• 제목/요약/키워드: Genetic Parameter

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One unusual species, Coilia sp. (Engraulidae, Pisces) from the Yellow Sea

  • Kwun, Hyuck-Joon;Kim, Yeong-Hye;Kim, Jong-Bin;Jeong, Choong-Hoon;Kim, Jin-Koo
    • Animal cells and systems
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    • 제14권2호
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    • pp.137-145
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    • 2010
  • Four specimens of unknown Coilia sp. were collected for the first time from the Yellow Sea in 2008 and compared with Coilia mystus and Coilia nasus. Coilia sp. showed similar morphology to C. mystus and C. nasus, but differed in that its tail was considerably shorter. We conducted an analysis of the morphological and genetic characteristics in an effort to clarify the taxonomic position of Coilia sp. In counts and measurements, Coilia sp. were well distinguished from C. nasus by the number of scutes (42-44 in Coilia sp. vs. 40-45 in C. mystus vs. 45-55 in C. nasus), ratio of dorsal base length to head length (43.4-47.6 vs. 37.9-47.6 vs. 33.0-41.0), and eye length to head length (19.2-20.8 vs. 17.0-22.4 vs. 13.8-18.2). In caudal skeleton of Coilia sp., urostyle, hypural and epural bones were not observed; instead of them, caudal fin rays were supported by the last vertebra, neural and haemal spines' extension. The molecular phylogenetic relationship was analyzed using 414 base-pair 12S rRNA mitochondrial DNA sequences. The Kimura-2-parameter distance between Coilia sp. and C. mystus was 0.3%, but was 1.3% between Coilia sp. and C. nasus. Both the neighbor-joining tree and maximum-likelihood tree showed that Coilia sp. are closely clustered with C. mystus. Therefore, our results suggest that the Coilia sp. may be a deformed fish of C. mystus.

두록의 동결정액의 운동학적 특성과 ESR1 유전자의 SNP(g.35756T>C)와 연관성 분석 (Association with Post-Thawed Semen Motility and Kinematic Characteristics of g.35756 T>C on Estrogen Receptor 1 (ESR1) Gene in Duroc Pigs)

  • 조은석;김기현;우제석;이미진;고준호;김영주;사수진
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.143-147
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    • 2015
  • Cryopreservation of boar semen is continually researched in reproductive technologies and genetic resource banking in breed conservation. For evaluating the boar semen quality, sperm motility (MOT) is an important parameter because the movement of spermatozoa indicates active metabolism, membrane integrity and fertilizing capacity. Various researches have been trying to improve the quality of semen Post-thawed in boar. Recently, polymorphism (g. 35756 T>C) of Estrogen Receptor 1 (ESR1) gene reported to be significant association with MOT. This study was conducted to evaluate the ESR1 gene as a positional controlling for motility and kinematic characteristics of post-thawed boar semen. To results, The g.35756 T>C SNP of ESR1 was significantly associated with frozen semen motility and kinematic characteristics. The g.35756 T>C SNP was high significantly associated with MOT, VCL, VSL and VAP (p<0.001). The SNP was also significantly associated with ALH (P<0.05). Therefore, we suggest that the g. 35756 T>C polymorphism in the intron 1 region of the porcine ESR1 gene could potentially be applied in frozen semen programs to improve MOT trait, but only after validation in other populations.

PLCz 유전자의 유전적 다형성(g.158T>C)과 두록 동결정액의 운동학적 특성과의 연관성 분석 (Association Study Analysis of Phospholipase C Zeta (PLCz) Gene Polymorphism (g.158T>C) for Duroc Boar Post-Thawed Semen Motility and Kinematic Characteristics)

  • 사수진;이미진;김기현;우제석;고준호;김영주;조은석
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.137-142
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    • 2015
  • Cryopreservation of boar semen is continually researched in reproductive technologies and genetic resource banking in breed conservation. For evaluating the boar semen quality, sperm motility (MOT) is an important parameter because the movement of spermatozoa indicates active metabolism, membrane integrity and fertilizing capacity. Various researches have been trying to improve the quality of semen post-thawed in boar. Recently, polymorphism (g.158T>C) of phospholipase C zeta (PLCz) gene reported to be significant association with MOT. This study was conducted to evaluate the PLCz gene as a positional controlling for motility and kinematic characteristics of post-thawed boar semen. To results, The g.158 T>C SNP of PLCz was significantly associated with frozen semen motility and kinematic characteristics. g.158 T>C SNP was high significantly associated with MOT, VCL, VSL and VAP (p<0.0001, p=0.0002, p<0.0001 and p<0.0001, respectively). Therefore, we suggest that the intron region of the porcine PLCz, may be used as a molecular marker for Duroc boar post-thawed semen quality, although its functional effect was not defined yet. Whether the association is due to the candidate gene or not require further verification. Thus, it will be of interest to continue association studies in the regions surrounding those genes.

태양 추적시스템을 위한 PC 기반의 퍼지제어기 설계 (Fuzzy Controller Design of PC Based for Solar Tracking System)

  • 정동화;최정식;고재섭
    • 조명전기설비학회논문지
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    • 제22권5호
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    • pp.86-94
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    • 2008
  • 본 논문은 PV(Photovoltaic) 어레이의 출력을 높이기 위해 PC 기반의 퍼지제어를 이용한 태양추적 시스템을 제안한다. 태양 추적시스템은 광센서의 신호에 의해 구동하는 두 개의 DC 모터로 동작한다. 두 축의 제어는 파라미터의 불확실성 및 비선형 특성 때문에 쉽지 않다. 최근 퍼지제어, 신경회로망 및 유전자 알고리즘 등의 인공지능 제어에 대한 연구가 많이 이루어지고 있다. 그 중 퍼지제어는 비선형 제어를 원활하게 수행할 수 있으며 파라미터 변동 및 비선형 특성에 대한 강인성 및 고성능의 특징을 가지고 있다. 따라서 퍼지제어는 설정된 오차 값과 비선형의 고도각 및 방위각 오차 값을 비교하여 추적 시스템 구동을 위해 사용된다. 본 논문에서는 PV 어레이의 출력 향상을 위해 퍼지제어기를 설계하고 종래의 Pl 제어기와 성능을 비교하며 평가한다. 실험을 통한 데이터는 제시한 제어기의 타당성을 입증한다.

옥수수 calreticulin 과발현 토마토에서 tobamovirus의 상엽 이동 억제 (Suppression of tobamovirus movement toward upper leaves in the tomato plant over-expressing a maize calreticulin)

  • 한증술
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제37권4호
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    • pp.567-573
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    • 2010
  • To ascertain the effect of over-expressed maize calreticulin in tomato plant on tobamovirus movement in addition to validating potentiality of the gene (ZmCRT) as a means for the virus-resistance resource, four ZmCRT-expressing homozygous lines were generated from the T0 plants as using an Agrobacterium-mediated transformation, nucleic acid analyses, and a conventional breeding method. Of them, a line was subjected to the bioassay for tolerances to tobacco mosaic virus-U1 (TMV-U1) and tomato mosaic virus (ToMV) followed by RT-PCR and a chlorophyll fluorescence quenching analyses. Both transgenic plants transcribing ZmCRT and wild-type plants showed no symptom by 20 days after viruses inoculation, however the photosystem II quantum yield parameter measured from the upper leaves of ToMV-inoculated plants revealed that ZmCRT transgenic plants have higher photosynthetic ability than wild-type ones at that time, which indirectly implies that over-expressed ZmCRT product acts as a barrier to the cell-to-cell and/or systemic movement of ToMV. Moreover, ZmCRT transgenic plants showed remarkably longer shoot length than wild-type ones in 40 days after TMV-U1 or ToMV inoculation each, which might be resulted from higher photosynthetic ability during the phase not yet showing any external symptoms. Collectively, over-expressed ZmCRT protein in tomato plants is able to interrupt the systemic movement of infected TMV-U1 and ToMV even though not perfect.

절대안정도를 보장하는 최적 PID 제어기 설계에 관한 연구 (A Study on Optimal PID Controller Design Ensure the Absolute Stability)

  • 조준호
    • 융합정보논문지
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    • 제11권2호
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    • pp.124-129
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    • 2021
  • 본 논문에서는 절대 안정도를 보장하는 최적의 제어기 설계에 대해 제안하였다. 논문의 적용 순서는 지연시간의 포함여부를 판단하고, 지연시간이 포함되었을 경우 Pade 근사법을 통해서 지연시간을 근사화 한다. 그 다음 공정모델과 제어기 전달함수에 대한 개루프 전달함수를 구하며, Routh-Hurwitz 판별법에 의해서 절대 안정도 구간을 계산한다. 마지막 단계에서는 앞 단계에서 구한 구간을 활용하여 유전자 알고리즘으로 최적의 PID 제어파라미터 값을 구한다. 그 결과 제안 된 방법은 안정성이 보장되며, 최적의 제어기를 설계하여 기존의 방법보다 성능 지표에서 우월함을 확인하였다. 향후 지연시간에 대한 보상방법이 연구된다면 더욱 좋은 성능지표를 얻을 것으로 판단된다.

Analysis of Cone and Seed Characteristics from Different Mating Design Strategies of Pinus densiflora for. multicaulis

  • Lee, Kyungmi;Lee, Hyunseok;Kang, Jun-Won
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제37권4호
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    • pp.309-314
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    • 2021
  • This study aimed to enhance seed productivity and secure genetic resources for Pinus densiflora for. multicaulis. We analyzed the characteristics of cone and seed generated by control pollination between Pinus densiflora (PD) and Pinus densiflora for. multicaulis (PDM). The highest number of cone scales (63.0) was obtained from the self-pollinated (sp) PDM clone B (PDM-sp-B), whereas the lowest number of cone scales (44.7) was obtained from two combinations designated as PDM-A×PD-075 and PDM-A×PD-0111. Both female parents of the hybrids were PDM-A. The highest seed production capacity (80.8) was obtained from the open-pollinated (op) PDM clone B (PDM-op-B). The seed potentials of PDM-B×PD-0111, PDM-op-A, and PDM-sp-B were 67.4, 66.5, and 63.1, respectively. The highest number of fertile scales (41.5) was obtained from PDM-op-B, and the lowest number of fertile scales (28.8) was obtained from PDM-A×PD-075. The total number of aborted ovules and 1st aborted ovules was not statistically significant in the mating design. The cross combination of PDM-B×PD-0111 had the highest number (34.8) of filled seeds and the lowest number of 2nd aborted ovules (5.2) and empty seeds (9). PDM-op-B had the highest number of developed seeds (47.6), although the number of empty seeds was the highest (41.2). Therefore, we conclude that the mating design of PDM-B×PD-0111 is useful for future breeding programs to improve seed yield of PDM. Our results showed that there was a strong correlation between the following two parameter pairs: number of scales and number of fertile scales, and the number of fertility scales and seeds potential (r=0.89 and r=0.84, respectively; both p<0.01).

Structural damage identification with output-only measurements using modified Jaya algorithm and Tikhonov regularization method

  • Guangcai Zhang;Chunfeng Wan;Liyu Xie;Songtao Xue
    • Smart Structures and Systems
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    • 제31권3호
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    • pp.229-245
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    • 2023
  • The absence of excitation measurements may pose a big challenge in the application of structural damage identification owing to the fact that substantial effort is needed to reconstruct or identify unknown input force. To address this issue, in this paper, an iterative strategy, a synergy of Tikhonov regularization method for force identification and modified Jaya algorithm (M-Jaya) for stiffness parameter identification, is developed for damage identification with partial output-only responses. On the one hand, the probabilistic clustering learning technique and nonlinear updating equation are introduced to improve the performance of standard Jaya algorithm. On the other hand, to deal with the difficulty of selection the appropriate regularization parameters in traditional Tikhonov regularization, an improved L-curve method based on B-spline interpolation function is presented. The applicability and effectiveness of the iterative strategy for simultaneous identification of structural damages and unknown input excitation is validated by numerical simulation on a 21-bar truss structure subjected to ambient excitation under noise free and contaminated measurements cases, as well as a series of experimental tests on a five-floor steel frame structure excited by sinusoidal force. The results from these numerical and experimental studies demonstrate that the proposed identification strategy can accurately and effectively identify damage locations and extents without the requirement of force measurements. The proposed M-Jaya algorithm provides more satisfactory performance than genetic algorithm, Gaussian bare-bones artificial bee colony and Jaya algorithm.

부도예측을 위한 KNN 앙상블 모형의 동시 최적화 (Investigating Dynamic Mutation Process of Issues Using Unstructured Text Analysis)

  • 민성환
    • 지능정보연구
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    • 제22권1호
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    • pp.139-157
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    • 2016
  • 앙상블 분류기란 개별 분류기보다 더 좋은 성과를 내기 위해 다수의 분류기를 결합하는 것을 의미한다. 이와 같은 앙상블 분류기는 단일 분류기의 일반화 성능을 향상시키는데 매우 유용한 것으로 알려져 있다. 랜덤 서브스페이스 앙상블 기법은 각각의 기저 분류기들을 위해 원 입력 변수 집합으로부터 랜덤하게 입력 변수 집합을 선택하며 이를 통해 기저 분류기들을 다양화 시키는 기법이다. k-최근접 이웃(KNN: k nearest neighbor)을 기저 분류기로 하는 랜덤 서브스페이스 앙상블 모형의 성과는 단일 모형의 성과를 개선시키는 데 효과적인 것으로 알려져 있으며, 이와 같은 랜덤 서브스페이스 앙상블의 성과는 각 기저 분류기를 위해 랜덤하게 선택된 입력 변수 집합과 KNN의 파라미터 k의 값이 중요한 영향을 미친다. 하지만, 단일 모형을 위한 k의 최적 선택이나 단일 모형을 위한 입력 변수 집합의 최적 선택에 관한 연구는 있었지만 KNN을 기저 분류기로 하는 앙상블 모형에서 이들의 최적화와 관련된 연구는 없는 것이 현실이다. 이에 본 연구에서는 KNN을 기저 분류기로 하는 앙상블 모형의 성과 개선을 위해 각 기저 분류기들의 k 파라미터 값과 입력 변수 집합을 동시에 최적화하는 새로운 형태의 앙상블 모형을 제안하였다. 본 논문에서 제안한 방법은 앙상블을 구성하게 될 각각의 KNN 기저 분류기들에 대해 최적의 앙상블 성과가 나올 수 있도록 각각의 기저 분류기가 사용할 파라미터 k의 값과 입력 변수를 유전자 알고리즘을 이용해 탐색하였다. 제안한 모형의 검증을 위해 국내 기업의 부도 예측 관련 데이터를 가지고 다양한 실험을 하였으며, 실험 결과 제안한 모형이 기존의 앙상블 모형보다 기저 분류기의 다양화와 예측 성과 개선에 효과적임을 알 수 있었다.

한우 당대검정우와 후대검정우의 성장형질에 관한 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters for The Growth Traits of Performance and Progeny Test in Hanwoo(Bos taurus Coreanae))

  • 기근서;최태정;김시동;최호성;백동훈
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권6호
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    • pp.699-710
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    • 2007
  • 본 연구는 1989년 8월부터 2005년 9월까지 농협중앙회 가축개량사업소에서 당대 검정을 실시한 비거세우 3,904두의 검정 자료와 1996년 8월부터 2004년 6월까지 축산연구소 한우시험장(대관령지소), 유전자원시험장(남원지소), 농협중앙회 가축개량사업소에서 출생한 후대검정 거세우 2,424두의 검정 자료를 조사 분석하였다. 분석 형질은 당대검정 비거세우(후보우)의 6개월령, 12개월령 체중 및 12개월령 일당증체량과 후대검정 거세우의 6, 12, 24개월령 체중 및 12개월령 일당증체량으로 DFREML 패키지를 이용하여 분석하였다. 측정된 당대검정우의 6개월령, 12개월령 체중 그리고 일당증체량은 각각 181.72±30.22kg, 351.48±40.24kg 그리고 998.07±153.84g으로 나타났으며 후대검정우의 6개월령, 12개월령, 24개월령 체중 그리고 일당증체량은 각각 169.18±32.82kg, 229.37±44.57kg, 570.45±64.36kg 그리고 739.41±172.14g으로 나타났다. 당대검정 비거세우(후보우)의 6개월령 체중, 12개월령 체중 및 일당증체의 유전력은 각각 0.54±0.06, 0.60±0.06 및 0.23±0.04 추정되었다. 후대검정 거세우의 6개월령, 12개월령 및 24개월령 체중에 대한 유전력은 0.80±0.08, 0.50±0.07 및 0.46±0.07로 나타났으며 일당증체에 대한 유전력은 0.07±0.03으로 추정되었다. 한우의 당대 검정에 있어서도 기존의 초기성장형질에 대한 조사뿐만 아니라 12개월 이후의 체중에 대한 조사도 고려해봐야 할 것이며 차후 후대 검정우의 체중과 도체형질간의 유전모수 추정 연구 또한 필요하다고 생각된다. 이는 곧 당대와 후대간 체중의 간접적인 비교와 후대의 체중과 도체형질간의 간접적인 비교를 가져올 것이라 사료된다.