화는 화분매개곤충의 방문이 열매의 생산과 밀접한 연관이 있었다. 그렇지만 개체군 내에서 폐쇄화의 생산이 보다 왕성하였고 일부 개체군에서는 개체의 크기가 큼에도 불구하고 폐쇄화만을 생산하였다. 개체의 크기는 개방화의 생산에 비해 폐쇄화의 생산에 보다 더 높은 상관이 있었다. 따라서 개체군내의 유묘 보충은 폐쇄화의 기여도가 높은 것으로 판단되었다. 개방화와 폐쇄화의 생산은 토양분석 항목 중 유효인산을 제외하고는 상관이 없는 것으로 나타났다. 넓은잎제비꽃은 자가불화합성으로 이것은 왕성한 폐쇄화의 생산능력이 존재하기 때문으로 생각되었다. 생육지에서 관찰된 잠재적인 위협요인으로는 석회암광산의 개발, 경작지의 확대 및 주택의 건설이 있었다. 넓은잎제비꽃은 한반도에서 석회암지대에 고립되어 분포하지만 초원부터 비교적 울폐도가 낮은 식생하부에 이르기까지 넓은 식생환경에 걸쳐 관찰되었다. 또한 다수의 개체군과 안정적인 개체군 구조를 유지하고 있어 현재와 같은 상태가 유지된다면 개체군의 지속은 가능할 것으로 평가되었다.

국내에서 재배된 밀 유전자원의 통밀에서 단백질 및 아라비노자일란 함량 분석 (Protein and Arabinoxylan Contents of Whole Grains from Wheat Genetic Resources Cultivated in Korea)

  • 양진우;박진희;손재한;김경훈;김경민;정한용;강천식;손지영;박태일;최창현
    • 한국작물학회지
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    • 제66권1호
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    • pp.29-36
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    • 2021
  • 본 연구는 국내외서 수집된 614 자원의 밀 자원에 대하여 근적외선 분광분석기을 이용하여 품질을 평가하고 통밀의 아라비노자일란의 함량을 분석하여 고품질의 밀 자원의 개발을 위한 데이터베이스를 구축하고자 하였다. 근적외선 분광분석기을 이용한 밀 종자의 품질 분석법을 이용하여 빠른 시간 안에 종자의 단백질, 회분, 그리고 단백질의 특성은 침전가를 분석할 수 있었으며 단백질과 SDS-침전가가 매우 높은 상관관계를 지니고 있음을 확인 할 수 있었다. 또한 원산지별 비교를 실시하였을 때, 자원간의 유전적 차이가 더 중요하게 작용하는 것을 확인 할 수 있었다. 통밀의 아라비노자일란의 함량을 측정하기 위하여 효소법을 이용하여 측정하였으며, 실험법을 검증하기 위하여 반복성, 재현성 그리고 회수율을 측정하여 실험법에 대한 검증 및 신뢰도를 확보하였다. 이후 검증된 효소법을 이용하여 아라비노자일란 함량을 측정하였다. 국내외에서 수집 및 개발된 자원이 다른 국가에서 수집된 자원과 비교하였을 때 비교적 높은 함량을 보유하고 있음을 확인 할 수 있었으며, 이를 통해 국내 밀 자원이 영양 및 기능적으로 우수함을 알 수 있었다. 이러한 결과를 통해 밀 자원에 대한 품질 및 주요 성분에 대한 데이터베이스를 구축함으로써 고품질 및 고기능성의 밀 자원 육종에 유용하게 이용 될 수 있을 것으로 기대한다.

말에서 Dopamine Receptor D4 유전자의 변이 특성 분석 (Characterization of Dopamine Receptor D4 Gene Polymorphisms in Horses)

  • 최재영;최연주;이종안;신상민;윤민중;강용준;신문철;유지현;김현아;조인철;양병철;김남영
    • 생명과학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.29-35
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    • 2022
  • 본 연구는 여러 말 품종에서 Dopamine Receptor D4 (DRD4)의 유전적 다형성 및 Jeju crossbred에서의 기질특성과의 연관성을 분석하였다. DRD4 유전자의 다형성은 인간을 포함한 다양한 포유동물에서 기질과 연관된 후보 유전자이다. 말의 DRD4의 엑손 3번 영역에 있는 SNP G292A는 Thoroughbred에서 호기심과 경계와 관련이 있는 것으로 보고 되었다. 세 가지 말 품종에서 DRD4 유전자 내 존재하는 변이들의 다형성을 확인하기 위해 Sanger sequencing을 활용하였다. 제주마에서 각각의 빈도는 타 품종과 큰 차이를 보였다. 말의 품성 평가는 Jeju crossbred를 이용하여 수행하였으며, 기질 평가와 접촉 평가를 활용하여 각각 5개 항목과 2개 항목을 점수화 하였다. 품성 평가 결과 각 항목 간의 높은 상관관계를 확인하였다. 말의 DRD4 유전자 내 변이와 품성 평가 결과를 비교한 결과 대립유전자 A를 가지고 있을 때 기질 평가 5개 항목에서 모두 점수가 낮은 경향을 보이는 것을 확인하였으나 유의성은 없었다. Jeju crossbred의 G292A의 SNP과 혈액 내 도파민 수치를 비교한 결과 GA형이 GG형보다 약 2.87배 높은 결과를 확인하였다. 이번 연구를 통하여 DRD4 유전자 다형성과 말의 기질을 평가하기 위한 여러 평가 방법 및 신경전달물질과의 연관성을 확인할 수 있었다. 추가적인 연구를 통하여 품성 평가를 위한 유전자 마커로서 활용 가능할 것으로 사료된다.

한국인에서의 Clusterin의 유전자다형성(-4453T<G, 5608T<C)과 관상동맥질환과의 연관성 (Association of Clusterin Polymorphisms (-4453T<G, 5608T<C) with Coronary Heart Disease in Korean Population)

  • 김수원;유민
    • 생명과학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.584-588
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    • 2010
  • Clusterin은 Apolipoprotein J 등으로도 불리우기도 하는데 이 유전자의 발현이 동맥경화의 진행에 영향을 미치며[4], 관상동맥질환과 같은 혈관질환에도 중요한 역할을 하는 것으로 보고되어 있다[9,10,18] 최근 연구결과에 따르면, clusterin 유전자 다형성 중 10580 C>A, 10613 A>G이 아프리카인에게서 HDL-C의 serum level에 영향을 미치며, 이들 변이가 African-American에게서 Caucasian보다는 드물게 나타나지만, Hispanic에게서는 빈번하게 일어나는 것으로 보고되어 있다[11]. 또 다른 연구에서는 11개의 유전자 다형성을 조사한 결과 -4453G >T, 4183 A>G, 5608 C>T 는 상관관계가 없는 것으로 나타났으나, 6316 delT 유전자 다형성은 상관관계가 있는 것으로 보고되었다[8]. 본 연구에서는 관상동맥질환 환자군과 대조군을 각각 100명으로 하여 한국인에서 clusterin 유전자 다형성을 조사하였고, 특히 -4453 T>G에서 유의한 차이를 보였다. 이는 이전의 연구결과[8]와는 다소 차이가 있는데, Miwa 등의 결과에 따르면 일본인에게서는 6316 delT가 4183 A>G 다형성보다 동맥경화와 상관관계가 크다고 보고되었으나, 본 연구결과를 분석해보면 5608 C>T 는 상관관계가 없었으며, -4453 T>G 다형성만 상관관계를 가지는 것으로 나타났다. 이러한 차이를 보이는 원인은 정확하게 지적할 수는 없으나, 다형성이 미치는 영향력이 서로 다른 유전적 그리고 환경적인 요인의 차이에 의해서 일어나는 것으로 추정된다. 따라서 본 연구결과의 의의를 확인하기 위하여서는 대상 환자 수와 대조군을 늘리고 clusterin 유전자의 여러 다형성에 대한 추가적인 연구를 할 필요가 있을 것으로 판단된다.

Morphology, Phylogeny and Ecology of Hyphomycetes Hyperparasitic to Rusts

  • Park, Mi-Jeong;Park, Jong-Han;Hong, Seung-Beom;Shin, Hyeon-Dong
    • 한국균학회소식:학술대회논문집
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    • 한국균학회 2015년도 춘계학술대회 및 임시총회
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    • pp.55-55
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    • 2015
  • Rust is one of the most destructive diseases on economically important plants such as agricultural and horticultural crops, as well as forest trees [1]. Chemical treatment is the most effective means to control rust, but use of the chemical fungicides involves inevitable risks to human health and environment [2]. Unfortunately, biocontrol is currently impracticable for rust disease management [3]. It is necessary to exploit biocontrol agents to help prevent rust diseases. As a fundamental research for future development of biocontrol agents for rusts, biodiversity of hyperparasites occurring on rust fungi was investigated. During 2006-2010, 197 fungal isolates of the rust hyperparasites were collected and isolated from various combinations of mycohosts and plant hosts in many regions of Korea. Based on morphological and molecular data, they were identified as 8 genera and 12 species. Besides, phylogenetic relationships between the hyperparasites and related taxa were inferred. A total of 114 isolates of Pseudovirgaria were obtained from rust pustules of Phragmidium spp. and Pucciniastrum agrimoniae infecting rosaceous plants. Phylogenetic analysis using multigene sequences revealed a high level of genetic variability among many isolates of Pseudovirgaria and close correlation between the isolates and mycohosts. Only two species of Pseudovirgaria, P. hyperparasitica and P. grisea are often difficult to distinguish by their morphological similarity, but on the molecular basis they were clearly differentiated from each other. There had been no previous record of P. grisea outside Europe, but the present study has proved its presence in Korea. Among six distinct groups (five of P. hyperparasitica and one of P. grisea) within the Pseudovirgaria isolates, each lineage of P. hyperparasitica was closely associated with specific mycohosts and thus might have cospeciated with their mycohosts, which probably led to coevolution. Although P. grisea possesses a host preference for Phragmidium species occurring on Rubus, it was not specific for a mycohost. P. grisea seems to evolve in the direction of having a broad mycohost range. Seventeen isolates of Verticillium-like fungi were isolated from rust sori. Based on morphological data and DNA sequence analysis, the isolates were identified as three Lecanicillium species, viz. L. attenuatum, Lecanicillium sp. 1, Lecanicillium sp. 2, and V. epiphytum. The unidenified two species of Lecanicillium appear to be previously unknown taxa. Sixty-six isolates of miscellaneous hyphomycetes belonging to 6 species of 5 genera were obtained from pustules of rust fungi. On the basis of morphological and molecular analyses, the miscellaneous hyphomycetes growing on rusts were identified as Acrodontium crateriforme, Cladophialophora pucciniophila, Cladosporium cladosporioides, Phacellium vossianum, Ramularia coleosporii, and R. uredinicola.

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Variation in Milk Fatty Acid Composition with Body Condition in Dairy Buffaloes (Bubalus bubalis)

  • Qureshi, Muhammad Subhan;Mushtaq, Anila;Khan, Sarzamin;Habib, Ghulam;Swati, Zahoor Ahmad
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제23권3호
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    • pp.340-346
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    • 2010
  • Buffaloes usually maintain higher body condition and do not produce milk at the cost of their own body reserves under tropical conditions. The mobilization of body reserves for fulfilling the demands of lactation has been extensively studied in dairy cows while limited work is available on this aspect in dairy buffaloes. Therefore, the present study was conducted to examine variations in milk fatty acid profiles with body condition in Nili-Ravi buffaloes. A total of 24 Nili-Ravi buffaloes within 60 days after parturition, were selected from a private dairy farm in the district of Peshawar. All animals consumed the same diet during the experimental period. A total of 576 raw milk samples were collected for laboratory analysis. The study continued up to 6 months during 2008. Body condition score (BCS), milk yield and composition were recorded once a week. Means for milk fatty acid profile were compared for various levels of BCS. The mean milk yield and fat content were 9.28 kg/d and 5.36%, respectively. The total saturated fatty acids (SFA) were 64.22 g/100 g and the unsaturated fatty acids (UFA) were 35.79 g/100 g. Of the SFA the highest amount was recorded for $C_{16:0}$, followed by $C_{18:0}$, and $C_{14:0}$. The total sum of hypercholesterolemic fatty acids (HCFA, $C_{12:0}$, $C_{14:0}$ and $C_{16:0}$) was 43.33 g/100 g. The concentrations of UFA were greater for moderate BCS followed by poor and highest BCS while SFA showed the opposite trend. The correlation analysis showed that milk yield was negatively affected by BCS and milk fat positively affected, though non-significantly. The present study suggests that Nili-Ravi dairy buffaloes produce similar milk to dairy cows regarding availability of cardioprotective fatty acids, with the highest concentration of $C_{18:1\;cis-9}$. Two HCFA ($C_{12:0}$ and $C_{14:0}$) were associated with higher body condition. Buffaloes with moderate body condition yielded milk containing healthier fatty acids.

한국인의 대장암 세포주에서 p53 돌연변이의 발견과 발현에 관한 연구 (Study on the expression and detection of the p53 mutation in Korean colon cancer cell lines)

  • 정지연;오상진
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제1권2호
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    • pp.151-161
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    • 2001
  • Background: Inactivation in p53 tumor suppressor gene through a point mutation and deletion is one of the most frequent genetic changes found in human cancer, with 50% of an incidence. This high rate of mutation mostly suggests that the gene plays a central role in the development of cancer and the mutations detected so far were found in exons 5 to 8. Mutation of p53 locus produced accumulation of abnormal p53 protein, and negative regulation of cell proliferation and transcriptional activation as a suppressor of transformation were lost. In addition, inhibition of its normal cellular function of wild-type by mutant is an important step in tumorigenesis. Method: 4 colon cancer cell lines (SNU C1, C2A, C4, C5) were examined for mutation in exons 5 to 8 of the p53 tumor suppressor gene by PCR-SSCP analysis and expression pattern by western blotting and immunoprecipitation. p53-mediated transactivation ability were examined by CAT assay and base substitution of p53 in SNU C2A cell were detected by DNA sequencing. Results: 1) SNU C2A cell and SNU C5 cell were detected mobility shifts each in exon 5 and exon 7 of p53 gene by the PCR-SSCP method, implicating being of p53 mutation. 2) 3 colon cancer cell lines (SNU C1, SNU C2A, SNU C5) expressed wild type and mutant type p53 protein. 3) In northern blot experiment, SNU C2A and SNU C5 cell expressed high level of p53 mRNA. 4) Results of p53-mediated transactivation in colon cancer cell lines by CAT assay represented only SNU C2A cell has transcriptional activity. 5) DNA sequencing in SNU C2A cell showed missense mutation in codon 179 of one allele, histidine to arginine and wild type p53 in the other allele. Conclusion: Colon cancer cell lines showed correlation with mutation in p53 gene and accumulation of abnormal p53 protein. Colon cancer cell SNU C2A retained p53-mediated transactivation as heterozygous p53 with one mutant allele in 179 codon and the other wild-type allele.

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건강증진행위의 영향요인 분석 -위암환자중심 - (Predicting Health-Promoting Behaviors in Patients with Stomach Cancer)

  • 오복자
    • 대한간호학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.681-695
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    • 1995
  • It has been noted that a genetic alteration of cells influenced by unhealthy lifestyle In addition to a series of other carcinogens increases various neoplasmic diseases. Therefore the importance of lifestyle that minimizes such impact on health should be emphasized. Since stomach cancer, the most common neoplasmic disease in Korea, is re-lated to the Korean lifestyle and as there's a possibility of its recurrence, people with stomach cancer need to lead a healthy lifestyle. The purpose of this study is to provide a basis for nursing intervention strategies to promote health promoting behaviors that are constructive to a healthy lifestyle. A multivariate model was constructed based on the fender's health promotion model and Booker's health belief model by including influential factors such as hope. The sample was composed of 164 patients with stomach cancer who visited outpatient clinics of a university hospital in Seoul. The following instruments were used in the study after some adaptation : Wallston and others' multidimensional health locus of control scale Laffrey's health conception scale, Lawston and others' health self- rating scale, Walker and others' health promotion lifestyle profile and Rogenberg's self esteem scale. In addition Moon's health belief scale was used with some modification. For self efficacy, the present author constructed a self-efficacy scale based on previous research. The above mentioned instruments were tested in a pilot study with 24 patients with stomach cancer. The reliabilities of instruments were tested with Cronbach's alpha(0.574∼0.949). Data were analyzed using a SAS program (or Pearson correlation coefficients, descriptive correlational statistics and stepwise multiple regression. The results are as follows : 1. The scores on the health promoting behavior scale ranged from 55 to 145 with a mean of 107.91 (S. D : 16.50). The mean scores(range 1-4) on the different dimensions were nutrition 3.14, exercise 2.48, stress management 2.69, health responsibility 2.65, interpersonal relationship 2.878E self actualization 2.85. 2. There were significant correlations among all the predictive variables & the health promoting behavior (r=.20-.55, p〈.01) 3. Stepwise multiple regression analysis showed that : 1) Hope was the main predictor and accounted for 29.8% of the total variance. 2) Self efficacy, perceived barriers & self esteem accounted for an additional 14.6% of the total variance. 3) Hope, self efficacy, perceived barriers & self esteem altogether accounted for 44.3% of the total variance. In conclusion, hope, self efficacy, perceived barriers & self esteem were identified as important variables that contributed to promote health promoting behavior.

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Correlation between EGFR Gene Mutations and Lung Cancer: a Hospital-Based Study

  • Kavitha, Matam;Iravathy, Goud;Adi Maha, Lakshmi M;Ravi, V;Sridhar, K;Vijayanand, Reddy P;Chakravarthy, Srinivas;Prasad, SVSS;Tabassum, Shaik Nazia;Shaik, Noor Ahmad;Syed, Rabbani;Alharbi, Khalid Khalaf;Khan, Imran Ali
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권16호
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    • pp.7071-7076
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    • 2015
  • Epidermal growth factor receptor (EGFR) is one of the targeted molecular markers in many cancers including lung malignancies. Gefitinib and erlotinib are two available therapeutics that act as specific inhibitors of tyrosine kinase (TK) domains. We performed a case-control study with formalin-fixed paraffin-embedded tissue blocks (FFPE) from tissue biopsies of 167 non-small cell lung carcinoma (NSCLC) patients and 167 healthy controls. The tissue biopsies were studied for mutations in exons 18-21 of the EGFR gene. This study was performed using PCR followed by DNA sequencing. We identified 63 mutations in 33 men and 30 women. Mutations were detected in exon 19 (delE746-A750, delE746-T751, delL747-E749, delL747-P753, delL747-T751) in 32 patients, exon 20 (S786I, T790M) in 16, and exon 21 (L858R) in 15. No mutations were observed in exon 18. The 63 patients with EFGR mutations were considered for upfront therapy with oral tyrosine kinase inhibitor (TKI) drugs and have responded well to therapy over the last 15 months. The control patients had no mutations in any of the exons studied. The advent of EGFR TKI therapy has provided a powerful new treatment modality for patients diagnosed with NSCLC. The study emphasizes the frequency of EGFR mutations in NSCLC patients and its role as an important predictive marker for response to oral TKI in the south Indian population.

유전자형과 재배환경에 따른 검정콩 안토시아닌 함량변이 (Variation of Anthocyanin Contents by Genotypes and Growing Environments in Black Colored Soybeans)

  • 황인택;이주영;최병렬;이은섭;김용호
    • 한국작물학회지
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    • 제59권4호
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    • pp.477-482
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    • 2014
  • 검정콩 함유 안토시아닌 함량의 환경 변이 특성을 구명하고자 검정콩의 재배 지역과 파종기를 달리하며 안토시아닌 함량을 분석한 결과 안토시아닌 함량은 지역, 품종 및 파종기 모두에 영향을 받는 것으로 나타났다. 품종별로는 일품검정콩의 평균 안토시아닌 함량이 11.58 mg/g으로 제일 높았으며, 지역에서는 연천에서 재배한 품종들의 평균 함량이 9.85 mg/g으로 제일 높았다. 파종기에서는 6월 15일 파종이 9.00 mg/g, 5월 30일 8.36 mg/g, 5월 15일 8.24 mg/g으로 나타나 만식재배가 안토시아닌 함량 제고에 유리할 것으로 판단되었다. 검정콩 안토시아닌의 색도와 안토시아닌 함량과의 상관을 분석한 결과 L (명도)과 b (적색도)값은 안토시아닌 개별색소 및 총 안토시아닌 함량과 고도의 부의 상관을 보인 반면, a (적색도)값은 고도의 정의 상관을 나타내었다. 검정콩 안토시아닌 함량과 기상요인의 관계를 분석한 결과, 일품검정콩과 청자콩은 평균기온 및 적산온도와 부의 상관, 평균일교차와는 정의 상관을 보였다. 따라서 안토시아닌 고함유 검정콩 생산을 위해서는 등숙기간 중 평균기온이 낮고 일교차가 큰 지역에서 생산하는 것이 유리할 것으로 판단되었다.