• 제목/요약/키워드: GPR

검색결과 481건 처리시간 0.031초

Computational Analysis of the 3-D structure of Human GPR87 Protein: Implications for Structure-Based Drug Design

  • Rani, Mukta;Nischal, Anuradha;Sahoo, Ganesh Chandra;Khattri, Sanjay
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제14권12호
    • /
    • pp.7473-7482
    • /
    • 2013
  • The G-protein coupled receptor 87 (GPR87) is a recently discovered orphan GPCR which means that the search of their endogenous ligands has been a novel challenge. GPR87 has been shown to be overexpressed in squamous cell carcinomas (SCCs) or adenocarcinomas in lungs and bladder. The 3D structure of GPR87 was here modeled using two templates (2VT4 and 2ZIY) by a threading method. Functional assignment of GPR87 by SVM revealed that along with transporter activity, various novel functions were predicted. The 3D structure was further validated by comparison with structural features of the templates through Verify-3D, ProSA and ERRAT for determining correct stereochemical parameters. The resulting model was evaluated by Ramachandran plot and good 3D structure compatibility was evidenced by DOPE score. Molecular dynamics simulation and solvation of protein were studied through explicit spherical boundaries with a harmonic restraint membrane water system. A DRY-motif (Asp-Arg-Tyr sequence) was found at the end of transmembrane helix3, where GPCR binds and thus activation of signals is transduced. In a search for better inhibitors of GPR87, in silico modification of some substrate ligands was carried out to form polar interactions with Arg115 and Lys296. Thus, this study provides early insights into the structure of a major drug target for SCCs.

지하 매설관 탐지를 위한 지하탐사레이다 신호의 특성에 관한 연구 (A Study on Characteristics of Ground-Penetrating Radar Signals for Detection of Buried Pipes)

  • 현승엽
    • 한국전자파학회논문지
    • /
    • 제28권1호
    • /
    • pp.42-48
    • /
    • 2017
  • 지하에 매설된 관을 탐지하기 위해 지하탐사레이다(GPR) 신호의 특성을 수치해석으로 조사하였다. GPR 시스템의 송수신부, 지하매질, 유전체로 채워진 플라스틱 관을 시간영역유한차분법(FDTD)으로 모델링하였다. GPR 신호의 양상을 관찰하기 위해서 관의 지름과 관 속에 채워진 물질의 유전율 변화에 따른 FDTD 모의계산을 수행하였다. 유전체로 채워진 플라스틱 관에 의해 산란된 GPR 신호는 관 외부의 전방 볼록면 반사파와 관 내부의 후방 오목면 반사파의 중첩으로 나타났다. 두 파의 진폭, 극성, 지연시간은 플라스틱 관 사이즈와 관 내부 충진 물질의 유전율에 종속되어 있음을 알 수 있었다.

지하투과레이다를 이용한 교각 주변의 하상변화 조사 (Application of Ground Penetrating Radar for Assessing Riverbed Variation Near Bridge Piers)

  • 박인찬;조원철;이종국
    • 지구물리와물리탐사
    • /
    • 제8권2호
    • /
    • pp.119-128
    • /
    • 2005
  • 하천에서 발생하는 세굴 과정을 파악하기 위해서 교량 우물통 주변의 침식 그리고 퇴적 양상을 조사하는 것은 필수적이다. 지구물리탐사법은 하천 하상변화를 파악하는데 매우 효과적이며, 과거에 발생한 하상의 세굴 현상을 이해하는데 도움을 줄 수 있다. 본 연구에서는 비파괴 지구물리탐사법인 지하 투과 레이다(Ground Penetrating Radar, GPR)를 이용하여 2002년 6월과 2002년 10월에 한강 내의 교각 주변을 대상으로 홍수전$\cdot$후 세굴에 의한 하상 변화,세굴과 되메움의 범위 및 깊이, 그리고 하상 매질을 조사하였다. 자료획득에는 100 MHz와 400 MHe안테나를 이용한 GSSI SIR 2000 시스템이 사용되었다. 하천의 흐름방향으로 조사한 24개의 교각 사이와 5개 교각의 주위를 돌며 획득된 GPR영상이 비교 제시되었다. 적절한 현장탐사장비와 탐사 절차가 적용된 GPR탐사는 교각 및 교대 주변의 하천 수심과 하상 지질학적 구조를 결정하는데 효과적일 수 있다는 결론을 얻었다.

콘크리트 배면공동 탐지를 위한 GPR, IE 및 IR기법의 복합 적용 (Integrated Application of GPR, IE and IR Methods to Detection of the Rear Cavity of Concrete)

  • 노명근;오석훈;장봉석
    • 지구물리와물리탐사
    • /
    • 제12권4호
    • /
    • pp.338-346
    • /
    • 2009
  • 콘크리트의 배면에 위치하는 공동을 탐지하기 위해 실제 구조물과 같은 스케일의 모형을 제작하여 비파괴 검사로 널리 사용되는 GPR (ground penetrating radar)탐사와 충격반향기법(IE; impact echo), 충격응답기법(IR; impulse response)을 복합적으로 적용하였다. 콘크리트 모형은 철근 및 공동의 유무에 따라 다양한 반응을 관찰할 수 있도록 설계 하였다. GPR 탐사결과 공동의 유무에 따라 반응의 차이가 나타났지만 정확하게 공동의 존재를 파악하기 어려웠으며, 주로 건전도 측정을 위해 지반조사에 활용되었던 IE 및 IR 기법은 공동의 유무를 구분할 수 있는 반응을 보여주었다. 각 탐사의 적용 결과 철근의 존재에 따라 각 방법별로 배면의 공동을 탐지하는데 반응의 변화가 나타나긴 했지만, 세 가지 방법을 복합적으로 적용하였을 때 단일 탐사를 이용한 결과보다 정확하게 배면 공동의 위치를 파악할 수 있었다.

유적지 발굴을 위한 효율적 3차원 GPR 탐사 (Effective 3-D GPR Survey for the Exploration of Old Remains)

  • 김정호;이명종;손정술;조성준;박삼규
    • 지구물리와물리탐사
    • /
    • 제8권4호
    • /
    • pp.262-269
    • /
    • 2005
  • 역사유물은 지질구조와는 달리 일정한 방향성이 없이 매몰되어 있는 경우가 많으므로 고적지 탐사를 위해서는 근본적으로 2차원 보다는 3차원 물리탐사가 바람직하다. 그러나 3차원 GPR 탐사는 매우 조밀한 측선설정과 아울러 대단히 많은 자료를 획득하여야 하므로 자력, 전자탐사와 같이 유적지 탐사에 많이 응용하는 다른 탐사방법에 비하여 상대적으로 현장탐사기간이 길어질 뿐만 아니라 많은 경비가 소요된다. 이 연구에서는 두 조의 송, 수신 안테나와 안테나 이동 궤적을 연속적으로 자동 기록할 수 있는 측량 시스템을 이용하여 소규모의 3차원 GPR 자동연속 탐사 시스템을 구성하였다. 3차원 측선을 미리 측량함 또한 상당한 기간과 경비가 소요되므로 미리 설정하지 않은 임의의 경로를 따라 자료를 취득하는 개념을 도입하였다. 이와 병행하여 개발한 자료취득 시스템으로 획득한 자료를 효율적으로 전산처리하고 영상화하는 소프트웨어 또한 개발하였다. 개발한 시스템을 이용하여 부여 외곽 백제 유적지로 추정되는 지역에서 3차원 GPR 탐사를 수행하였다. 약 $17,000m^2$에 걸친 지역의 3차원 GPR 탐사에 약 6 시간의 현장작업시간이 소요되었으며 이는 개발한 시스템의 효율성을 입증한다. 미리 설정한 격자망 측선이 아닌 임의의 측선 경로를 따라 자료를 획득하였음에도 불구하고 고분해능 3차원 지하 영상의 획득이 가능하였으며, 이로부터 경작지, 수로, 인공 구조물 또는 유물 등의 존재를 알려주는 이상대들을 파악할 수 있었다. 이 연구를 통하여, 3차원 GPR 탐사 또한 국부적인 이상대의 규명뿐만 아니라 광역적인 유적지 조사에도 다른 물리탐사와 마찬가지로 쉽게 활용될 수 있다는 결론을 얻을 수 있었다.

지하레이다(GPR)를 이용한 터널 라이닝 비파괴시험에 관한 연구 (Non-Destructive Test for Tunnel Lining Using Ground Penetrating Radar)

  • 김영근;이용호;정한중;신상범;조철현
    • 터널과지하공간
    • /
    • 제7권4호
    • /
    • pp.274-283
    • /
    • 1997
  • It is necessary to estimate the soundness of tunnel using non-destructive tests(NDT) for effective repairs and maintenances. But, the state of tunnel lining could not be investigated using previous non-destructive techniques, due to the various types of support and accessibility only from one side in tunnel lining. Recently, the various non-destructive techniques such as ground penetrating radar(GPR) have been researched and developed for inspection of tunnel lining. In this study, the usefulness and applicability of GPR test in tunnel lining inspection has been investigated through model tests and tunnel site application. This paper described the tunnel lining inspection for lining thickness, cavity and support using GPR test. From the results of tests, we have concluded that GPR test are very useful and effective techniques to look into the interior of lining and measure the lining thickness.

  • PDF

Advances in Imaging of Subsurface Archaeology using GPR

  • Goodman Dean;Nishimur Yasushi;Schneider Kent;Piro Salvadore;Hongo Hiromichi;Higashi Noriaki
    • 한국지구물리탐사학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국지구물리탐사학회 2004년도 정기총회 및 제6최 특별 심포지움
    • /
    • pp.8-21
    • /
    • 2004
  • Examples of GPR survey results at a variety of archaeological sites are presented. Several new analyses which include static corrections for the tilt of the GPR antenna are shown for imaging of burial mounds with significant topography. Example archaeological site plans developed from GPR remote sensing of Roman and Japanese sites are given. The first completely automated GPR survey, using only Global Positioning Satellite navigation to create 3D data volumes, is employed for a site in Louisiana to detect lost graves of the Choctaw Indian Tribe.

  • PDF

금강 부여 군수리 충적 대수층 조사를 위한 고해상도 지구물리탐사 - 탄성파 탐사 및 GPR 조사를 중심으로 -

  • 김형수;서만철;이철우;진세화
    • 한국지하수토양환경학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국지하수토양환경학회 2003년도 총회 및 춘계학술발표회
    • /
    • pp.287-291
    • /
    • 2003
  • To delineate the internal structures of alluvial aquifer, high resolution seismic and GPR methods were adopted in Buyeo Gunsu-Ri area. The result of seismic refraction survey shows the water table of the aquifer and the result of seismic reflection reveals the basement and somewhat dominant internal structures of alluvial aquifer. The internal heterogeneity due to variations in channel behavior can be delineated using GPR survey. GPR profiles for the point bar deposits near Buyeo county reveals two different stratigraphic units the lower inclined heterogeneous strata and the upper horizontally stratified strata. According to the increase of demand for water resource using artificial recharge in alluvium, it is believed that the information acquired by high resolution geophysical methods will have an important roles for the effective and sustainable development and usage of groundwater in alluvial aquifer.

  • PDF

GPR 및 단일채널 탄성파탐사에 의한 터널라이닝 배면공동 조사 (Detection of the Cavity Behind the Tunnel Lining by Single Channel Seismic and GPR Method)

  • 신성렬;조철현;신창수;양승진;장원일
    • 한국구조물진단유지관리공학회 논문집
    • /
    • 제2권4호
    • /
    • pp.148-158
    • /
    • 1998
  • Determining the thickness if concrete lining and detecting of the cavity where is located behind tunnel lining plays an important role in the safety diagnosis of tunnel structure and the quality control. In this study, we made use of GPR and seismic method in order to find the cavity or flaw. Although GPR is very useful method in the concrete lining without rebar, it is difficult to detect the cavity in the reinforced concrete lining. We applied mini-seismic method to the reinforced concrete lining. The obtained seismic data was processed by means of seismic section in time domain and image section of power spectrum in frequency domain using Impact-Echo method as well. The proposed method can accurately show the location and depth of the cavity in the reinforced concrete lining.

  • PDF