Lee Chung-Kuen;Shin Jae-Hoon;Shin Jin-Chul;Kim Duk-Su;Choi Kyung-Jin
한국작물학회:학술대회논문집
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한국작물학회 2004년도 춘계 학술대회지
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pp.100-101
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2004
[ $\bigcirc$ ] In the growth simulation using genetic coefficients calculated with fooled data under various condition, WAGT was not higher and LAI, WLVG, WSO were higher, but WST was similar before grain-filling stage after the became lower because of higher translocation of carbohydrates than in the growth simulation using genetic coefficients calculated with data under high nitrogen applicated condition. $\bigcirc$ Genetic coefficients should be calculated with data showing potential in ORYZA2000, but under 180 kg and 240 kg N condition in 2003, plants were infected by panicle blast and also yield was not higher than under 120 kg N condition showing not potential condition and therefore not appropriate for genetic coefficients estimation compared with pooled data from various condition.
This study was conducted to examine the relationships between the methods used to determine the number of transferable embryos collected per flush and the estimated cumulative genetic improvements in the Japanese Holstein MOET breeding population. Cumulative genetic improvements were predicted by Monte Carlo simulation using three different determination methods (MODEL 1, MODEL 2, and MODEL 3), for calculating the number of embryos collected per flush. Moreover EBVs were estimated including or ignoring coefficients of inbreeding in MME. Inbreeding coefficients were also predicted. The number of transferable embryos was determined using normal, gamma, and Poisson distributions in MODEL 1, gamma and Poisson distributions in MODEL 2, and only the Poisson distribution in MODEL 3. The fitness of MODEL 2 in relation to field data from Hokkaido Japan was the best, and the results for MODEL3 indicated that this model is unsuitable for determining the number of transferable embryos. The largest cumulative genetic improvement (3.11) in the 10th generation was predicted by MODEL 3 and the smallest (2.83) by MODEL 2. Mean coefficients of correlation between the true and estimated breeding values were 0.738, 0.729, and 0.773 in MODELS 1, 2, and 3, respectively. It is suggested that the smallest genetic improvement in MODEL 2 resulted from the smallest correlation coefficient between the true and estimated breeding values. The differences in milk, fat, and protein yields between MODELS 2 and 3 were 182.0, 7.0, and 5.6 kg, respectively, in real units when each trait was independently selected. The inbreeding coefficient was the highest (0.374) in MODEL 2 and the lowest (0.357) in MODEL 3. The effects of different methods for determining the number of transferable embryos per flush on genetic improvements and inbreeding coefficients of the simulated populations were remarkable. The effects of including coefficients of inbreeding in MME, however, were unclear.
등지방을 포함한 산육형질과 번식 및 산자형질간의 관계를 규명하기 위하여 경남흑돈(버크셔)의 자료를 분석하였다. Pearson 상관의 추정에서 등지방은 번식형질과 -0.24~-.26을 나타냈다. 유전적 관계를 조사하기 위한 초분만일령, 초분만일령과 첫 분만을 위한 종부횟수에 관한 유전상관 추정은 자료의 부족으로 추정치의 변동이 많고 폭이 컸다. 등지방과 산자형질과는 낮은 Pearson 상관을 보였지만 총산자, 생존산자, 생시복체중, 이유복체중의 유전상관계수가 각각 .21, .24, .11, .07으로 조사되어 유전적 상관이 더 높게 조사되어 등지방의 개량이 산자능력을 감소시킬 수 있다. 90kg 도달일령과 총산자, 생존산자, 생시복체중, 이유복체중과의 유전상관 계수는 .14, .17, .09 그리고 0.0으로 각각 조사되어 산육능력이 우수할수록 산자능력의 감소를 의미하고 있다.
기후변화 영향평가를 위해 작물생육모형을 폭넓게 사용하고 있지만 모형을 구동하기 위해서는 품종모수를 결정하는 것이 필수적이다. 그러나 품종모수 결정을 위한 실험은 장시간의 노력이 필요하여 대부분 작황자료 또는 지역적응 시험 자료를 많이 사용하고 있다. 그러나 밭작물의 경우 작황자료 또는 지역적응 시험을 사용하는 경우에는 포장의 관개량과 시기에 대한 자료가 없고 또한 별도의 기상관측 없이 최인접지역의 기상자료를 사용하기 때문에 문제가 발생할 수 있다. CERES-MAIZE를 이용하여 밭작물인 옥수수에 대해서 이 문제점들을 검토하였다. 출사기와 관련된 품종모수는 최대 27km 내에 기상관측 지점이 있는 경우에도 신뢰성있는 품종모수가 얻어졌다. 온도의 경우에는 지형에 따라 유효한 거리가 달라질 수 있지만 본 연구의 대상 지역에서는 품종 모수 추정에 문제가 크지는 않을 것으로 보인다. 또한 온도 이외의 요소인 강수 또는 관개량은 생물계절관련 품종모수와는 큰 영향이 없기 때문에 비교적 정확도가 높은 결과가 나온 것으로 보인다. 그러나 수량과 관련된 품종 모수 요소에서는 그렇지 못하였다. 이는 밭작물의 경우 강수량에 따라 스트레스 정도가 결정되기 때문에 관개 및 강수량 정보가 중요한데, 관개량에 대한 정보를 작황 또는 지적시험 보고서에서는 얻을 수 없기 때문이다. 더구나 강수량의 경우에 온도보다 더 가까운 위치에 기상관측소가 존재해야만 유의미한 정보를 제공할 수 있다. 그러나 시험포장에 따라 기상관측소와의 거리가 충분히 가깝지 않은 경우가 대부분이었다. 따라서, 작황 또는 지역적응 시험자료를 이용하여 옥수수의 품종모수를 결정할 때는 기상관측 지점이 최소한 20km 이내의 인접지역에서 생물계절과 관련된 모수에 대해서만 결정하는 것이 타당할 것으로 생각된다. 그 반면에 수량과 관련된 요소의 결정은 적절하지 않을 것으로 생각된다. 수량과 관련된 요소를 결정하기 위해서는 가급적 직접 기상관측망을 설치하여 해당 포장에서 관개시기와 관개량을 모두 확보한 실험한 결과를 바탕으로 얻는 것이 적절할 것으로 생각된다.
국내 5개 지역에서 채집된 염주알다슬기 (Koreanomelania nodifila)와 띠구슬다슬기(Koreoleptoxis globus ovalis)간의 유전적 분화수준을 토대로 속간 수준의 분류적 유의성을 검증하고자 전기영동을 이용한 등위효소 분석을 실시하였다. 종내 집단간 유전적 근연치는 염주알다슬기가 S=0.848(0.805-0.905)로 나타났고 띠구슬다슬기는 이보다 낮은 S=0.755 (0.666-0.860)의 값을 보였다. 각 종의 속간 유전적 근연치는 곳체다슬기와 염주알다슬기가 S=0.194의 매우 낮은 값을 보였고 곳체다슬기와 띠구슬다슬기 사이는 S=0.301을 나타내었다. 또한 염주알다슬기와 머구슬다슬기 간에는 S=0.301의 유전적 근연치를 보여 이들 간의 유전적 분화수준이 속간 차이에 이름을 알 수 있었다.
Genetic gains and inbreeding coefficients in a Holstein MOET breeding population were predicted under different conditions relating to the distribution of the number of transferable embryos collected per flush using Monte Carlo simulation. The numbers of transferable embryos collected per flush were determined using five distributions (distributions 1, 3, 5, 7 and 9) with different aspects and similar means. Distributions 1, 3, 5, 7 and 9 were assumed to have gamma distribution's parameters ($\alpha$ and $\beta$) of (1 and 4.4), (3 and 1.47), (5 and 0.88), (7 and 0.63) and (9 and 0.49), respectively. Inbreeding rates were statistically significantly different among distributions but genetic gains were not. Relationships between inbreeding rates and variances of family size could be were clearly distinguished. The highest inbreeding coefficients were predicted in distribution 1 with the largest variance of family size, while distributions 5, 7 and 9 with smaller variance of family size had lower inbreeding coefficients.
남한의 15개 지역에서 채집된 재첩속(Corbicula) 4종간의 유전적 분화수준 및 계통 유연관계를 규명하고자 전기영동을 이용한 동위효소 분석을 실시하였다. 이들 4종 중 담수 산인 C. fluminea, C. leana, C. colorata 3종의 종내 집단간 유전적 근연치는 S=0.970 이상 (0.970∼1.000)으로 매우 가깝게 나타났으나 기수산인 C. japonica의 집단들은 Gp-1 유전자 에서 뚜렷한 대립인자 차이를 가지는 2개의 유전적 group으로 분리(S=0.873)되어 이에 대한 추가적인 분류학적 검토가 요구되었다. 각 종간의 유전적 근연치는 C. fluninea와 C. leana 가 S=0.689, C. fluminea와 C. colorata는 S=0.594 그리고 C. leana와 C. colorata는 S=0.737 로 나타나 이들 담수산 3종간의 유전적 차이는 매우 뚜렷하였다. 특히, 기수산인 C. japonica는 담수산 3종과의 평균 유전적 근연치가 S=0.370으로 가장 먼 유전적 근연관계를 나타내었다.
International Journal of Fuzzy Logic and Intelligent Systems
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제2권2호
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pp.115-121
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2002
This paper presents an evolutionary design of digital IIR filters using the genetic algorithm (GA) with modified genetic operators and real-valued encoding. Conventional digital IIR filter design methods involve algebraic transformations of the transfer function of an analog low-pass filter (LPF) that satisfies prescribed filter specifications. Other types of frequency-selective digital fillers as high-pass (HPF), band-pass (BPF), and band-stop (BSF) filters are obtained by appropriate transformations of a prototype low-pass filter. In the GA-based digital IIR filter design scheme, filter coefficients are represented as a set of real-valued genes in a chromosome. Each chromosome represents the structure and weights of an individual filter. GA directly finds the coefficients of the desired filter transfer function through genetic search fur given filter specifications of minimum filter order. Crossover and mutation operators are selected to ensure the stability of resulting IIR filters. Other types of filters can be found independently from the filter specifications, not from algebraic transformations.
Journal of Advanced Marine Engineering and Technology
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제31권7호
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pp.863-871
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2007
This paper proposes a methodology to estimate the system coefficients for the infinite impulse response(IIR) digital filters using real code GA. In the traditional real coded GA, it adapts the general genetic operations, whereas in this paper the proposed real coded GA applies improved genetic operations in order to search the optimal solution in given problems. Each of unknown IIR digital coefficients collected as forms of a chromosome. Two illustrative examples including the band pass and band stop IIR digital filters are demonstrated to verify the proposed method.
Growth records over six generations of 686 pigs in SD-II Swine Line were used to estimate the genetic and phenotypic covariance functions for body weight as longitudinal data. A random regression model with Legendre polynomials of age as independent variables was used to estimate the (co)variances among the regression coefficients, thus the coefficients of genetic and permanent environmental covariance functions by restricted maximum likelihood employing the average information algorithm. The results showed that, using litter effect as additional random effect, a reduced order of fit did not describe the data adequately. For all five orders of fit, however, the change trends of genetic and phenotypic (co)variances were very similar from ${\kappa}$=3 onwards.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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