• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제17권1호
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• pp.249-254
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• 2016

Molecular detection methods such as RT-PCR for detecting breast cancer-associated gene expression in the peripheral blood have the potential to modify breast cancer (BC) staging and therapy. In this regard, we evaluated the potential of erb-B2 molecular marker in BC detection and analyzed the expression of erb-B2 mRNA in the peripheral blood and fresh tissue samples of 50 pretreated female BC patients and 50 healthy females by reverse transcription-PCR (RT-PCR) method. We also assessed the correlation of erb-B2 mRNA marker positivity in peripheral blood and tumor tissue samples with clinical and pathological factors in BC patients in order to evaluate its prognostic value. It was shown that there is a significant difference between healthy females and BC patients with expression of the erb-B2 molecular marker (p<0.01). A significant difference between the expression of erb-B2 in the peripheral blood and tissue samples of BC patients (p<0.01) and the frequency of circulating erb-B2 mRNA expression in peripheral blood and in tissue was detected by RT-PCR. No correlation was found between erb-B2 mRNA expression in blood or tumor tissue samples and lymph node, tumor grade, tumor stage, tumor size, patient's age, ki67, estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PGR), P53, and HER-2 status. However, in a small subset of 31 BC patients we found that expression of erb-B2 in peripheral blood or in both peripheral blood and tumor tissue was directly correlated with lympho-vascular invasion and perineural invasion as poor prognostic features. The highest rates of erb-B2 expression in peripheral blood or tumor tissue were in the ER and PR negative and HER-2 positive group. This study suggests that the application of the RT-PCR and immunohistochemical methods for erb-B2 molecular marker detection would provide a higher detection rate, especially in early stage BC.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권13호
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• pp.5249-5252
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• 2014

Nogo protein, encoded by gene reticulon-4 (RTN4), includes three major isoforms by different splicing, named Nogo-A Nogo-B and Nogo-C. Nogo proteins play an important role in the apoptosis of cells, especially in tumor cells. RTN4 single nucleotide polymorphisms (SNPs) can influence the efficiency of transcription and translation thus being related with an individual's predisposition to cancer. The CAA insertion/deletion polymorphism (rs34917480) within RTN4 3'-UTR has been reported to be associated with many cancer types. In order to investigate the relationship between this polymorphism and susceptibility to non-small cell lung cancer (NSCLC) in the Chinese population, we conducted the present case-control study including 411 NSCLC patients and 471 unrelated healthy controls. The genotype distributions were significantly different between cases and controls (p=0.014). We found that the del allele could significantly increase NSCLC risk (ins/ins vs ins/del: p=0.007, OR 1.46, 95%CI=1.11-1.93; dominant model: p=0.004, OR 1.47, 95%CI=1.13-1.92 and allele model: p=0.008, OR 1.35, 95%CI=1.08-1.67). This association was stronger in participants over 60 years old, males and smokers. We therefore conclude that the CAA insertion/deletion polymorphism (rs34917480) contributes to non-small cell lung cancer risk in Chinese population. Age, sex and environmental exposure are also related to carcinogenic effects of rs34917480.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제19권6호
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• pp.775-778
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• 2006

Sarabi cows (n = 136) from the Sarabi Breeding Station were genotyped at bovine lymphocyte antigen (BoLA)-DRB3.2 locus by a genotyping system that used the polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism. Genomic DNA was extracted from whole blood samples. A two-step polymerase chain reaction was carried out in order to amplify a 284 base-pair fragment of target gene. Nested-PCR products were digested with three restriction endonuclease enzymes RsaI, BstYI and HaeIII. Digested fragments were analyzed by polyacrylamide gel electrophoresis. Twenty-six BoLA-DRB3.2 alleles were identified with frequencies ranging from 0.4 to 15.1%. Six new allele types observed in this study have not been reported previously. Identified alleles include: BoLA-DRB3.$2^*1$, $^*2$, $^*4$, $^*6$, $^*8$, $^*12$, $^*13$, $^*14$, $^*15$, $^*16$, $^*17$, $^*23$, $^*24$, $^*25$, $^*28$, $^*32$, $^*34$, $^*35$, $^*36$, $^*37$, $^*42$, $^*46$, $^*51$, $^*kba$, $^*laa$ and $^*vaa$. Their frequencies were found to be 0.4, 0.4, 0.7, 11.4, 1.1, 1.8, 2.9, 2.2, 4.4, 9.6, 1.1, 13.6, 0.4, 0.4, 1.1, 0.7, 0.4, 6.2, 2.2, 3.7, 1.1, 7.7, 1.5, 15.1, 2.6 and 7.3% respectively. The six most frequent alleles (DRB3.2 $^*6$, $^*16$, $^*23$, $^*46$, $^*kba$ and $^*vaa$) accounted for 64.7% of the alleles in the population of this herd. Numerous studies on this locus, covering different breeds, has revealed the existence of various alleles in this locus, and new investigations have introduced novel alleles. With respect to the high number of the observed alleles in this survey and the novelty of some alleles with no previous record of reporting, it is plausible to conclude that the BoLA-DRB3.2 locus is highly polymorphic in Iranian native Sarabi cows.

• 대한한의학회지
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• 제26권3호
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• pp.1-12
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• 2005

Objectives : Substantial evidence suggests that reinforcing effects of nicotine can be mediated by the mesolimbic dopaminergic system. It has been shown that repeated injections of nicotine produce an increase in locomotor activity and expression of the immediate-early gene, c-fos, in the dopaminergic target areas. Herbal medicine as a therapeutic intervention has been widely used for the treatment of mental dysfunction. Many studies have shown that Radix Scutellariae (RS) can affect the biochemical balance in the central nervous system. Tn order to investigate whether RS has an influence on nicotine-induced behavioral sensitization, we examined the effect of RS on nicotine-induced locomotor activity and c-fos expression in the striatum and nucleus accumbens utilizing the fos-tike immunohistochemistry (FLI). Methods : Male SD rats received RS (200mg/kg, i.p.) 30min before repeated daily injections of nicotine (0.4mg/kg, s.c.) for 7 days. This was followed by withdrawal for 3 days and one challenge for 1 day. Results : System challenge with nicotine produced a much larger increase in locomotor activity and accumbal FLI. Pretreatment with RS significantly inhibited nicotine-induced locomotor activity and FLI in the striatum and nucleus accumbens. Conclusions : These results demonstrate that reduction in locomotor activity by RS may be reflected by reduction of dopamine release and postsynaptic neuronal activity in the striatum and nucleus accumbens. Our results suggest that RS may have therapeutic effect on nicotine addiction.

• 한국응용과학기술학회지
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• 제30권1호
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• pp.173-182
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• 2013

아토피성 피부염은 만성 재발성 염증성 피부질환으로 피부장벽기능의 이상과 환경유발인자에 대한 피부과민성과 연관되어 있다. 이전의 연구에서는 아토피성피부염에 효과적인 약용식물 추출물을 발굴하기 위하여 노회, 자회지정, 석류, 석곡 추출물들의 세포독성, 항산화, 항염, 항알레르기 효과를 검토하였다. 본 연구에서는 지질다당류로 활성화시킨 대식세포 RAW26.7 에 대한 약용식물 추출물들의 항염작용을 보다 상세하게 검토하여 항염작용의 근본적인 분자기전을 확인하고자 하였다. 역전사중합효소연쇄반응분석(reverse transcription polymerase chain reaction analysis) 결과, 석류, 석곡, 노회는 염증성 사이토카인인 IL-6 와 IL-$1{\beta}$ 유전자발현을 현저하게 억제시켰으며 자화지정은 영향이 없었다. 형질주입과 발광효소분석(transfection and luciferase analysis) 결과, 약용식물 모두가 전사 핵인자 카파비(NF-${\kappa}B$)의 활성화를 억제시켰다. 웨스턴 블럿 분석(western blot analysis) 결과, 노회는 JNK MAP 인산화효소의 활성화를 차단하였지만 p38 MAP 인산화효소의 활성화는 차단하지 못하였다. 반면에 자화지정, 석류, 석곡은 JNK MAP 인산화효소뿐만 아니라 p38 MAP 인산화효소의 활성화도 차단하였다. 이들 실험결과들은 노회, 자화지정, 석류, 석곡은 항염효능을 가지고 있으며 따라서 아토피성 피부염의 증상을 경감 또는 완화시키는 잠재력이 있음을 보여 준다.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제46권4호
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• pp.315-323
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• 2013

본 연구에서 청미래덩굴 잎과 뿌리의 물추출물을 이용하여 총 폴리페놀과 플라보노이드의 함량을 측정한 결과 잎 추출물에서 더 많은 함량이 확인되었으며, DPPH 및 ABTS radical 소거능, 환원력 측정을 통한 항산화 활성을 비교한 결과도 폴리페놀과 플라보노이드함량 측정 결과와 마찬가지로 잎에서 높은 활성을 명확하게 확인할 수 있었다. 그리고 청미래덩굴 추출물의 항당뇨 효능에 대한 최초의 시도로서 ${\alpha}$-glucosidase 활성억제능을 측정한 결과 뿌리추출물에서는 효소의 억제력을 확인할 수 없었지만 잎 추출물에서는 농도 및 반응시간의 증가에 따라 억제력이 증가하여 물 추출물 상태에서 1 mg/mL 기준으로 acarbose의 ${\alpha}$-glucosidase 활성 억제능과 비교하여 71.8%의 활성을 관찰할 수 있었다. 또한 당뇨와 염증의 관련성이 대두되는 최근의 연구 상황에서 청미래덩굴 잎 추출물의 IL-$1{\beta}$, IL-6, iNOS, COX-2의 mRNA 발현 억제작용을 확인함으로써 염증반응의 개선 가능성도 제시할 수 있었다. 결과적으로 청미래덩굴 잎 추출물의 항산화능, ${\alpha}$-glucosidase 활성억제능 및 항염증효능을 확인함으로써 neutraceuticals 소재로서의 개발가능성을 증명하였고 추가 연구의 필요성을 제시하였다.

• 대한치과교정학회지
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• 제44권2호
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• pp.96-102
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• 2014

Objective: A recent study suggested that rs6504340, a polymorphism within the homeobox B (HOXB) gene cluster, is associated with the susceptibility for malocclusions in Europeans. The resulting malocclusions require orthodontic treatment. The aim of this study was to investigate the association of rs6504340 and other dentition-implicated polymorphisms with dental and occlusal traits in Korean and Japanese populations. Methods: The study participants included 223 unrelated Koreans from the Busan area and 256 unrelated Japanese individuals from the Tokyo metropolitan area. DNA samples were extracted from saliva specimens. Genotyping for rs6504340 and four single nucleotide polymorphisms (SNPs) that have been shown to be associated with the timing of first tooth eruption and the number of teeth at 1 year of age (rs10506525, rs1956529, rs9674544, and rs8079702) was performed using TaqMan assays. The Index of Orthodontic Treatment Need (IOTN), overjet, overbite, arch length discrepancy, crown sizes, and length and width of the dental arches were measured. Spearman's correlation coefficients were calculated to evaluate relationships between rs6504340 and these dental/occlusal traits. Results: We evaluated the aesthetic components and dental health components of the IOTN in the Korean and Japanese populations and found that neither rs6504340 nor the other four SNPs showed any association with dental and occlusal traits in these East Asian populations. Conclusions: These negative results suggest that further research is needed to identify the genetic determinants of malocclusions in order to reach a consensus.

• 대한의생명과학회지
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• 제6권1호
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• pp.65-72
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• 2000

반추수에서 발생하는 Johne병의 조기 진단 방법을 제시하고 이 질병의 원인체와 미생물학적 특징 이 유사한 M. bovis, M. avium 등의 mycobacteria 감염증을 감별 진단하는 방법 을 개발하기 위하여 Mycobacterium 균속의 표준균주를 사용하여 중합효소 연쇄반응을 확립하였다. Johne병으로 의심되는 소의 혈액과 유즙을 채취하여 분리한 단핵구 및 거식세포로부터 genomic DNA를 추출하였다. 각 시료로부터 추출한 DNA를 template로 이용하여 Mycobacterium spp.에 특이적인 16S rDNA primer set를 이용한 PCR을 수행하여 시료내의 mycobacterial DNA 보유 여부를 확인하였다. 한편 mycobacteria 양성으로 확인된 시료는 M. avium complex 균종에 특이한 16S rDNA 염기서열을 기초로 하여 제작한 primer set와 M. paratuberculosis의 IS900 sequence에 특이한 primer set를 이용하여 duplex PCR을 수행하여 Johne병 원인체의 보균 여부를 조사하였으며, 이 결과를 oligonucleotide probe를 사용한 Southern blot hybridization을 통하여 다시 확인하였다. 이와 같은 duplex PCR기법을 실제 축산 현장에서 수집한 유즙과 말초혈액으로부터 분리한 단핵구 및 거식세포 시료에 적용한 결과 본 연구에서 확립한 duplex PCR기법 유용성을 확인할 수 있었다.

• 한국균학회지
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• 제40권2호
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• pp.118-123
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• 2012

대표적인 감귤 녹색곰팡이병(Penicillium digitatum) 방제용 생물농약을 개발하고자 제주도내 7개 과수원으로부터 채집된 citrus 잎에서 21균주의 내생세균을 분리하였다. 그 중 5개의 세균이 녹색곰팡이병균 P. digitatum에 항균활성을 나타냈으며, 대치배양에서 가장 강력한 항균활성을 보인 CB3 균주가 선발되었다. CB3 균주는 간상형의 그람 양성세균으로 생리 생화학적 특성과 gyrA 유전자 염기서열 분석에 의해 Bacillus velezensis로 동정되었다. CB3 균주는 감귤 저장병 병원균 Penicillium digitatum에 강력한 항균활성을 나타내었다. $1{\times}10^5$ spores/ml에 이르는 고농도의 P. digitatum을 감귤에 상처접종했을 때에도, $1{\times}10^8$ cfu/ml의 CB3에 의한 방제효과는 66.7%로 매우 높았다. 본 연구결과, Bacillus velezensis CB3의 안정성과 강한 방제활성 등을 고려할 때 유용 친환경적 방제제로서 매우 가치가 있을 것으로 판단된다.

• 미생물학회지
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• 제43권2호
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• pp.77-82
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• 2007

자웅동체 자낭균류인 Aspergillus nidulans의 유성분화는 다양한 외부 환경 스트레스, 즉, 아세트산을 함유한 배지, 가시광선의 조사, 높은 삼투압 조건 등에서 강하게 저해 받는다. 본 연구에서는 이에 관련된 유전자들을 분리, 분석하기 위하여 다양한 외부 환경 스트레스를 준 상태에서도 정상적으로 유성포자를 만들 수 있는 돌연변이 균주들을 분리하였다. 총 167개의 돌연변이 균주들 중에서 152종의 균주들은 각각 빛, 삼투, 아세트산 등의 조건에서 유성분화를 할 수 있었으나 두가지 이상을 동시에 주었을 때에는 유성분화를 하지 못하였다. 또한 6개의 돌연변이 균주들은 KCl 첨가 배지에서는 야생형과 변화가 없었으나 빛을 쬐거나 아세트산배지에서는 유성분화를 진행하였다. 그리고, 3개의 돌연변이 균주는 각각의 단일 스트레스 조건뿐만 아니라 KCl과 아세트산이 함께 들어있는 배지에서도 유성분화를 할 수 있었다. 이들 가운데 아세트산과 KCl 배지에서는 야생형과 표현형이 동일하나, 빛이 있는 조건에서는 야생형과 달리 유성분화를 하는 돌연변이 6균주를 얻었으며 이를 SIL 돌연변이라 칭하였다. 상보군 검정결과 이들은 모두 각각 다른 돌연변이를 가지고 있는 것으로 파악되어 silA에서 silF까지 여섯 그룹으로 명명하였고, 우열검정 결과 이들은 모두 열성임이 확인되었다. 대부분의 균주들은 각각 3종류의 스트레스 조건에서 유성분화를 하는 돌연변이들이었기 때문에, 특별하게 빛에만 반응하여 분화에 영향을 주는 유전자는 몇몇에 불과하고, 다른 스트레스들과 관련된 유전자와 연관성이 많으며, 성장에 있어서는 외부 환경 스트레스에 따른 영향은 크지 않은 것으로 사료된다.